RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000498268.1

USP34-222, Transcript of ubiquitin specific peptidase 34, human

TSL 3

Gene USP34, Length 497 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Nucleus .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
USP34-222	ENST00000498268	OXNAD1	Q96HP4	312 aa	Predicted RBP	3.21	□□□□□ -1.9
USP34-222	ENST00000498268	IWS1	Q96ST2	819 aa		3.21	□□□□□ -1.9
USP34-222	ENST00000498268	PCGF1	Q9BSM1	259 aa		3.21	□□□□□ -1.9
USP34-222	ENST00000498268	FUZ	Q9BT04	418 aa		3.21	□□□□□ -1.9
USP34-222	ENST00000498268	TUBB2B	Q9BVA1	445 aa		3.21	□□□□□ -1.9
USP34-222	ENST00000498268	USP44	Q9H0E7	712 aa		3.21	□□□□□ -1.9
USP34-222	ENST00000498268	ZBTB20	Q9HC78	741 aa	Predicted RBP	3.21	□□□□□ -1.9
USP34-222	ENST00000498268	SIX2	Q9NPC8	291 aa		3.21	□□□□□ -1.9
USP34-222	ENST00000498268	BARHL2	Q9NY43	387 aa		3.21	□□□□□ -1.9
USP34-222	ENST00000498268	GPR52	Q9Y2T5	361 aa		3.21	□□□□□ -1.9
USP34-222	ENST00000498268		A0A0G2JNG1	304 aa		3.2	□□□□□ -1.9
USP34-222	ENST00000498268	FAM237A	A0A1B0GTK4	181 aa		3.2	□□□□□ -1.9
USP34-222	ENST00000498268	MAGEB17	A8MXT2	336 aa		3.2	□□□□□ -1.9
USP34-222	ENST00000498268		M0QZ24	198 aa		3.2	□□□□□ -1.9
USP34-222	ENST00000498268	NADK	O95544	446 aa	Predicted RBP	3.2	□□□□□ -1.9
USP34-222	ENST00000498268	TFAP2A	P05549	437 aa		3.2	□□□□□ -1.9
USP34-222	ENST00000498268	IL7R	P16871	459 aa		3.2	□□□□□ -1.9
USP34-222	ENST00000498268	HOXA13	P31271	388 aa	Predicted RBP	3.2	□□□□□ -1.9
USP34-222	ENST00000498268	ELF1	P32519	619 aa		3.2	□□□□□ -1.9
USP34-222	ENST00000498268	TBX2	Q13207	712 aa	Predicted RBP	3.2	□□□□□ -1.9
USP34-222	ENST00000498268	BIRC2	Q13490	618 aa		3.2	□□□□□ -1.9
USP34-222	ENST00000498268	CAMK1	Q14012	370 aa		3.2	□□□□□ -1.9
USP34-222	ENST00000498268	KIR2DS5	Q14953	304 aa		3.2	□□□□□ -1.9
USP34-222	ENST00000498268	ADAMTSL4-AS1	Q5T5F5	129 aa		3.2	□□□□□ -1.9
USP34-222	ENST00000498268	LCN10	Q6JVE6	187 aa		3.2	□□□□□ -1.9
USP34-222	ENST00000498268	SH2D5	Q6ZV89	423 aa		3.2	□□□□□ -1.9
USP34-222	ENST00000498268	BMPER	Q8N8U9	685 aa		3.2	□□□□□ -1.9
USP34-222	ENST00000498268	ZCCHC10	Q8TBK6	192 aa		3.2	□□□□□ -1.9
USP34-222	ENST00000498268	ABHD8	Q96I13	439 aa		3.2	□□□□□ -1.9
USP34-222	ENST00000498268	PRAC1	Q96KF2	57 aa		3.2	□□□□□ -1.9
USP34-222	ENST00000498268	C18orf12	Q96KH6	178 aa		3.2	□□□□□ -1.9
USP34-222	ENST00000498268	SMC6	Q96SB8	1091 aa		3.2	□□□□□ -1.9
USP34-222	ENST00000498268	SLX1A	Q9BQ83	275 aa		3.2	□□□□□ -1.9
USP34-222	ENST00000498268	TMEM47	Q9BQJ4	181 aa		3.2	□□□□□ -1.9
USP34-222	ENST00000498268	SYT11	Q9BT88	431 aa		3.2	□□□□□ -1.9
USP34-222	ENST00000498268	GPR63	Q9BZJ6	419 aa		3.2	□□□□□ -1.9
USP34-222	ENST00000498268	KIF9	Q9HAQ2	790 aa		3.2	□□□□□ -1.9
USP34-222	ENST00000498268	KCNJ14	Q9UNX9	436 aa		3.2	□□□□□ -1.9
USP34-222	ENST00000498268	AAR2	Q9Y312	384 aa	Known RBP	3.2	□□□□□ -1.9
USP34-222	ENST00000498268	CROCC	Q5TZA2	2017 aa		3.2	□□□□□ -1.9
USP34-222	ENST00000498268		A0A1W2PNU3	283 aa	Predicted RBP	3.19	□□□□□ -1.9
USP34-222	ENST00000498268	MEIOC	A2RUB1	952 aa		3.19	□□□□□ -1.9
USP34-222	ENST00000498268	HS3ST1	O14792	307 aa		3.19	□□□□□ -1.9
USP34-222	ENST00000498268	TPO	P07202	933 aa		3.19	□□□□□ -1.9
USP34-222	ENST00000498268	IGHV4-38-2	P0DP08	117 aa		3.19	□□□□□ -1.9
USP34-222	ENST00000498268	GATA2	P23769	480 aa	Predicted RBP	3.19	□□□□□ -1.9
USP34-222	ENST00000498268	NR2C2	P49116	596 aa		3.19	□□□□□ -1.9
USP34-222	ENST00000498268	ENPP2	Q13822	863 aa		3.19	□□□□□ -1.9
USP34-222	ENST00000498268	MYLK3	Q32MK0	819 aa		3.19	□□□□□ -1.9
USP34-222	ENST00000498268	SNAI3	Q3KNW1	292 aa		3.19	□□□□□ -1.9
USP34-222	ENST00000498268	CXorf66	Q5JRM2	361 aa	Predicted RBP	3.19	□□□□□ -1.9
USP34-222	ENST00000498268	PAPD4	Q6PIY7	484 aa	Known RBP	3.19	□□□□□ -1.9
USP34-222	ENST00000498268	LDHAL6A	Q6ZMR3	332 aa		3.19	□□□□□ -1.9
USP34-222	ENST00000498268	CACNA2D4	Q7Z3S7	1137 aa		3.19	□□□□□ -1.9
USP34-222	ENST00000498268	OR2T6	Q8NHC8	308 aa		3.19	□□□□□ -1.9
USP34-222	ENST00000498268	APOPT1	Q96IL0	206 aa		3.19	□□□□□ -1.9
USP34-222	ENST00000498268	PRMT6	Q96LA8	375 aa	Predicted RBP	3.19	□□□□□ -1.9
USP34-222	ENST00000498268	RPS6KC1	Q96S38	1066 aa		3.19	□□□□□ -1.9
USP34-222	ENST00000498268	SLC28A3	Q9HAS3	691 aa		3.19	□□□□□ -1.9
USP34-222	ENST00000498268	PELI2	Q9HAT8	420 aa		3.19	□□□□□ -1.9
USP34-222	ENST00000498268	MYH15	Q9Y2K3	1946 aa		3.19	□□□□□ -1.9
USP34-222	ENST00000498268	STK36	Q9NRP7	1315 aa		3.19	□□□□□ -1.9
USP34-222	ENST00000498268	C1orf226	A1L170	272 aa		3.18	□□□□□ -1.9
USP34-222	ENST00000498268	PDE9A	O76083	593 aa		3.18	□□□□□ -1.9
USP34-222	ENST00000498268	NGF	P01138	241 aa		3.18	□□□□□ -1.9
USP34-222	ENST00000498268	KRT19	P08727	400 aa		3.18	□□□□□ -1.9
USP34-222	ENST00000498268	HOXB5	P09067	269 aa		3.18	□□□□□ -1.9
USP34-222	ENST00000498268	GATA1	P15976	413 aa	Predicted RBP	3.18	□□□□□ -1.9
USP34-222	ENST00000498268	MCC	P23508	829 aa		3.18	□□□□□ -1.9
USP34-222	ENST00000498268	MLLT10	P55197	1068 aa		3.18	□□□□□ -1.9
USP34-222	ENST00000498268	KRTAP10-8	P60410	259 aa		3.18	□□□□□ -1.9
USP34-222	ENST00000498268	RPP30	P78346	268 aa	Known RBP	3.18	□□□□□ -1.9
USP34-222	ENST00000498268	CDC16	Q13042	620 aa		3.18	□□□□□ -1.9
USP34-222	ENST00000498268	MAD2L1	Q13257	205 aa	Predicted RBP	3.18	□□□□□ -1.9
USP34-222	ENST00000498268	XKR6	Q5GH73	641 aa		3.18	□□□□□ -1.9
USP34-222	ENST00000498268	TCTE1	Q5JU00	501 aa		3.18	□□□□□ -1.9
USP34-222	ENST00000498268	BSPRY	Q5W0U4	402 aa		3.18	□□□□□ -1.9
USP34-222	ENST00000498268	LONP2	Q86WA8	852 aa		3.18	□□□□□ -1.9
USP34-222	ENST00000498268	GBGT1	Q8N5D6	347 aa		3.18	□□□□□ -1.9
USP34-222	ENST00000498268	SPATA5	Q8NB90	893 aa		3.18	□□□□□ -1.9
USP34-222	ENST00000498268	GRHL3	Q8TE85	626 aa		3.18	□□□□□ -1.9
USP34-222	ENST00000498268	UTP15	Q8TED0	518 aa	Known RBP	3.18	□□□□□ -1.9
USP34-222	ENST00000498268	NOC3L	Q8WTT2	800 aa	Known RBP	3.18	□□□□□ -1.9
USP34-222	ENST00000498268	KIF1BP	Q96EK5	621 aa		3.18	□□□□□ -1.9
USP34-222	ENST00000498268	MAEL	Q96JY0	434 aa	Known RBP	3.18	□□□□□ -1.9
USP34-222	ENST00000498268	RBM4B	Q9BQ04	359 aa	Known RBP	3.18	□□□□□ -1.9
USP34-222	ENST00000498268	ZNF71	Q9NQZ8	489 aa	Predicted RBP	3.18	□□□□□ -1.9
USP34-222	ENST00000498268	SLC7A10	Q9NS82	523 aa		3.18	□□□□□ -1.9
USP34-222	ENST00000498268	INTS6	Q9UL03	887 aa	Known RBP	3.18	□□□□□ -1.9
USP34-222	ENST00000498268	COMMD10	Q9Y6G5	202 aa		3.18	□□□□□ -1.9
USP34-222	ENST00000498268		H0YIN7	160 aa		3.17	□□□□□ -1.9
USP34-222	ENST00000498268	CLIC2	O15247	247 aa		3.17	□□□□□ -1.9
USP34-222	ENST00000498268	PIP5K1C	O60331	668 aa		3.17	□□□□□ -1.9
USP34-222	ENST00000498268	SRSF10	O75494	262 aa	Known RBP	3.17	□□□□□ -1.9
USP34-222	ENST00000498268	GNAZ	P19086	355 aa		3.17	□□□□□ -1.9
USP34-222	ENST00000498268	PIP4K2A	P48426	406 aa	Predicted RBP	3.17	□□□□□ -1.9
USP34-222	ENST00000498268	BMX	P51813	675 aa		3.17	□□□□□ -1.9
USP34-222	ENST00000498268	GALNT2	Q10471	571 aa		3.17	□□□□□ -1.9
USP34-222	ENST00000498268	PRICKLE4	Q2TBC4	344 aa		3.17	□□□□□ -1.9
USP34-222	ENST00000498268	CDON	Q4KMG0	1287 aa		3.17	□□□□□ -1.9

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