RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000497230.2

PRRX1-207, Transcript of paired related homeobox 1, humanhuman

TSL 2 BASIC

Gene PRRX1, Length 3,501 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRRX1-207ENST00000497230 MAMDC4Q6UXC1 1216 aa11.88□□□□□ -0.51
PRRX1-207ENST00000497230 USP43Q70EL4 1123 aa11.88□□□□□ -0.51
PRRX1-207ENST00000497230 ANKRD46Q86W74 232 aa11.88□□□□□ -0.51
PRRX1-207ENST00000497230 HORMAD1Q86X24 394 aa11.88□□□□□ -0.51
PRRX1-207ENST00000497230 MMAAQ8IVH4 418 aaKnown RBP11.88□□□□□ -0.51
PRRX1-207ENST00000497230 FAM83FQ8NEG4 500 aaPredicted RBP11.88□□□□□ -0.51
PRRX1-207ENST00000497230 OR13F1Q8NGS4 319 aa11.88□□□□□ -0.51
PRRX1-207ENST00000497230 METTL6Q8TCB7 284 aa11.88□□□□□ -0.51
PRRX1-207ENST00000497230 ADAMTS10Q9H324 1103 aa11.88□□□□□ -0.51
PRRX1-207ENST00000497230 TMEM134Q9H6X4 195 aa11.88□□□□□ -0.51
PRRX1-207ENST00000497230 AGPAT4Q9NRZ5 378 aa11.88□□□□□ -0.51
PRRX1-207ENST00000497230 USE1Q9NZ43 259 aa11.88□□□□□ -0.51
PRRX1-207ENST00000497230 TPRKBQ9Y3C4 175 aa11.88□□□□□ -0.51
PRRX1-207ENST00000497230 AIREO43918 545 aa11.88□□□□□ -0.51
PRRX1-207ENST00000497230 PRKD3O94806 890 aa11.88□□□□□ -0.51
PRRX1-207ENST00000497230 SERPINH1P50454 418 aaKnown RBP11.88□□□□□ -0.51
PRRX1-207ENST00000497230 RPS3AP61247 264 aaKnown RBP11.88□□□□□ -0.51
PRRX1-207ENST00000497230 SKIV2LQ15477 1246 aaKnown RBP11.88□□□□□ -0.51
PRRX1-207ENST00000497230 SMN1Q16637 294 aaKnown RBP11.88□□□□□ -0.51
PRRX1-207ENST00000497230 SLC10A6Q3KNW5 377 aa11.88□□□□□ -0.51
PRRX1-207ENST00000497230 NECAB2Q7Z6G3 386 aa11.88□□□□□ -0.51
PRRX1-207ENST00000497230 FBXO16Q8IX29 292 aaPredicted RBP11.88□□□□□ -0.51
PRRX1-207ENST00000497230 CADM2Q8N3J6 435 aa11.88□□□□□ -0.51
PRRX1-207ENST00000497230 CELF2-AS1Q8N7Q2 184 aa11.88□□□□□ -0.51
PRRX1-207ENST00000497230 EFHBQ8N7U6 833 aa11.88□□□□□ -0.51
PRRX1-207ENST00000497230 APPL2Q8NEU8 664 aa11.88□□□□□ -0.51
PRRX1-207ENST00000497230 TPD52L3Q96J77 140 aa11.88□□□□□ -0.51
PRRX1-207ENST00000497230 APOL5Q9BWW9 433 aa11.88□□□□□ -0.51
PRRX1-207ENST00000497230 ERVK13-1Q9NX77 482 aa11.88□□□□□ -0.51
PRRX1-207ENST00000497230 TMEM181Q9P2C4 612 aa11.88□□□□□ -0.51
PRRX1-207ENST00000497230 hCG_2039718K7EN88 272 aa11.87□□□□□ -0.51
PRRX1-207ENST00000497230 ARVCFO00192 962 aa11.87□□□□□ -0.51
PRRX1-207ENST00000497230 BTN3A1O00481 513 aa11.87□□□□□ -0.51
PRRX1-207ENST00000497230 ALDOCP09972 364 aaKnown RBP11.87□□□□□ -0.51
PRRX1-207ENST00000497230 DDX5P17844 614 aaKnown RBP11.87□□□□□ -0.51
PRRX1-207ENST00000497230 EFNA1P20827 205 aaPredicted RBP11.87□□□□□ -0.51
PRRX1-207ENST00000497230 GABRB3P28472 473 aa11.87□□□□□ -0.51
PRRX1-207ENST00000497230 SNRPD2P62316 118 aaKnown RBP11.87□□□□□ -0.51
PRRX1-207ENST00000497230 CLDN10P78369 228 aa11.87□□□□□ -0.51
PRRX1-207ENST00000497230 ATP6AP1Q15904 470 aa11.87□□□□□ -0.51
PRRX1-207ENST00000497230 HECTD2Q5U5R9 776 aa11.87□□□□□ -0.51
PRRX1-207ENST00000497230 ZCCHC8Q6NZY4 707 aaKnown RBP11.87□□□□□ -0.51
PRRX1-207ENST00000497230 CYP4V2Q6ZWL3 525 aaPredicted RBP11.87□□□□□ -0.51
PRRX1-207ENST00000497230 SLC22A9Q8IVM8 553 aa11.87□□□□□ -0.51
PRRX1-207ENST00000497230 ELMOD2Q8IZ81 293 aa11.87□□□□□ -0.51
PRRX1-207ENST00000497230 TTC30BQ8N4P2 665 aa11.87□□□□□ -0.51
PRRX1-207ENST00000497230 ANKRD49Q8WVL7 239 aa11.87□□□□□ -0.51
PRRX1-207ENST00000497230 LPAR1Q92633 364 aa11.87□□□□□ -0.51
PRRX1-207ENST00000497230 RMDN1Q96DB5 314 aa11.87□□□□□ -0.51
PRRX1-207ENST00000497230 COPS4Q9BT78 406 aa11.87□□□□□ -0.51
PRRX1-207ENST00000497230 MROQ9BYG7 248 aa11.87□□□□□ -0.51
PRRX1-207ENST00000497230 TOR4AQ9NXH8 423 aa11.87□□□□□ -0.51
PRRX1-207ENST00000497230 PRKAB1Q9Y478 270 aa11.87□□□□□ -0.51
PRRX1-207ENST00000497230 A0A1W2PQ72 361 aa11.87□□□□□ -0.51
PRRX1-207ENST00000497230 MOXD2PA6NHM9 499 aa11.87□□□□□ -0.51
PRRX1-207ENST00000497230 B4GALT4O60513 344 aa11.87□□□□□ -0.51
PRRX1-207ENST00000497230 LCKP06239 509 aa11.87□□□□□ -0.51
PRRX1-207ENST00000497230 ITIH1P19827 911 aa11.87□□□□□ -0.51
PRRX1-207ENST00000497230 AQP1P29972 269 aa11.87□□□□□ -0.51
PRRX1-207ENST00000497230 MATKP42679 507 aa11.87□□□□□ -0.51
PRRX1-207ENST00000497230 RAB25P57735 213 aa11.87□□□□□ -0.51
PRRX1-207ENST00000497230 MXD1Q05195 221 aa11.87□□□□□ -0.51
PRRX1-207ENST00000497230 TSTA3Q13630 321 aaPredicted RBP11.87□□□□□ -0.51
PRRX1-207ENST00000497230 TAZQ16635 292 aa11.87□□□□□ -0.51
PRRX1-207ENST00000497230 INTS11Q5TA45 600 aaKnown RBP11.87□□□□□ -0.51
PRRX1-207ENST00000497230 GALNT10Q86SR1 603 aa11.87□□□□□ -0.51
PRRX1-207ENST00000497230 FUNDC1Q8IVP5 155 aa11.87□□□□□ -0.51
PRRX1-207ENST00000497230 NLGN1Q8N2Q7 840 aa11.87□□□□□ -0.51
PRRX1-207ENST00000497230 OR2T12Q8NG77 320 aa11.87□□□□□ -0.51
PRRX1-207ENST00000497230 MYRFLQ96LU7 910 aa11.87□□□□□ -0.51
PRRX1-207ENST00000497230 ZNF560Q96MR9 790 aa11.87□□□□□ -0.51
PRRX1-207ENST00000497230 PIGVQ9NUD9 493 aa11.87□□□□□ -0.51
PRRX1-207ENST00000497230 MPP6Q9NZW5 540 aa11.87□□□□□ -0.51
PRRX1-207ENST00000497230 ANKMY1Q9P2S6 941 aa11.87□□□□□ -0.51
PRRX1-207ENST00000497230 LEF1Q9UJU2 399 aaPredicted RBP11.87□□□□□ -0.51
PRRX1-207ENST00000497230 SPO11Q9Y5K1 396 aa11.87□□□□□ -0.51
PRRX1-207ENST00000497230 EP400Q96L91 3159 aa11.87□□□□□ -0.51
PRRX1-207ENST00000497230 TRIM24O15164 1050 aa11.87□□□□□ -0.51
PRRX1-207ENST00000497230 ALDH7A1P49419 539 aaKnown RBP11.87□□□□□ -0.51
PRRX1-207ENST00000497230 POLR2JP52435 117 aaKnown RBP11.87□□□□□ -0.51
PRRX1-207ENST00000497230 CATSPEREQ5SY80 951 aa11.87□□□□□ -0.51
PRRX1-207ENST00000497230 ANKS6Q68DC2 871 aa11.87□□□□□ -0.51
PRRX1-207ENST00000497230 DENND5AQ6IQ26 1287 aa11.87□□□□□ -0.51
PRRX1-207ENST00000497230 SAMD7Q7Z3H4 446 aa11.87□□□□□ -0.51
PRRX1-207ENST00000497230 CAMKK1Q8N5S9 505 aa11.87□□□□□ -0.51
PRRX1-207ENST00000497230 PACRGLQ8N7B6 248 aa11.87□□□□□ -0.51
PRRX1-207ENST00000497230 LGALS12Q96DT0 336 aa11.87□□□□□ -0.51
PRRX1-207ENST00000497230 MTERF3Q96E29 417 aa11.87□□□□□ -0.51
PRRX1-207ENST00000497230 FAM120BQ96EK7 910 aaKnown RBP11.87□□□□□ -0.51
PRRX1-207ENST00000497230 AURKBQ96GD4 344 aaPredicted RBP11.87□□□□□ -0.51
PRRX1-207ENST00000497230 GJD4Q96KN9 370 aaPredicted RBP11.87□□□□□ -0.51
PRRX1-207ENST00000497230 MLPHQ9BV36 600 aaPredicted RBP11.87□□□□□ -0.51
PRRX1-207ENST00000497230 INTS10Q9NVR2 710 aaKnown RBP11.87□□□□□ -0.51
PRRX1-207ENST00000497230 PCDH10Q9P2E7 1040 aa11.87□□□□□ -0.51
PRRX1-207ENST00000497230 MAP10Q9P2G4 905 aa11.87□□□□□ -0.51
PRRX1-207ENST00000497230 KCTD3Q9Y597 815 aa11.87□□□□□ -0.51
PRRX1-207ENST00000497230 E5RI56 91 aa11.86□□□□□ -0.51
PRRX1-207ENST00000497230 TSPAN9O75954 239 aa11.86□□□□□ -0.51
PRRX1-207ENST00000497230 ARF4P18085 180 aaPredicted RBP11.86□□□□□ -0.51
PRRX1-207ENST00000497230 ADRA1BP35368 520 aa11.86□□□□□ -0.51
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 22.9 ms