RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000490575.1

PTPRVP-202, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type V, pseudogene, humanhuman

TSL 5 BASIC

Gene PTPRVP, Length 953 nt, Biotype processed transcript.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRVP-202ENST00000490575 A6NCN8 305 aa16.07■□□□□ 0.16
PTPRVP-202ENST00000490575 OR51F1A6NGY5 319 aa16.07■□□□□ 0.16
PTPRVP-202ENST00000490575 PPM1DO15297 605 aa16.07■□□□□ 0.16
PTPRVP-202ENST00000490575 KIF5CO60282 957 aa16.07■□□□□ 0.16
PTPRVP-202ENST00000490575 PRAMEF1O95521 474 aa16.07■□□□□ 0.16
PTPRVP-202ENST00000490575 GP1BAP07359 652 aa16.07■□□□□ 0.16
PTPRVP-202ENST00000490575 FDFT1P37268 417 aa16.07■□□□□ 0.16
PTPRVP-202ENST00000490575 TNNT3P45378 269 aaPredicted RBP16.07■□□□□ 0.16
PTPRVP-202ENST00000490575 CCL7P80098 99 aa16.07■□□□□ 0.16
PTPRVP-202ENST00000490575 TMEM115Q12893 351 aaPredicted RBP16.07■□□□□ 0.16
PTPRVP-202ENST00000490575 ILF3Q12906 894 aaKnown RBP eCLIP16.07■□□□□ 0.16
PTPRVP-202ENST00000490575 CYP1B1Q16678 543 aa16.07■□□□□ 0.16
PTPRVP-202ENST00000490575 C14orf28Q4W4Y0 310 aa16.07■□□□□ 0.16
PTPRVP-202ENST00000490575 UNQ6494/PRO21346Q6UXR6 183 aa16.07■□□□□ 0.16
PTPRVP-202ENST00000490575 TMPRSS12Q86WS5 348 aa16.07■□□□□ 0.16
PTPRVP-202ENST00000490575 PHYKPLQ8IUZ5 450 aa16.07■□□□□ 0.16
PTPRVP-202ENST00000490575 ARL14Q8N4G2 192 aa16.07■□□□□ 0.16
PTPRVP-202ENST00000490575 CCDC89Q8N998 374 aa16.07■□□□□ 0.16
PTPRVP-202ENST00000490575 ZNF398Q8TD17 642 aa16.07■□□□□ 0.16
PTPRVP-202ENST00000490575 DTX3LQ8TDB6 740 aa16.07■□□□□ 0.16
PTPRVP-202ENST00000490575 SCHIP1Q9P0W5 487 aaPredicted RBP16.07■□□□□ 0.16
PTPRVP-202ENST00000490575 PAK5Q9P286 719 aa16.07■□□□□ 0.16
PTPRVP-202ENST00000490575 SLC2A6Q9UGQ3 507 aa16.07■□□□□ 0.16
PTPRVP-202ENST00000490575 PKP3Q9Y446 797 aa16.07■□□□□ 0.16
PTPRVP-202ENST00000490575 KNTC1P50748 2209 aa16.06■□□□□ 0.16
PTPRVP-202ENST00000490575 PRAMEF33A0A0G2JMD5 474 aa16.06■□□□□ 0.16
PTPRVP-202ENST00000490575 TRABD2BA6NFA1 517 aa16.06■□□□□ 0.16
PTPRVP-202ENST00000490575 MROH6A6NGR9 719 aa16.06■□□□□ 0.16
PTPRVP-202ENST00000490575 C2orf81A6NN90 581 aa16.06■□□□□ 0.16
PTPRVP-202ENST00000490575 AGAP14A8MT82 685 aa16.06■□□□□ 0.16
PTPRVP-202ENST00000490575 TAF4O00268 1085 aa16.06■□□□□ 0.16
PTPRVP-202ENST00000490575 B4GAT1O43505 415 aa16.06■□□□□ 0.16
PTPRVP-202ENST00000490575 ZNF189O75820 626 aaPredicted RBP16.06■□□□□ 0.16
PTPRVP-202ENST00000490575 SRP72O76094 671 aaKnown RBP16.06■□□□□ 0.16
PTPRVP-202ENST00000490575 MT-CO3P00414 261 aa16.06■□□□□ 0.16
PTPRVP-202ENST00000490575 APRTP07741 180 aa16.06■□□□□ 0.16
PTPRVP-202ENST00000490575 COILP38432 576 aaPredicted RBP16.06■□□□□ 0.16
PTPRVP-202ENST00000490575 VPS41P49754 854 aa16.06■□□□□ 0.16
PTPRVP-202ENST00000490575 DUSP3P51452 185 aaPredicted RBP16.06■□□□□ 0.16
PTPRVP-202ENST00000490575 CCDC173Q0VFZ6 552 aa16.06■□□□□ 0.16
PTPRVP-202ENST00000490575 SEPT6Q14141 434 aa16.06■□□□□ 0.16
PTPRVP-202ENST00000490575 ANKRD22Q5VYY1 191 aa16.06■□□□□ 0.16
PTPRVP-202ENST00000490575 ZNF761Q86XN6 746 aaPredicted RBP16.06■□□□□ 0.16
PTPRVP-202ENST00000490575 BEND7Q8N7W2 519 aaPredicted RBP16.06■□□□□ 0.16
PTPRVP-202ENST00000490575 DCBLD1Q8N8Z6 715 aa16.06■□□□□ 0.16
PTPRVP-202ENST00000490575 Q8N9G6 341 aaPredicted RBP16.06■□□□□ 0.16
PTPRVP-202ENST00000490575 DDHD1Q8NEL9 900 aa16.06■□□□□ 0.16
PTPRVP-202ENST00000490575 MDM1Q8TC05 714 aa16.06■□□□□ 0.16
PTPRVP-202ENST00000490575 MAPK15Q8TD08 544 aa16.06■□□□□ 0.16
PTPRVP-202ENST00000490575 ACTRT1Q8TDG2 376 aa16.06■□□□□ 0.16
PTPRVP-202ENST00000490575 MAIP1Q8WWC4 291 aa16.06■□□□□ 0.16
PTPRVP-202ENST00000490575 SCG3Q8WXD2 468 aaKnown RBP16.06■□□□□ 0.16
PTPRVP-202ENST00000490575 MAGOHBQ96A72 148 aaKnown RBP16.06■□□□□ 0.16
PTPRVP-202ENST00000490575 ASB8Q9H765 288 aa16.06■□□□□ 0.16
PTPRVP-202ENST00000490575 PRDM8Q9NQV8 689 aa16.06■□□□□ 0.16
PTPRVP-202ENST00000490575 MAP1BP46821 2468 aaKnown RBP16.06■□□□□ 0.16
PTPRVP-202ENST00000490575 ZFHX4Q86UP3 3567 aa16.05■□□□□ 0.16
PTPRVP-202ENST00000490575 UNC13CQ8NB66 2214 aa16.05■□□□□ 0.16
PTPRVP-202ENST00000490575 NTN3O00634 580 aaPredicted RBP16.05■□□□□ 0.16
PTPRVP-202ENST00000490575 PSMD3O43242 534 aa16.05■□□□□ 0.16
PTPRVP-202ENST00000490575 CDK14O94921 469 aa16.05■□□□□ 0.16
PTPRVP-202ENST00000490575 CRTAMO95727 393 aa16.05■□□□□ 0.16
PTPRVP-202ENST00000490575 JUPP14923 745 aa16.05■□□□□ 0.16
PTPRVP-202ENST00000490575 PSMA3P25788 255 aa16.05■□□□□ 0.16
PTPRVP-202ENST00000490575 MC4RP32245 332 aa16.05■□□□□ 0.16
PTPRVP-202ENST00000490575 GNG11P61952 73 aa16.05■□□□□ 0.16
PTPRVP-202ENST00000490575 CRADDP78560 199 aa16.05■□□□□ 0.16
PTPRVP-202ENST00000490575 E2F1Q01094 437 aa16.05■□□□□ 0.16
PTPRVP-202ENST00000490575 FAM83HQ6ZRV2 1179 aaPredicted RBP16.05■□□□□ 0.16
PTPRVP-202ENST00000490575 DET1Q7L5Y6 550 aa16.05■□□□□ 0.16
PTPRVP-202ENST00000490575 GSTA5Q7RTV2 222 aa16.05■□□□□ 0.16
PTPRVP-202ENST00000490575 B3GNT8Q7Z7M8 397 aa16.05■□□□□ 0.16
PTPRVP-202ENST00000490575 CREG2Q8IUH2 290 aa16.05■□□□□ 0.16
PTPRVP-202ENST00000490575 PIANPQ8IYJ0 282 aa16.05■□□□□ 0.16
PTPRVP-202ENST00000490575 OR13J1Q8NGT2 312 aa16.05■□□□□ 0.16
PTPRVP-202ENST00000490575 SLC37A2Q8TED4 501 aa16.05■□□□□ 0.16
PTPRVP-202ENST00000490575 CDKN2AIPNLQ96HQ2 116 aa16.05■□□□□ 0.16
PTPRVP-202ENST00000490575 PPP1R2P1Q96PQ5 205 aa16.05■□□□□ 0.16
PTPRVP-202ENST00000490575 RMI1Q9H9A7 625 aa16.05■□□□□ 0.16
PTPRVP-202ENST00000490575 KLC4Q9NSK0 619 aa16.05■□□□□ 0.16
PTPRVP-202ENST00000490575 NLE1Q9NVX2 485 aaPredicted RBP16.05■□□□□ 0.16
PTPRVP-202ENST00000490575 SMOXQ9NWM0 555 aa16.05■□□□□ 0.16
PTPRVP-202ENST00000490575 LRIT1Q9P2V4 623 aa16.05■□□□□ 0.16
PTPRVP-202ENST00000490575 ATXN7L1Q9ULK2 861 aaPredicted RBP16.05■□□□□ 0.16
PTPRVP-202ENST00000490575 CLCA2Q9UQC9 943 aa16.05■□□□□ 0.16
PTPRVP-202ENST00000490575 ACACBO00763 2458 aa16.04■□□□□ 0.16
PTPRVP-202ENST00000490575 DMXL2Q8TDJ6 3036 aa16.04■□□□□ 0.16
PTPRVP-202ENST00000490575 TPRP12270 2363 aaKnown RBP16.04■□□□□ 0.16
PTPRVP-202ENST00000490575 OR2AG2A6NM03 316 aa16.04■□□□□ 0.16
PTPRVP-202ENST00000490575 PGRMC1O00264 195 aaKnown RBP16.04■□□□□ 0.16
PTPRVP-202ENST00000490575 SNX2O60749 519 aa16.04■□□□□ 0.16
PTPRVP-202ENST00000490575 PPFIA2O75334 1257 aa16.04■□□□□ 0.16
PTPRVP-202ENST00000490575 KRT14P02533 472 aa16.04■□□□□ 0.16
PTPRVP-202ENST00000490575 BRAFP15056 766 aa16.04■□□□□ 0.16
PTPRVP-202ENST00000490575 GLB1P16278 677 aa16.04■□□□□ 0.16
PTPRVP-202ENST00000490575 ZNF7P17097 686 aaPredicted RBP16.04■□□□□ 0.16
PTPRVP-202ENST00000490575 RPIAP49247 311 aa16.04■□□□□ 0.16
PTPRVP-202ENST00000490575 OR1D5P58170 312 aa16.04■□□□□ 0.16
PTPRVP-202ENST00000490575 BASP1P80723 227 aaKnown RBP16.04■□□□□ 0.16
PTPRVP-202ENST00000490575 CDH17Q12864 832 aa16.04■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 23.2 ms