RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000489977.5

SKAP2-206, Transcript of src kinase associated phosphoprotein 2, humanhuman

TSL 5

Gene SKAP2, Length 679 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SKAP2-206ENST00000489977 MSH3P20585 1137 aa3.36□□□□□ -1.87
SKAP2-206ENST00000489977 CDAP32320 146 aa3.36□□□□□ -1.87
SKAP2-206ENST00000489977 UBA7P41226 1012 aa3.36□□□□□ -1.87
SKAP2-206ENST00000489977 FGFBP1Q14512 234 aa3.36□□□□□ -1.87
SKAP2-206ENST00000489977 ZNF239Q16600 458 aaKnown RBP3.36□□□□□ -1.87
SKAP2-206ENST00000489977 KIAA1644Q3SXP7 199 aa3.36□□□□□ -1.87
SKAP2-206ENST00000489977 C6orf141Q5SZD1 244 aa3.36□□□□□ -1.87
SKAP2-206ENST00000489977 DPPA4Q7L190 304 aa3.36□□□□□ -1.87
SKAP2-206ENST00000489977 DDHD1Q8NEL9 900 aa3.36□□□□□ -1.87
SKAP2-206ENST00000489977 ZCCHC10Q8TBK6 192 aa3.36□□□□□ -1.87
SKAP2-206ENST00000489977 IGSF8Q969P0 613 aa3.36□□□□□ -1.87
SKAP2-206ENST00000489977 VGLL1Q99990 258 aa3.36□□□□□ -1.87
SKAP2-206ENST00000489977 ZBTB20Q9HC78 741 aaPredicted RBP3.36□□□□□ -1.87
SKAP2-206ENST00000489977 SLC7A10Q9NS82 523 aa3.36□□□□□ -1.87
SKAP2-206ENST00000489977 LUZP4Q9P127 313 aa3.36□□□□□ -1.87
SKAP2-206ENST00000489977 GTF2A1LQ9UNN4 478 aa3.36□□□□□ -1.87
SKAP2-206ENST00000489977 GPR52Q9Y2T5 361 aa3.36□□□□□ -1.87
SKAP2-206ENST00000489977 A6NL46 340 aa3.35□□□□□ -1.87
SKAP2-206ENST00000489977 SLC22A2O15244 555 aa3.35□□□□□ -1.87
SKAP2-206ENST00000489977 PIP5K1CO60331 668 aa3.35□□□□□ -1.87
SKAP2-206ENST00000489977 PDE9AO76083 593 aa3.35□□□□□ -1.87
SKAP2-206ENST00000489977 NR3C1P04150 777 aa3.35□□□□□ -1.87
SKAP2-206ENST00000489977 HOXA13P31271 388 aaPredicted RBP3.35□□□□□ -1.87
SKAP2-206ENST00000489977 ARL1P40616 181 aaPredicted RBP3.35□□□□□ -1.87
SKAP2-206ENST00000489977 MRPS5P82675 430 aaKnown RBP3.35□□□□□ -1.87
SKAP2-206ENST00000489977 MBTD1Q05BQ5 628 aa3.35□□□□□ -1.87
SKAP2-206ENST00000489977 ACVR2BQ13705 512 aa3.35□□□□□ -1.87
SKAP2-206ENST00000489977 TUBB2AQ13885 445 aa3.35□□□□□ -1.87
SKAP2-206ENST00000489977 LCE3AQ5TA76 89 aa3.35□□□□□ -1.87
SKAP2-206ENST00000489977 MFSD6Q6ZSS7 791 aa3.35□□□□□ -1.87
SKAP2-206ENST00000489977 Q75L30 129 aa3.35□□□□□ -1.87
SKAP2-206ENST00000489977 CACNA2D4Q7Z3S7 1137 aa3.35□□□□□ -1.87
SKAP2-206ENST00000489977 CCDC13Q8IYE1 715 aa3.35□□□□□ -1.87
SKAP2-206ENST00000489977 FAM222BQ8WU58 562 aa3.35□□□□□ -1.87
SKAP2-206ENST00000489977 MOCOSQ96EN8 888 aa3.35□□□□□ -1.87
SKAP2-206ENST00000489977 ABHD8Q96I13 439 aa3.35□□□□□ -1.87
SKAP2-206ENST00000489977 TMEM47Q9BQJ4 181 aa3.35□□□□□ -1.87
SKAP2-206ENST00000489977 PCGF1Q9BSM1 259 aa3.35□□□□□ -1.87
SKAP2-206ENST00000489977 TUBB2BQ9BVA1 445 aa3.35□□□□□ -1.87
SKAP2-206ENST00000489977 BARHL2Q9NY43 387 aa3.35□□□□□ -1.87
SKAP2-206ENST00000489977 PDP2Q9P2J9 529 aa3.35□□□□□ -1.87
SKAP2-206ENST00000489977 LRRFIP2Q9Y608 721 aaKnown RBP3.35□□□□□ -1.87
SKAP2-206ENST00000489977 PRAG1Q86YV5 1406 aa3.35□□□□□ -1.87
SKAP2-206ENST00000489977 A0A0G2JNG1 304 aa3.34□□□□□ -1.87
SKAP2-206ENST00000489977 SNAP23O00161 211 aa3.34□□□□□ -1.87
SKAP2-206ENST00000489977 CREB3O43889 395 aa3.34□□□□□ -1.87
SKAP2-206ENST00000489977 IGHV4-38-2P0DP08 117 aa3.34□□□□□ -1.87
SKAP2-206ENST00000489977 ELF1P32519 619 aa3.34□□□□□ -1.87
SKAP2-206ENST00000489977 FOXD4Q12950 439 aaPredicted RBP3.34□□□□□ -1.87
SKAP2-206ENST00000489977 DRAP1Q14919 205 aaPredicted RBP3.34□□□□□ -1.87
SKAP2-206ENST00000489977 KIR2DS5Q14953 304 aa3.34□□□□□ -1.87
SKAP2-206ENST00000489977 TAF12Q16514 161 aa3.34□□□□□ -1.87
SKAP2-206ENST00000489977 MYLK3Q32MK0 819 aa3.34□□□□□ -1.87
SKAP2-206ENST00000489977 TCTE1Q5JU00 501 aa3.34□□□□□ -1.87
SKAP2-206ENST00000489977 FAAP20Q6NZ36 180 aa3.34□□□□□ -1.87
SKAP2-206ENST00000489977 PSD2Q9BQI7 771 aa3.34□□□□□ -1.87
SKAP2-206ENST00000489977 CABLES2Q9BTV7 478 aa3.34□□□□□ -1.87
SKAP2-206ENST00000489977 USP44Q9H0E7 712 aa3.34□□□□□ -1.87
SKAP2-206ENST00000489977 BRF2Q9HAW0 419 aa3.34□□□□□ -1.87
SKAP2-206ENST00000489977 TRPC7Q9HCX4 862 aa3.34□□□□□ -1.87
SKAP2-206ENST00000489977 SLC6A13Q9NSD5 602 aa3.34□□□□□ -1.87
SKAP2-206ENST00000489977 TMEM98Q9Y2Y6 226 aa3.34□□□□□ -1.87
SKAP2-206ENST00000489977 AAR2Q9Y312 384 aaKnown RBP3.34□□□□□ -1.87
SKAP2-206ENST00000489977 IGKV6D-41A0A0C4DH26 115 aa3.33□□□□□ -1.88
SKAP2-206ENST00000489977 M0QZ24 198 aa3.33□□□□□ -1.88
SKAP2-206ENST00000489977 TNPO2O14787 897 aaKnown RBP3.33□□□□□ -1.88
SKAP2-206ENST00000489977 HS3ST1O14792 307 aa3.33□□□□□ -1.88
SKAP2-206ENST00000489977 NPHP1O15259 732 aa3.33□□□□□ -1.88
SKAP2-206ENST00000489977 ZFAND5O76080 213 aa3.33□□□□□ -1.88
SKAP2-206ENST00000489977 HOXC9P31274 260 aa3.33□□□□□ -1.88
SKAP2-206ENST00000489977 GGT5P36269 586 aa3.33□□□□□ -1.88
SKAP2-206ENST00000489977 MLLT10P55197 1068 aa3.33□□□□□ -1.88
SKAP2-206ENST00000489977 CAMK1Q14012 370 aa3.33□□□□□ -1.88
SKAP2-206ENST00000489977 FFAR4Q5NUL3 377 aa3.33□□□□□ -1.88
SKAP2-206ENST00000489977 LCN10Q6JVE6 187 aa3.33□□□□□ -1.88
SKAP2-206ENST00000489977 PAPD4Q6PIY7 484 aaKnown RBP3.33□□□□□ -1.88
SKAP2-206ENST00000489977 TSPYL6Q8N831 410 aa3.33□□□□□ -1.88
SKAP2-206ENST00000489977 ANKRD52Q8NB46 1076 aa3.33□□□□□ -1.88
SKAP2-206ENST00000489977 IL17REQ8NFR9 667 aa3.33□□□□□ -1.88
SKAP2-206ENST00000489977 UBXN10Q96LJ8 280 aa3.33□□□□□ -1.88
SKAP2-206ENST00000489977 RBM4BQ9BQ04 359 aaKnown RBP3.33□□□□□ -1.88
SKAP2-206ENST00000489977 GPR63Q9BZJ6 419 aa3.33□□□□□ -1.88
SKAP2-206ENST00000489977 RAD21L1Q9H4I0 556 aa3.33□□□□□ -1.88
SKAP2-206ENST00000489977 INTS10Q9NVR2 710 aaKnown RBP3.33□□□□□ -1.88
SKAP2-206ENST00000489977 PPP1R14DQ9NXH3 145 aa3.33□□□□□ -1.88
SKAP2-206ENST00000489977 MPP6Q9NZW5 540 aa3.33□□□□□ -1.88
SKAP2-206ENST00000489977 ASIC3Q9UHC3 531 aa3.33□□□□□ -1.88
SKAP2-206ENST00000489977 FLT1P17948 1338 aa3.33□□□□□ -1.88
SKAP2-206ENST00000489977 FAM237AA0A1B0GTK4 181 aa3.32□□□□□ -1.88
SKAP2-206ENST00000489977 A0A1B0GVC2 190 aa3.32□□□□□ -1.88
SKAP2-206ENST00000489977 MEIOCA2RUB1 952 aa3.32□□□□□ -1.88
SKAP2-206ENST00000489977 TMEM178BH3BS89 294 aa3.32□□□□□ -1.88
SKAP2-206ENST00000489977 HOXC11O43248 304 aaPredicted RBP3.32□□□□□ -1.88
SKAP2-206ENST00000489977 DCXO43602 365 aa3.32□□□□□ -1.88
SKAP2-206ENST00000489977 SYNCRIPO60506 623 aaKnown RBP3.32□□□□□ -1.88
SKAP2-206ENST00000489977 NADKO95544 446 aaPredicted RBP3.32□□□□□ -1.88
SKAP2-206ENST00000489977 TFAP2AP05549 437 aa3.32□□□□□ -1.88
SKAP2-206ENST00000489977 XBP1P17861 261 aa3.32□□□□□ -1.88
SKAP2-206ENST00000489977 MCCP23508 829 aa3.32□□□□□ -1.88
SKAP2-206ENST00000489977 MAD2L1Q13257 205 aaPredicted RBP3.32□□□□□ -1.88
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 41.3 ms