RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000468371.5

SHQ1-205, Transcript of SHQ1, H/ACA ribonucleoprotein assembly factor, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene SHQ1, Length 4,024 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SHQ1-205ENST00000468371 LGALS13Q9UHV8 139 aa5.96□□□□□ -1.45
SHQ1-205ENST00000468371 VPS51Q9UID3 782 aa5.96□□□□□ -1.45
SHQ1-205ENST00000468371 SLC39A10Q9ULF5 831 aa5.96□□□□□ -1.45
SHQ1-205ENST00000468371 DMTF1Q9Y222 760 aa5.96□□□□□ -1.45
SHQ1-205ENST00000468371 SIP14410 1827 aa5.96□□□□□ -1.46
SHQ1-205ENST00000468371 GOLGA8TH3BQL2 631 aa5.96□□□□□ -1.46
SHQ1-205ENST00000468371 PRPF4O43172 522 aaKnown RBP eCLIP5.96□□□□□ -1.46
SHQ1-205ENST00000468371 MTSS1O43312 755 aa5.96□□□□□ -1.46
SHQ1-205ENST00000468371 SNX2O60749 519 aa5.96□□□□□ -1.46
SHQ1-205ENST00000468371 JCHAINP01591 159 aa5.96□□□□□ -1.46
SHQ1-205ENST00000468371 CHRM1P11229 460 aaPredicted RBP5.96□□□□□ -1.46
SHQ1-205ENST00000468371 PEX2P28328 305 aa5.96□□□□□ -1.46
SHQ1-205ENST00000468371 RBL1P28749 1068 aa5.96□□□□□ -1.46
SHQ1-205ENST00000468371 MIPP30301 263 aa5.96□□□□□ -1.46
SHQ1-205ENST00000468371 STIP1P31948 543 aaKnown RBP5.96□□□□□ -1.46
SHQ1-205ENST00000468371 PTPN9P43378 593 aa5.96□□□□□ -1.46
SHQ1-205ENST00000468371 CXCR3P49682 368 aa5.96□□□□□ -1.46
SHQ1-205ENST00000468371 FOLH1Q04609 750 aa5.96□□□□□ -1.46
SHQ1-205ENST00000468371 PDK2Q15119 407 aa5.96□□□□□ -1.46
SHQ1-205ENST00000468371 RAB41Q5JT25 222 aa5.96□□□□□ -1.46
SHQ1-205ENST00000468371 VWA5B1Q5TIE3 1220 aa5.96□□□□□ -1.46
SHQ1-205ENST00000468371 CYP2R1Q6VVX0 501 aa5.96□□□□□ -1.46
SHQ1-205ENST00000468371 NET1Q7Z628 596 aaPredicted RBP5.96□□□□□ -1.46
SHQ1-205ENST00000468371 PHF13Q86YI8 300 aaPredicted RBP5.96□□□□□ -1.46
SHQ1-205ENST00000468371 CDKL3Q8IVW4 592 aaPredicted RBP5.96□□□□□ -1.46
SHQ1-205ENST00000468371 APCDD1Q8J025 514 aa5.96□□□□□ -1.46
SHQ1-205ENST00000468371 ZNF276Q8N554 614 aa5.96□□□□□ -1.46
SHQ1-205ENST00000468371 EID2Q8N6I1 236 aa5.96□□□□□ -1.46
SHQ1-205ENST00000468371 CATSPER2Q96P56 530 aa5.96□□□□□ -1.46
SHQ1-205ENST00000468371 PKMYT1Q99640 499 aa5.96□□□□□ -1.46
SHQ1-205ENST00000468371 C11orf16Q9NQ32 467 aa5.96□□□□□ -1.46
SHQ1-205ENST00000468371 PRSS16Q9NQE7 514 aa5.96□□□□□ -1.46
SHQ1-205ENST00000468371 ETNK2Q9NVF9 386 aa5.96□□□□□ -1.46
SHQ1-205ENST00000468371 KCNK4Q9NYG8 393 aa5.96□□□□□ -1.46
SHQ1-205ENST00000468371 BFARQ9NZS9 450 aa5.96□□□□□ -1.46
SHQ1-205ENST00000468371 PKP3Q9Y446 797 aa5.96□□□□□ -1.46
SHQ1-205ENST00000468371 RPS6KL1Q9Y6S9 549 aa5.96□□□□□ -1.46
SHQ1-205ENST00000468371 NCOR2Q9Y618 2525 aa5.96□□□□□ -1.46
SHQ1-205ENST00000468371 SDC3O75056 442 aa5.96□□□□□ -1.46
SHQ1-205ENST00000468371 SPAG6O75602 509 aa5.96□□□□□ -1.46
SHQ1-205ENST00000468371 TMCC1O94876 653 aa5.96□□□□□ -1.46
SHQ1-205ENST00000468371 TRIM16O95361 564 aa5.96□□□□□ -1.46
SHQ1-205ENST00000468371 AMD1P17707 334 aa5.96□□□□□ -1.46
SHQ1-205ENST00000468371 ERCC2P18074 760 aa5.96□□□□□ -1.46
SHQ1-205ENST00000468371 HTR7P34969 479 aa5.96□□□□□ -1.46
SHQ1-205ENST00000468371 CHN2P52757 468 aa5.96□□□□□ -1.46
SHQ1-205ENST00000468371 SEMG2Q02383 582 aa5.96□□□□□ -1.46
SHQ1-205ENST00000468371 TSTA3Q13630 321 aaPredicted RBP5.96□□□□□ -1.46
SHQ1-205ENST00000468371 ATP1A4Q13733 1029 aa5.96□□□□□ -1.46
SHQ1-205ENST00000468371 PKN3Q6P5Z2 889 aa5.96□□□□□ -1.46
SHQ1-205ENST00000468371 ENPP7Q6UWV6 458 aa5.96□□□□□ -1.46
SHQ1-205ENST00000468371 SNX32Q86XE0 403 aa5.96□□□□□ -1.46
SHQ1-205ENST00000468371 LRRC49Q8IUZ0 686 aa5.96□□□□□ -1.46
SHQ1-205ENST00000468371 SCML4Q8N228 414 aa5.96□□□□□ -1.46
SHQ1-205ENST00000468371 FAM46DQ8NEK8 389 aa5.96□□□□□ -1.46
SHQ1-205ENST00000468371 LPCAT1Q8NF37 534 aa5.96□□□□□ -1.46
SHQ1-205ENST00000468371 JOSD2Q8TAC2 188 aa5.96□□□□□ -1.46
SHQ1-205ENST00000468371 TMEM174Q8WUU8 243 aa5.96□□□□□ -1.46
SHQ1-205ENST00000468371 LRIG1Q96JA1 1093 aa5.96□□□□□ -1.46
SHQ1-205ENST00000468371 STRADBQ9C0K7 418 aa5.96□□□□□ -1.46
SHQ1-205ENST00000468371 POLR1EQ9GZS1 481 aaKnown RBP5.96□□□□□ -1.46
SHQ1-205ENST00000468371 CCDC68Q9H2F9 335 aa5.96□□□□□ -1.46
SHQ1-205ENST00000468371 FAM96AQ9H5X1 160 aa5.96□□□□□ -1.46
SHQ1-205ENST00000468371 TMEM30AQ9NV96 361 aa5.96□□□□□ -1.46
SHQ1-205ENST00000468371 PPM1HQ9ULR3 514 aa5.96□□□□□ -1.46
SHQ1-205ENST00000468371 MKI67P46013 3256 aaKnown RBP5.96□□□□□ -1.46
SHQ1-205ENST00000468371 OTOL1A6NHN0 477 aaPredicted RBP5.96□□□□□ -1.46
SHQ1-205ENST00000468371 GNGT2O14610 69 aa5.96□□□□□ -1.46
SHQ1-205ENST00000468371 TSPAN6O43657 245 aa5.96□□□□□ -1.46
SHQ1-205ENST00000468371 PMPCBO75439 489 aa5.96□□□□□ -1.46
SHQ1-205ENST00000468371 LEFTY1O75610 366 aa5.96□□□□□ -1.46
SHQ1-205ENST00000468371 OLFM2O95897 454 aa5.96□□□□□ -1.46
SHQ1-205ENST00000468371 PENKP01210 267 aaPredicted RBP5.96□□□□□ -1.46
SHQ1-205ENST00000468371 FAM58BPP0C7Q3 252 aa5.96□□□□□ -1.46
SHQ1-205ENST00000468371 JMJD7P0C870 316 aa5.96□□□□□ -1.46
SHQ1-205ENST00000468371 BCKDHBP21953 392 aa5.96□□□□□ -1.46
SHQ1-205ENST00000468371 HNRNPA2B1P22626 353 aaKnown RBP5.96□□□□□ -1.46
SHQ1-205ENST00000468371 MAP4P27816 1152 aaKnown RBP5.96□□□□□ -1.46
SHQ1-205ENST00000468371 P2RY2P41231 377 aa5.96□□□□□ -1.46
SHQ1-205ENST00000468371 SERPINB9P50453 376 aa5.96□□□□□ -1.46
SHQ1-205ENST00000468371 AQP4P55087 323 aa5.96□□□□□ -1.46
SHQ1-205ENST00000468371 USP10Q14694 798 aaKnown RBP5.96□□□□□ -1.46
SHQ1-205ENST00000468371 TRIP6Q15654 476 aaKnown RBP5.96□□□□□ -1.46
SHQ1-205ENST00000468371 CYP1B1Q16678 543 aa5.96□□□□□ -1.46
SHQ1-205ENST00000468371 ATXN7L2Q5T6C5 722 aaPredicted RBP5.96□□□□□ -1.46
SHQ1-205ENST00000468371 PMS2CLQ68D20 193 aa5.96□□□□□ -1.46
SHQ1-205ENST00000468371 ZNF783Q6ZMS7 281 aa5.96□□□□□ -1.46
SHQ1-205ENST00000468371 DPY19L3Q6ZPD9 716 aa5.96□□□□□ -1.46
SHQ1-205ENST00000468371 USP30Q70CQ3 517 aa5.96□□□□□ -1.46
SHQ1-205ENST00000468371 HORMAD1Q86X24 394 aa5.96□□□□□ -1.46
SHQ1-205ENST00000468371 PTPRN2Q92932 1015 aa5.96□□□□□ -1.46
SHQ1-205ENST00000468371 UTP4Q969X6 686 aaKnown RBP5.96□□□□□ -1.46
SHQ1-205ENST00000468371 SLC7A6OSQ96CW6 309 aaPredicted RBP5.96□□□□□ -1.46
SHQ1-205ENST00000468371 NPY6RQ99463 290 aa5.96□□□□□ -1.46
SHQ1-205ENST00000468371 TMEM79Q9BSE2 394 aa5.96□□□□□ -1.46
SHQ1-205ENST00000468371 HERPUD2Q9BSE4 406 aa5.96□□□□□ -1.46
SHQ1-205ENST00000468371 TXLNGYQ9BZA5 131 aa5.96□□□□□ -1.46
SHQ1-205ENST00000468371 DRC3Q9H069 523 aa5.96□□□□□ -1.46
SHQ1-205ENST00000468371 PAIP1Q9H074 479 aaKnown RBP5.96□□□□□ -1.46
SHQ1-205ENST00000468371 PNPOQ9NVS9 261 aa5.96□□□□□ -1.46
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 23.1 ms