RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000459627.1

SH3BP5-208, Transcript of SH3 domain binding protein 5, humanhuman

TSL 3

Gene SH3BP5, Length 473 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SH3BP5-208ENST00000459627 C1orf54Q8WWF1 131 aa23.62■■□□□ 1.37
SH3BP5-208ENST00000459627 PRR11Q96HE9 360 aaPredicted RBP23.62■■□□□ 1.37
SH3BP5-208ENST00000459627 PLEKHG4BQ96PX9 1271 aa23.62■■□□□ 1.37
SH3BP5-208ENST00000459627 TBL1YQ9BQ87 522 aa23.62■■□□□ 1.37
SH3BP5-208ENST00000459627 KLC4Q9NSK0 619 aa23.62■■□□□ 1.37
SH3BP5-208ENST00000459627 HACD3Q9P035 362 aa23.62■■□□□ 1.37
SH3BP5-208ENST00000459627 CHD6Q8TD26 2715 aa23.62■■□□□ 1.37
SH3BP5-208ENST00000459627 GAPDHSO14556 408 aaPredicted RBP23.61■■□□□ 1.37
SH3BP5-208ENST00000459627 CCDC175P0C221 793 aa23.61■■□□□ 1.37
SH3BP5-208ENST00000459627 LSSP48449 732 aa23.61■■□□□ 1.37
SH3BP5-208ENST00000459627 INHBCP55103 352 aa23.61■■□□□ 1.37
SH3BP5-208ENST00000459627 CCDC173Q0VFZ6 552 aa23.61■■□□□ 1.37
SH3BP5-208ENST00000459627 TBC1D25Q3MII6 688 aa23.61■■□□□ 1.37
SH3BP5-208ENST00000459627 DENND5AQ6IQ26 1287 aa23.61■■□□□ 1.37
SH3BP5-208ENST00000459627 NUDT22Q9BRQ3 303 aa23.61■■□□□ 1.37
SH3BP5-208ENST00000459627 OSGEPL1Q9H4B0 414 aa23.61■■□□□ 1.37
SH3BP5-208ENST00000459627 PRDM8Q9NQV8 689 aa23.61■■□□□ 1.37
SH3BP5-208ENST00000459627 PIH1D1Q9NWS0 290 aaKnown RBP23.61■■□□□ 1.37
SH3BP5-208ENST00000459627 DNAJC16Q9Y2G8 782 aa23.61■■□□□ 1.37
SH3BP5-208ENST00000459627 AAR2Q9Y312 384 aaKnown RBP23.61■■□□□ 1.37
SH3BP5-208ENST00000459627 STX7O15400 261 aaKnown RBP23.6■■□□□ 1.37
SH3BP5-208ENST00000459627 PNLIPP16233 465 aa23.6■■□□□ 1.37
SH3BP5-208ENST00000459627 EIF2S3P41091 472 aaKnown RBP23.6■■□□□ 1.37
SH3BP5-208ENST00000459627 TMPRSS15P98073 1019 aa23.6■■□□□ 1.37
SH3BP5-208ENST00000459627 SNX1Q13596 522 aa23.6■■□□□ 1.37
SH3BP5-208ENST00000459627 LRP8Q14114 963 aa23.6■■□□□ 1.37
SH3BP5-208ENST00000459627 RPS6KA1Q15418 735 aa23.6■■□□□ 1.37
SH3BP5-208ENST00000459627 PDPK2PQ6A1A2 396 aa23.6■■□□□ 1.37
SH3BP5-208ENST00000459627 ZNF438Q7Z4V0 828 aa23.6■■□□□ 1.37
SH3BP5-208ENST00000459627 SLC13A5Q86YT5 568 aaPredicted RBP23.6■■□□□ 1.37
SH3BP5-208ENST00000459627 OR4K2Q8NGD2 314 aa23.6■■□□□ 1.37
SH3BP5-208ENST00000459627 OR13C4Q8NGS5 318 aa23.6■■□□□ 1.37
SH3BP5-208ENST00000459627 SEMA6CQ9H3T2 930 aa23.6■■□□□ 1.37
SH3BP5-208ENST00000459627 RMI1Q9H9A7 625 aa23.6■■□□□ 1.37
SH3BP5-208ENST00000459627 FKBPLQ9UIM3 349 aa23.6■■□□□ 1.37
SH3BP5-208ENST00000459627 PKP3Q9Y446 797 aa23.6■■□□□ 1.37
SH3BP5-208ENST00000459627 ADAMTS20P59510 1910 aa23.59■■□□□ 1.37
SH3BP5-208ENST00000459627 GLYATL1P3A0A0U1RQE8 302 aa23.59■■□□□ 1.37
SH3BP5-208ENST00000459627 CCL22O00626 93 aa23.59■■□□□ 1.37
SH3BP5-208ENST00000459627 CDK14O94921 469 aa23.59■■□□□ 1.37
SH3BP5-208ENST00000459627 TPH1P17752 444 aa23.59■■□□□ 1.37
SH3BP5-208ENST00000459627 MSLNQ13421 630 aaPredicted RBP23.59■■□□□ 1.37
SH3BP5-208ENST00000459627 NFATC2Q13469 925 aa23.59■■□□□ 1.37
SH3BP5-208ENST00000459627 KCTD19Q17RG1 926 aaPredicted RBP23.59■■□□□ 1.37
SH3BP5-208ENST00000459627 INSCQ1MX18 579 aa23.59■■□□□ 1.37
SH3BP5-208ENST00000459627 MAP9Q49MG5 647 aa23.59■■□□□ 1.37
SH3BP5-208ENST00000459627 ZNF547Q8IVP9 402 aa23.59■■□□□ 1.37
SH3BP5-208ENST00000459627 FGF11Q92914 225 aa23.59■■□□□ 1.37
SH3BP5-208ENST00000459627 VPS35Q96QK1 796 aa23.59■■□□□ 1.37
SH3BP5-208ENST00000459627 ASCL3Q9NQ33 180 aa23.59■■□□□ 1.37
SH3BP5-208ENST00000459627 SCHIP1Q9P0W5 487 aaPredicted RBP23.59■■□□□ 1.37
SH3BP5-208ENST00000459627 ITPR1Q14643 2758 aa23.58■■□□□ 1.37
SH3BP5-208ENST00000459627 CCDC187A0A096LP49 1063 aa23.58■■□□□ 1.37
SH3BP5-208ENST00000459627 CHUKO15111 745 aa23.58■■□□□ 1.37
SH3BP5-208ENST00000459627 ETS1P14921 441 aa23.58■■□□□ 1.37
SH3BP5-208ENST00000459627 ZNF7P17097 686 aaPredicted RBP23.58■■□□□ 1.37
SH3BP5-208ENST00000459627 MPSTP25325 297 aa23.58■■□□□ 1.37
SH3BP5-208ENST00000459627 CD1CP29017 333 aa23.58■■□□□ 1.37
SH3BP5-208ENST00000459627 ACTN2P35609 894 aa23.58■■□□□ 1.37
SH3BP5-208ENST00000459627 PPM1FP49593 454 aaPredicted RBP23.58■■□□□ 1.37
SH3BP5-208ENST00000459627 TMEM115Q12893 351 aaPredicted RBP23.58■■□□□ 1.37
SH3BP5-208ENST00000459627 TAF1AQ15573 450 aaPredicted RBP23.58■■□□□ 1.37
SH3BP5-208ENST00000459627 SEPT7Q16181 437 aaKnown RBP23.58■■□□□ 1.37
SH3BP5-208ENST00000459627 PARP6Q2NL67 630 aa23.58■■□□□ 1.37
SH3BP5-208ENST00000459627 PHF19Q5T6S3 580 aa23.58■■□□□ 1.37
SH3BP5-208ENST00000459627 LRRTM4Q86VH4 590 aa23.58■■□□□ 1.37
SH3BP5-208ENST00000459627 SFRP1Q8N474 314 aa23.58■■□□□ 1.37
SH3BP5-208ENST00000459627 WDR36Q8NI36 951 aaKnown RBP23.58■■□□□ 1.37
SH3BP5-208ENST00000459627 GRPEL1Q9HAV7 217 aa23.58■■□□□ 1.37
SH3BP5-208ENST00000459627 LHX6Q9UPM6 363 aa23.58■■□□□ 1.37
SH3BP5-208ENST00000459627 PPP2R2CQ9Y2T4 447 aa23.58■■□□□ 1.37
SH3BP5-208ENST00000459627 NBEAQ8NFP9 2946 aa23.57■■□□□ 1.36
SH3BP5-208ENST00000459627 A6NCN8 305 aa23.57■■□□□ 1.36
SH3BP5-208ENST00000459627 LIASO43766 372 aa23.57■■□□□ 1.36
SH3BP5-208ENST00000459627 TNFSF15O95150 251 aa23.57■■□□□ 1.36
SH3BP5-208ENST00000459627 HOXB3P14651 431 aaPredicted RBP23.57■■□□□ 1.36
SH3BP5-208ENST00000459627 LPOP22079 712 aaPredicted RBP23.57■■□□□ 1.36
SH3BP5-208ENST00000459627 CTSCP53634 463 aa23.57■■□□□ 1.36
SH3BP5-208ENST00000459627 GPRC6AQ5T6X5 926 aa23.57■■□□□ 1.36
SH3BP5-208ENST00000459627 KCTD11Q693B1 232 aa23.57■■□□□ 1.36
SH3BP5-208ENST00000459627 IYDQ6PHW0 289 aa23.57■■□□□ 1.36
SH3BP5-208ENST00000459627 ZNF574Q6ZN55 896 aaPredicted RBP23.57■■□□□ 1.36
SH3BP5-208ENST00000459627 RAB11FIP2Q7L804 512 aa23.57■■□□□ 1.36
SH3BP5-208ENST00000459627 TRAPPC5Q8IUR0 188 aa23.57■■□□□ 1.36
SH3BP5-208ENST00000459627 CCDC97Q96F63 343 aaPredicted RBP23.57■■□□□ 1.36
SH3BP5-208ENST00000459627 FAM96AQ9H5X1 160 aa23.57■■□□□ 1.36
SH3BP5-208ENST00000459627 KCNK4Q9NYG8 393 aa23.57■■□□□ 1.36
SH3BP5-208ENST00000459627 IGF2BP1Q9NZI8 577 aaKnown RBP eCLIP23.57■■□□□ 1.36
SH3BP5-208ENST00000459627 TMEM9Q9P0T7 183 aa23.57■■□□□ 1.36
SH3BP5-208ENST00000459627 IGHV1OR21-1A0A087WYE8 117 aa23.56■■□□□ 1.36
SH3BP5-208ENST00000459627 PRAMEF33A0A0G2JMD5 474 aa23.56■■□□□ 1.36
SH3BP5-208ENST00000459627 C2orf81A6NN90 581 aa23.56■■□□□ 1.36
SH3BP5-208ENST00000459627 KMOO15229 486 aa23.56■■□□□ 1.36
SH3BP5-208ENST00000459627 RBMS1P29558 406 aaKnown RBP23.56■■□□□ 1.36
SH3BP5-208ENST00000459627 CFHR1Q03591 330 aa23.56■■□□□ 1.36
SH3BP5-208ENST00000459627 PEX6Q13608 980 aa23.56■■□□□ 1.36
SH3BP5-208ENST00000459627 NR1D2Q14995 579 aa23.56■■□□□ 1.36
SH3BP5-208ENST00000459627 OASLQ15646 514 aaKnown RBP23.56■■□□□ 1.36
SH3BP5-208ENST00000459627 DET1Q7L5Y6 550 aa23.56■■□□□ 1.36
SH3BP5-208ENST00000459627 SLITRK4Q8IW52 837 aa23.56■■□□□ 1.36
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 23 ms