RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000441222.7

USP46-201, Transcript of ubiquitin specific peptidase 46, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene USP46, Length 7,954 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP46-201ENST00000441222 SNX15Q9NRS6 342 aa6.64□□□□□ -1.35
USP46-201ENST00000441222 PIH1D1Q9NWS0 290 aaKnown RBP6.64□□□□□ -1.35
USP46-201ENST00000441222 PCDHGA10Q9Y5H3 936 aa6.64□□□□□ -1.35
USP46-201ENST00000441222 TARBP1Q13395 1621 aaKnown RBP6.64□□□□□ -1.35
USP46-201ENST00000441222 MOXD2PA6NHM9 499 aa6.64□□□□□ -1.35
USP46-201ENST00000441222 DHX15O43143 795 aaKnown RBP6.64□□□□□ -1.35
USP46-201ENST00000441222 IFNW1P05000 195 aa6.64□□□□□ -1.35
USP46-201ENST00000441222 MC4RP32245 332 aa6.64□□□□□ -1.35
USP46-201ENST00000441222 CTNNB1P35222 781 aa6.64□□□□□ -1.35
USP46-201ENST00000441222 POLR2JP52435 117 aaKnown RBP6.64□□□□□ -1.35
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USP46-201ENST00000441222 CBX3Q13185 183 aa6.64□□□□□ -1.35
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USP46-201ENST00000441222 SEC23AQ15436 765 aa6.64□□□□□ -1.35
USP46-201ENST00000441222 CELF3Q5SZQ8 465 aaKnown RBP6.64□□□□□ -1.35
USP46-201ENST00000441222 FIP1L1Q6UN15 594 aaKnown RBP6.64□□□□□ -1.35
USP46-201ENST00000441222 FAM183BPQ6ZVS7 135 aa6.64□□□□□ -1.35
USP46-201ENST00000441222 C1orf186Q6ZWK4 172 aa6.64□□□□□ -1.35
USP46-201ENST00000441222 RAB11FIP2Q7L804 512 aa6.64□□□□□ -1.35
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USP46-201ENST00000441222 GLB1L3Q8NCI6 653 aaPredicted RBP6.64□□□□□ -1.35
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USP46-201ENST00000441222 TM6SF2Q9BZW4 377 aa6.64□□□□□ -1.35
USP46-201ENST00000441222 APOBEC3CQ9NRW3 190 aaKnown RBP eCLIP6.64□□□□□ -1.35
USP46-201ENST00000441222 KCND1Q9NSA2 647 aa6.64□□□□□ -1.35
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USP46-201ENST00000441222 LINC00032P0C843 101 aa6.63□□□□□ -1.35
USP46-201ENST00000441222 ALPPL2P10696 532 aa6.63□□□□□ -1.35
USP46-201ENST00000441222 CD247P20963 164 aa6.63□□□□□ -1.35
USP46-201ENST00000441222 IL12BP29460 328 aa6.63□□□□□ -1.35
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USP46-201ENST00000441222 C3orf67Q6ZVT6 689 aa6.63□□□□□ -1.35
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USP46-201ENST00000441222 ZSWIM3Q96MP5 696 aa6.63□□□□□ -1.35
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USP46-201ENST00000441222 A0A1B0GVC2 190 aa6.63□□□□□ -1.35
USP46-201ENST00000441222 FAM237BA0A1B0GVD1 139 aa6.63□□□□□ -1.35
USP46-201ENST00000441222 F8VP50 259 aa6.63□□□□□ -1.35
USP46-201ENST00000441222 NOS1APO75052 506 aaPredicted RBP6.63□□□□□ -1.35
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USP46-201ENST00000441222 UROSP10746 265 aa6.63□□□□□ -1.35
USP46-201ENST00000441222 PEPDP12955 493 aa6.63□□□□□ -1.35
USP46-201ENST00000441222 PVALBP20472 110 aaPredicted RBP6.63□□□□□ -1.35
USP46-201ENST00000441222 STOMP27105 288 aa6.63□□□□□ -1.35
USP46-201ENST00000441222 PRDX6P30041 224 aa6.63□□□□□ -1.35
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USP46-201ENST00000441222 CDK18Q07002 472 aa6.63□□□□□ -1.35
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USP46-201ENST00000441222 DNM1P34Q6PK57 102 aa6.63□□□□□ -1.35
USP46-201ENST00000441222 THAP5Q7Z6K1 395 aa6.63□□□□□ -1.35
USP46-201ENST00000441222 TTLQ8NG68 377 aa6.63□□□□□ -1.35
USP46-201ENST00000441222 OR52K2Q8NGK3 314 aa6.63□□□□□ -1.35
USP46-201ENST00000441222 OR10G6Q8NH81 332 aa6.63□□□□□ -1.35
USP46-201ENST00000441222 SUN3Q8TAQ9 357 aa6.63□□□□□ -1.35
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USP46-201ENST00000441222 DNAJC11Q9NVH1 559 aa6.63□□□□□ -1.35
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USP46-201ENST00000441222 DISP2A7MBM2 1401 aa6.63□□□□□ -1.35
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USP46-201ENST00000441222 RIC1Q4ADV7 1423 aa6.63□□□□□ -1.35
USP46-201ENST00000441222 DCLK1O15075 740 aa6.63□□□□□ -1.35
USP46-201ENST00000441222 ARL3P36405 182 aa6.63□□□□□ -1.35
USP46-201ENST00000441222 C2orf80Q0P641 193 aa6.63□□□□□ -1.35
USP46-201ENST00000441222 TOP6BLQ8N6T0 577 aa6.63□□□□□ -1.35
USP46-201ENST00000441222 ARL10Q8N8L6 244 aa6.63□□□□□ -1.35
USP46-201ENST00000441222 ZNF527Q8NB42 609 aa6.63□□□□□ -1.35
USP46-201ENST00000441222 C1orf216Q8TAB5 229 aa6.63□□□□□ -1.35
USP46-201ENST00000441222 MFSD14AQ96MC6 490 aa6.63□□□□□ -1.35
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USP46-201ENST00000441222 WASH3PC4AMC7 463 aa6.63□□□□□ -1.35
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USP46-201ENST00000441222 SLC25A25Q6KCM7 469 aa6.63□□□□□ -1.35
USP46-201ENST00000441222 WASH2PQ6VEQ5 465 aa6.63□□□□□ -1.35
USP46-201ENST00000441222 USP50Q70EL3 339 aaPredicted RBP6.63□□□□□ -1.35
USP46-201ENST00000441222 SPPL2BQ8TCT7 592 aa6.63□□□□□ -1.35
USP46-201ENST00000441222 AGAP11Q8TF27 550 aa6.63□□□□□ -1.35
USP46-201ENST00000441222 HPS1Q92902 700 aa6.63□□□□□ -1.35
USP46-201ENST00000441222 RCN3Q96D15 328 aa6.63□□□□□ -1.35
USP46-201ENST00000441222 GORASP1Q9BQQ3 440 aa6.63□□□□□ -1.35
USP46-201ENST00000441222 DUSP16Q9BY84 665 aa6.63□□□□□ -1.35
USP46-201ENST00000441222 BRINP2Q9C0B6 783 aa6.63□□□□□ -1.35
USP46-201ENST00000441222 GLS2Q9UI32 602 aa6.63□□□□□ -1.35
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