RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000435136.6

SH3BP2-202, Transcript of SH3 domain binding protein 2, humanhuman

APPRIS P3 TSL 2 BASIC

Gene SH3BP2, Length 2,318 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SH3BP2-202ENST00000435136 PRAMEF12O95522 483 aa18.48■□□□□ 0.55
SH3BP2-202ENST00000435136 ALPIP09923 528 aa18.48■□□□□ 0.55
SH3BP2-202ENST00000435136 HLA-FP30511 346 aa18.48■□□□□ 0.55
SH3BP2-202ENST00000435136 CLCN7P51798 805 aa18.48■□□□□ 0.55
SH3BP2-202ENST00000435136 SLC34A1Q06495 639 aa18.48■□□□□ 0.55
SH3BP2-202ENST00000435136 PFKFB4Q16877 469 aa18.48■□□□□ 0.55
SH3BP2-202ENST00000435136 MYLK3Q32MK0 819 aa18.48■□□□□ 0.55
SH3BP2-202ENST00000435136 UGT3A2Q3SY77 523 aa18.48■□□□□ 0.55
SH3BP2-202ENST00000435136 KANK2Q63ZY3 851 aa18.48■□□□□ 0.55
SH3BP2-202ENST00000435136 DEFB107AQ8IZN7 70 aa18.48■□□□□ 0.55
SH3BP2-202ENST00000435136 POF1BQ8WVV4 589 aa18.48■□□□□ 0.55
SH3BP2-202ENST00000435136 GAS2L1Q99501 681 aaPredicted RBP18.48■□□□□ 0.55
SH3BP2-202ENST00000435136 SERPINI1Q99574 410 aa18.48■□□□□ 0.55
SH3BP2-202ENST00000435136 TDP1Q9NUW8 608 aa18.48■□□□□ 0.55
SH3BP2-202ENST00000435136 ANGPTL2Q9UKU9 493 aa18.48■□□□□ 0.55
SH3BP2-202ENST00000435136 GAPDHSO14556 408 aaPredicted RBP18.48■□□□□ 0.55
SH3BP2-202ENST00000435136 OR1I1O60431 355 aa18.48■□□□□ 0.55
SH3BP2-202ENST00000435136 VPS4BO75351 444 aa18.48■□□□□ 0.55
SH3BP2-202ENST00000435136 CDK14O94921 469 aa18.48■□□□□ 0.55
SH3BP2-202ENST00000435136 PRAMEF1O95521 474 aa18.48■□□□□ 0.55
SH3BP2-202ENST00000435136 HNF1BP35680 557 aa18.48■□□□□ 0.55
SH3BP2-202ENST00000435136 SPAM1P38567 509 aa18.48■□□□□ 0.55
SH3BP2-202ENST00000435136 MTTPP55157 894 aa18.48■□□□□ 0.55
SH3BP2-202ENST00000435136 TSNQ15631 228 aaKnown RBP18.48■□□□□ 0.55
SH3BP2-202ENST00000435136 FBXW8Q8N3Y1 598 aa18.48■□□□□ 0.55
SH3BP2-202ENST00000435136 NUSAP1Q9BXS6 441 aaKnown RBP18.48■□□□□ 0.55
SH3BP2-202ENST00000435136 SLC2A11Q9BYW1 496 aa18.48■□□□□ 0.55
SH3BP2-202ENST00000435136 CLPBQ9H078 707 aa18.48■□□□□ 0.55
SH3BP2-202ENST00000435136 EFCAB1Q9HAE3 211 aa18.48■□□□□ 0.55
SH3BP2-202ENST00000435136 TNFRSF12AQ9NP84 129 aa18.48■□□□□ 0.55
SH3BP2-202ENST00000435136 UTP6Q9NYH9 597 aaKnown RBP18.48■□□□□ 0.55
SH3BP2-202ENST00000435136 NUDT4Q9NZJ9 180 aa18.48■□□□□ 0.55
SH3BP2-202ENST00000435136 MARK1Q9P0L2 795 aa18.48■□□□□ 0.55
SH3BP2-202ENST00000435136 UBDO15205 165 aa18.47■□□□□ 0.55
SH3BP2-202ENST00000435136 CLASP2O75122 1294 aaKnown RBP18.47■□□□□ 0.55
SH3BP2-202ENST00000435136 SKAP2O75563 359 aaPredicted RBP18.47■□□□□ 0.55
SH3BP2-202ENST00000435136 KRT36O76013 467 aa18.47■□□□□ 0.55
SH3BP2-202ENST00000435136 TBL3Q12788 808 aaKnown RBP18.47■□□□□ 0.55
SH3BP2-202ENST00000435136 NFATC2Q13469 925 aa18.47■□□□□ 0.55
SH3BP2-202ENST00000435136 TEAD2Q15562 447 aa18.47■□□□□ 0.55
SH3BP2-202ENST00000435136 CCDC85BQ15834 202 aaPredicted RBP18.47■□□□□ 0.55
SH3BP2-202ENST00000435136 ZNF77Q15935 545 aa18.47■□□□□ 0.55
SH3BP2-202ENST00000435136 CCDC6Q16204 474 aa18.47■□□□□ 0.55
SH3BP2-202ENST00000435136 FUT11Q495W5 492 aa18.47■□□□□ 0.55
SH3BP2-202ENST00000435136 ELMSAN1Q6PJG2 1045 aa18.47■□□□□ 0.55
SH3BP2-202ENST00000435136 TPRG1Q6ZUI0 275 aa18.47■□□□□ 0.55
SH3BP2-202ENST00000435136 PGAM4Q8N0Y7 254 aa18.47■□□□□ 0.55
SH3BP2-202ENST00000435136 SIDT2Q8NBJ9 832 aaKnown RBP18.47■□□□□ 0.55
SH3BP2-202ENST00000435136 GIMAP7Q8NHV1 300 aa18.47■□□□□ 0.55
SH3BP2-202ENST00000435136 ZNF483Q8TF39 744 aaPredicted RBP18.47■□□□□ 0.55
SH3BP2-202ENST00000435136 IRF7Q92985 503 aa18.47■□□□□ 0.55
SH3BP2-202ENST00000435136 EXT2Q93063 718 aa18.47■□□□□ 0.55
SH3BP2-202ENST00000435136 C19orf60Q96EN9 201 aa18.47■□□□□ 0.55
SH3BP2-202ENST00000435136 LINGO1Q96FE5 620 aa18.47■□□□□ 0.55
SH3BP2-202ENST00000435136 CLPTM1LQ96KA5 538 aa18.47■□□□□ 0.55
SH3BP2-202ENST00000435136 PPP1R36Q96LQ0 422 aa18.47■□□□□ 0.55
SH3BP2-202ENST00000435136 MCCC1Q96RQ3 725 aaPredicted RBP18.47■□□□□ 0.55
SH3BP2-202ENST00000435136 HCFC1R1Q9NWW0 138 aa18.47■□□□□ 0.55
SH3BP2-202ENST00000435136 DPP7Q9UHL4 492 aa18.47■□□□□ 0.55
SH3BP2-202ENST00000435136 AGAP14A8MT82 685 aa18.46■□□□□ 0.55
SH3BP2-202ENST00000435136 BTN3A1O00481 513 aa18.46■□□□□ 0.55
SH3BP2-202ENST00000435136 AZIN1O14977 448 aa18.46■□□□□ 0.55
SH3BP2-202ENST00000435136 POP4O95707 220 aaKnown RBP18.46■□□□□ 0.55
SH3BP2-202ENST00000435136 MLYCDO95822 493 aa18.46■□□□□ 0.55
SH3BP2-202ENST00000435136 RHOP08100 348 aa18.46■□□□□ 0.55
SH3BP2-202ENST00000435136 CHRM3P20309 590 aa18.46■□□□□ 0.55
SH3BP2-202ENST00000435136 CLCQ05315 142 aa18.46■□□□□ 0.55
SH3BP2-202ENST00000435136 PTK2BQ14289 1009 aa18.46■□□□□ 0.55
SH3BP2-202ENST00000435136 TMEM198Q66K66 360 aa18.46■□□□□ 0.55
SH3BP2-202ENST00000435136 USP45Q70EL2 814 aa18.46■□□□□ 0.55
SH3BP2-202ENST00000435136 LARP4Q71RC2 724 aaKnown RBP eCLIP18.46■□□□□ 0.55
SH3BP2-202ENST00000435136 KIAA0907Q7Z7F0 614 aaPredicted RBP18.46■□□□□ 0.55
SH3BP2-202ENST00000435136 ADGRG6Q86SQ4 1221 aa18.46■□□□□ 0.55
SH3BP2-202ENST00000435136 ADAMTSL2Q86TH1 951 aa18.46■□□□□ 0.55
SH3BP2-202ENST00000435136 SERPINA9Q86WD7 417 aa18.46■□□□□ 0.55
SH3BP2-202ENST00000435136 CHCHD4Q8N4Q1 142 aa18.46■□□□□ 0.55
SH3BP2-202ENST00000435136 VOPP1Q96AW1 172 aa18.46■□□□□ 0.55
SH3BP2-202ENST00000435136 SCRN2Q96FV2 425 aa18.46■□□□□ 0.55
SH3BP2-202ENST00000435136 KLHL42Q9P2K6 505 aa18.46■□□□□ 0.55
SH3BP2-202ENST00000435136 LRRC42Q9Y546 428 aa18.46■□□□□ 0.55
SH3BP2-202ENST00000435136 MTCH2Q9Y6C9 303 aa18.46■□□□□ 0.55
SH3BP2-202ENST00000435136 GLYATL1P3A0A0U1RQE8 302 aa18.46■□□□□ 0.55
SH3BP2-202ENST00000435136 NPEPPSL1A6NEC2 478 aa18.46■□□□□ 0.55
SH3BP2-202ENST00000435136 WASH3PC4AMC7 463 aa18.46■□□□□ 0.55
SH3BP2-202ENST00000435136 CSPG5O95196 566 aa18.46■□□□□ 0.55
SH3BP2-202ENST00000435136 RB1P06400 928 aa18.46■□□□□ 0.55
SH3BP2-202ENST00000435136 PABPC1P11940 636 aaKnown RBP18.46■□□□□ 0.55
SH3BP2-202ENST00000435136 ACRV1P26436 265 aa18.46■□□□□ 0.55
SH3BP2-202ENST00000435136 EEF1DP29692 281 aaKnown RBP18.46■□□□□ 0.55
SH3BP2-202ENST00000435136 PTDSS1P48651 473 aaKnown RBP18.46■□□□□ 0.55
SH3BP2-202ENST00000435136 ACADVLP49748 655 aa18.46■□□□□ 0.55
SH3BP2-202ENST00000435136 VASPP50552 380 aaPredicted RBP18.46■□□□□ 0.55
SH3BP2-202ENST00000435136 AP2B1P63010 937 aa18.46■□□□□ 0.55
SH3BP2-202ENST00000435136 SH3BP2P78314 561 aa18.46■□□□□ 0.55
SH3BP2-202ENST00000435136 CARD16Q5EG05 197 aa18.46■□□□□ 0.55
SH3BP2-202ENST00000435136 PRSS36Q5K4E3 855 aa18.46■□□□□ 0.55
SH3BP2-202ENST00000435136 HOMEZQ8IX15 550 aa18.46■□□□□ 0.55
SH3BP2-202ENST00000435136 OR6K2Q8NGY2 324 aa18.46■□□□□ 0.55
SH3BP2-202ENST00000435136 SLC30A3Q99726 388 aa18.46■□□□□ 0.55
SH3BP2-202ENST00000435136 SUV39H2Q9H5I1 410 aa18.46■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 29.5 ms