RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000427220.5

TTLL3-210, Transcript of tubulin tyrosine ligase like 3, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene TTLL3, Length 3,233 nt, Biotype nonsense mediated decay.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TTLL3-210ENST00000427220 PCYOX1LQ8NBM8 494 aa19.49■□□□□ 0.71
TTLL3-210ENST00000427220 GFM2Q969S9 779 aaKnown RBP19.49■□□□□ 0.71
TTLL3-210ENST00000427220 NR1H4Q96RI1 486 aaPredicted RBP19.49■□□□□ 0.71
TTLL3-210ENST00000427220 ATOH8Q96SQ7 321 aa19.49■□□□□ 0.71
TTLL3-210ENST00000427220 ZNF385DQ9H6B1 395 aa19.49■□□□□ 0.71
TTLL3-210ENST00000427220 ACOT8O14734 319 aa19.48■□□□□ 0.71
TTLL3-210ENST00000427220 CHEK2O96017 543 aa19.48■□□□□ 0.71
TTLL3-210ENST00000427220 CAPN1P07384 714 aa19.48■□□□□ 0.71
TTLL3-210ENST00000427220 ACRP10323 421 aa19.48■□□□□ 0.71
TTLL3-210ENST00000427220 HK3P52790 923 aa19.48■□□□□ 0.71
TTLL3-210ENST00000427220 BFSP2Q13515 415 aa19.48■□□□□ 0.71
TTLL3-210ENST00000427220 ADGRF1Q5T601 910 aa19.48■□□□□ 0.71
TTLL3-210ENST00000427220 SLC2A7Q6PXP3 512 aa19.48■□□□□ 0.71
TTLL3-210ENST00000427220 RBM44Q6ZP01 1051 aaKnown RBP19.48■□□□□ 0.71
TTLL3-210ENST00000427220 LCA5Q86VQ0 697 aa19.48■□□□□ 0.71
TTLL3-210ENST00000427220 ADGRE3Q9BY15 652 aa19.48■□□□□ 0.71
TTLL3-210ENST00000427220 INTS7Q9NVH2 962 aaKnown RBP19.48■□□□□ 0.71
TTLL3-210ENST00000427220 RIMS3Q9UJD0 308 aa19.48■□□□□ 0.71
TTLL3-210ENST00000427220 YIPF1Q9Y548 306 aa19.48■□□□□ 0.71
TTLL3-210ENST00000427220 PLOD2O00469 737 aa19.48■□□□□ 0.71
TTLL3-210ENST00000427220 CLDN11O75508 207 aa19.48■□□□□ 0.71
TTLL3-210ENST00000427220 PAPSS2O95340 614 aaPredicted RBP19.48■□□□□ 0.71
TTLL3-210ENST00000427220 MTPNP58546 118 aa19.48■□□□□ 0.71
TTLL3-210ENST00000427220 SATB1Q01826 763 aa19.48■□□□□ 0.71
TTLL3-210ENST00000427220 VEPH1Q14D04 833 aa19.48■□□□□ 0.71
TTLL3-210ENST00000427220 ZIK1Q3SY52 487 aaPredicted RBP19.48■□□□□ 0.71
TTLL3-210ENST00000427220 PAGE3Q5JUK9 113 aa19.48■□□□□ 0.71
TTLL3-210ENST00000427220 FAM26DQ5JW98 314 aa19.48■□□□□ 0.71
TTLL3-210ENST00000427220 LIN28AQ9H9Z2 209 aaKnown RBP19.48■□□□□ 0.71
TTLL3-210ENST00000427220 C6orf203Q9P0P8 240 aaPredicted RBP19.48■□□□□ 0.71
TTLL3-210ENST00000427220 MED16Q9Y2X0 877 aa19.48■□□□□ 0.71
TTLL3-210ENST00000427220 A0A1B0GVG6 124 aa19.47■□□□□ 0.71
TTLL3-210ENST00000427220 C7orf72A4D263 438 aa19.47■□□□□ 0.71
TTLL3-210ENST00000427220 PRAMEF1O95521 474 aa19.47■□□□□ 0.71
TTLL3-210ENST00000427220 TUFMP49411 452 aaKnown RBP19.47■□□□□ 0.71
TTLL3-210ENST00000427220 LCP2Q13094 533 aa19.47■□□□□ 0.71
TTLL3-210ENST00000427220 ARHGEF7Q14155 803 aa19.47■□□□□ 0.71
TTLL3-210ENST00000427220 DEFB115Q30KQ5 88 aa19.47■□□□□ 0.71
TTLL3-210ENST00000427220 TSPAN33Q86UF1 283 aa19.47■□□□□ 0.71
TTLL3-210ENST00000427220 OFCC1Q8IZS5 231 aa19.47■□□□□ 0.71
TTLL3-210ENST00000427220 TRIML2Q8N7C3 387 aa19.47■□□□□ 0.71
TTLL3-210ENST00000427220 Q9H521 79 aa19.47■□□□□ 0.71
TTLL3-210ENST00000427220 MAP10Q9P2G4 905 aa19.47■□□□□ 0.71
TTLL3-210ENST00000427220 SUN2Q9UH99 717 aa19.47■□□□□ 0.71
TTLL3-210ENST00000427220 VPS51Q9UID3 782 aa19.47■□□□□ 0.71
TTLL3-210ENST00000427220 CRLS1Q9UJA2 301 aa19.47■□□□□ 0.71
TTLL3-210ENST00000427220 CNOT6Q9ULM6 557 aaKnown RBP19.47■□□□□ 0.71
TTLL3-210ENST00000427220 OXTRP30559 389 aa19.47■□□□□ 0.71
TTLL3-210ENST00000427220 OGFRL1Q5TC84 451 aaPredicted RBP19.47■□□□□ 0.71
TTLL3-210ENST00000427220 ASIC4Q96FT7 647 aa19.47■□□□□ 0.71
TTLL3-210ENST00000427220 MAELQ96JY0 434 aaKnown RBP19.47■□□□□ 0.71
TTLL3-210ENST00000427220 VN1R3Q9BXE9 311 aa19.47■□□□□ 0.71
TTLL3-210ENST00000427220 PDFQ9HBH1 243 aa19.47■□□□□ 0.71
TTLL3-210ENST00000427220 A0A1B0GVM2 712 aa19.47■□□□□ 0.71
TTLL3-210ENST00000427220 SLC2A4P14672 509 aa19.47■□□□□ 0.71
TTLL3-210ENST00000427220 GABRR2P28476 465 aa19.47■□□□□ 0.71
TTLL3-210ENST00000427220 HK2P52789 917 aa19.47■□□□□ 0.71
TTLL3-210ENST00000427220 ZXDBP98169 803 aa19.47■□□□□ 0.71
TTLL3-210ENST00000427220 MRPL58Q14197 206 aaKnown RBP19.47■□□□□ 0.71
TTLL3-210ENST00000427220 SETMARQ53H47 684 aaPredicted RBP19.47■□□□□ 0.71
TTLL3-210ENST00000427220 PYCR2Q96C36 320 aa19.47■□□□□ 0.71
TTLL3-210ENST00000427220 VPS50Q96JG6 964 aa19.47■□□□□ 0.71
TTLL3-210ENST00000427220 MYO16Q9Y6X6 1858 aa19.47■□□□□ 0.71
TTLL3-210ENST00000427220 KDELR3O43731 214 aa19.46■□□□□ 0.71
TTLL3-210ENST00000427220 GPX3P22352 226 aa19.46■□□□□ 0.71
TTLL3-210ENST00000427220 ZNF140P52738 457 aaPredicted RBP19.46■□□□□ 0.71
TTLL3-210ENST00000427220 GSTA3Q16772 222 aa19.46■□□□□ 0.71
TTLL3-210ENST00000427220 UGT3A2Q3SY77 523 aa19.46■□□□□ 0.71
TTLL3-210ENST00000427220 CTSL3PQ5NE16 218 aa19.46■□□□□ 0.71
TTLL3-210ENST00000427220 SLC22A15Q8IZD6 547 aa19.46■□□□□ 0.71
TTLL3-210ENST00000427220 HS6ST3Q8IZP7 471 aa19.46■□□□□ 0.71
TTLL3-210ENST00000427220 CBR4Q8N4T8 237 aa19.46■□□□□ 0.71
TTLL3-210ENST00000427220 ZNF366Q8N895 744 aa19.46■□□□□ 0.71
TTLL3-210ENST00000427220 NAT16Q8N8M0 369 aa19.46■□□□□ 0.71
TTLL3-210ENST00000427220 LKAAEAR1Q8TD35 194 aa19.46■□□□□ 0.71
TTLL3-210ENST00000427220 MGME1Q9BQP7 344 aa19.46■□□□□ 0.71
TTLL3-210ENST00000427220 CLPBQ9H078 707 aa19.46■□□□□ 0.71
TTLL3-210ENST00000427220 FARSBQ9NSD9 589 aaKnown RBP19.46■□□□□ 0.71
TTLL3-210ENST00000427220 NLE1Q9NVX2 485 aaPredicted RBP19.46■□□□□ 0.71
TTLL3-210ENST00000427220 POLR3HQ9Y535 204 aaPredicted RBP19.46■□□□□ 0.71
TTLL3-210ENST00000427220 SLC25A14O95258 325 aaPredicted RBP19.46■□□□□ 0.71
TTLL3-210ENST00000427220 HSPA8P11142 646 aaKnown RBP19.46■□□□□ 0.71
TTLL3-210ENST00000427220 NFKBIAP25963 317 aa19.46■□□□□ 0.71
TTLL3-210ENST00000427220 HMOX2P30519 316 aa19.46■□□□□ 0.71
TTLL3-210ENST00000427220 SAMD4BQ5PRF9 694 aaKnown RBP19.46■□□□□ 0.71
TTLL3-210ENST00000427220 SERPINA9Q86WD7 417 aa19.46■□□□□ 0.71
TTLL3-210ENST00000427220 OR2T11Q8NH01 316 aa19.46■□□□□ 0.71
TTLL3-210ENST00000427220 PBXIP1Q96AQ6 731 aa19.46■□□□□ 0.71
TTLL3-210ENST00000427220 ASB9Q96DX5 294 aa19.46■□□□□ 0.71
TTLL3-210ENST00000427220 BIRC8Q96P09 236 aa19.46■□□□□ 0.71
TTLL3-210ENST00000427220 PLEKHG4BQ96PX9 1271 aa19.46■□□□□ 0.71
TTLL3-210ENST00000427220 RANBP9Q96S59 729 aa19.46■□□□□ 0.71
TTLL3-210ENST00000427220 ARHGAP10A1A4S6 786 aa19.46■□□□□ 0.7
TTLL3-210ENST00000427220 TYW5A2RUC4 315 aaKnown RBP19.46■□□□□ 0.7
TTLL3-210ENST00000427220 CCDC154A6NI56 674 aa19.46■□□□□ 0.7
TTLL3-210ENST00000427220 EFNA1P20827 205 aaPredicted RBP19.46■□□□□ 0.7
TTLL3-210ENST00000427220 CTSOP43234 321 aaPredicted RBP19.46■□□□□ 0.7
TTLL3-210ENST00000427220 NOGQ13253 232 aa19.46■□□□□ 0.7
TTLL3-210ENST00000427220 TAF1AQ15573 450 aaPredicted RBP19.46■□□□□ 0.7
TTLL3-210ENST00000427220 ZNF786Q8N393 782 aa19.46■□□□□ 0.7
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 21.7 ms