RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000398417.6

SMAD4-202, Transcript of SMAD family member 4, humanhuman

APPRIS P1 TSL 5 BASIC

Gene SMAD4, Length 8,495 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMAD4-202ENST00000398417 RUNDC3AQ59EK9 446 aa4.9□□□□□ -1.63
SMAD4-202ENST00000398417 ZNF549Q6P9A3 640 aa4.9□□□□□ -1.63
SMAD4-202ENST00000398417 C16orf87Q6PH81 154 aa4.9□□□□□ -1.63
SMAD4-202ENST00000398417 SPESP1Q6UW49 350 aa4.9□□□□□ -1.63
SMAD4-202ENST00000398417 GPRIN3Q6ZVF9 776 aa4.9□□□□□ -1.63
SMAD4-202ENST00000398417 SLC15A3Q8IY34 581 aa4.9□□□□□ -1.63
SMAD4-202ENST00000398417 AHI1Q8N157 1196 aa4.9□□□□□ -1.63
SMAD4-202ENST00000398417 TTC9BQ8N6N2 239 aa4.9□□□□□ -1.63
SMAD4-202ENST00000398417 MDGA1Q8NFP4 955 aa4.9□□□□□ -1.63
SMAD4-202ENST00000398417 NUDT8Q8WV74 236 aa4.9□□□□□ -1.63
SMAD4-202ENST00000398417 ISL2Q96A47 359 aa4.9□□□□□ -1.63
SMAD4-202ENST00000398417 CDKN2AIPNLQ96HQ2 116 aa4.9□□□□□ -1.63
SMAD4-202ENST00000398417 FEM1CQ96JP0 617 aa4.9□□□□□ -1.63
SMAD4-202ENST00000398417 SPOCK3Q9BQ16 436 aa4.9□□□□□ -1.63
SMAD4-202ENST00000398417 NMRK2Q9NPI5 230 aa4.9□□□□□ -1.63
SMAD4-202ENST00000398417 PNPLA3Q9NST1 481 aa4.9□□□□□ -1.63
SMAD4-202ENST00000398417 ZDHHC7Q9NXF8 308 aa4.9□□□□□ -1.63
SMAD4-202ENST00000398417 BAG5Q9UL15 447 aa4.9□□□□□ -1.63
SMAD4-202ENST00000398417 ACOT8O14734 319 aa4.89□□□□□ -1.63
SMAD4-202ENST00000398417 SNAP91O60641 907 aa4.89□□□□□ -1.63
SMAD4-202ENST00000398417 NIPSNAP2O75323 286 aa4.89□□□□□ -1.63
SMAD4-202ENST00000398417 CAPN3P20807 821 aa4.89□□□□□ -1.63
SMAD4-202ENST00000398417 PRKACGP22612 351 aa4.89□□□□□ -1.63
SMAD4-202ENST00000398417 RGRP47804 291 aa4.89□□□□□ -1.63
SMAD4-202ENST00000398417 RPS6KA3P51812 740 aa4.89□□□□□ -1.63
SMAD4-202ENST00000398417 DGKQP52824 942 aa4.89□□□□□ -1.63
SMAD4-202ENST00000398417 RPS24P62847 133 aaKnown RBP4.89□□□□□ -1.63
SMAD4-202ENST00000398417 PPP1R8Q12972 351 aaKnown RBP4.89□□□□□ -1.63
SMAD4-202ENST00000398417 BNIP2Q12982 314 aa4.89□□□□□ -1.63
SMAD4-202ENST00000398417 DUSP4Q13115 394 aa4.89□□□□□ -1.63
SMAD4-202ENST00000398417 TRIP4Q15650 581 aaPredicted RBP4.89□□□□□ -1.63
SMAD4-202ENST00000398417 GTDC1Q4AE62 458 aa4.89□□□□□ -1.63
SMAD4-202ENST00000398417 ITFG1Q8TB96 612 aa4.89□□□□□ -1.63
SMAD4-202ENST00000398417 FAM110BQ8TC76 370 aa4.89□□□□□ -1.63
SMAD4-202ENST00000398417 TP53INP1Q96A56 240 aa4.89□□□□□ -1.63
SMAD4-202ENST00000398417 OSBPL11Q9BXB4 747 aa4.89□□□□□ -1.63
SMAD4-202ENST00000398417 CMTM6Q9NX76 183 aa4.89□□□□□ -1.63
SMAD4-202ENST00000398417 POLG2Q9UHN1 485 aa4.89□□□□□ -1.63
SMAD4-202ENST00000398417 SLC8A2Q9UPR5 921 aa4.89□□□□□ -1.63
SMAD4-202ENST00000398417 SYCE1LA8MT33 242 aa4.89□□□□□ -1.63
SMAD4-202ENST00000398417 HAS3O00219 553 aa4.89□□□□□ -1.63
SMAD4-202ENST00000398417 SCAMP1O15126 338 aa4.89□□□□□ -1.63
SMAD4-202ENST00000398417 HIST1H2AGP0C0S8 130 aaPredicted RBP4.89□□□□□ -1.63
SMAD4-202ENST00000398417 HIST1H2ADP20671 130 aa4.89□□□□□ -1.63
SMAD4-202ENST00000398417 LEPRP48357 1165 aaKnown RBP4.89□□□□□ -1.63
SMAD4-202ENST00000398417 OR4D2P58180 307 aa4.89□□□□□ -1.63
SMAD4-202ENST00000398417 MTPNP58546 118 aa4.89□□□□□ -1.63
SMAD4-202ENST00000398417 IL5RAQ01344 420 aa4.89□□□□□ -1.63
SMAD4-202ENST00000398417 PRKCZQ05513 592 aa4.89□□□□□ -1.63
SMAD4-202ENST00000398417 MORN1Q5T089 497 aa4.89□□□□□ -1.63
SMAD4-202ENST00000398417 UGT2A3Q6UWM9 527 aa4.89□□□□□ -1.63
SMAD4-202ENST00000398417 TPGS1Q6ZTW0 290 aa4.89□□□□□ -1.63
SMAD4-202ENST00000398417 DET1Q7L5Y6 550 aa4.89□□□□□ -1.63
SMAD4-202ENST00000398417 CAMK1DQ8IU85 385 aa4.89□□□□□ -1.63
SMAD4-202ENST00000398417 HIST1H2AHQ96KK5 128 aa4.89□□□□□ -1.63
SMAD4-202ENST00000398417 SUSD3Q96L08 255 aa4.89□□□□□ -1.63
SMAD4-202ENST00000398417 GLT1D1Q96MS3 346 aa4.89□□□□□ -1.63
SMAD4-202ENST00000398417 HIST1H2AJQ99878 128 aa4.89□□□□□ -1.63
SMAD4-202ENST00000398417 H2AFJQ9BTM1 129 aa4.89□□□□□ -1.63
SMAD4-202ENST00000398417 IPPKQ9H8X2 491 aa4.89□□□□□ -1.63
SMAD4-202ENST00000398417 CACNA2D2Q9NY47 1150 aa4.89□□□□□ -1.63
SMAD4-202ENST00000398417 PLK2Q9NYY3 685 aa4.89□□□□□ -1.63
SMAD4-202ENST00000398417 ATXN10Q9UBB4 475 aa4.89□□□□□ -1.63
SMAD4-202ENST00000398417 FADS3Q9Y5Q0 445 aa4.89□□□□□ -1.63
SMAD4-202ENST00000398417 C7orf72A4D263 438 aa4.89□□□□□ -1.63
SMAD4-202ENST00000398417 BBIP1A8MTZ0 92 aa4.89□□□□□ -1.63
SMAD4-202ENST00000398417 GKP32189 559 aa4.89□□□□□ -1.63
SMAD4-202ENST00000398417 HSPA7P48741 367 aa4.89□□□□□ -1.63
SMAD4-202ENST00000398417 SLC11A1P49279 550 aa4.89□□□□□ -1.63
SMAD4-202ENST00000398417 POLR2JP52435 117 aaKnown RBP4.89□□□□□ -1.63
SMAD4-202ENST00000398417 LDLRAP1Q5SW96 308 aa4.89□□□□□ -1.63
SMAD4-202ENST00000398417 GRAMD4Q6IC98 578 aa4.89□□□□□ -1.63
SMAD4-202ENST00000398417 TMEM214Q6NUQ4 689 aaKnown RBP4.89□□□□□ -1.63
SMAD4-202ENST00000398417 PRMT9Q6P2P2 845 aa4.89□□□□□ -1.63
SMAD4-202ENST00000398417 FAM171BQ6P995 826 aa4.89□□□□□ -1.63
SMAD4-202ENST00000398417 FAM151BQ6UXP7 276 aa4.89□□□□□ -1.63
SMAD4-202ENST00000398417 TMEM26Q6ZUK4 368 aa4.89□□□□□ -1.63
SMAD4-202ENST00000398417 USP51Q70EK9 711 aa4.89□□□□□ -1.63
SMAD4-202ENST00000398417 MRPL10Q7Z7H8 261 aaKnown RBP4.89□□□□□ -1.63
SMAD4-202ENST00000398417 ZNF555Q8NEP9 628 aa4.89□□□□□ -1.63
SMAD4-202ENST00000398417 PTCD2Q8WV60 388 aaKnown RBP4.89□□□□□ -1.63
SMAD4-202ENST00000398417 SOCS4Q8WXH5 440 aa4.89□□□□□ -1.63
SMAD4-202ENST00000398417 ASB9Q96DX5 294 aa4.89□□□□□ -1.63
SMAD4-202ENST00000398417 FANCEQ9HB96 536 aa4.89□□□□□ -1.63
SMAD4-202ENST00000398417 STARD7Q9NQZ5 370 aa4.89□□□□□ -1.63
SMAD4-202ENST00000398417 TMEM248Q9NWD8 314 aa4.89□□□□□ -1.63
SMAD4-202ENST00000398417 EI24O14681 340 aa4.89□□□□□ -1.63
SMAD4-202ENST00000398417 NDST3O95803 873 aa4.89□□□□□ -1.63
SMAD4-202ENST00000398417 CAPN1P07384 714 aa4.89□□□□□ -1.63
SMAD4-202ENST00000398417 AP1S2P56377 157 aa4.89□□□□□ -1.63
SMAD4-202ENST00000398417 ATP6V0D1P61421 351 aa4.89□□□□□ -1.63
SMAD4-202ENST00000398417 RHDQ02161 417 aa4.89□□□□□ -1.63
SMAD4-202ENST00000398417 ATP1A4Q13733 1029 aa4.89□□□□□ -1.63
SMAD4-202ENST00000398417 ERMP1Q7Z2K6 904 aa4.89□□□□□ -1.63
SMAD4-202ENST00000398417 SPATA19Q7Z5L4 167 aa4.89□□□□□ -1.63
SMAD4-202ENST00000398417 EEF1AKMT1Q8WVE0 214 aa4.89□□□□□ -1.63
SMAD4-202ENST00000398417 NT5C3BQ969T7 300 aa4.89□□□□□ -1.63
SMAD4-202ENST00000398417 BTN2A3PQ96KV6 586 aa4.89□□□□□ -1.63
SMAD4-202ENST00000398417 PLEKHG4BQ96PX9 1271 aa4.89□□□□□ -1.63
SMAD4-202ENST00000398417 C9orf16Q9BUW7 83 aa4.89□□□□□ -1.63
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 19.6 ms