RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000362869.1

RNU6-552P-201, Transcript of RNA, U6 small nuclear 552, pseudogene, humanhuman

BASIC

Gene RNU6-552P, Length 119 nt, Biotype snRNA.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNU6-552P-201ENST00000362869 UTP15Q8TED0 518 aaKnown RBP2.97□□□□□ -1.93
RNU6-552P-201ENST00000362869 PPP4R1Q8TF05 950 aa2.97□□□□□ -1.93
RNU6-552P-201ENST00000362869 ARHGEF2Q92974 986 aaKnown RBP2.97□□□□□ -1.93
RNU6-552P-201ENST00000362869 ZKSCAN4Q969J2 545 aaPredicted RBP2.97□□□□□ -1.93
RNU6-552P-201ENST00000362869 PHF21AQ96BD5 680 aa2.97□□□□□ -1.93
RNU6-552P-201ENST00000362869 FBXO17Q96EF6 278 aa2.97□□□□□ -1.93
RNU6-552P-201ENST00000362869 C1orf74Q96LT6 269 aa2.97□□□□□ -1.93
RNU6-552P-201ENST00000362869 SMC6Q96SB8 1091 aa2.97□□□□□ -1.93
RNU6-552P-201ENST00000362869 MAGIXQ9H6Y5 334 aa2.97□□□□□ -1.93
RNU6-552P-201ENST00000362869 UPF2Q9HAU5 1272 aaKnown RBP2.97□□□□□ -1.93
RNU6-552P-201ENST00000362869 DIAPH3Q9NSV4 1193 aa2.97□□□□□ -1.93
RNU6-552P-201ENST00000362869 FAM118AQ9NWS6 357 aa2.97□□□□□ -1.93
RNU6-552P-201ENST00000362869 R3HDM2Q9Y2K5 976 aaKnown RBP2.97□□□□□ -1.93
RNU6-552P-201ENST00000362869 GREB1LQ9C091 1923 aaPredicted RBP2.97□□□□□ -1.93
RNU6-552P-201ENST00000362869 IGLV5-45A0A087WSX0 123 aa2.96□□□□□ -1.94
RNU6-552P-201ENST00000362869 CTAGE9A4FU28 777 aa2.96□□□□□ -1.94
RNU6-552P-201ENST00000362869 ERVV-2B6SEH9 535 aa2.96□□□□□ -1.94
RNU6-552P-201ENST00000362869 BUD23O43709 281 aaKnown RBP2.96□□□□□ -1.94
RNU6-552P-201ENST00000362869 SYNGR3O43761 229 aa2.96□□□□□ -1.94
RNU6-552P-201ENST00000362869 GAS8-AS1O95177 125 aa2.96□□□□□ -1.94
RNU6-552P-201ENST00000362869 MBD4O95243 580 aa2.96□□□□□ -1.94
RNU6-552P-201ENST00000362869 CD4P01730 458 aa2.96□□□□□ -1.94
RNU6-552P-201ENST00000362869 ICAM1P05362 532 aa2.96□□□□□ -1.94
RNU6-552P-201ENST00000362869 PRSS1P07477 247 aa2.96□□□□□ -1.94
RNU6-552P-201ENST00000362869 CTAGE8P0CG41 777 aa2.96□□□□□ -1.94
RNU6-552P-201ENST00000362869 CSF2RAP15509 400 aa2.96□□□□□ -1.94
RNU6-552P-201ENST00000362869 ZNF23P17027 643 aa2.96□□□□□ -1.94
RNU6-552P-201ENST00000362869 CDH2P19022 906 aaPredicted RBP2.96□□□□□ -1.94
RNU6-552P-201ENST00000362869 MAN1A1P33908 653 aa2.96□□□□□ -1.94
RNU6-552P-201ENST00000362869 GLIPR1P48060 266 aa2.96□□□□□ -1.94
RNU6-552P-201ENST00000362869 GALCP54803 685 aa2.96□□□□□ -1.94
RNU6-552P-201ENST00000362869 MLLT10P55197 1068 aa2.96□□□□□ -1.94
RNU6-552P-201ENST00000362869 LINC01547P58512 204 aaPredicted RBP2.96□□□□□ -1.94
RNU6-552P-201ENST00000362869 RUNX1T1Q06455 604 aa2.96□□□□□ -1.94
RNU6-552P-201ENST00000362869 ACVR2BQ13705 512 aa2.96□□□□□ -1.94
RNU6-552P-201ENST00000362869 SOWAHCQ53LP3 525 aaPredicted RBP2.96□□□□□ -1.94
RNU6-552P-201ENST00000362869 CCNYL2Q5T2Q4 361 aa2.96□□□□□ -1.94
RNU6-552P-201ENST00000362869 LRIF1Q5T3J3 769 aa2.96□□□□□ -1.94
RNU6-552P-201ENST00000362869 NSUN5P2Q63ZY6 315 aa2.96□□□□□ -1.94
RNU6-552P-201ENST00000362869 LCN10Q6JVE6 187 aa2.96□□□□□ -1.94
RNU6-552P-201ENST00000362869 ZNF449Q6P9G9 518 aa2.96□□□□□ -1.94
RNU6-552P-201ENST00000362869 CCDC190Q86UF4 302 aa2.96□□□□□ -1.94
RNU6-552P-201ENST00000362869 CTAGE4Q8IX94 777 aa2.96□□□□□ -1.94
RNU6-552P-201ENST00000362869 PM20D2Q8IYS1 436 aa2.96□□□□□ -1.94
RNU6-552P-201ENST00000362869 ADSSL1Q8N142 457 aa2.96□□□□□ -1.94
RNU6-552P-201ENST00000362869 PAF1Q8N7H5 531 aa2.96□□□□□ -1.94
RNU6-552P-201ENST00000362869 ST6GAL2Q96JF0 529 aa2.96□□□□□ -1.94
RNU6-552P-201ENST00000362869 ZNF354BQ96LW1 612 aa2.96□□□□□ -1.94
RNU6-552P-201ENST00000362869 SEMA3CQ99985 751 aa2.96□□□□□ -1.94
RNU6-552P-201ENST00000362869 MUC13Q9H3R2 512 aa2.96□□□□□ -1.94
RNU6-552P-201ENST00000362869 EPB41L5Q9HCM4 733 aa2.96□□□□□ -1.94
RNU6-552P-201ENST00000362869 OLA1Q9NTK5 396 aaKnown RBP2.96□□□□□ -1.94
RNU6-552P-201ENST00000362869 TCP11L1Q9NUJ3 509 aa2.96□□□□□ -1.94
RNU6-552P-201ENST00000362869 ORC3Q9UBD5 711 aaPredicted RBP2.96□□□□□ -1.94
RNU6-552P-201ENST00000362869 AASSQ9UDR5 926 aa2.96□□□□□ -1.94
RNU6-552P-201ENST00000362869 PIAS3Q9Y6X2 628 aa2.96□□□□□ -1.94
RNU6-552P-201ENST00000362869 LIPT2A6NK58 231 aa2.95□□□□□ -1.94
RNU6-552P-201ENST00000362869 ANKRD66B4E2M5 251 aa2.95□□□□□ -1.94
RNU6-552P-201ENST00000362869 SCAMP1O15126 338 aa2.95□□□□□ -1.94
RNU6-552P-201ENST00000362869 PDE9AO76083 593 aa2.95□□□□□ -1.94
RNU6-552P-201ENST00000362869 PAX1P15863 534 aa2.95□□□□□ -1.94
RNU6-552P-201ENST00000362869 ANXA7P20073 488 aaKnown RBP2.95□□□□□ -1.94
RNU6-552P-201ENST00000362869 MCCP23508 829 aa2.95□□□□□ -1.94
RNU6-552P-201ENST00000362869 TIMP3P35625 211 aa2.95□□□□□ -1.94
RNU6-552P-201ENST00000362869 ARL3P36405 182 aa2.95□□□□□ -1.94
RNU6-552P-201ENST00000362869 CDKN1AP38936 164 aa2.95□□□□□ -1.94
RNU6-552P-201ENST00000362869 KRTAP10-7P60409 375 aaPredicted RBP2.95□□□□□ -1.94
RNU6-552P-201ENST00000362869 RPL24P83731 157 aaKnown RBP2.95□□□□□ -1.94
RNU6-552P-201ENST00000362869 MRGPRG-AS1Q2M3A8 158 aa2.95□□□□□ -1.94
RNU6-552P-201ENST00000362869 GKAP1Q5VSY0 366 aaPredicted RBP2.95□□□□□ -1.94
RNU6-552P-201ENST00000362869 ACSM2BQ68CK6 577 aa2.95□□□□□ -1.94
RNU6-552P-201ENST00000362869 ATG9AQ7Z3C6 839 aa2.95□□□□□ -1.94
RNU6-552P-201ENST00000362869 EPHX4Q8IUS5 362 aa2.95□□□□□ -1.94
RNU6-552P-201ENST00000362869 KLHDC8BQ8IXV7 354 aa2.95□□□□□ -1.94
RNU6-552P-201ENST00000362869 HACE1Q8IYU2 909 aa2.95□□□□□ -1.94
RNU6-552P-201ENST00000362869 RASGEF1CQ8N431 466 aa2.95□□□□□ -1.94
RNU6-552P-201ENST00000362869 EMC1Q8N766 993 aa2.95□□□□□ -1.94
RNU6-552P-201ENST00000362869 CNBD1Q8NA66 436 aa2.95□□□□□ -1.94
RNU6-552P-201ENST00000362869 OR8K5Q8NH50 307 aa2.95□□□□□ -1.94
RNU6-552P-201ENST00000362869 GRAPLQ8TC17 118 aaPredicted RBP2.95□□□□□ -1.94
RNU6-552P-201ENST00000362869 ELMOD3Q96FG2 381 aa2.95□□□□□ -1.94
RNU6-552P-201ENST00000362869 SCRN2Q96FV2 425 aa2.95□□□□□ -1.94
RNU6-552P-201ENST00000362869 OXNAD1Q96HP4 312 aaPredicted RBP2.95□□□□□ -1.94
RNU6-552P-201ENST00000362869 ABHD8Q96I13 439 aa2.95□□□□□ -1.94
RNU6-552P-201ENST00000362869 EGLN2Q96KS0 407 aa2.95□□□□□ -1.94
RNU6-552P-201ENST00000362869 TMEM39BQ9GZU3 492 aa2.95□□□□□ -1.94
RNU6-552P-201ENST00000362869 TFB2MQ9H5Q4 396 aaKnown RBP2.95□□□□□ -1.94
RNU6-552P-201ENST00000362869 SH2D4AQ9H788 454 aa2.95□□□□□ -1.94
RNU6-552P-201ENST00000362869 KRT84Q9NSB2 600 aa2.95□□□□□ -1.94
RNU6-552P-201ENST00000362869 MTMR10Q9NXD2 777 aa2.95□□□□□ -1.94
RNU6-552P-201ENST00000362869 KLHL9Q9P2J3 617 aa2.95□□□□□ -1.94
RNU6-552P-201ENST00000362869 GAB2Q9UQC2 676 aa2.95□□□□□ -1.94
RNU6-552P-201ENST00000362869 MTMR6Q9Y217 621 aa2.95□□□□□ -1.94
RNU6-552P-201ENST00000362869 TDRD9Q8NDG6 1382 aaKnown RBP2.95□□□□□ -1.94
RNU6-552P-201ENST00000362869 EPB41L2O43491 1005 aaKnown RBP2.94□□□□□ -1.94
RNU6-552P-201ENST00000362869 CTSVO60911 334 aa2.94□□□□□ -1.94
RNU6-552P-201ENST00000362869 RNASEH2AO75792 299 aaKnown RBP2.94□□□□□ -1.94
RNU6-552P-201ENST00000362869 DDX58O95786 925 aaKnown RBP2.94□□□□□ -1.94
RNU6-552P-201ENST00000362869 SCGB1D1O95968 90 aa2.94□□□□□ -1.94
RNU6-552P-201ENST00000362869 HIST1H2ABP04908 130 aa2.94□□□□□ -1.94
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 38.4 ms