RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000361543.3

SGMS1-201, Transcript of sphingomyelin synthase 1, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene SGMS1, Length 1,096 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Endoplasmic reticulum, Nucleus, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SGMS1-201ENST00000361543 ACP5P13686 325 aa7.58□□□□□ -1.2
SGMS1-201ENST00000361543 BPIP17213 487 aa7.58□□□□□ -1.2
SGMS1-201ENST00000361543 HLA-DPA1P20036 260 aa7.58□□□□□ -1.2
SGMS1-201ENST00000361543 RBL1P28749 1068 aa7.58□□□□□ -1.2
SGMS1-201ENST00000361543 ALDH4A1P30038 563 aa7.58□□□□□ -1.2
SGMS1-201ENST00000361543 CHRNA4P43681 627 aa7.58□□□□□ -1.2
SGMS1-201ENST00000361543 OR1D5P58170 312 aa7.58□□□□□ -1.2
SGMS1-201ENST00000361543 B4GALNT1Q00973 533 aa7.58□□□□□ -1.2
SGMS1-201ENST00000361543 OTUD4Q01804 1114 aaKnown RBP7.58□□□□□ -1.2
SGMS1-201ENST00000361543 TLE3Q04726 772 aa7.58□□□□□ -1.2
SGMS1-201ENST00000361543 MPP3Q13368 585 aa7.58□□□□□ -1.2
SGMS1-201ENST00000361543 SLC1A5Q15758 541 aa7.58□□□□□ -1.2
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SGMS1-201ENST00000361543 PHF19Q5T6S3 580 aa7.58□□□□□ -1.2
SGMS1-201ENST00000361543 ITPRIPL1Q6GPH6 555 aa7.58□□□□□ -1.2
SGMS1-201ENST00000361543 RAB11FIP2Q7L804 512 aa7.58□□□□□ -1.2
SGMS1-201ENST00000361543 CHST15Q7LFX5 561 aaPredicted RBP7.58□□□□□ -1.2
SGMS1-201ENST00000361543 PID1Q7Z2X4 250 aa7.58□□□□□ -1.2
SGMS1-201ENST00000361543 TMPRSS9Q7Z410 1059 aa7.58□□□□□ -1.2
SGMS1-201ENST00000361543 TMC3Q7Z5M5 1100 aa7.58□□□□□ -1.2
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SGMS1-201ENST00000361543 FBXO39Q8N4B4 442 aa7.58□□□□□ -1.2
SGMS1-201ENST00000361543 SLC25A41Q8N5S1 370 aa7.58□□□□□ -1.2
SGMS1-201ENST00000361543 TRAM1L1Q8N609 369 aa7.58□□□□□ -1.2
SGMS1-201ENST00000361543 IPMKQ8NFU5 416 aa7.58□□□□□ -1.2
SGMS1-201ENST00000361543 ACTL9Q8TC94 416 aa7.58□□□□□ -1.2
SGMS1-201ENST00000361543 SLC37A2Q8TED4 501 aa7.58□□□□□ -1.2
SGMS1-201ENST00000361543 KCNE4Q8WWG9 221 aa7.58□□□□□ -1.2
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SGMS1-201ENST00000361543 GLYATL1Q969I3 302 aa7.58□□□□□ -1.2
SGMS1-201ENST00000361543 LRRC45Q96CN5 670 aa7.58□□□□□ -1.2
SGMS1-201ENST00000361543 PRR11Q96HE9 360 aaPredicted RBP7.58□□□□□ -1.2
SGMS1-201ENST00000361543 NAF1Q96HR8 494 aaKnown RBP7.58□□□□□ -1.2
SGMS1-201ENST00000361543 HES6Q96HZ4 224 aa7.58□□□□□ -1.2
SGMS1-201ENST00000361543 MRGPRX2Q96LB1 330 aa7.58□□□□□ -1.2
SGMS1-201ENST00000361543 PLEKHG4BQ96PX9 1271 aa7.58□□□□□ -1.2
SGMS1-201ENST00000361543 FCRL5Q96RD9 977 aa7.58□□□□□ -1.2
SGMS1-201ENST00000361543 NAP1L3Q99457 506 aaPredicted RBP7.58□□□□□ -1.2
SGMS1-201ENST00000361543 FSD1LQ9BXM9 530 aa7.58□□□□□ -1.2
SGMS1-201ENST00000361543 OR2AG1Q9H205 316 aa7.58□□□□□ -1.2
SGMS1-201ENST00000361543 GBA3Q9H227 469 aa7.58□□□□□ -1.2
SGMS1-201ENST00000361543 TRABDQ9H4I3 376 aa7.58□□□□□ -1.2
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SGMS1-201ENST00000361543 ARFGAP3Q9NP61 516 aa7.58□□□□□ -1.2
SGMS1-201ENST00000361543 ATXN10Q9UBB4 475 aa7.58□□□□□ -1.2
SGMS1-201ENST00000361543 KCNK6Q9Y257 313 aa7.58□□□□□ -1.2
SGMS1-201ENST00000361543 JRKLQ9Y4A0 524 aa7.58□□□□□ -1.2
SGMS1-201ENST00000361543 HELZ2Q9BYK8 2649 aaKnown RBP7.58□□□□□ -1.2
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SGMS1-201ENST00000361543 FTCDO95954 541 aa7.57□□□□□ -1.2
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SGMS1-201ENST00000361543 JMJD7P0C870 316 aa7.57□□□□□ -1.2
SGMS1-201ENST00000361543 GPR89BP0CG08 455 aa7.57□□□□□ -1.2
SGMS1-201ENST00000361543 RBP3P10745 1247 aa7.57□□□□□ -1.2
SGMS1-201ENST00000361543 PYGMP11217 842 aa7.57□□□□□ -1.2
SGMS1-201ENST00000361543 HGFP14210 728 aa7.57□□□□□ -1.2
SGMS1-201ENST00000361543 SLC2A4P14672 509 aa7.57□□□□□ -1.2
SGMS1-201ENST00000361543 ZNF8P17098 575 aaPredicted RBP7.57□□□□□ -1.2
SGMS1-201ENST00000361543 UGT1A5P35504 534 aa7.57□□□□□ -1.2
SGMS1-201ENST00000361543 HMGCLP35914 325 aa7.57□□□□□ -1.2
SGMS1-201ENST00000361543 GPR3P46089 330 aa7.57□□□□□ -1.2
SGMS1-201ENST00000361543 FASLGP48023 281 aa7.57□□□□□ -1.2
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SGMS1-201ENST00000361543 MEI1Q5TIA1 1274 aa7.57□□□□□ -1.2
SGMS1-201ENST00000361543 BROXQ5VW32 411 aa7.57□□□□□ -1.2
SGMS1-201ENST00000361543 AADACL2Q6P093 401 aa7.57□□□□□ -1.2
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SGMS1-201ENST00000361543 GLT6D1Q7Z4J2 308 aa7.57□□□□□ -1.2
SGMS1-201ENST00000361543 PIM3Q86V86 326 aa7.57□□□□□ -1.2
SGMS1-201ENST00000361543 JAMLQ86YT9 394 aa7.57□□□□□ -1.2
SGMS1-201ENST00000361543 SFRP1Q8N474 314 aa7.57□□□□□ -1.2
SGMS1-201ENST00000361543 TTC30BQ8N4P2 665 aa7.57□□□□□ -1.2
SGMS1-201ENST00000361543 BLOC1S5Q8TDH9 187 aa7.57□□□□□ -1.2
SGMS1-201ENST00000361543 COL26A1Q96A83 441 aa7.57□□□□□ -1.2
SGMS1-201ENST00000361543 FCRL3Q96P31 734 aaPredicted RBP7.57□□□□□ -1.2
SGMS1-201ENST00000361543 VPS35Q96QK1 796 aa7.57□□□□□ -1.2
SGMS1-201ENST00000361543 FAM118BQ9BPY3 351 aa7.57□□□□□ -1.2
SGMS1-201ENST00000361543 GORASP1Q9BQQ3 440 aa7.57□□□□□ -1.2
SGMS1-201ENST00000361543 NUDT22Q9BRQ3 303 aa7.57□□□□□ -1.2
SGMS1-201ENST00000361543 DPH1Q9BZG8 443 aa7.57□□□□□ -1.2
SGMS1-201ENST00000361543 SEMA6CQ9H3T2 930 aa7.57□□□□□ -1.2
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