RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000339098.9

CERKL-201, Transcript of ceramide kinase like, humanhuman

APPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC

Gene CERKL, Length 1,677 nt, Biotype protein coding.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CERKL-201ENST00000339098 LAMA1P25391 3075 aa20.09■□□□□ 0.81
CERKL-201ENST00000339098 UQCRHLA0A096LP55 91 aa20.09■□□□□ 0.81
CERKL-201ENST00000339098 CACNB4O00305 520 aaPredicted RBP20.09■□□□□ 0.81
CERKL-201ENST00000339098 UQCRHP07919 91 aa20.09■□□□□ 0.81
CERKL-201ENST00000339098 THEGLP0DJG4 465 aa20.09■□□□□ 0.81
CERKL-201ENST00000339098 PPARGP37231 505 aaPredicted RBP20.09■□□□□ 0.81
CERKL-201ENST00000339098 AFF3P51826 1226 aaKnown RBP20.09■□□□□ 0.81
CERKL-201ENST00000339098 KIAA1024LP59773 190 aa20.09■□□□□ 0.81
CERKL-201ENST00000339098 B4GALNT1Q00973 533 aa20.09■□□□□ 0.81
CERKL-201ENST00000339098 NFATC4Q14934 902 aa20.09■□□□□ 0.81
CERKL-201ENST00000339098 BEND6Q5SZJ8 279 aaPredicted RBP20.09■□□□□ 0.81
CERKL-201ENST00000339098 PEAR1Q5VY43 1037 aaPredicted RBP20.09■□□□□ 0.81
CERKL-201ENST00000339098 LAYNQ6UX15 382 aa20.09■□□□□ 0.81
CERKL-201ENST00000339098 KIAA0408Q6ZU52 694 aa20.09■□□□□ 0.81
CERKL-201ENST00000339098 PIGKQ92643 395 aa20.09■□□□□ 0.81
CERKL-201ENST00000339098 BOCQ9BWV1 1114 aa20.09■□□□□ 0.81
CERKL-201ENST00000339098 PSAT1Q9Y617 370 aa20.09■□□□□ 0.81
CERKL-201ENST00000339098 A0A1B0GTW7 788 aa20.08■□□□□ 0.81
CERKL-201ENST00000339098 TMEM202A6NGA9 273 aa20.08■□□□□ 0.81
CERKL-201ENST00000339098 OR1I1O60431 355 aa20.08■□□□□ 0.81
CERKL-201ENST00000339098 F7P08709 466 aaPredicted RBP20.08■□□□□ 0.81
CERKL-201ENST00000339098 GNSP15586 552 aa20.08■□□□□ 0.81
CERKL-201ENST00000339098 HOXD12P35452 270 aa20.08■□□□□ 0.81
CERKL-201ENST00000339098 CSNK1EP49674 416 aaKnown RBP20.08■□□□□ 0.81
CERKL-201ENST00000339098 THOP1P52888 689 aa20.08■□□□□ 0.81
CERKL-201ENST00000339098 TMEM115Q12893 351 aaPredicted RBP20.08■□□□□ 0.81
CERKL-201ENST00000339098 PDE1CQ14123 709 aaPredicted RBP20.08■□□□□ 0.81
CERKL-201ENST00000339098 ITIH4Q14624 930 aa20.08■□□□□ 0.81
CERKL-201ENST00000339098 EFTUD2Q15029 972 aaKnown RBP eCLIP20.08■□□□□ 0.81
CERKL-201ENST00000339098 ZNF789Q5FWF6 425 aa20.08■□□□□ 0.81
CERKL-201ENST00000339098 PACS1Q6VY07 963 aa20.08■□□□□ 0.81
CERKL-201ENST00000339098 GALNT7Q86SF2 657 aa20.08■□□□□ 0.81
CERKL-201ENST00000339098 LOXL4Q96JB6 756 aa20.08■□□□□ 0.81
CERKL-201ENST00000339098 KCNH6Q9H252 994 aa20.08■□□□□ 0.81
CERKL-201ENST00000339098 INTS10Q9NVR2 710 aaKnown RBP20.08■□□□□ 0.81
CERKL-201ENST00000339098 ATXN10Q9UBB4 475 aa20.08■□□□□ 0.81
CERKL-201ENST00000339098 SUSD2Q9UGT4 822 aa20.08■□□□□ 0.81
CERKL-201ENST00000339098 TMEM98Q9Y2Y6 226 aa20.08■□□□□ 0.81
CERKL-201ENST00000339098 RALGAPA1Q6GYQ0 2036 aa20.08■□□□□ 0.8
CERKL-201ENST00000339098 LRP4O75096 1905 aa20.08■□□□□ 0.8
CERKL-201ENST00000339098 TDRD6O60522 2096 aaKnown RBP20.07■□□□□ 0.8
CERKL-201ENST00000339098 MYO15AQ9UKN7 3530 aa20.07■□□□□ 0.8
CERKL-201ENST00000339098 PRR5-ARHGAP8B1AHC4 643 aa20.07■□□□□ 0.8
CERKL-201ENST00000339098 TLR4O00206 839 aa20.07■□□□□ 0.8
CERKL-201ENST00000339098 VILLO15195 856 aa20.07■□□□□ 0.8
CERKL-201ENST00000339098 NDUFS3O75489 264 aa20.07■□□□□ 0.8
CERKL-201ENST00000339098 H2AFXP16104 143 aaPredicted RBP20.07■□□□□ 0.8
CERKL-201ENST00000339098 GABRB3P28472 473 aa20.07■□□□□ 0.8
CERKL-201ENST00000339098 AKT1P31749 480 aa20.07■□□□□ 0.8
CERKL-201ENST00000339098 LEPRP48357 1165 aaKnown RBP20.07■□□□□ 0.8
CERKL-201ENST00000339098 MPP1Q00013 466 aa20.07■□□□□ 0.8
CERKL-201ENST00000339098 RNF187Q5TA31 235 aaPredicted RBP20.07■□□□□ 0.8
CERKL-201ENST00000339098 ADGRG6Q86SQ4 1221 aa20.07■□□□□ 0.8
CERKL-201ENST00000339098 SLC26A11Q86WA9 606 aa20.07■□□□□ 0.8
CERKL-201ENST00000339098 LRRC6Q86X45 466 aa20.07■□□□□ 0.8
CERKL-201ENST00000339098 DCP2Q8IU60 420 aaKnown RBP20.07■□□□□ 0.8
CERKL-201ENST00000339098 CTAGE3PQ8IX95 158 aa20.07■□□□□ 0.8
CERKL-201ENST00000339098 RBFAQ8N0V3 343 aa20.07■□□□□ 0.8
CERKL-201ENST00000339098 HEXDCQ8WVB3 486 aa20.07■□□□□ 0.8
CERKL-201ENST00000339098 LPGAT1Q92604 370 aa20.07■□□□□ 0.8
CERKL-201ENST00000339098 OR2AG1Q9H205 316 aa20.07■□□□□ 0.8
CERKL-201ENST00000339098 FBXO6Q9NRD1 293 aaPredicted RBP20.07■□□□□ 0.8
CERKL-201ENST00000339098 NSMCE4AQ9NXX6 385 aa20.07■□□□□ 0.8
CERKL-201ENST00000339098 VPS18Q9P253 973 aa20.07■□□□□ 0.8
CERKL-201ENST00000339098 SPTY2D1-AS1A0A0U1RR47 76 aa20.07■□□□□ 0.8
CERKL-201ENST00000339098 PFDN6O15212 129 aa20.07■□□□□ 0.8
CERKL-201ENST00000339098 HAUS5O94927 633 aa20.07■□□□□ 0.8
CERKL-201ENST00000339098 AHSGP02765 367 aa20.07■□□□□ 0.8
CERKL-201ENST00000339098 CEACAM5P06731 702 aa20.07■□□□□ 0.8
CERKL-201ENST00000339098 MSH3P20585 1137 aa20.07■□□□□ 0.8
CERKL-201ENST00000339098 HTR1BP28222 390 aa20.07■□□□□ 0.8
CERKL-201ENST00000339098 DPP6P42658 865 aa20.07■□□□□ 0.8
CERKL-201ENST00000339098 NSG1P42857 185 aa20.07■□□□□ 0.8
CERKL-201ENST00000339098 POLD2P49005 469 aa20.07■□□□□ 0.8
CERKL-201ENST00000339098 MACC1Q6ZN28 852 aa20.07■□□□□ 0.8
CERKL-201ENST00000339098 MARK2Q7KZI7 788 aaKnown RBP20.07■□□□□ 0.8
CERKL-201ENST00000339098 PPM1NQ8N819 430 aa20.07■□□□□ 0.8
CERKL-201ENST00000339098 WDR92Q96MX6 357 aa20.07■□□□□ 0.8
CERKL-201ENST00000339098 IRF2BPLQ9H1B7 796 aa20.07■□□□□ 0.8
CERKL-201ENST00000339098 RAB23Q9ULC3 237 aa20.07■□□□□ 0.8
CERKL-201ENST00000339098 VPS9D1Q9Y2B5 631 aa20.07■□□□□ 0.8
CERKL-201ENST00000339098 SLC17A4Q9Y2C5 497 aa20.07■□□□□ 0.8
CERKL-201ENST00000339098 VEGFDO43915 354 aa20.06■□□□□ 0.8
CERKL-201ENST00000339098 CDK14O94921 469 aa20.06■□□□□ 0.8
CERKL-201ENST00000339098 ASMTLO95671 621 aa20.06■□□□□ 0.8
CERKL-201ENST00000339098 FUCA1P04066 466 aa20.06■□□□□ 0.8
CERKL-201ENST00000339098 RALBP11234 206 aa20.06■□□□□ 0.8
CERKL-201ENST00000339098 ATP1B2P14415 290 aaPredicted RBP20.06■□□□□ 0.8
CERKL-201ENST00000339098 KELP23276 732 aa20.06■□□□□ 0.8
CERKL-201ENST00000339098 ADARP55265 1226 aaKnown RBP20.06■□□□□ 0.8
CERKL-201ENST00000339098 NAB1Q13506 487 aa20.06■□□□□ 0.8
CERKL-201ENST00000339098 PTK2BQ14289 1009 aa20.06■□□□□ 0.8
CERKL-201ENST00000339098 FZD2Q14332 565 aa20.06■□□□□ 0.8
CERKL-201ENST00000339098 KCTD16Q68DU8 428 aa20.06■□□□□ 0.8
CERKL-201ENST00000339098 DOK6Q6PKX4 331 aa20.06■□□□□ 0.8
CERKL-201ENST00000339098 STRA8Q7Z7C7 330 aa20.06■□□□□ 0.8
CERKL-201ENST00000339098 CLDN19Q8N6F1 224 aa20.06■□□□□ 0.8
CERKL-201ENST00000339098 RASGEF1AQ8N9B8 481 aa20.06■□□□□ 0.8
CERKL-201ENST00000339098 OR56A4Q8NGH8 313 aa20.06■□□□□ 0.8
CERKL-201ENST00000339098 NAT14Q8WUY8 206 aa20.06■□□□□ 0.8
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 65.3 ms