RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000319942.7

RABGGTB-201, Transcript of Rab geranylgeranyltransferase subunit beta, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene RABGGTB, Length 1,496 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RABGGTB-201ENST00000319942 OXSMQ9NWU1 459 aa10.04□□□□□ -0.8
RABGGTB-201ENST00000319942 GTSE1Q9NYZ3 720 aa10.04□□□□□ -0.8
RABGGTB-201ENST00000319942 CPSF2Q9P2I0 782 aaKnown RBP10.04□□□□□ -0.8
RABGGTB-201ENST00000319942 CRLS1Q9UJA2 301 aa10.04□□□□□ -0.8
RABGGTB-201ENST00000319942 MTCH2Q9Y6C9 303 aa10.04□□□□□ -0.8
RABGGTB-201ENST00000319942 USH1CQ9Y6N9 552 aa10.04□□□□□ -0.8
RABGGTB-201ENST00000319942 NOTCH4Q99466 2003 aa10.04□□□□□ -0.8
RABGGTB-201ENST00000319942 DENND4CQ5VZ89 1909 aa10.04□□□□□ -0.8
RABGGTB-201ENST00000319942 CCDC189A1A4V9 331 aa10.04□□□□□ -0.8
RABGGTB-201ENST00000319942 TSPAN11A1L157 253 aa10.04□□□□□ -0.8
RABGGTB-201ENST00000319942 NPIPB15A6NHN6 443 aaPredicted RBP10.04□□□□□ -0.8
RABGGTB-201ENST00000319942 CCT8L1PA6NM43 557 aa10.04□□□□□ -0.8
RABGGTB-201ENST00000319942 TMEM114B3SHH9 223 aa10.04□□□□□ -0.8
RABGGTB-201ENST00000319942 E5RI56 91 aa10.04□□□□□ -0.8
RABGGTB-201ENST00000319942 F8W8V4 182 aa10.04□□□□□ -0.8
RABGGTB-201ENST00000319942 G3V2L1 256 aa10.04□□□□□ -0.8
RABGGTB-201ENST00000319942 KPNA3O00505 521 aaPredicted RBP10.04□□□□□ -0.8
RABGGTB-201ENST00000319942 NPC1O15118 1278 aa10.04□□□□□ -0.8
RABGGTB-201ENST00000319942 DNAJC6O75061 913 aa10.04□□□□□ -0.8
RABGGTB-201ENST00000319942 SNNO75324 88 aaPredicted RBP10.04□□□□□ -0.8
RABGGTB-201ENST00000319942 SNUPNO95149 360 aaKnown RBP10.04□□□□□ -0.8
RABGGTB-201ENST00000319942 IGFBP4P22692 258 aa10.04□□□□□ -0.8
RABGGTB-201ENST00000319942 VIPR1P32241 457 aa10.04□□□□□ -0.8
RABGGTB-201ENST00000319942 OPRD1P41143 372 aa10.04□□□□□ -0.8
RABGGTB-201ENST00000319942 GLRBP48167 497 aa10.04□□□□□ -0.8
RABGGTB-201ENST00000319942 SLC1A6P48664 564 aa10.04□□□□□ -0.8
RABGGTB-201ENST00000319942 KDSRQ06136 332 aa10.04□□□□□ -0.8
RABGGTB-201ENST00000319942 DLX2Q07687 328 aaPredicted RBP10.04□□□□□ -0.8
RABGGTB-201ENST00000319942 ITGA9Q13797 1035 aa10.04□□□□□ -0.8
RABGGTB-201ENST00000319942 ELAVL3Q14576 367 aaKnown RBP10.04□□□□□ -0.8
RABGGTB-201ENST00000319942 PCLAFQ15004 111 aa10.04□□□□□ -0.8
RABGGTB-201ENST00000319942 SETDB1Q15047 1291 aa10.04□□□□□ -0.8
RABGGTB-201ENST00000319942 CHRNA6Q15825 494 aa10.04□□□□□ -0.8
RABGGTB-201ENST00000319942 LRRC8EQ6NSJ5 796 aa10.04□□□□□ -0.8
RABGGTB-201ENST00000319942 PSAPL1Q6NUJ1 521 aa10.04□□□□□ -0.8
RABGGTB-201ENST00000319942 ZNF549Q6P9A3 640 aa10.04□□□□□ -0.8
RABGGTB-201ENST00000319942 C6orf89Q6UWU4 347 aa10.04□□□□□ -0.8
RABGGTB-201ENST00000319942 SLCO4C1Q6ZQN7 724 aa10.04□□□□□ -0.8
RABGGTB-201ENST00000319942 ZSWIM9Q86XI8 627 aa10.04□□□□□ -0.8
RABGGTB-201ENST00000319942 SLC22A9Q8IVM8 553 aa10.04□□□□□ -0.8
RABGGTB-201ENST00000319942 RAVER1Q8IY67 606 aaKnown RBP10.04□□□□□ -0.8
RABGGTB-201ENST00000319942 SPATA6LQ8N4H0 392 aa10.04□□□□□ -0.8
RABGGTB-201ENST00000319942 GBP7Q8N8V2 638 aaPredicted RBP10.04□□□□□ -0.8
RABGGTB-201ENST00000319942 ST13P5Q8NFI4 369 aaPredicted RBP10.04□□□□□ -0.8
RABGGTB-201ENST00000319942 DTX3LQ8TDB6 740 aa10.04□□□□□ -0.8
RABGGTB-201ENST00000319942 KCNJ9Q92806 393 aa10.04□□□□□ -0.8
RABGGTB-201ENST00000319942 FGF14Q92915 247 aa10.04□□□□□ -0.8
RABGGTB-201ENST00000319942 NXPE3Q969Y0 559 aa10.04□□□□□ -0.8
RABGGTB-201ENST00000319942 ULK4Q96C45 1275 aa10.04□□□□□ -0.8
RABGGTB-201ENST00000319942 PPP1R16AQ96I34 528 aa10.04□□□□□ -0.8
RABGGTB-201ENST00000319942 GPR78Q96P69 363 aa10.04□□□□□ -0.8
RABGGTB-201ENST00000319942 SIKE1Q9BRV8 207 aa10.04□□□□□ -0.8
RABGGTB-201ENST00000319942 DYRK4Q9NR20 520 aa10.04□□□□□ -0.8
RABGGTB-201ENST00000319942 IGSF5Q9NSI5 407 aa10.04□□□□□ -0.8
RABGGTB-201ENST00000319942 EPS15L1Q9UBC2 864 aa10.04□□□□□ -0.8
RABGGTB-201ENST00000319942 B4GALT6Q9UBX8 382 aa10.04□□□□□ -0.8
RABGGTB-201ENST00000319942 TRMT6Q9UJA5 497 aaKnown RBP10.04□□□□□ -0.8
RABGGTB-201ENST00000319942 PPM1HQ9ULR3 514 aa10.04□□□□□ -0.8
RABGGTB-201ENST00000319942 OBSL1O75147 1896 aa10.03□□□□□ -0.8
RABGGTB-201ENST00000319942 TRBV5-4A0A0C4DH59 114 aa10.03□□□□□ -0.8
RABGGTB-201ENST00000319942 A0A0U1RQS6 177 aa10.03□□□□□ -0.8
RABGGTB-201ENST00000319942 A0A1W2PPC1 479 aa10.03□□□□□ -0.8
RABGGTB-201ENST00000319942 TBX10O75333 385 aa10.03□□□□□ -0.8
RABGGTB-201ENST00000319942 DCTN3O75935 186 aa10.03□□□□□ -0.8
RABGGTB-201ENST00000319942 PRSS56P0CW18 603 aa10.03□□□□□ -0.8
RABGGTB-201ENST00000319942 TPBGLP0DKB5 382 aa10.03□□□□□ -0.8
RABGGTB-201ENST00000319942 FGF3P11487 239 aaPredicted RBP10.03□□□□□ -0.8
RABGGTB-201ENST00000319942 UGT1A6P19224 532 aa10.03□□□□□ -0.8
RABGGTB-201ENST00000319942 UGT1A1P22309 533 aa10.03□□□□□ -0.8
RABGGTB-201ENST00000319942 UGT1A4P22310 534 aa10.03□□□□□ -0.8
RABGGTB-201ENST00000319942 RPS3P23396 243 aaKnown RBP eCLIP10.03□□□□□ -0.8
RABGGTB-201ENST00000319942 ATP5F1P24539 256 aaPredicted RBP10.03□□□□□ -0.8
RABGGTB-201ENST00000319942 UGT1A3P35503 534 aa10.03□□□□□ -0.8
RABGGTB-201ENST00000319942 UGT1A5P35504 534 aa10.03□□□□□ -0.8
RABGGTB-201ENST00000319942 LTBRP36941 435 aa10.03□□□□□ -0.8
RABGGTB-201ENST00000319942 TNFRSF4P43489 277 aa10.03□□□□□ -0.8
RABGGTB-201ENST00000319942 SPINT3P49223 89 aa10.03□□□□□ -0.8
RABGGTB-201ENST00000319942 CDKN1CP49918 316 aaPredicted RBP10.03□□□□□ -0.8
RABGGTB-201ENST00000319942 ABCE1P61221 599 aaKnown RBP10.03□□□□□ -0.8
RABGGTB-201ENST00000319942 ATP6V0D1P61421 351 aa10.03□□□□□ -0.8
RABGGTB-201ENST00000319942 OCRLQ01968 901 aa10.03□□□□□ -0.8
RABGGTB-201ENST00000319942 CCDC15Q0P6D6 951 aa10.03□□□□□ -0.8
RABGGTB-201ENST00000319942 ELP6Q0PNE2 266 aa10.03□□□□□ -0.8
RABGGTB-201ENST00000319942 SF3A3Q12874 501 aaKnown RBP eCLIP10.03□□□□□ -0.85e-13■■■■■ 31.1
RABGGTB-201ENST00000319942 ZNF234Q14588 700 aa10.03□□□□□ -0.8
RABGGTB-201ENST00000319942 ZNF460Q14592 562 aa10.03□□□□□ -0.8
RABGGTB-201ENST00000319942 C9orf64Q5T6V5 341 aa10.03□□□□□ -0.8
RABGGTB-201ENST00000319942 FAM46CQ5VWP2 391 aa10.03□□□□□ -0.8
RABGGTB-201ENST00000319942 LIPMQ5VYY2 423 aa10.03□□□□□ -0.8
RABGGTB-201ENST00000319942 PTRHD1Q6GMV3 140 aaKnown RBP10.03□□□□□ -0.8
RABGGTB-201ENST00000319942 FBXL19Q6PCT2 694 aa10.03□□□□□ -0.8
RABGGTB-201ENST00000319942 TRPM8Q7Z2W7 1104 aa10.03□□□□□ -0.8
RABGGTB-201ENST00000319942 TSPAN33Q86UF1 283 aa10.03□□□□□ -0.8
RABGGTB-201ENST00000319942 SERPINA9Q86WD7 417 aa10.03□□□□□ -0.8
RABGGTB-201ENST00000319942 WDR75Q8IWA0 830 aaKnown RBP10.03□□□□□ -0.8
RABGGTB-201ENST00000319942 PHTF2Q8N3S3 785 aa10.03□□□□□ -0.8
RABGGTB-201ENST00000319942 PNPLA1Q8N8W4 532 aa10.03□□□□□ -0.8
RABGGTB-201ENST00000319942 GPR26Q8NDV2 337 aa10.03□□□□□ -0.8
RABGGTB-201ENST00000319942 STAG3L4Q8TBR4 150 aa10.03□□□□□ -0.8
RABGGTB-201ENST00000319942 VOPP1Q96AW1 172 aa10.03□□□□□ -0.8
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 119.2 ms