RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000278833.3

ROM1-201, Transcript of retinal outer segment membrane protein 1, humanhuman

APPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC

Gene ROM1, Length 1,878 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ROM1-201ENST00000278833 C19orf43Q9BQ61 176 aa24.85■■□□□ 1.57
ROM1-201ENST00000278833 PCDHGB4Q9UN71 923 aa24.85■■□□□ 1.57
ROM1-201ENST00000278833 DMTF1Q9Y222 760 aa24.85■■□□□ 1.57
ROM1-201ENST00000278833 PCDHGB5Q9Y5G0 923 aa24.85■■□□□ 1.57
ROM1-201ENST00000278833 EEDO75530 441 aaKnown RBP24.85■■□□□ 1.57
ROM1-201ENST00000278833 RHOCP08134 193 aa24.85■■□□□ 1.57
ROM1-201ENST00000278833 PRSS56P0CW18 603 aa24.85■■□□□ 1.57
ROM1-201ENST00000278833 SLC8B1Q6J4K2 584 aa24.85■■□□□ 1.57
ROM1-201ENST00000278833 TTC30BQ8N4P2 665 aa24.85■■□□□ 1.57
ROM1-201ENST00000278833 METTL25Q8N6Q8 603 aa24.85■■□□□ 1.57
ROM1-201ENST00000278833 SNX31Q8N9S9 440 aa24.85■■□□□ 1.57
ROM1-201ENST00000278833 OR56A4Q8NGH8 313 aa24.85■■□□□ 1.57
ROM1-201ENST00000278833 RMDN1Q96DB5 314 aa24.85■■□□□ 1.57
ROM1-201ENST00000278833 KCNA7Q96RP8 456 aa24.85■■□□□ 1.57
ROM1-201ENST00000278833 TTPALQ9BTX7 342 aa24.85■■□□□ 1.57
ROM1-201ENST00000278833 ADGRE3Q9BY15 652 aa24.85■■□□□ 1.57
ROM1-201ENST00000278833 CMTM6Q9NX76 183 aa24.85■■□□□ 1.57
ROM1-201ENST00000278833 ZIM2Q9NZV7 527 aa24.85■■□□□ 1.57
ROM1-201ENST00000278833 HSFX1Q9UBD0 423 aa24.85■■□□□ 1.57
ROM1-201ENST00000278833 RNF11Q9Y3C5 154 aa24.85■■□□□ 1.57
ROM1-201ENST00000278833 PTGDR2Q9Y5Y4 395 aa24.85■■□□□ 1.57
ROM1-201ENST00000278833 EFEMP2O95967 443 aa24.84■■□□□ 1.57
ROM1-201ENST00000278833 CHEK2O96017 543 aa24.84■■□□□ 1.57
ROM1-201ENST00000278833 NPPAP01160 153 aa24.84■■□□□ 1.57
ROM1-201ENST00000278833 CYBBP04839 570 aa24.84■■□□□ 1.57
ROM1-201ENST00000278833 GPIP06744 558 aa24.84■■□□□ 1.57
ROM1-201ENST00000278833 ZFP36L2P47974 494 aaKnown RBP24.84■■□□□ 1.57
ROM1-201ENST00000278833 FXNQ16595 210 aa24.84■■□□□ 1.57
ROM1-201ENST00000278833 PTPRNQ16849 979 aa24.84■■□□□ 1.57
ROM1-201ENST00000278833 NADK2Q4G0N4 442 aa24.84■■□□□ 1.57
ROM1-201ENST00000278833 CTSL3PQ5NE16 218 aa24.84■■□□□ 1.57
ROM1-201ENST00000278833 PRR23BQ6ZRT6 265 aa24.84■■□□□ 1.57
ROM1-201ENST00000278833 PDLIM5Q96HC4 596 aaKnown RBP24.84■■□□□ 1.57
ROM1-201ENST00000278833 ZNF382Q96SR6 550 aa24.84■■□□□ 1.57
ROM1-201ENST00000278833 HAUS8Q9BT25 410 aa24.84■■□□□ 1.57
ROM1-201ENST00000278833 TRMT6Q9UJA5 497 aaKnown RBP24.84■■□□□ 1.57
ROM1-201ENST00000278833 SNX13Q9Y5W8 968 aa24.84■■□□□ 1.57
ROM1-201ENST00000278833 CDC7O00311 574 aa24.83■■□□□ 1.57
ROM1-201ENST00000278833 VILLO15195 856 aa24.83■■□□□ 1.57
ROM1-201ENST00000278833 TUFMP49411 452 aaKnown RBP24.83■■□□□ 1.57
ROM1-201ENST00000278833 HECTD3Q5T447 861 aa24.83■■□□□ 1.57
ROM1-201ENST00000278833 CYP2R1Q6VVX0 501 aa24.83■■□□□ 1.57
ROM1-201ENST00000278833 SYVN1Q86TM6 617 aa24.83■■□□□ 1.57
ROM1-201ENST00000278833 CRIPAKQ8N1N5 446 aa24.83■■□□□ 1.57
ROM1-201ENST00000278833 STK40Q8N2I9 435 aa24.83■■□□□ 1.57
ROM1-201ENST00000278833 CD200R1Q8TD46 325 aa24.83■■□□□ 1.57
ROM1-201ENST00000278833 GIPC2Q8TF65 315 aa24.83■■□□□ 1.57
ROM1-201ENST00000278833 SLC39A3Q9BRY0 314 aa24.83■■□□□ 1.57
ROM1-201ENST00000278833 PNPLA3Q9NST1 481 aa24.83■■□□□ 1.57
ROM1-201ENST00000278833 NUDT4Q9NZJ9 180 aa24.83■■□□□ 1.57
ROM1-201ENST00000278833 MTRRQ9UBK8 725 aa24.83■■□□□ 1.57
ROM1-201ENST00000278833 FAM50BQ9Y247 325 aa24.83■■□□□ 1.57
ROM1-201ENST00000278833 RAI2Q9Y5P3 530 aa24.83■■□□□ 1.57
ROM1-201ENST00000278833 ST14Q9Y5Y6 855 aa24.83■■□□□ 1.57
ROM1-201ENST00000278833 ZNF106Q9H2Y7 1883 aaKnown RBP24.83■■□□□ 1.57
ROM1-201ENST00000278833 ZNF559-ZNF177A0A0A6YYI6 481 aaPredicted RBP24.83■■□□□ 1.56
ROM1-201ENST00000278833 DHRS12A0PJE2 317 aa24.83■■□□□ 1.56
ROM1-201ENST00000278833 ZNF840PA6NDX5 716 aa24.83■■□□□ 1.56
ROM1-201ENST00000278833 NPEPPSL1A6NEC2 478 aa24.83■■□□□ 1.56
ROM1-201ENST00000278833 ZNF839A8K0R7 811 aa24.83■■□□□ 1.56
ROM1-201ENST00000278833 ESR1P03372 595 aa24.83■■□□□ 1.56
ROM1-201ENST00000278833 GALTP07902 379 aa24.83■■□□□ 1.56
ROM1-201ENST00000278833 GRIA3P42263 894 aa24.83■■□□□ 1.56
ROM1-201ENST00000278833 SCNN1BP51168 640 aa24.83■■□□□ 1.56
ROM1-201ENST00000278833 ZNF177Q13360 481 aaPredicted RBP24.83■■□□□ 1.56
ROM1-201ENST00000278833 GK3PQ14409 553 aa24.83■■□□□ 1.56
ROM1-201ENST00000278833 SLC5A9Q2M3M2 681 aa24.83■■□□□ 1.56
ROM1-201ENST00000278833 VPS26BQ4G0F5 336 aa24.83■■□□□ 1.56
ROM1-201ENST00000278833 NPAS4Q8IUM7 802 aa24.83■■□□□ 1.56
ROM1-201ENST00000278833 CANT1Q8WVQ1 401 aa24.83■■□□□ 1.56
ROM1-201ENST00000278833 TMEM125Q96AQ2 219 aa24.83■■□□□ 1.56
ROM1-201ENST00000278833 PRPF18Q99633 342 aaKnown RBP24.83■■□□□ 1.56
ROM1-201ENST00000278833 AGPAT4Q9NRZ5 378 aa24.83■■□□□ 1.56
ROM1-201ENST00000278833 STOML2Q9UJZ1 356 aa24.83■■□□□ 1.56
ROM1-201ENST00000278833 APPL1Q9UKG1 709 aa24.83■■□□□ 1.56
ROM1-201ENST00000278833 BACE2Q9Y5Z0 518 aa24.83■■□□□ 1.56
ROM1-201ENST00000278833 ACTL7AQ9Y615 435 aa24.83■■□□□ 1.56
ROM1-201ENST00000278833 CEP290O15078 2479 aa24.82■■□□□ 1.56
ROM1-201ENST00000278833 KIAA1671Q9BY89 1806 aa24.82■■□□□ 1.56
ROM1-201ENST00000278833 PDE4DIPQ5VU43 2346 aa24.82■■□□□ 1.56
ROM1-201ENST00000278833 HTRA2O43464 458 aaPredicted RBP24.82■■□□□ 1.56
ROM1-201ENST00000278833 LINC00032P0C843 101 aa24.82■■□□□ 1.56
ROM1-201ENST00000278833 FCGR1AP12314 374 aa24.82■■□□□ 1.56
ROM1-201ENST00000278833 PTGER3P43115 390 aa24.82■■□□□ 1.56
ROM1-201ENST00000278833 EEFSECP57772 596 aaKnown RBP24.82■■□□□ 1.56
ROM1-201ENST00000278833 RPS24P62847 133 aaKnown RBP24.82■■□□□ 1.56
ROM1-201ENST00000278833 ERVK-8P63133 956 aa24.82■■□□□ 1.56
ROM1-201ENST00000278833 RPS6KA2Q15349 733 aa24.82■■□□□ 1.56
ROM1-201ENST00000278833 UGT3A1Q6NUS8 523 aa24.82■■□□□ 1.56
ROM1-201ENST00000278833 HM13Q8TCT9 377 aa24.82■■□□□ 1.56
ROM1-201ENST00000278833 MYRFLQ96LU7 910 aa24.82■■□□□ 1.56
ROM1-201ENST00000278833 SPON2Q9BUD6 331 aa24.82■■□□□ 1.56
ROM1-201ENST00000278833 SEMA6AQ9H2E6 1030 aa24.82■■□□□ 1.56
ROM1-201ENST00000278833 RIC8BQ9NVN3 520 aa24.82■■□□□ 1.56
ROM1-201ENST00000278833 DUS2Q9NX74 493 aaKnown RBP24.82■■□□□ 1.56
ROM1-201ENST00000278833 ANKRD66B4E2M5 251 aa24.81■■□□□ 1.56
ROM1-201ENST00000278833 BTN3A1O00481 513 aa24.81■■□□□ 1.56
ROM1-201ENST00000278833 CRCPO75575 148 aa24.81■■□□□ 1.56
ROM1-201ENST00000278833 STC2O76061 302 aa24.81■■□□□ 1.56
ROM1-201ENST00000278833 LATS1O95835 1130 aa24.81■■□□□ 1.56
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 34.5 ms