RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000273261.7

LRIG1-201, Transcript of leucine rich repeats and immunoglobulin like domains 1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene LRIG1, Length 5,273 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRIG1-201ENST00000273261 TMEM175Q9BSA9 504 aa20.23■□□□□ 0.83
LRIG1-201ENST00000273261 KLHL1Q9NR64 748 aa20.23■□□□□ 0.83
LRIG1-201ENST00000273261 CRNNQ9UBG3 495 aaPredicted RBP20.23■□□□□ 0.83
LRIG1-201ENST00000273261 HNF4AP41235 474 aa20.23■□□□□ 0.83
LRIG1-201ENST00000273261 DCTN2Q13561 401 aaKnown RBP20.23■□□□□ 0.83
LRIG1-201ENST00000273261 GRB14Q14449 540 aa20.23■□□□□ 0.83
LRIG1-201ENST00000273261 KBTBD8Q8NFY9 601 aa20.23■□□□□ 0.83
LRIG1-201ENST00000273261 TSSK3Q96PN8 268 aa20.23■□□□□ 0.83
LRIG1-201ENST00000273261 UNC93B1Q9H1C4 597 aa20.23■□□□□ 0.83
LRIG1-201ENST00000273261 NOL11Q9H8H0 719 aaKnown RBP20.23■□□□□ 0.83
LRIG1-201ENST00000273261 EXD2Q9NVH0 621 aa20.23■□□□□ 0.83
LRIG1-201ENST00000273261 ETAA1Q9NY74 926 aa20.23■□□□□ 0.83
LRIG1-201ENST00000273261 ATP6V1HQ9UI12 483 aa20.23■□□□□ 0.83
LRIG1-201ENST00000273261 LRP6O75581 1613 aa20.23■□□□□ 0.83
LRIG1-201ENST00000273261 TBC1D3DA0A087WVF3 549 aa20.23■□□□□ 0.83
LRIG1-201ENST00000273261 TBC1D3IA0A087WXS9 549 aa20.23■□□□□ 0.83
LRIG1-201ENST00000273261 TBC1D3EA0A087X179 549 aa20.23■□□□□ 0.83
LRIG1-201ENST00000273261 TBC1D3KA0A087X1G2 549 aa20.23■□□□□ 0.83
LRIG1-201ENST00000273261 A0A0U1RQF3 1178 aa20.23■□□□□ 0.83
LRIG1-201ENST00000273261 TBC1D3FA6NER0 549 aaPredicted RBP20.23■□□□□ 0.83
LRIG1-201ENST00000273261 TBC1D3LB9A6J9 549 aa20.23■□□□□ 0.83
LRIG1-201ENST00000273261 TBC1D3HP0C7X1 549 aa20.23■□□□□ 0.83
LRIG1-201ENST00000273261 MANFP55145 182 aaKnown RBP20.23■□□□□ 0.83
LRIG1-201ENST00000273261 TBC1D3GQ6DHY5 549 aa20.23■□□□□ 0.83
LRIG1-201ENST00000273261 TBC1D3CQ6IPX1 549 aa20.23■□□□□ 0.83
LRIG1-201ENST00000273261 ARHGAP22Q7Z5H3 698 aa20.23■□□□□ 0.83
LRIG1-201ENST00000273261 TBC1D3Q8IZP1 549 aaPredicted RBP20.23■□□□□ 0.83
LRIG1-201ENST00000273261 ZNF540Q8NDQ6 660 aa20.23■□□□□ 0.83
LRIG1-201ENST00000273261 TTLL2Q9BWV7 592 aa20.23■□□□□ 0.83
LRIG1-201ENST00000273261 ADGRE2Q9UHX3 823 aa20.23■□□□□ 0.83
LRIG1-201ENST00000273261 ERGIC3Q9Y282 383 aa20.23■□□□□ 0.83
LRIG1-201ENST00000273261 SNX10Q9Y5X0 201 aa20.23■□□□□ 0.83
LRIG1-201ENST00000273261 ARFGEF2Q9Y6D5 1785 aa20.23■□□□□ 0.83
LRIG1-201ENST00000273261 GSAPA4D1B5 854 aa20.22■□□□□ 0.83
LRIG1-201ENST00000273261 NEK5Q6P3R8 708 aa20.22■□□□□ 0.83
LRIG1-201ENST00000273261 ARL14EPQ8N8R7 260 aaPredicted RBP20.22■□□□□ 0.83
LRIG1-201ENST00000273261 IMP3Q9NV31 184 aaKnown RBP20.22■□□□□ 0.83
LRIG1-201ENST00000273261 SLC18A1P54219 525 aa20.22■□□□□ 0.83
LRIG1-201ENST00000273261 ALG11Q2TAA5 492 aa20.22■□□□□ 0.83
LRIG1-201ENST00000273261 MZT2AQ6P582 158 aa20.22■□□□□ 0.83
LRIG1-201ENST00000273261 FSTL5Q8N475 847 aaPredicted RBP20.22■□□□□ 0.83
LRIG1-201ENST00000273261 ACDQ96AP0 544 aa20.22■□□□□ 0.83
LRIG1-201ENST00000273261 MFSD1Q9H3U5 465 aa20.22■□□□□ 0.83
LRIG1-201ENST00000273261 BMP7P18075 431 aa20.22■□□□□ 0.83
LRIG1-201ENST00000273261 NSG1P42857 185 aa20.22■□□□□ 0.83
LRIG1-201ENST00000273261 CAP1Q01518 475 aa20.22■□□□□ 0.83
LRIG1-201ENST00000273261 CRHR2Q13324 411 aa20.22■□□□□ 0.83
LRIG1-201ENST00000273261 GTF2H2Q13888 395 aa20.22■□□□□ 0.83
LRIG1-201ENST00000273261 DGCR6Q14129 220 aa20.22■□□□□ 0.83
LRIG1-201ENST00000273261 KCTD19Q17RG1 926 aaPredicted RBP20.22■□□□□ 0.83
LRIG1-201ENST00000273261 SH3PXD2AQ5TCZ1 1133 aa20.22■□□□□ 0.83
LRIG1-201ENST00000273261 GTF2H2CQ6P1K8 395 aa20.22■□□□□ 0.83
LRIG1-201ENST00000273261 TMPRSS11BQ86T26 416 aa20.22■□□□□ 0.83
LRIG1-201ENST00000273261 ANKRD49Q8WVL7 239 aa20.22■□□□□ 0.83
LRIG1-201ENST00000273261 BCAS3Q9H6U6 928 aa20.22■□□□□ 0.83
LRIG1-201ENST00000273261 POLR1BQ9H9Y6 1135 aa20.22■□□□□ 0.83
LRIG1-201ENST00000273261 CCNYL3P0C7X3 344 aa20.22■□□□□ 0.83
LRIG1-201ENST00000273261 PRPS2P11908 318 aa20.22■□□□□ 0.83
LRIG1-201ENST00000273261 IL1R2P27930 398 aa20.22■□□□□ 0.83
LRIG1-201ENST00000273261 GAD2Q05329 585 aa20.22■□□□□ 0.83
LRIG1-201ENST00000273261 INCA1Q0VD86 236 aa20.22■□□□□ 0.83
LRIG1-201ENST00000273261 NCBP2-AS2Q69YL0 99 aa20.22■□□□□ 0.83
LRIG1-201ENST00000273261 MINDY3Q9H8M7 445 aa20.22■□□□□ 0.83
LRIG1-201ENST00000273261 NMUR1Q9HB89 426 aa20.22■□□□□ 0.83
LRIG1-201ENST00000273261 TRPS1Q9UHF7 1281 aa20.22■□□□□ 0.83
LRIG1-201ENST00000273261 METTL18O95568 372 aa20.21■□□□□ 0.83
LRIG1-201ENST00000273261 ATXN1P54253 815 aaKnown RBP20.21■□□□□ 0.83
LRIG1-201ENST00000273261 TCEAL1Q15170 157 aa20.21■□□□□ 0.83
LRIG1-201ENST00000273261 COMMD3-BMI1R4GMX3 469 aa20.21■□□□□ 0.83
LRIG1-201ENST00000273261 OR10H3O60404 316 aa20.21■□□□□ 0.83
LRIG1-201ENST00000273261 ATAT1Q5SQI0 421 aa20.21■□□□□ 0.83
LRIG1-201ENST00000273261 CACTIN-AS1Q8N1I8 211 aa20.21■□□□□ 0.83
LRIG1-201ENST00000273261 WFIKKN2Q8TEU8 576 aa20.21■□□□□ 0.83
LRIG1-201ENST00000273261 SPACA7Q96KW9 195 aa20.21■□□□□ 0.83
LRIG1-201ENST00000273261 SLC28A3Q9HAS3 691 aa20.21■□□□□ 0.83
LRIG1-201ENST00000273261 TMEM59LQ9UK28 342 aa20.21■□□□□ 0.83
LRIG1-201ENST00000273261 GLYATQ6IB77 296 aa20.21■□□□□ 0.83
LRIG1-201ENST00000273261 LDB1Q86U70 411 aaPredicted RBP20.21■□□□□ 0.83
LRIG1-201ENST00000273261 SLC35F5Q8WV83 523 aa20.21■□□□□ 0.83
LRIG1-201ENST00000273261 FKBPLQ9UIM3 349 aa20.21■□□□□ 0.83
LRIG1-201ENST00000273261 PCDHGB3Q9Y5G1 929 aa20.21■□□□□ 0.83
LRIG1-201ENST00000273261 G3V2T6 193 aa20.21■□□□□ 0.83
LRIG1-201ENST00000273261 ZNF792Q3KQV3 632 aa20.21■□□□□ 0.83
LRIG1-201ENST00000273261 DCAF12L1Q5VU92 463 aa20.21■□□□□ 0.83
LRIG1-201ENST00000273261 IL23RQ5VWK5 629 aa20.21■□□□□ 0.83
LRIG1-201ENST00000273261 FAM92BQ6ZTR7 304 aa20.21■□□□□ 0.83
LRIG1-201ENST00000273261 TFB2MQ9H5Q4 396 aaKnown RBP20.21■□□□□ 0.83
LRIG1-201ENST00000273261 DUS2Q9NX74 493 aaKnown RBP20.21■□□□□ 0.83
LRIG1-201ENST00000273261 FCF1Q9Y324 198 aaKnown RBP20.21■□□□□ 0.83
LRIG1-201ENST00000273261 SLC28A2O43868 658 aa20.2■□□□□ 0.82
LRIG1-201ENST00000273261 OR6B1O95007 311 aa20.2■□□□□ 0.82
LRIG1-201ENST00000273261 TAS2R39P59534 338 aa20.2■□□□□ 0.82
LRIG1-201ENST00000273261 JAG1P78504 1218 aa20.2■□□□□ 0.82
LRIG1-201ENST00000273261 SYPL2Q5VXT5 272 aa20.2■□□□□ 0.82
LRIG1-201ENST00000273261 CIR1Q86X95 450 aaPredicted RBP20.2■□□□□ 0.82
LRIG1-201ENST00000273261 TNKS2Q9H2K2 1166 aa20.2■□□□□ 0.82
LRIG1-201ENST00000273261 LYVE1Q9Y5Y7 322 aa20.2■□□□□ 0.82
LRIG1-201ENST00000273261 LIN7AO14910 233 aaPredicted RBP20.2■□□□□ 0.82
LRIG1-201ENST00000273261 F2P00734 622 aa20.2■□□□□ 0.82
LRIG1-201ENST00000273261 NUP62P37198 522 aaPredicted RBP20.2■□□□□ 0.82
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 30.3 ms