RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000261889.9

SNX1-201, Transcript of sorting nexin 1, humanhuman

TSL 2 BASIC

Gene SNX1, Length 3,373 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNX1-201ENST00000261889 OAS3Q9Y6K5 1087 aaKnown RBP12.9□□□□□ -0.34
SNX1-201ENST00000261889 ASB14A6NK59 587 aa12.89□□□□□ -0.35
SNX1-201ENST00000261889 MUSKO15146 869 aa12.89□□□□□ -0.35
SNX1-201ENST00000261889 HS6ST1O60243 411 aa12.89□□□□□ -0.35
SNX1-201ENST00000261889 CAPN15O75808 1086 aa12.89□□□□□ -0.35
SNX1-201ENST00000261889 MMP3P08254 477 aa12.89□□□□□ -0.35
SNX1-201ENST00000261889 IMPDH1P20839 514 aa12.89□□□□□ -0.35
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SNX1-201ENST00000261889 SERPINH1P50454 418 aaKnown RBP12.89□□□□□ -0.35
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SNX1-201ENST00000261889 SIRPB2Q5JXA9 342 aa12.89□□□□□ -0.35
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SNX1-201ENST00000261889 GLYATQ6IB77 296 aa12.89□□□□□ -0.35
SNX1-201ENST00000261889 DTWD1Q8N5C7 304 aa12.89□□□□□ -0.35
SNX1-201ENST00000261889 TMEM125Q96AQ2 219 aa12.89□□□□□ -0.35
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SNX1-201ENST00000261889 DNAJC25-GNG10A0A024R161 153 aa12.89□□□□□ -0.35
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SNX1-201ENST00000261889 CTU2Q2VPK5 515 aaKnown RBP12.89□□□□□ -0.35
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SNX1-201ENST00000261889 IKZF5Q9H5V7 419 aa12.89□□□□□ -0.35
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SNX1-201ENST00000261889 ZNF225Q9UK10 706 aa12.89□□□□□ -0.35
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SNX1-201ENST00000261889 PAMP19021 973 aa12.89□□□□□ -0.35
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SNX1-201ENST00000261889 OR10T2Q8NGX3 314 aa12.89□□□□□ -0.35
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SNX1-201ENST00000261889 C9orf16Q9BUW7 83 aa12.89□□□□□ -0.35
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SNX1-201ENST00000261889 FUNDC2Q9BWH2 189 aa12.89□□□□□ -0.35
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SNX1-201ENST00000261889 DFNA5O60443 496 aa12.88□□□□□ -0.35
SNX1-201ENST00000261889 E2F6O75461 281 aa12.88□□□□□ -0.35
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SNX1-201ENST00000261889 EFEMP1Q12805 493 aa12.88□□□□□ -0.35
SNX1-201ENST00000261889 RAP1GAP2Q684P5 730 aa12.88□□□□□ -0.35
SNX1-201ENST00000261889 ALKAL1Q6UXT8 129 aa12.88□□□□□ -0.35
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SNX1-201ENST00000261889 IFNL1Q8IU54 200 aa12.88□□□□□ -0.35
SNX1-201ENST00000261889 KCNN1Q92952 543 aa12.88□□□□□ -0.35
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SNX1-201ENST00000261889 PDHXO00330 501 aa12.88□□□□□ -0.35
SNX1-201ENST00000261889 CD4P01730 458 aa12.88□□□□□ -0.35
SNX1-201ENST00000261889 FTH1P02794 183 aa12.88□□□□□ -0.35
SNX1-201ENST00000261889 CD1DP15813 335 aa12.88□□□□□ -0.35
SNX1-201ENST00000261889 HMGCS1Q01581 520 aa12.88□□□□□ -0.35
SNX1-201ENST00000261889 GSTM4Q03013 218 aa12.88□□□□□ -0.35
SNX1-201ENST00000261889 ADRM1Q16186 407 aa12.88□□□□□ -0.35
SNX1-201ENST00000261889 CCL15Q16663 113 aa12.88□□□□□ -0.35
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