RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000261177.9

TSPAN11-201, Transcript of tetraspanin 11, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene TSPAN11, Length 5,505 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TSPAN11-201ENST00000261177 CLCQ05315 142 aa14.73□□□□□ -0.05
TSPAN11-201ENST00000261177 ZFP69Q49AA0 526 aa14.73□□□□□ -0.05
TSPAN11-201ENST00000261177 GALNT15Q8N3T1 639 aa14.73□□□□□ -0.05
TSPAN11-201ENST00000261177 PNPT1Q8TCS8 783 aaKnown RBP14.73□□□□□ -0.05
TSPAN11-201ENST00000261177 NDRG1Q92597 394 aaKnown RBP14.73□□□□□ -0.05
TSPAN11-201ENST00000261177 FERD3LQ96RJ6 166 aa14.73□□□□□ -0.05
TSPAN11-201ENST00000261177 GPR21Q99679 349 aa14.73□□□□□ -0.05
TSPAN11-201ENST00000261177 AARSD1Q9BTE6 412 aaKnown RBP14.73□□□□□ -0.05
TSPAN11-201ENST00000261177 RACGAP1Q9H0H5 632 aa14.73□□□□□ -0.05
TSPAN11-201ENST00000261177 GNEQ9Y223 722 aaKnown RBP14.73□□□□□ -0.05
TSPAN11-201ENST00000261177 LMO7Q8WWI1 1683 aa14.73□□□□□ -0.05
TSPAN11-201ENST00000261177 KCNU1A8MYU2 1149 aa14.73□□□□□ -0.05
TSPAN11-201ENST00000261177 M0R2N6 131 aa14.73□□□□□ -0.05
TSPAN11-201ENST00000261177 GNA12Q03113 381 aa14.73□□□□□ -0.05
TSPAN11-201ENST00000261177 CBX2Q14781 532 aaPredicted RBP14.73□□□□□ -0.05
TSPAN11-201ENST00000261177 DPYSL2Q16555 572 aa14.73□□□□□ -0.05
TSPAN11-201ENST00000261177 COMMD2Q86X83 199 aa14.73□□□□□ -0.05
TSPAN11-201ENST00000261177 CCDC36Q8IYA8 594 aa14.73□□□□□ -0.05
TSPAN11-201ENST00000261177 MFSD3Q96ES6 412 aa14.73□□□□□ -0.05
TSPAN11-201ENST00000261177 KLHL32Q96NJ5 620 aa14.73□□□□□ -0.05
TSPAN11-201ENST00000261177 RBM4BQ9BQ04 359 aaKnown RBP14.73□□□□□ -0.05
TSPAN11-201ENST00000261177 RBM4Q9BWF3 364 aaKnown RBP14.73□□□□□ -0.05
TSPAN11-201ENST00000261177 C3orf14Q9HBI5 128 aa14.73□□□□□ -0.05
TSPAN11-201ENST00000261177 NFKBIL1Q9UBC1 381 aaPredicted RBP14.73□□□□□ -0.05
TSPAN11-201ENST00000261177 MKL2Q9ULH7 1088 aa14.73□□□□□ -0.05
TSPAN11-201ENST00000261177 PLK4O00444 970 aa14.73□□□□□ -0.05
TSPAN11-201ENST00000261177 CCNKO75909 580 aa14.73□□□□□ -0.05
TSPAN11-201ENST00000261177 CLDN9O95484 217 aa14.73□□□□□ -0.05
TSPAN11-201ENST00000261177 KIR3DL1P43629 444 aa14.73□□□□□ -0.05
TSPAN11-201ENST00000261177 MPP1Q00013 466 aa14.73□□□□□ -0.05
TSPAN11-201ENST00000261177 DSC2Q02487 901 aa14.73□□□□□ -0.05
TSPAN11-201ENST00000261177 REP15Q6BDI9 236 aa14.73□□□□□ -0.05
TSPAN11-201ENST00000261177 C17orf64Q86WR6 236 aa14.73□□□□□ -0.05
TSPAN11-201ENST00000261177 C2orf15Q8WU43 125 aaKnown RBP14.73□□□□□ -0.05
TSPAN11-201ENST00000261177 AGAP2Q99490 1192 aa14.73□□□□□ -0.05
TSPAN11-201ENST00000261177 SEMA3GQ9NS98 782 aa14.73□□□□□ -0.05
TSPAN11-201ENST00000261177 TRMT13Q9NUP7 481 aaKnown RBP14.73□□□□□ -0.05
TSPAN11-201ENST00000261177 TRNAU1APQ9NX07 287 aaKnown RBP14.73□□□□□ -0.05
TSPAN11-201ENST00000261177 A0A1B0GVM2 712 aa14.72□□□□□ -0.05
TSPAN11-201ENST00000261177 TCAF2A6NFQ2 919 aa14.72□□□□□ -0.05
TSPAN11-201ENST00000261177 A8MUI8 341 aa14.72□□□□□ -0.05
TSPAN11-201ENST00000261177 OR10H2O60403 315 aa14.72□□□□□ -0.05
TSPAN11-201ENST00000261177 VNN1O95497 513 aa14.72□□□□□ -0.05
TSPAN11-201ENST00000261177 GPIP06744 558 aa14.72□□□□□ -0.05
TSPAN11-201ENST00000261177 OGNP20774 298 aaKnown RBP14.72□□□□□ -0.05
TSPAN11-201ENST00000261177 ARMCX6Q7L4S7 300 aa14.72□□□□□ -0.05
TSPAN11-201ENST00000261177 MINDY2Q8NBR6 621 aa14.72□□□□□ -0.05
TSPAN11-201ENST00000261177 TRIT1Q9H3H1 467 aaKnown RBP14.72□□□□□ -0.05
TSPAN11-201ENST00000261177 VIRMAQ69YN4 1812 aaKnown RBP14.72□□□□□ -0.05
TSPAN11-201ENST00000261177 PER2O15055 1255 aa14.72□□□□□ -0.05
TSPAN11-201ENST00000261177 SLC7A4O43246 635 aa14.72□□□□□ -0.05
TSPAN11-201ENST00000261177 CLK3P49761 638 aaKnown RBP14.72□□□□□ -0.05
TSPAN11-201ENST00000261177 FLT3LGP49771 235 aa14.72□□□□□ -0.05
TSPAN11-201ENST00000261177 ALG11Q2TAA5 492 aa14.72□□□□□ -0.05
TSPAN11-201ENST00000261177 SLC10A6Q3KNW5 377 aa14.72□□□□□ -0.05
TSPAN11-201ENST00000261177 POM121L1PQ3SYA9 428 aa14.72□□□□□ -0.05
TSPAN11-201ENST00000261177 NOL9Q5SY16 702 aaKnown RBP14.72□□□□□ -0.05
TSPAN11-201ENST00000261177 PIK3C3Q8NEB9 887 aa14.72□□□□□ -0.05
TSPAN11-201ENST00000261177 PCDH19Q8TAB3 1148 aa14.72□□□□□ -0.05
TSPAN11-201ENST00000261177 PLD4Q96BZ4 506 aa14.72□□□□□ -0.05
TSPAN11-201ENST00000261177 PTGFRNQ9P2B2 879 aa14.72□□□□□ -0.05
TSPAN11-201ENST00000261177 IFT80Q9P2H3 777 aaPredicted RBP14.72□□□□□ -0.05
TSPAN11-201ENST00000261177 ATRNL1Q5VV63 1379 aa14.72□□□□□ -0.05
TSPAN11-201ENST00000261177 GSAPA4D1B5 854 aa14.72□□□□□ -0.05
TSPAN11-201ENST00000261177 FGBP02675 491 aa14.72□□□□□ -0.05
TSPAN11-201ENST00000261177 AP1S1P61966 158 aa14.72□□□□□ -0.05
TSPAN11-201ENST00000261177 PUDPQ08623 228 aa14.72□□□□□ -0.05
TSPAN11-201ENST00000261177 ELP6Q0PNE2 266 aa14.72□□□□□ -0.05
TSPAN11-201ENST00000261177 IRAK1BP1Q5VVH5 260 aa14.72□□□□□ -0.05
TSPAN11-201ENST00000261177 THAP5Q7Z6K1 395 aa14.72□□□□□ -0.05
TSPAN11-201ENST00000261177 PEG10Q86TG7 708 aaKnown RBP14.72□□□□□ -0.05
TSPAN11-201ENST00000261177 AIF1LQ9BQI0 150 aa14.72□□□□□ -0.05
TSPAN11-201ENST00000261177 NUSAP1Q9BXS6 441 aaKnown RBP14.72□□□□□ -0.05
TSPAN11-201ENST00000261177 MIOSQ9NXC5 875 aa14.72□□□□□ -0.05
TSPAN11-201ENST00000261177 C2orf71A6NGG8 1288 aa14.72□□□□□ -0.05
TSPAN11-201ENST00000261177 CAPN8A6NHC0 703 aa14.72□□□□□ -0.05
TSPAN11-201ENST00000261177 LOC110117498-PIK3R3F6TDL0 507 aa14.72□□□□□ -0.05
TSPAN11-201ENST00000261177 CACNB4O00305 520 aaPredicted RBP14.72□□□□□ -0.05
TSPAN11-201ENST00000261177 CXCL14O95715 111 aa14.72□□□□□ -0.05
TSPAN11-201ENST00000261177 IFNA16P05015 189 aa14.72□□□□□ -0.05
TSPAN11-201ENST00000261177 EML3Q32P44 896 aa14.72□□□□□ -0.05
TSPAN11-201ENST00000261177 PYROXD2Q8N2H3 581 aa14.72□□□□□ -0.05
TSPAN11-201ENST00000261177 MAB21L3Q8N8X9 362 aa14.72□□□□□ -0.05
TSPAN11-201ENST00000261177 ATAD1Q8NBU5 361 aa14.72□□□□□ -0.05
TSPAN11-201ENST00000261177 TBATAQ96M53 351 aa14.72□□□□□ -0.05
TSPAN11-201ENST00000261177 DENND2DQ9H6A0 471 aaPredicted RBP14.72□□□□□ -0.05
TSPAN11-201ENST00000261177 SLC28A2O43868 658 aa14.71□□□□□ -0.05
TSPAN11-201ENST00000261177 C22orf31O95567 290 aa14.71□□□□□ -0.05
TSPAN11-201ENST00000261177 DHFRP00374 187 aa14.71□□□□□ -0.05
TSPAN11-201ENST00000261177 RPS6KA3P51812 740 aa14.71□□□□□ -0.05
TSPAN11-201ENST00000261177 MANFP55145 182 aaKnown RBP14.71□□□□□ -0.05
TSPAN11-201ENST00000261177 CCDC157Q569K6 752 aa14.71□□□□□ -0.05
TSPAN11-201ENST00000261177 CRTC3Q6UUV7 619 aa14.71□□□□□ -0.05
TSPAN11-201ENST00000261177 RAB43Q86YS6 212 aa14.71□□□□□ -0.05
TSPAN11-201ENST00000261177 SPPL2CQ8IUH8 684 aa14.71□□□□□ -0.05
TSPAN11-201ENST00000261177 HM13Q8TCT9 377 aa14.71□□□□□ -0.05
TSPAN11-201ENST00000261177 LPGAT1Q92604 370 aa14.71□□□□□ -0.05
TSPAN11-201ENST00000261177 CRISPLD1Q9H336 500 aa14.71□□□□□ -0.05
TSPAN11-201ENST00000261177 CNTN6Q9UQ52 1028 aa14.71□□□□□ -0.05
TSPAN11-201ENST00000261177 PTPRJQ12913 1337 aa14.71□□□□□ -0.05
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 26.8 ms