RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000249504.6

HOXD11-201, Transcript of homeobox D11, humanhuman

APPRIS P1 TSL 3 BASIC

Gene HOXD11, Length 1,533 nt, Biotype protein coding.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXD11-201ENST00000249504 WDR26Q9H7D7 661 aa19.31■□□□□ 0.68
HOXD11-201ENST00000249504 OR1A2Q9Y585 309 aa19.31■□□□□ 0.68
HOXD11-201ENST00000249504 SNX11Q9Y5W9 270 aa19.31■□□□□ 0.68
HOXD11-201ENST00000249504 GOLGA8KD6RF30 607 aa19.3■□□□□ 0.68
HOXD11-201ENST00000249504 GOLGA8TH3BQL2 631 aa19.3■□□□□ 0.68
HOXD11-201ENST00000249504 K7ESM1 405 aa19.3■□□□□ 0.68
HOXD11-201ENST00000249504 AGPSO00116 658 aa19.3■□□□□ 0.68
HOXD11-201ENST00000249504 CACNB4O00305 520 aaPredicted RBP19.3■□□□□ 0.68
HOXD11-201ENST00000249504 SOD1P00441 154 aa19.3■□□□□ 0.68
HOXD11-201ENST00000249504 ITGALP20701 1170 aa19.3■□□□□ 0.68
HOXD11-201ENST00000249504 CTSKP43235 329 aa19.3■□□□□ 0.68
HOXD11-201ENST00000249504 BNC1Q01954 994 aa19.3■□□□□ 0.68
HOXD11-201ENST00000249504 CACNG1Q06432 222 aa19.3■□□□□ 0.68
HOXD11-201ENST00000249504 MGAT5Q09328 741 aa19.3■□□□□ 0.68
HOXD11-201ENST00000249504 NFATC2Q13469 925 aa19.3■□□□□ 0.68
HOXD11-201ENST00000249504 THOC5Q13769 683 aaKnown RBP19.3■□□□□ 0.68
HOXD11-201ENST00000249504 ITGA9Q13797 1035 aa19.3■□□□□ 0.68
HOXD11-201ENST00000249504 PTK2BQ14289 1009 aa19.3■□□□□ 0.68
HOXD11-201ENST00000249504 SMAD1Q15797 465 aaKnown RBP19.3■□□□□ 0.68
HOXD11-201ENST00000249504 ATP13A5Q4VNC0 1218 aa19.3■□□□□ 0.68
HOXD11-201ENST00000249504 HSP90AA5PQ58FG0 334 aa19.3■□□□□ 0.68
HOXD11-201ENST00000249504 ZRANB3Q5FWF4 1079 aa19.3■□□□□ 0.68
HOXD11-201ENST00000249504 NEPROQ6NW34 567 aa19.3■□□□□ 0.68
HOXD11-201ENST00000249504 LMNTD2Q8IXW0 634 aa19.3■□□□□ 0.68
HOXD11-201ENST00000249504 PELI3Q8N2H9 469 aa19.3■□□□□ 0.68
HOXD11-201ENST00000249504 GPR150Q8NGU9 434 aa19.3■□□□□ 0.68
HOXD11-201ENST00000249504 ZNF398Q8TD17 642 aa19.3■□□□□ 0.68
HOXD11-201ENST00000249504 PHPT1Q9NRX4 125 aaPredicted RBP19.3■□□□□ 0.68
HOXD11-201ENST00000249504 CATSPERZQ9NTU4 200 aa19.3■□□□□ 0.68
HOXD11-201ENST00000249504 RABGEF1Q9UJ41 708 aa19.3■□□□□ 0.68
HOXD11-201ENST00000249504 NFS1Q9Y697 457 aa19.3■□□□□ 0.68
HOXD11-201ENST00000249504 PTPRZ1P23471 2315 aaPredicted RBP19.3■□□□□ 0.68
HOXD11-201ENST00000249504 BPTFQ12830 3046 aa19.3■□□□□ 0.68
HOXD11-201ENST00000249504 A0A087WUV0 522 aaPredicted RBP19.3■□□□□ 0.68
HOXD11-201ENST00000249504 TRBV5-4A0A0C4DH59 114 aa19.3■□□□□ 0.68
HOXD11-201ENST00000249504 FAM159BA6NKW6 160 aa19.3■□□□□ 0.68
HOXD11-201ENST00000249504 FADS2P1A8MWK0 482 aa19.3■□□□□ 0.68
HOXD11-201ENST00000249504 CD3EAPO15446 510 aaKnown RBP19.3■□□□□ 0.68
HOXD11-201ENST00000249504 GPR39O43194 453 aa19.3■□□□□ 0.68
HOXD11-201ENST00000249504 CER1O95813 267 aa19.3■□□□□ 0.68
HOXD11-201ENST00000249504 PRSS56P0CW18 603 aa19.3■□□□□ 0.68
HOXD11-201ENST00000249504 HTR1BP28222 390 aa19.3■□□□□ 0.68
HOXD11-201ENST00000249504 TEAD1P28347 426 aa19.3■□□□□ 0.68
HOXD11-201ENST00000249504 GPR33Q49SQ1 333 aa19.3■□□□□ 0.68
HOXD11-201ENST00000249504 FASTKD1Q53R41 847 aaKnown RBP19.3■□□□□ 0.68
HOXD11-201ENST00000249504 PSAPL1Q6NUJ1 521 aa19.3■□□□□ 0.68
HOXD11-201ENST00000249504 HEATR4Q86WZ0 1026 aa19.3■□□□□ 0.68
HOXD11-201ENST00000249504 CNTN4Q8IWV2 1026 aa19.3■□□□□ 0.68
HOXD11-201ENST00000249504 SLC22A18ASQ8N1D0 253 aa19.3■□□□□ 0.68
HOXD11-201ENST00000249504 CALML6Q8TD86 181 aa19.3■□□□□ 0.68
HOXD11-201ENST00000249504 SH3GL2Q99962 352 aa19.3■□□□□ 0.68
HOXD11-201ENST00000249504 FAM167BQ9BTA0 163 aa19.3■□□□□ 0.68
HOXD11-201ENST00000249504 FAM96AQ9H5X1 160 aa19.3■□□□□ 0.68
HOXD11-201ENST00000249504 ACSS3Q9H6R3 686 aa19.3■□□□□ 0.68
HOXD11-201ENST00000249504 PPANQ9NQ55 473 aaKnown RBP19.3■□□□□ 0.68
HOXD11-201ENST00000249504 SMYD2Q9NRG4 433 aa19.3■□□□□ 0.68
HOXD11-201ENST00000249504 SMOXQ9NWM0 555 aa19.3■□□□□ 0.68
HOXD11-201ENST00000249504 MARCH4Q9P2E8 410 aaPredicted RBP19.3■□□□□ 0.68
HOXD11-201ENST00000249504 UGT1A9O60656 530 aa19.29■□□□□ 0.68
HOXD11-201ENST00000249504 MYZAPP0CAP1 466 aa19.29■□□□□ 0.68
HOXD11-201ENST00000249504 UGT1A6P19224 532 aa19.29■□□□□ 0.68
HOXD11-201ENST00000249504 UGT1A1P22309 533 aa19.29■□□□□ 0.68
HOXD11-201ENST00000249504 UGT1A4P22310 534 aa19.29■□□□□ 0.68
HOXD11-201ENST00000249504 CA5AP35218 305 aa19.29■□□□□ 0.68
HOXD11-201ENST00000249504 UGT1A3P35503 534 aa19.29■□□□□ 0.68
HOXD11-201ENST00000249504 UGT1A5P35504 534 aa19.29■□□□□ 0.68
HOXD11-201ENST00000249504 TRIM23P36406 574 aa19.29■□□□□ 0.68
HOXD11-201ENST00000249504 CDKN1CP49918 316 aaPredicted RBP19.29■□□□□ 0.68
HOXD11-201ENST00000249504 SEMA3AQ14563 771 aa19.29■□□□□ 0.68
HOXD11-201ENST00000249504 NFATC4Q14934 902 aa19.29■□□□□ 0.68
HOXD11-201ENST00000249504 CEP85LQ5SZL2 805 aa19.29■□□□□ 0.68
HOXD11-201ENST00000249504 TEDDM1Q5T9Z0 273 aa19.29■□□□□ 0.68
HOXD11-201ENST00000249504 SPATS2Q86XZ4 545 aaKnown RBP19.29■□□□□ 0.68
HOXD11-201ENST00000249504 PIANPQ8IYJ0 282 aa19.29■□□□□ 0.68
HOXD11-201ENST00000249504 OXR1Q8N573 874 aa19.29■□□□□ 0.68
HOXD11-201ENST00000249504 UHMK1Q8TAS1 419 aaKnown RBP19.29■□□□□ 0.68
HOXD11-201ENST00000249504 VPS35Q96QK1 796 aa19.29■□□□□ 0.68
HOXD11-201ENST00000249504 CCDC77Q9BR77 488 aa19.29■□□□□ 0.68
HOXD11-201ENST00000249504 GAREM1Q9H706 876 aa19.29■□□□□ 0.68
HOXD11-201ENST00000249504 UGT1A7Q9HAW7 530 aa19.29■□□□□ 0.68
HOXD11-201ENST00000249504 UGT1A10Q9HAW8 530 aa19.29■□□□□ 0.68
HOXD11-201ENST00000249504 UGT1A8Q9HAW9 530 aa19.29■□□□□ 0.68
HOXD11-201ENST00000249504 GPR27Q9NS67 375 aa19.29■□□□□ 0.68
HOXD11-201ENST00000249504 IARS2Q9NSE4 1012 aaKnown RBP19.29■□□□□ 0.68
HOXD11-201ENST00000249504 TMPRSS11EQ9UL52 423 aa19.29■□□□□ 0.68
HOXD11-201ENST00000249504 TDRD6O60522 2096 aaKnown RBP19.29■□□□□ 0.68
HOXD11-201ENST00000249504 PIKFYVEQ9Y2I7 2098 aa19.28■□□□□ 0.68
HOXD11-201ENST00000249504 OGNP20774 298 aaKnown RBP19.28■□□□□ 0.68
HOXD11-201ENST00000249504 KIAA1024LP59773 190 aa19.28■□□□□ 0.68
HOXD11-201ENST00000249504 CDK3Q00526 305 aa19.28■□□□□ 0.68
HOXD11-201ENST00000249504 ZNF844Q08AG5 666 aa19.28■□□□□ 0.68
HOXD11-201ENST00000249504 HLA-BQ31612 363 aa19.28■□□□□ 0.68
HOXD11-201ENST00000249504 KBTBD12Q3ZCT8 623 aa19.28■□□□□ 0.68
HOXD11-201ENST00000249504 ZNF470Q6ECI4 717 aa19.28■□□□□ 0.68
HOXD11-201ENST00000249504 MRNIPQ6NTE8 343 aa19.28■□□□□ 0.68
HOXD11-201ENST00000249504 ADAMTSL4Q6UY14 1074 aa19.28■□□□□ 0.68
HOXD11-201ENST00000249504 MACC1Q6ZN28 852 aa19.28■□□□□ 0.68
HOXD11-201ENST00000249504 KIAA2013Q8IYS2 634 aa19.28■□□□□ 0.68
HOXD11-201ENST00000249504 MINDY1Q8N5J2 469 aa19.28■□□□□ 0.68
HOXD11-201ENST00000249504 GABPB2Q8TAK5 448 aaPredicted RBP19.28■□□□□ 0.68
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 55.4 ms