RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000236273.8

SYF2-201, Transcript of SYF2 pre-mRNA splicing factor, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene SYF2, Length 1,345 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYF2-201ENST00000236273 HADHAP40939 763 aa22.02■■□□□ 1.12
SYF2-201ENST00000236273 CDKN1CP49918 316 aaPredicted RBP22.02■■□□□ 1.12
SYF2-201ENST00000236273 DAB2P98082 770 aa22.02■■□□□ 1.12
SYF2-201ENST00000236273 ILF3Q12906 894 aaKnown RBP eCLIP22.02■■□□□ 1.12
SYF2-201ENST00000236273 ILKQ13418 452 aa22.02■■□□□ 1.12
SYF2-201ENST00000236273 SEPT6Q14141 434 aa22.02■■□□□ 1.12
SYF2-201ENST00000236273 DHRS13Q6UX07 377 aa22.02■■□□□ 1.12
SYF2-201ENST00000236273 SYT10Q6XYQ8 523 aa22.02■■□□□ 1.12
SYF2-201ENST00000236273 C11orf96Q7Z7L8 435 aa22.02■■□□□ 1.12
SYF2-201ENST00000236273 ARL10Q8N8L6 244 aa22.02■■□□□ 1.12
SYF2-201ENST00000236273 SCG3Q8WXD2 468 aaKnown RBP22.02■■□□□ 1.12
SYF2-201ENST00000236273 ASB8Q9H765 288 aa22.02■■□□□ 1.12
SYF2-201ENST00000236273 SIRPGQ9P1W8 387 aa22.02■■□□□ 1.12
SYF2-201ENST00000236273 SLC2A6Q9UGQ3 507 aa22.02■■□□□ 1.12
SYF2-201ENST00000236273 RIMKLBQ9ULI2 386 aa22.02■■□□□ 1.12
SYF2-201ENST00000236273 KNTC1P50748 2209 aa22.01■■□□□ 1.11
SYF2-201ENST00000236273 TRBV5-4A0A0C4DH59 114 aa22.01■■□□□ 1.11
SYF2-201ENST00000236273 CCDC78A2IDD5 438 aa22.01■■□□□ 1.11
SYF2-201ENST00000236273 GPR89AB7ZAQ6 455 aa22.01■■□□□ 1.11
SYF2-201ENST00000236273 CASC3O15234 703 aaKnown RBP22.01■■□□□ 1.11
SYF2-201ENST00000236273 TMEM63AO94886 807 aa22.01■■□□□ 1.11
SYF2-201ENST00000236273 EML2O95834 649 aa22.01■■□□□ 1.11
SYF2-201ENST00000236273 GPR89BP0CG08 455 aa22.01■■□□□ 1.11
SYF2-201ENST00000236273 PRSS56P0CW18 603 aa22.01■■□□□ 1.11
SYF2-201ENST00000236273 SPINK2P20155 84 aa22.01■■□□□ 1.11
SYF2-201ENST00000236273 ADRA1DP25100 572 aa22.01■■□□□ 1.11
SYF2-201ENST00000236273 TERF1P54274 439 aa22.01■■□□□ 1.11
SYF2-201ENST00000236273 SHC2P98077 582 aa22.01■■□□□ 1.11
SYF2-201ENST00000236273 CDK16Q00536 496 aa22.01■■□□□ 1.11
SYF2-201ENST00000236273 B4GALNT1Q00973 533 aa22.01■■□□□ 1.11
SYF2-201ENST00000236273 FOXK2Q01167 660 aa22.01■■□□□ 1.11
SYF2-201ENST00000236273 ACVR1Q04771 509 aa22.01■■□□□ 1.11
SYF2-201ENST00000236273 LRP8Q14114 963 aa22.01■■□□□ 1.11
SYF2-201ENST00000236273 NR0B2Q15466 257 aa22.01■■□□□ 1.11
SYF2-201ENST00000236273 CCDC157Q569K6 752 aa22.01■■□□□ 1.11
SYF2-201ENST00000236273 PERM1Q5SV97 790 aa22.01■■□□□ 1.11
SYF2-201ENST00000236273 LRRC8BQ6P9F7 803 aa22.01■■□□□ 1.11
SYF2-201ENST00000236273 SLC30A9Q6PML9 568 aa22.01■■□□□ 1.11
SYF2-201ENST00000236273 CHST15Q7LFX5 561 aaPredicted RBP22.01■■□□□ 1.11
SYF2-201ENST00000236273 RASGEF1AQ8N9B8 481 aa22.01■■□□□ 1.11
SYF2-201ENST00000236273 FAM96AQ9H5X1 160 aa22.01■■□□□ 1.11
SYF2-201ENST00000236273 GULP1Q9UBP9 304 aa22.01■■□□□ 1.11
SYF2-201ENST00000236273 RNF14Q9UBS8 474 aa22.01■■□□□ 1.11
SYF2-201ENST00000236273 PADI4Q9UM07 663 aa22.01■■□□□ 1.11
SYF2-201ENST00000236273 TCAF1Q9Y4C2 921 aa22.01■■□□□ 1.11
SYF2-201ENST00000236273 HEATR9A2RTY3 570 aa22■■□□□ 1.11
SYF2-201ENST00000236273 FAM221BA6H8Z2 402 aa22■■□□□ 1.11
SYF2-201ENST00000236273 ECEL1O95672 775 aa22■■□□□ 1.11
SYF2-201ENST00000236273 MC4RP32245 332 aa22■■□□□ 1.11
SYF2-201ENST00000236273 DUSP3P51452 185 aaPredicted RBP22■■□□□ 1.11
SYF2-201ENST00000236273 CTSCP53634 463 aa22■■□□□ 1.11
SYF2-201ENST00000236273 CLDN6P56747 220 aa22■■□□□ 1.11
SYF2-201ENST00000236273 HLTFQ14527 1009 aaKnown RBP eCLIP22■■□□□ 1.11
SYF2-201ENST00000236273 SMAD1Q15797 465 aaKnown RBP22■■□□□ 1.11
SYF2-201ENST00000236273 LDLRAP1Q5SW96 308 aa22■■□□□ 1.11
SYF2-201ENST00000236273 TSTD2Q5T7W7 516 aa22■■□□□ 1.11
SYF2-201ENST00000236273 SNX20Q7Z614 316 aa22■■□□□ 1.11
SYF2-201ENST00000236273 CAND1Q86VP6 1230 aaKnown RBP22■■□□□ 1.11
SYF2-201ENST00000236273 NAGSQ8N159 534 aa22■■□□□ 1.11
SYF2-201ENST00000236273 GRK7Q8WTQ7 553 aa22■■□□□ 1.11
SYF2-201ENST00000236273 DPEP2Q9H4A9 486 aa22■■□□□ 1.11
SYF2-201ENST00000236273 CHRAC1Q9NRG0 131 aa22■■□□□ 1.11
SYF2-201ENST00000236273 NCKIPSDQ9NZQ3 722 aa22■■□□□ 1.11
SYF2-201ENST00000236273 RABGEF1Q9UJ41 708 aa22■■□□□ 1.11
SYF2-201ENST00000236273 AKAP13Q12802 2813 aa21.99■■□□□ 1.11
SYF2-201ENST00000236273 CPED1A4D0V7 1026 aa21.99■■□□□ 1.11
SYF2-201ENST00000236273 SGTAO43765 313 aa21.99■■□□□ 1.11
SYF2-201ENST00000236273 GP1BAP07359 652 aa21.99■■□□□ 1.11
SYF2-201ENST00000236273 ACP5P13686 325 aa21.99■■□□□ 1.11
SYF2-201ENST00000236273 IVDP26440 423 aa21.99■■□□□ 1.11
SYF2-201ENST00000236273 CASQ1P31415 396 aa21.99■■□□□ 1.11
SYF2-201ENST00000236273 ACTR1BP42025 376 aa21.99■■□□□ 1.11
SYF2-201ENST00000236273 NPY2RP49146 381 aa21.99■■□□□ 1.11
SYF2-201ENST00000236273 CLCNKAP51800 687 aa21.99■■□□□ 1.11
SYF2-201ENST00000236273 SESN2P58004 480 aaPredicted RBP21.99■■□□□ 1.11
SYF2-201ENST00000236273 ACTR1AP61163 376 aa21.99■■□□□ 1.11
SYF2-201ENST00000236273 CRADDP78560 199 aa21.99■■□□□ 1.11
SYF2-201ENST00000236273 SKIDA1Q1XH10 827 aa21.99■■□□□ 1.11
SYF2-201ENST00000236273 CRTC3Q6UUV7 619 aa21.99■■□□□ 1.11
SYF2-201ENST00000236273 TMPRSS7Q7RTY8 843 aa21.99■■□□□ 1.11
SYF2-201ENST00000236273 PIANPQ8IYJ0 282 aa21.99■■□□□ 1.11
SYF2-201ENST00000236273 NAT8LQ8N9F0 302 aa21.99■■□□□ 1.11
SYF2-201ENST00000236273 GDAP1Q8TB36 358 aa21.99■■□□□ 1.11
SYF2-201ENST00000236273 IFI44Q8TCB0 444 aa21.99■■□□□ 1.11
SYF2-201ENST00000236273 ZDHHC1Q8WTX9 485 aa21.99■■□□□ 1.11
SYF2-201ENST00000236273 NAT14Q8WUY8 206 aa21.99■■□□□ 1.11
SYF2-201ENST00000236273 PATE1Q8WXA2 126 aa21.99■■□□□ 1.11
SYF2-201ENST00000236273 SCNM1Q9BWG6 230 aa21.99■■□□□ 1.11
SYF2-201ENST00000236273 KLK13Q9UKR3 277 aa21.99■■□□□ 1.11
SYF2-201ENST00000236273 KCNK6Q9Y257 313 aa21.99■■□□□ 1.11
SYF2-201ENST00000236273 COL27A1Q8IZC6 1860 aaPredicted RBP21.99■■□□□ 1.11
SYF2-201ENST00000236273 A6NCN8 305 aa21.98■■□□□ 1.11
SYF2-201ENST00000236273 OR51F1A6NGY5 319 aa21.98■■□□□ 1.11
SYF2-201ENST00000236273 B4DGG1 531 aa21.98■■□□□ 1.11
SYF2-201ENST00000236273 AVILO75366 819 aa21.98■■□□□ 1.11
SYF2-201ENST00000236273 INSM1Q01101 510 aaPredicted RBP21.98■■□□□ 1.11
SYF2-201ENST00000236273 PTK6Q13882 451 aa21.98■■□□□ 1.11
SYF2-201ENST00000236273 PCID2Q5JVF3 399 aa21.98■■□□□ 1.11
SYF2-201ENST00000236273 EFL1Q7Z2Z2 1120 aaKnown RBP21.98■■□□□ 1.11
SYF2-201ENST00000236273 LRRTM4Q86VH4 590 aa21.98■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 18.7 ms