RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000204679.8

GNPTG-201, Transcript of N-acetylglucosamine-1-phosphate transferase subunit gamma, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene GNPTG, Length 1,983 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GNPTG-201ENST00000204679 WDR55Q9H6Y2 383 aaPredicted RBP22.94■■□□□ 1.26
GNPTG-201ENST00000204679 THG1LQ9NWX6 298 aaKnown RBP22.94■■□□□ 1.26
GNPTG-201ENST00000204679 VTI1BQ9UEU0 232 aa22.94■■□□□ 1.26
GNPTG-201ENST00000204679 GNPTGQ9UJJ9 305 aa22.94■■□□□ 1.26
GNPTG-201ENST00000204679 STK38LQ9Y2H1 464 aa22.94■■□□□ 1.26
GNPTG-201ENST00000204679 PRR5-ARHGAP8B1AHC4 643 aa22.93■■□□□ 1.26
GNPTG-201ENST00000204679 SUPT3HB4E1H0 165 aa22.93■■□□□ 1.26
GNPTG-201ENST00000204679 HNRNPCL1O60812 293 aaKnown RBP22.93■■□□□ 1.26
GNPTG-201ENST00000204679 SUPT3HO75486 399 aa22.93■■□□□ 1.26
GNPTG-201ENST00000204679 SNUPNO95149 360 aaKnown RBP22.93■■□□□ 1.26
GNPTG-201ENST00000204679 GFAPP14136 432 aa22.93■■□□□ 1.26
GNPTG-201ENST00000204679 ITGB6P18564 788 aa22.93■■□□□ 1.26
GNPTG-201ENST00000204679 NCF2P19878 526 aaPredicted RBP22.93■■□□□ 1.26
GNPTG-201ENST00000204679 RPS3P23396 243 aaKnown RBP eCLIP22.93■■□□□ 1.26
GNPTG-201ENST00000204679 PTPN4P29074 926 aa22.93■■□□□ 1.26
GNPTG-201ENST00000204679 PTPN5P54829 565 aa22.93■■□□□ 1.26
GNPTG-201ENST00000204679 HERVK_113P63132 956 aa22.93■■□□□ 1.26
GNPTG-201ENST00000204679 ELF3P78545 371 aaPredicted RBP22.93■■□□□ 1.26
GNPTG-201ENST00000204679 ARHGAP8P85298 464 aa22.93■■□□□ 1.26
GNPTG-201ENST00000204679 ARHGEF7Q14155 803 aa22.93■■□□□ 1.26
GNPTG-201ENST00000204679 ERVK-6Q9BXR3 956 aa22.93■■□□□ 1.26
GNPTG-201ENST00000204679 OSBPL1AQ9BXW6 950 aa22.93■■□□□ 1.26
GNPTG-201ENST00000204679 TRPV4Q9HBA0 871 aa22.93■■□□□ 1.26
GNPTG-201ENST00000204679 EML4Q9HC35 981 aaKnown RBP22.93■■□□□ 1.26
GNPTG-201ENST00000204679 HPS4Q9NQG7 708 aa22.93■■□□□ 1.26
GNPTG-201ENST00000204679 CD84Q9UIB8 345 aa22.93■■□□□ 1.26
GNPTG-201ENST00000204679 E9PBE3 544 aa22.92■■□□□ 1.26
GNPTG-201ENST00000204679 SLCO1B7G3V0H7 640 aa22.92■■□□□ 1.26
GNPTG-201ENST00000204679 KLHL41O60662 606 aa22.92■■□□□ 1.26
GNPTG-201ENST00000204679 ECI2O75521 394 aa22.92■■□□□ 1.26
GNPTG-201ENST00000204679 SIX3O95343 332 aaPredicted RBP22.92■■□□□ 1.26
GNPTG-201ENST00000204679 JUNP05412 331 aaKnown RBP22.92■■□□□ 1.26
GNPTG-201ENST00000204679 TSPAN8P19075 237 aa22.92■■□□□ 1.26
GNPTG-201ENST00000204679 VASPP50552 380 aaPredicted RBP22.92■■□□□ 1.26
GNPTG-201ENST00000204679 PDCD2Q16342 344 aaPredicted RBP22.92■■□□□ 1.26
GNPTG-201ENST00000204679 UNC50Q53HI1 259 aa22.92■■□□□ 1.26
GNPTG-201ENST00000204679 GDF15Q99988 308 aa22.92■■□□□ 1.26
GNPTG-201ENST00000204679 ABCG8Q9H221 673 aa22.92■■□□□ 1.26
GNPTG-201ENST00000204679 ZFP14Q9HCL3 533 aa22.92■■□□□ 1.26
GNPTG-201ENST00000204679 TCF7L2Q9NQB0 619 aa22.92■■□□□ 1.26
GNPTG-201ENST00000204679 OBP2AQ9NY56 170 aa22.92■■□□□ 1.26
GNPTG-201ENST00000204679 DHRS7Q9Y394 339 aa22.92■■□□□ 1.26
GNPTG-201ENST00000204679 FIS1Q9Y3D6 152 aa22.92■■□□□ 1.26
GNPTG-201ENST00000204679 EPHA3P29320 983 aa22.92■■□□□ 1.26
GNPTG-201ENST00000204679 SPINT3P49223 89 aa22.92■■□□□ 1.26
GNPTG-201ENST00000204679 ATP13A5Q4VNC0 1218 aa22.92■■□□□ 1.26
GNPTG-201ENST00000204679 NAIF1Q69YI7 327 aaPredicted RBP22.92■■□□□ 1.26
GNPTG-201ENST00000204679 ANKRD54Q6NXT1 300 aa22.92■■□□□ 1.26
GNPTG-201ENST00000204679 CYB5D1Q6P9G0 228 aa22.92■■□□□ 1.26
GNPTG-201ENST00000204679 VITQ6UXI7 678 aa22.92■■□□□ 1.26
GNPTG-201ENST00000204679 RAB44Q7Z6P3 723 aaPredicted RBP22.92■■□□□ 1.26
GNPTG-201ENST00000204679 CUZD1Q86UP6 607 aa22.92■■□□□ 1.26
GNPTG-201ENST00000204679 LKAAEAR1Q8TD35 194 aa22.92■■□□□ 1.26
GNPTG-201ENST00000204679 FUBP1Q96AE4 644 aaKnown RBP22.92■■□□□ 1.26
GNPTG-201ENST00000204679 TNFRSF12AQ9NP84 129 aa22.92■■□□□ 1.26
GNPTG-201ENST00000204679 PCDH12Q9NPG4 1184 aa22.92■■□□□ 1.26
GNPTG-201ENST00000204679 TSR3Q9UJK0 312 aaKnown RBP22.92■■□□□ 1.26
GNPTG-201ENST00000204679 SORCS3Q9UPU3 1222 aa22.92■■□□□ 1.26
GNPTG-201ENST00000204679 LRRC14BA6NHZ5 514 aa22.91■■□□□ 1.26
GNPTG-201ENST00000204679 AGAP14A8MT82 685 aa22.91■■□□□ 1.26
GNPTG-201ENST00000204679 UPK3BL1B0FP48 263 aa22.91■■□□□ 1.26
GNPTG-201ENST00000204679 UPK3BL2E5RIL1 263 aa22.91■■□□□ 1.26
GNPTG-201ENST00000204679 CYP2A6P11509 494 aaPredicted RBP22.91■■□□□ 1.26
GNPTG-201ENST00000204679 TIMP2P16035 220 aa22.91■■□□□ 1.26
GNPTG-201ENST00000204679 CPA2P48052 419 aa22.91■■□□□ 1.26
GNPTG-201ENST00000204679 PDGFRLQ15198 375 aa22.91■■□□□ 1.26
GNPTG-201ENST00000204679 TBCCQ15814 346 aa22.91■■□□□ 1.26
GNPTG-201ENST00000204679 ZNF805Q5CZA5 627 aa22.91■■□□□ 1.26
GNPTG-201ENST00000204679 SFTPA1Q8IWL2 248 aa22.91■■□□□ 1.26
GNPTG-201ENST00000204679 UTP4Q969X6 686 aaKnown RBP22.91■■□□□ 1.26
GNPTG-201ENST00000204679 PLEKHG4BQ96PX9 1271 aa22.91■■□□□ 1.26
GNPTG-201ENST00000204679 TBC1D10AQ9BXI6 508 aa22.91■■□□□ 1.26
GNPTG-201ENST00000204679 CDH7Q9ULB5 785 aa22.91■■□□□ 1.26
GNPTG-201ENST00000204679 ANKRD12Q6UB98 2062 aa22.91■■□□□ 1.26
GNPTG-201ENST00000204679 DOCK8Q8NF50 2099 aa22.91■■□□□ 1.26
GNPTG-201ENST00000204679 UBFD1O14562 309 aaKnown RBP22.9■■□□□ 1.26
GNPTG-201ENST00000204679 TRIM16O95361 564 aa22.9■■□□□ 1.26
GNPTG-201ENST00000204679 VIPR1P32241 457 aa22.9■■□□□ 1.26
GNPTG-201ENST00000204679 FNDC3BQ53EP0 1204 aaKnown RBP22.9■■□□□ 1.26
GNPTG-201ENST00000204679 TMEM184AQ6ZMB5 413 aa22.9■■□□□ 1.26
GNPTG-201ENST00000204679 FBXO39Q8N4B4 442 aa22.9■■□□□ 1.26
GNPTG-201ENST00000204679 PIKFYVEQ9Y2I7 2098 aa22.9■■□□□ 1.26
GNPTG-201ENST00000204679 SZT2Q5T011 3432 aa22.9■■□□□ 1.26
GNPTG-201ENST00000204679 PLXNB3Q9ULL4 1909 aa22.9■■□□□ 1.26
GNPTG-201ENST00000204679 TSPAN11A1L157 253 aa22.9■■□□□ 1.26
GNPTG-201ENST00000204679 NCF1BA6NI72 391 aaPredicted RBP22.9■■□□□ 1.26
GNPTG-201ENST00000204679 SYCE1LA8MT33 242 aa22.9■■□□□ 1.26
GNPTG-201ENST00000204679 NCF1CA8MVU1 366 aaPredicted RBP22.9■■□□□ 1.26
GNPTG-201ENST00000204679 SLC25A14O95258 325 aaPredicted RBP22.9■■□□□ 1.26
GNPTG-201ENST00000204679 HLA-EP13747 358 aa22.9■■□□□ 1.26
GNPTG-201ENST00000204679 NCF1P14598 390 aaPredicted RBP22.9■■□□□ 1.26
GNPTG-201ENST00000204679 XPAP23025 273 aaPredicted RBP22.9■■□□□ 1.26
GNPTG-201ENST00000204679 CDH13P55290 713 aa22.9■■□□□ 1.26
GNPTG-201ENST00000204679 GRM2Q14416 872 aa22.9■■□□□ 1.26
GNPTG-201ENST00000204679 RINLQ6ZS11 566 aa22.9■■□□□ 1.26
GNPTG-201ENST00000204679 LRIG1Q96JA1 1093 aa22.9■■□□□ 1.26
GNPTG-201ENST00000204679 RAB3IPQ96QF0 476 aaPredicted RBP22.9■■□□□ 1.26
GNPTG-201ENST00000204679 TRMOQ9BU70 441 aa22.9■■□□□ 1.26
GNPTG-201ENST00000204679 NSUN3Q9H649 340 aaKnown RBP22.9■■□□□ 1.26
GNPTG-201ENST00000204679 PKD2L2Q9NZM6 624 aa22.9■■□□□ 1.26
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 45.7 ms