RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000608369.1

LINC00963-211, long intergenic non-protein coding RNA 963, humanhuman

TSL 5 BASIC

Gene LINC00963, Length 961 nt, Biotype lincRNA, Subcellular localisation Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LINC00963-211ENST00000608369 GDF10P55107 478 aa11.31□□□□□ -0.6
LINC00963-211ENST00000608369 KLHL38Q2WGJ6 581 aa11.31□□□□□ -0.6
LINC00963-211ENST00000608369 DEFB133Q30KQ1 61 aa11.31□□□□□ -0.6
LINC00963-211ENST00000608369 ALFQ53S48 1182 aa11.31□□□□□ -0.6
LINC00963-211ENST00000608369 ZNF805Q5CZA5 627 aa11.31□□□□□ -0.6
LINC00963-211ENST00000608369 PRRT3Q5FWE3 981 aa11.31□□□□□ -0.6
LINC00963-211ENST00000608369 ZNF449Q6P9G9 518 aa11.31□□□□□ -0.6
LINC00963-211ENST00000608369 NPNTQ6UXI9 565 aa11.31□□□□□ -0.6
LINC00963-211ENST00000608369 USP53Q70EK8 1073 aa11.31□□□□□ -0.6
LINC00963-211ENST00000608369 PRICKLE2Q7Z3G6 844 aa11.31□□□□□ -0.6
LINC00963-211ENST00000608369 C14orf80Q86SX3 495 aa11.31□□□□□ -0.6
LINC00963-211ENST00000608369 TDRPQ86YL5 185 aa11.31□□□□□ -0.6
LINC00963-211ENST00000608369 ZNF683Q8IZ20 524 aa11.31□□□□□ -0.6
LINC00963-211ENST00000608369 UMODL1-AS1Q8N2C9 162 aa11.31□□□□□ -0.6
LINC00963-211ENST00000608369 PYROXD2Q8N2H3 581 aa11.31□□□□□ -0.6
LINC00963-211ENST00000608369 RTL3Q8N8U3 475 aaKnown RBP11.31□□□□□ -0.6
LINC00963-211ENST00000608369 CHST14Q8NCH0 376 aa11.31□□□□□ -0.6
LINC00963-211ENST00000608369 CCDC3Q9BQI4 270 aa11.31□□□□□ -0.6
LINC00963-211ENST00000608369 ZYG11BQ9C0D3 744 aa11.31□□□□□ -0.6
LINC00963-211ENST00000608369 ATP13A1Q9HD20 1204 aa11.31□□□□□ -0.6
LINC00963-211ENST00000608369 SAYSD1Q9NPB0 183 aa11.31□□□□□ -0.6
LINC00963-211ENST00000608369 STARD5Q9NSY2 213 aa11.31□□□□□ -0.6
LINC00963-211ENST00000608369 ETNK2Q9NVF9 386 aa11.31□□□□□ -0.6
LINC00963-211ENST00000608369 VPS18Q9P253 973 aa11.31□□□□□ -0.6
LINC00963-211ENST00000608369 IL17BQ9UHF5 180 aa11.31□□□□□ -0.6
LINC00963-211ENST00000608369 SLC24A2Q9UI40 661 aa11.31□□□□□ -0.6
LINC00963-211ENST00000608369 PADI4Q9UM07 663 aa11.31□□□□□ -0.6
LINC00963-211ENST00000608369 DOLKQ9UPQ8 538 aa11.31□□□□□ -0.6
LINC00963-211ENST00000608369 ACTL7BQ9Y614 415 aa11.31□□□□□ -0.6
LINC00963-211ENST00000608369 A0A0D9SEW6 157 aa11.3□□□□□ -0.6
LINC00963-211ENST00000608369 K7ERQ8 282 aa11.3□□□□□ -0.6
LINC00963-211ENST00000608369 MUSKO15146 869 aa11.3□□□□□ -0.6
LINC00963-211ENST00000608369 RGS16O15492 202 aaPredicted RBP11.3□□□□□ -0.6
LINC00963-211ENST00000608369 ZW10O43264 779 aa11.3□□□□□ -0.6
LINC00963-211ENST00000608369 SMAD6O43541 496 aaKnown RBP11.3□□□□□ -0.6
LINC00963-211ENST00000608369 CNTN5O94779 1100 aa11.3□□□□□ -0.6
LINC00963-211ENST00000608369 POP4O95707 220 aaKnown RBP11.3□□□□□ -0.6
LINC00963-211ENST00000608369 GSRP00390 522 aa11.3□□□□□ -0.6
LINC00963-211ENST00000608369 PNLIPP16233 465 aa11.3□□□□□ -0.6
LINC00963-211ENST00000608369 STX2P32856 288 aa11.3□□□□□ -0.6
LINC00963-211ENST00000608369 YBEYP58557 167 aaPredicted RBP11.3□□□□□ -0.6
LINC00963-211ENST00000608369 SNRPD1P62314 119 aaKnown RBP11.3□□□□□ -0.6
LINC00963-211ENST00000608369 IFI35P80217 286 aaPredicted RBP11.3□□□□□ -0.6
LINC00963-211ENST00000608369 GNA12Q03113 381 aa11.3□□□□□ -0.6
LINC00963-211ENST00000608369 PPARDQ03181 441 aa11.3□□□□□ -0.6
LINC00963-211ENST00000608369 RAD51Q06609 339 aa11.3□□□□□ -0.6
LINC00963-211ENST00000608369 FGL2Q14314 439 aa11.3□□□□□ -0.6
LINC00963-211ENST00000608369 PRPSAP1Q14558 356 aa11.3□□□□□ -0.6
LINC00963-211ENST00000608369 PARP15Q460N3 678 aa11.3□□□□□ -0.6
LINC00963-211ENST00000608369 ZNF542PQ5EBM4 170 aa11.3□□□□□ -0.6
LINC00963-211ENST00000608369 ANKRD20A2Q5SQ80 823 aa11.3□□□□□ -0.6
LINC00963-211ENST00000608369 ANKRD20A1Q5TYW2 823 aa11.3□□□□□ -0.6
LINC00963-211ENST00000608369 ANKRD20A3Q5VUR7 823 aa11.3□□□□□ -0.6
LINC00963-211ENST00000608369 PARS2Q7L3T8 475 aaKnown RBP11.3□□□□□ -0.6
LINC00963-211ENST00000608369 RAB11FIP2Q7L804 512 aa11.3□□□□□ -0.6
LINC00963-211ENST00000608369 SLC35F3Q8IY50 421 aa11.3□□□□□ -0.6
LINC00963-211ENST00000608369 CCDC13Q8IYE1 715 aa11.3□□□□□ -0.6
LINC00963-211ENST00000608369 PHACTR4Q8IZ21 702 aa11.3□□□□□ -0.6
LINC00963-211ENST00000608369 ATPAF2Q8N5M1 289 aa11.3□□□□□ -0.6
LINC00963-211ENST00000608369 GLIS1Q8NBF1 620 aa11.3□□□□□ -0.6
LINC00963-211ENST00000608369 CCNYQ8ND76 341 aa11.3□□□□□ -0.6
LINC00963-211ENST00000608369 PYROXD1Q8WU10 500 aa11.3□□□□□ -0.6
LINC00963-211ENST00000608369 CENPTQ96BT3 561 aa11.3□□□□□ -0.6
LINC00963-211ENST00000608369 GFM1Q96RP9 751 aaKnown RBP11.3□□□□□ -0.6
LINC00963-211ENST00000608369 TNKS2Q9H2K2 1166 aa11.3□□□□□ -0.6
LINC00963-211ENST00000608369 EPB41L4BQ9H329 900 aa11.3□□□□□ -0.6
LINC00963-211ENST00000608369 TMEM248Q9NWD8 314 aa11.3□□□□□ -0.6
LINC00963-211ENST00000608369 NINJ2Q9NZG7 142 aa11.3□□□□□ -0.6
LINC00963-211ENST00000608369 SEPT3Q9UH03 358 aa11.3□□□□□ -0.6
LINC00963-211ENST00000608369 LGALS13Q9UHV8 139 aa11.3□□□□□ -0.6
LINC00963-211ENST00000608369 NEU3Q9UQ49 428 aa11.3□□□□□ -0.6
LINC00963-211ENST00000608369 DOCK4Q8N1I0 1966 aa11.3□□□□□ -0.6
LINC00963-211ENST00000608369 COL27A1Q8IZC6 1860 aaPredicted RBP11.29□□□□□ -0.6
LINC00963-211ENST00000608369 A0A1W2PNU3 283 aaPredicted RBP11.29□□□□□ -0.6
LINC00963-211ENST00000608369 IGLON5A6NGN9 336 aa11.29□□□□□ -0.6
LINC00963-211ENST00000608369 ARHGAP42A6NI28 874 aa11.29□□□□□ -0.6
LINC00963-211ENST00000608369 C16orf96A6NNT2 1141 aa11.29□□□□□ -0.6
LINC00963-211ENST00000608369 RAD51BO15315 384 aa11.29□□□□□ -0.6
LINC00963-211ENST00000608369 ZNF821O75541 412 aaPredicted RBP11.29□□□□□ -0.6
LINC00963-211ENST00000608369 ZMPSTE24O75844 475 aa11.29□□□□□ -0.6
LINC00963-211ENST00000608369 ANXA9O76027 345 aa11.29□□□□□ -0.6
LINC00963-211ENST00000608369 TM7SF2O76062 418 aa11.29□□□□□ -0.6
LINC00963-211ENST00000608369 ZSCAN5DPP0CG00 497 aa11.29□□□□□ -0.6
LINC00963-211ENST00000608369 NR1D1P20393 614 aa11.29□□□□□ -0.6
LINC00963-211ENST00000608369 NUMBP49757 651 aa11.29□□□□□ -0.6
LINC00963-211ENST00000608369 IRAK1P51617 712 aa11.29□□□□□ -0.6
LINC00963-211ENST00000608369 CBX1P83916 185 aa11.29□□□□□ -0.6
LINC00963-211ENST00000608369 ELP6Q0PNE2 266 aa11.29□□□□□ -0.6
LINC00963-211ENST00000608369 AP1B1Q10567 949 aa11.29□□□□□ -0.6
LINC00963-211ENST00000608369 SLC10A2Q12908 348 aaPredicted RBP11.29□□□□□ -0.6
LINC00963-211ENST00000608369 PDIA2Q13087 525 aaKnown RBP11.29□□□□□ -0.6
LINC00963-211ENST00000608369 EIF2B5Q13144 721 aaKnown RBP11.29□□□□□ -0.6
LINC00963-211ENST00000608369 GRM3Q14832 879 aa11.29□□□□□ -0.6
LINC00963-211ENST00000608369 CLPPQ16740 277 aaPredicted RBP11.29□□□□□ -0.6
LINC00963-211ENST00000608369 FAXCQ5TGI0 409 aa11.29□□□□□ -0.6
LINC00963-211ENST00000608369 KIAA1614Q5VZ46 1190 aa11.29□□□□□ -0.6
LINC00963-211ENST00000608369 AFMIDQ63HM1 303 aa11.29□□□□□ -0.6
LINC00963-211ENST00000608369 RWDD4Q6NW29 188 aaKnown RBP11.29□□□□□ -0.6
LINC00963-211ENST00000608369 LINGO4Q6UY18 593 aa11.29□□□□□ -0.6
LINC00963-211ENST00000608369 CYS1Q717R9 158 aa11.29□□□□□ -0.6
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 61.1 ms