RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000587563.5

RPRD1A-205, Transcript of regulation of nuclear pre-mRNA domain containing 1A, human

TSL 3

Gene RPRD1A, Length 643 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytosol .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
RPRD1A-205	ENST00000587563	TRAV19	A0A0A6YYK7	116 aa		4.87	□□□□□ -1.63
RPRD1A-205	ENST00000587563	ZNF840P	A6NDX5	716 aa		4.87	□□□□□ -1.63
RPRD1A-205	ENST00000587563	SGK1	O00141	431 aa		4.87	□□□□□ -1.63
RPRD1A-205	ENST00000587563	PES1	O00541	588 aa	Known RBP	4.87	□□□□□ -1.63
RPRD1A-205	ENST00000587563	MDM4	O15151	490 aa		4.87	□□□□□ -1.63
RPRD1A-205	ENST00000587563	TBX18	O95935	607 aa		4.87	□□□□□ -1.63
RPRD1A-205	ENST00000587563	MT-CO1	P00395	513 aa		4.87	□□□□□ -1.63
RPRD1A-205	ENST00000587563	OAS1	P00973	400 aa	Known RBP	4.87	□□□□□ -1.63
RPRD1A-205	ENST00000587563	HLA-DRA	P01903	254 aa		4.87	□□□□□ -1.63
RPRD1A-205	ENST00000587563	AFP	P02771	609 aa	Known RBP	4.87	□□□□□ -1.63
RPRD1A-205	ENST00000587563	HNRNPC	P07910	306 aa	Known RBP eCLIP	4.87	□□□□□ -1.63
RPRD1A-205	ENST00000587563	TPM2	P07951	284 aa		4.87	□□□□□ -1.63
RPRD1A-205	ENST00000587563	CSH1	P0DML2	217 aa		4.87	□□□□□ -1.63
RPRD1A-205	ENST00000587563	CSH2	P0DML3	217 aa		4.87	□□□□□ -1.63
RPRD1A-205	ENST00000587563	ATP1A3	P13637	1013 aa		4.87	□□□□□ -1.63
RPRD1A-205	ENST00000587563	CCDC130	P13994	396 aa		4.87	□□□□□ -1.63
RPRD1A-205	ENST00000587563	ZNF18	P17022	549 aa		4.87	□□□□□ -1.63
RPRD1A-205	ENST00000587563	WARS	P23381	471 aa	Known RBP	4.87	□□□□□ -1.63
RPRD1A-205	ENST00000587563	PNPLA4	P41247	253 aa		4.87	□□□□□ -1.63
RPRD1A-205	ENST00000587563	PIK3CA	P42336	1068 aa		4.87	□□□□□ -1.63
RPRD1A-205	ENST00000587563	WAS	P42768	502 aa		4.87	□□□□□ -1.63
RPRD1A-205	ENST00000587563	IFNAR2	P48551	515 aa		4.87	□□□□□ -1.63
RPRD1A-205	ENST00000587563	FMO5	P49326	533 aa		4.87	□□□□□ -1.63
RPRD1A-205	ENST00000587563	MXI1	P50539	228 aa		4.87	□□□□□ -1.63
RPRD1A-205	ENST00000587563	COPB1	P53618	953 aa	Known RBP	4.87	□□□□□ -1.63
RPRD1A-205	ENST00000587563	RPL10A	P62906	217 aa	Known RBP	4.87	□□□□□ -1.63
RPRD1A-205	ENST00000587563	NOMO3	P69849	1222 aa		4.87	□□□□□ -1.63
RPRD1A-205	ENST00000587563	MYL7	Q01449	175 aa		4.87	□□□□□ -1.63
RPRD1A-205	ENST00000587563	TSPY1	Q01534	308 aa		4.87	□□□□□ -1.63
RPRD1A-205	ENST00000587563	KDSR	Q06136	332 aa		4.87	□□□□□ -1.63
RPRD1A-205	ENST00000587563	TAF10	Q12962	218 aa		4.87	□□□□□ -1.63
RPRD1A-205	ENST00000587563	TRPC3	Q13507	836 aa		4.87	□□□□□ -1.63
RPRD1A-205	ENST00000587563	NOMO1	Q15155	1222 aa		4.87	□□□□□ -1.63
RPRD1A-205	ENST00000587563	KRT31	Q15323	416 aa		4.87	□□□□□ -1.63
RPRD1A-205	ENST00000587563	TRIP6	Q15654	476 aa	Known RBP	4.87	□□□□□ -1.63
RPRD1A-205	ENST00000587563	CFAP221	Q4G0U5	840 aa		4.87	□□□□□ -1.63
RPRD1A-205	ENST00000587563	CBWD6	Q4V339	395 aa		4.87	□□□□□ -1.63
RPRD1A-205	ENST00000587563	CBWD3	Q5JTY5	395 aa		4.87	□□□□□ -1.63
RPRD1A-205	ENST00000587563	CBWD5	Q5RIA9	395 aa		4.87	□□□□□ -1.63
RPRD1A-205	ENST00000587563	KRT39	Q6A163	491 aa		4.87	□□□□□ -1.63
RPRD1A-205	ENST00000587563	KRTAP5-4	Q6L8H1	288 aa		4.87	□□□□□ -1.63
RPRD1A-205	ENST00000587563	RHBDF2	Q6PJF5	856 aa		4.87	□□□□□ -1.63
RPRD1A-205	ENST00000587563	MEPCE	Q7L2J0	689 aa	Known RBP	4.87	□□□□□ -1.63
RPRD1A-205	ENST00000587563	GAS2L3	Q86XJ1	694 aa		4.87	□□□□□ -1.63
RPRD1A-205	ENST00000587563	ALLC	Q8N6M5	410 aa		4.87	□□□□□ -1.63
RPRD1A-205	ENST00000587563	CLRN3	Q8NCR9	226 aa		4.87	□□□□□ -1.63
RPRD1A-205	ENST00000587563	C1orf162	Q8NEQ5	155 aa	Predicted RBP	4.87	□□□□□ -1.63
RPRD1A-205	ENST00000587563	ANKRD20A12P	Q8NF67	263 aa		4.87	□□□□□ -1.63
RPRD1A-205	ENST00000587563	OR2I1P	Q8NGU4	316 aa		4.87	□□□□□ -1.63
RPRD1A-205	ENST00000587563	OR6B3	Q8NGW1	331 aa		4.87	□□□□□ -1.63
RPRD1A-205	ENST00000587563	MYCBPAP	Q8TBZ2	947 aa		4.87	□□□□□ -1.63
RPRD1A-205	ENST00000587563	TAS1R2	Q8TE23	839 aa		4.87	□□□□□ -1.63
RPRD1A-205	ENST00000587563	C2orf15	Q8WU43	125 aa	Known RBP	4.87	□□□□□ -1.63
RPRD1A-205	ENST00000587563	OSCP1	Q8WVF1	389 aa		4.87	□□□□□ -1.63
RPRD1A-205	ENST00000587563	MRPS31	Q92665	395 aa	Known RBP	4.87	□□□□□ -1.63
RPRD1A-205	ENST00000587563	SEMA4D	Q92854	862 aa		4.87	□□□□□ -1.63
RPRD1A-205	ENST00000587563	CD101	Q93033	1021 aa		4.87	□□□□□ -1.63
RPRD1A-205	ENST00000587563	TTC17	Q96AE7	1141 aa		4.87	□□□□□ -1.63
RPRD1A-205	ENST00000587563	FAXDC2	Q96IV6	333 aa		4.87	□□□□□ -1.63
RPRD1A-205	ENST00000587563	GCNA	Q96QF7	691 aa		4.87	□□□□□ -1.63
RPRD1A-205	ENST00000587563	ACOX2	Q99424	681 aa		4.87	□□□□□ -1.63
RPRD1A-205	ENST00000587563	SMO	Q99835	787 aa		4.87	□□□□□ -1.63
RPRD1A-205	ENST00000587563	P2RY13	Q9BPV8	354 aa		4.87	□□□□□ -1.63
RPRD1A-205	ENST00000587563	RTKN	Q9BST9	563 aa		4.87	□□□□□ -1.63
RPRD1A-205	ENST00000587563	TTLL2	Q9BWV7	592 aa		4.87	□□□□□ -1.63
RPRD1A-205	ENST00000587563	QTRT1	Q9BXR0	403 aa	Known RBP	4.87	□□□□□ -1.63
RPRD1A-205	ENST00000587563	PRSS22	Q9GZN4	317 aa		4.87	□□□□□ -1.63
RPRD1A-205	ENST00000587563	SPRTN	Q9H040	489 aa	Predicted RBP	4.87	□□□□□ -1.63
RPRD1A-205	ENST00000587563	NDST4	Q9H3R1	872 aa		4.87	□□□□□ -1.63
RPRD1A-205	ENST00000587563	TMEM140	Q9NV12	185 aa		4.87	□□□□□ -1.63
RPRD1A-205	ENST00000587563	OSER1	Q9NX31	292 aa		4.87	□□□□□ -1.63
RPRD1A-205	ENST00000587563	RAB20	Q9NX57	234 aa		4.87	□□□□□ -1.63
RPRD1A-205	ENST00000587563	CFAP97	Q9P2B7	532 aa		4.87	□□□□□ -1.63
RPRD1A-205	ENST00000587563	MRFAP1	Q9Y605	127 aa		4.87	□□□□□ -1.63
RPRD1A-205	ENST00000587563	ATXN2	Q99700	1313 aa	Known RBP	4.87	□□□□□ -1.63
RPRD1A-205	ENST00000587563	ATRX	P46100	2492 aa		4.87	□□□□□ -1.63
RPRD1A-205	ENST00000587563	CACNA1E	Q15878	2313 aa		4.86	□□□□□ -1.63
RPRD1A-205	ENST00000587563	FAM208B	Q5VWN6	2430 aa		4.86	□□□□□ -1.63
RPRD1A-205	ENST00000587563	PLXNB3	Q9ULL4	1909 aa		4.86	□□□□□ -1.63
RPRD1A-205	ENST00000587563	MSANTD3-TMEFF1	A0A0A6YYJ0	341 aa		4.86	□□□□□ -1.63
RPRD1A-205	ENST00000587563	LNP1	A1A4G5	178 aa		4.86	□□□□□ -1.63
RPRD1A-205	ENST00000587563	PCNX2	A6NKB5	2137 aa		4.86	□□□□□ -1.63
RPRD1A-205	ENST00000587563	C4orf47	A7E2U8	309 aa		4.86	□□□□□ -1.63
RPRD1A-205	ENST00000587563	CDX4	O14627	284 aa	Predicted RBP	4.86	□□□□□ -1.63
RPRD1A-205	ENST00000587563	P4HA2	O15460	535 aa		4.86	□□□□□ -1.63
RPRD1A-205	ENST00000587563	COCH	O43405	550 aa		4.86	□□□□□ -1.63
RPRD1A-205	ENST00000587563	KDM1A	O60341	852 aa		4.86	□□□□□ -1.63
RPRD1A-205	ENST00000587563	EPN2	O95208	641 aa		4.86	□□□□□ -1.63
RPRD1A-205	ENST00000587563	KLF8	O95600	359 aa	Predicted RBP	4.86	□□□□□ -1.63
RPRD1A-205	ENST00000587563	FGF19	O95750	216 aa		4.86	□□□□□ -1.63
RPRD1A-205	ENST00000587563	OLFM2	O95897	454 aa		4.86	□□□□□ -1.63
RPRD1A-205	ENST00000587563	SERPINC1	P01008	464 aa		4.86	□□□□□ -1.63
RPRD1A-205	ENST00000587563	CALCA	P01258	141 aa		4.86	□□□□□ -1.63
RPRD1A-205	ENST00000587563	IRF1	P10914	325 aa		4.86	□□□□□ -1.63
RPRD1A-205	ENST00000587563	HOXA6	P31267	233 aa		4.86	□□□□□ -1.63
RPRD1A-205	ENST00000587563	ATIC	P31939	592 aa		4.86	□□□□□ -1.63
RPRD1A-205	ENST00000587563	GNL1	P36915	607 aa	Predicted RBP	4.86	□□□□□ -1.63
RPRD1A-205	ENST00000587563	PTGER3	P43115	390 aa		4.86	□□□□□ -1.63
RPRD1A-205	ENST00000587563	MAGEA11	P43364	429 aa		4.86	□□□□□ -1.63
RPRD1A-205	ENST00000587563	HTR3A	P46098	478 aa		4.86	□□□□□ -1.63

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