RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000576084.5

COX11-208, Transcript of cytochrome c oxidase copper chaperone COX11, human

TSL 3

Gene COX11, Length 652 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus, Ribosome .

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RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
COX11-208	ENST00000576084	NUF2	Q9BZD4	464 aa		3.42	□□□□□ -1.86
COX11-208	ENST00000576084	PLEKHA4	Q9H4M7	779 aa		3.42	□□□□□ -1.86
COX11-208	ENST00000576084	MKKS	Q9NPJ1	570 aa	Predicted RBP	3.42	□□□□□ -1.86
COX11-208	ENST00000576084	SMC4	Q9NTJ3	1288 aa		3.42	□□□□□ -1.86
COX11-208	ENST00000576084	IRAK4	Q9NWZ3	460 aa		3.42	□□□□□ -1.86
COX11-208	ENST00000576084	TAS2R10	Q9NYW0	307 aa		3.42	□□□□□ -1.86
COX11-208	ENST00000576084	CISD1	Q9NZ45	108 aa	Known RBP	3.42	□□□□□ -1.86
COX11-208	ENST00000576084	CDC14A	Q9UNH5	594 aa		3.42	□□□□□ -1.86
COX11-208	ENST00000576084	CAMK2A	Q9UQM7	478 aa		3.42	□□□□□ -1.86
COX11-208	ENST00000576084	CARD8	Q9Y2G2	431 aa		3.42	□□□□□ -1.86
COX11-208	ENST00000576084	LSM4	Q9Y4Z0	139 aa	Known RBP	3.42	□□□□□ -1.86
COX11-208	ENST00000576084	RGPD5	Q99666	1765 aa		3.42	□□□□□ -1.86
COX11-208	ENST00000576084	UNC80	Q8N2C7	3258 aa		3.42	□□□□□ -1.86
COX11-208	ENST00000576084	PIK3C2G	O75747	1445 aa		3.42	□□□□□ -1.86
COX11-208	ENST00000576084	ACE	P12821	1306 aa		3.42	□□□□□ -1.86
COX11-208	ENST00000576084	KDM3A	Q9Y4C1	1321 aa		3.42	□□□□□ -1.86
COX11-208	ENST00000576084	PALLD	Q8WX93	1383 aa		3.41	□□□□□ -1.86
COX11-208	ENST00000576084	LAMB4	A4D0S4	1761 aa		3.41	□□□□□ -1.86
COX11-208	ENST00000576084		A0A1W2PPH5	198 aa		3.41	□□□□□ -1.86
COX11-208	ENST00000576084	PRAC2	D3DTV9	90 aa		3.41	□□□□□ -1.86
COX11-208	ENST00000576084	ZNF587B	E7ETH6	402 aa		3.41	□□□□□ -1.86
COX11-208	ENST00000576084	LINC00271	P0C7V0	271 aa		3.41	□□□□□ -1.86
COX11-208	ENST00000576084	HMGB2	P26583	209 aa	Known RBP	3.41	□□□□□ -1.86
COX11-208	ENST00000576084	POU1F1	P28069	291 aa		3.41	□□□□□ -1.86
COX11-208	ENST00000576084	MAN1A1	P33908	653 aa		3.41	□□□□□ -1.86
COX11-208	ENST00000576084	HARS2	P49590	506 aa	Known RBP	3.41	□□□□□ -1.86
COX11-208	ENST00000576084	CCR9	P51686	369 aa		3.41	□□□□□ -1.86
COX11-208	ENST00000576084	HDAC4	P56524	1084 aa		3.41	□□□□□ -1.86
COX11-208	ENST00000576084	RALBP1	Q15311	655 aa		3.41	□□□□□ -1.86
COX11-208	ENST00000576084	OASL	Q15646	514 aa	Known RBP	3.41	□□□□□ -1.86
COX11-208	ENST00000576084	PKN2	Q16513	984 aa	Known RBP	3.41	□□□□□ -1.86
COX11-208	ENST00000576084	TST	Q16762	297 aa	Known RBP	3.41	□□□□□ -1.86
COX11-208	ENST00000576084	C2orf68	Q2NKX9	166 aa		3.41	□□□□□ -1.86
COX11-208	ENST00000576084	ZNF718	Q3SXZ3	478 aa		3.41	□□□□□ -1.86
COX11-208	ENST00000576084	AMZ1	Q400G9	498 aa		3.41	□□□□□ -1.86
COX11-208	ENST00000576084	MMEL1	Q495T6	779 aa		3.41	□□□□□ -1.86
COX11-208	ENST00000576084	ZNF672	Q499Z4	452 aa	Predicted RBP	3.41	□□□□□ -1.86
COX11-208	ENST00000576084	SLC9B1	Q4ZJI4	515 aa		3.41	□□□□□ -1.86
COX11-208	ENST00000576084	PPP6R3	Q5H9R7	873 aa	Predicted RBP	3.41	□□□□□ -1.86
COX11-208	ENST00000576084	CST9	Q5W186	159 aa		3.41	□□□□□ -1.86
COX11-208	ENST00000576084	WBP2NL	Q6ICG8	309 aa		3.41	□□□□□ -1.86
COX11-208	ENST00000576084	FAM180B	Q6P0A1	224 aa		3.41	□□□□□ -1.86
COX11-208	ENST00000576084	FBXO46	Q6PJ61	603 aa	Predicted RBP	3.41	□□□□□ -1.86
COX11-208	ENST00000576084	SATL1	Q86VE3	508 aa		3.41	□□□□□ -1.86
COX11-208	ENST00000576084	NR2C2AP	Q86WQ0	139 aa		3.41	□□□□□ -1.86
COX11-208	ENST00000576084	RFLNB	Q8N5W9	214 aa		3.41	□□□□□ -1.86
COX11-208	ENST00000576084	ZNF441	Q8N8Z8	693 aa		3.41	□□□□□ -1.86
COX11-208	ENST00000576084	TDRD7	Q8NHU6	1098 aa	Known RBP	3.41	□□□□□ -1.86
COX11-208	ENST00000576084	SPATA20	Q8TB22	786 aa		3.41	□□□□□ -1.86
COX11-208	ENST00000576084	CREB3L4	Q8TEY5	395 aa		3.41	□□□□□ -1.86
COX11-208	ENST00000576084	RND1	Q92730	232 aa		3.41	□□□□□ -1.86
COX11-208	ENST00000576084	FBXL8	Q96CD0	374 aa		3.41	□□□□□ -1.86
COX11-208	ENST00000576084	ZC3HAV1L	Q96H79	300 aa	Known RBP	3.41	□□□□□ -1.86
COX11-208	ENST00000576084	NR1H4	Q96RI1	486 aa	Predicted RBP	3.41	□□□□□ -1.86
COX11-208	ENST00000576084	HAUS8	Q9BT25	410 aa		3.41	□□□□□ -1.86
COX11-208	ENST00000576084	TKTL2	Q9H0I9	626 aa		3.41	□□□□□ -1.86
COX11-208	ENST00000576084	C1RL	Q9NZP8	487 aa		3.41	□□□□□ -1.86
COX11-208	ENST00000576084	TINAG	Q9UJW2	476 aa		3.41	□□□□□ -1.86
COX11-208	ENST00000576084	NAALADL1	Q9UQQ1	740 aa		3.41	□□□□□ -1.86
COX11-208	ENST00000576084	PAM16	Q9Y3D7	125 aa		3.41	□□□□□ -1.86
COX11-208	ENST00000576084	STON1	Q9Y6Q2	735 aa		3.41	□□□□□ -1.86
COX11-208	ENST00000576084	CCDC88A	Q3V6T2	1871 aa		3.41	□□□□□ -1.86
COX11-208	ENST00000576084	SCN4A	P35499	1836 aa		3.4	□□□□□ -1.86
COX11-208	ENST00000576084		A0A087X0M5	115 aa		3.4	□□□□□ -1.87
COX11-208	ENST00000576084		A0A1B0GX30	115 aa		3.4	□□□□□ -1.87
COX11-208	ENST00000576084	DENND3	A2RUS2	1198 aa		3.4	□□□□□ -1.87
COX11-208	ENST00000576084	MID1	O15344	667 aa		3.4	□□□□□ -1.87
COX11-208	ENST00000576084	PLRG1	O43660	514 aa	Known RBP	3.4	□□□□□ -1.87
COX11-208	ENST00000576084	BAIAP3	O94812	1187 aa		3.4	□□□□□ -1.87
COX11-208	ENST00000576084	ZNF432	O94892	652 aa		3.4	□□□□□ -1.87
COX11-208	ENST00000576084	TF	P02787	698 aa		3.4	□□□□□ -1.87
COX11-208	ENST00000576084	MMP2	P08253	660 aa		3.4	□□□□□ -1.87
COX11-208	ENST00000576084	TAF1	P21675	1872 aa		3.4	□□□□□ -1.87
COX11-208	ENST00000576084	GPT	P24298	496 aa		3.4	□□□□□ -1.87
COX11-208	ENST00000576084	EPHX2	P34913	555 aa		3.4	□□□□□ -1.87
COX11-208	ENST00000576084	RXRG	P48443	463 aa		3.4	□□□□□ -1.87
COX11-208	ENST00000576084	TMF1	P82094	1093 aa		3.4	□□□□□ -1.87
COX11-208	ENST00000576084	SIM2	Q14190	667 aa	Predicted RBP	3.4	□□□□□ -1.87
COX11-208	ENST00000576084	MAPRE1	Q15691	268 aa	Known RBP	3.4	□□□□□ -1.87
COX11-208	ENST00000576084	ZRSR1	Q15695	479 aa	Known RBP	3.4	□□□□□ -1.87
COX11-208	ENST00000576084	C9orf50	Q5SZB4	431 aa		3.4	□□□□□ -1.87
COX11-208	ENST00000576084	C1orf122	Q6ZSJ8	110 aa		3.4	□□□□□ -1.87
COX11-208	ENST00000576084	R3HCC1L	Q7Z5L2	792 aa	Known RBP	3.4	□□□□□ -1.87
COX11-208	ENST00000576084	SMIM29	Q86T20	159 aa		3.4	□□□□□ -1.87
COX11-208	ENST00000576084	TBC1D1	Q86TI0	1168 aa	Predicted RBP	3.4	□□□□□ -1.87
COX11-208	ENST00000576084	CHERP	Q8IWX8	916 aa	Known RBP	3.4	□□□□□ -1.87
COX11-208	ENST00000576084	MUC20	Q8N307	709 aa	Predicted RBP	3.4	□□□□□ -1.87
COX11-208	ENST00000576084	AGBL3	Q8NEM8	1001 aa		3.4	□□□□□ -1.87
COX11-208	ENST00000576084	SPATA3	Q8NHX4	192 aa		3.4	□□□□□ -1.87
COX11-208	ENST00000576084	METTL6	Q8TCB7	284 aa		3.4	□□□□□ -1.87
COX11-208	ENST00000576084	HDAC2	Q92769	488 aa	Known RBP	3.4	□□□□□ -1.87
COX11-208	ENST00000576084	OTULIN	Q96BN8	352 aa		3.4	□□□□□ -1.87
COX11-208	ENST00000576084	SAAL1	Q96ER3	474 aa		3.4	□□□□□ -1.87
COX11-208	ENST00000576084	IL17F	Q96PD4	163 aa		3.4	□□□□□ -1.87
COX11-208	ENST00000576084	MMTAG2	Q9BU76	263 aa	Known RBP	3.4	□□□□□ -1.87
COX11-208	ENST00000576084	USP44	Q9H0E7	712 aa		3.4	□□□□□ -1.87
COX11-208	ENST00000576084	RETREG1	Q9H6L5	497 aa		3.4	□□□□□ -1.87
COX11-208	ENST00000576084	EBF2	Q9HAK2	575 aa		3.4	□□□□□ -1.87
COX11-208	ENST00000576084	MAGEE1	Q9HCI5	957 aa		3.4	□□□□□ -1.87
COX11-208	ENST00000576084	OLA1	Q9NTK5	396 aa	Known RBP	3.4	□□□□□ -1.87

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