RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000570380.5

CTDNEP1-202, Transcript of CTD nuclear envelope phosphatase 1, humanhuman

TSL 5

Gene CTDNEP1, Length 506 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytosol .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTDNEP1-202ENST00000570380 RAPSNQ13702 412 aa10.3□□□□□ -0.76
CTDNEP1-202ENST00000570380 KIR2DS5Q14953 304 aa10.3□□□□□ -0.76
CTDNEP1-202ENST00000570380 TMCO4Q5TGY1 634 aa10.3□□□□□ -0.76
CTDNEP1-202ENST00000570380 CACHD1Q5VU97 1274 aa10.3□□□□□ -0.76
CTDNEP1-202ENST00000570380 NAA35Q5VZE5 725 aa10.3□□□□□ -0.76
CTDNEP1-202ENST00000570380 ARHGAP36Q6ZRI8 547 aa10.3□□□□□ -0.76
CTDNEP1-202ENST00000570380 PRSS42Q7Z5A4 293 aa10.3□□□□□ -0.76
CTDNEP1-202ENST00000570380 GLIS1Q8NBF1 620 aa10.3□□□□□ -0.76
CTDNEP1-202ENST00000570380 MSANTD4Q8NCY6 345 aa10.3□□□□□ -0.76
CTDNEP1-202ENST00000570380 INPP5DQ92835 1189 aa10.3□□□□□ -0.76
CTDNEP1-202ENST00000570380 SCAMP4Q969E2 229 aa10.3□□□□□ -0.76
CTDNEP1-202ENST00000570380 AP2M1Q96CW1 435 aa10.3□□□□□ -0.76
CTDNEP1-202ENST00000570380 PLEKHG4BQ96PX9 1271 aa10.3□□□□□ -0.76
CTDNEP1-202ENST00000570380 UCK1Q9HA47 277 aa10.3□□□□□ -0.76
CTDNEP1-202ENST00000570380 G3BP2Q9UN86 482 aaKnown RBP10.3□□□□□ -0.76
CTDNEP1-202ENST00000570380 B3GNT3Q9Y2A9 372 aa10.3□□□□□ -0.76
CTDNEP1-202ENST00000570380 COPG1Q9Y678 874 aaKnown RBP10.3□□□□□ -0.76
CTDNEP1-202ENST00000570380 DNHD1Q96M86 4753 aa10.3□□□□□ -0.76
CTDNEP1-202ENST00000570380 DOCK10Q96BY6 2186 aa10.29□□□□□ -0.76
CTDNEP1-202ENST00000570380 A0A1W2PQ67 120 aa10.29□□□□□ -0.76
CTDNEP1-202ENST00000570380 GTPBP10A4D1E9 387 aaKnown RBP10.29□□□□□ -0.76
CTDNEP1-202ENST00000570380 ARHGAP42A6NI28 874 aa10.29□□□□□ -0.76
CTDNEP1-202ENST00000570380 OR5K4A6NMS3 321 aa10.29□□□□□ -0.76
CTDNEP1-202ENST00000570380 F5H423 210 aaPredicted RBP10.29□□□□□ -0.76
CTDNEP1-202ENST00000570380 FGF10O15520 208 aaPredicted RBP10.29□□□□□ -0.76
CTDNEP1-202ENST00000570380 CPP00450 1065 aa10.29□□□□□ -0.76
CTDNEP1-202ENST00000570380 MMEP08473 750 aa10.29□□□□□ -0.76
CTDNEP1-202ENST00000570380 SLC2A4P14672 509 aa10.29□□□□□ -0.76
CTDNEP1-202ENST00000570380 AMD1P17707 334 aa10.29□□□□□ -0.76
CTDNEP1-202ENST00000570380 NELFEP18615 380 aaKnown RBP10.29□□□□□ -0.76
CTDNEP1-202ENST00000570380 ITGA3P26006 1051 aa10.29□□□□□ -0.76
CTDNEP1-202ENST00000570380 PER3P56645 1201 aa10.29□□□□□ -0.76
CTDNEP1-202ENST00000570380 TESK1Q15569 626 aa10.29□□□□□ -0.76
CTDNEP1-202ENST00000570380 FAM69BQ5VUD6 431 aa10.29□□□□□ -0.76
CTDNEP1-202ENST00000570380 DPY19L2P1Q6NXN4 242 aa10.29□□□□□ -0.76
CTDNEP1-202ENST00000570380 ZNF517Q6ZMY9 492 aaPredicted RBP10.29□□□□□ -0.76
CTDNEP1-202ENST00000570380 FAM92BQ6ZTR7 304 aa10.29□□□□□ -0.76
CTDNEP1-202ENST00000570380 TMEM26Q6ZUK4 368 aa10.29□□□□□ -0.76
CTDNEP1-202ENST00000570380 NOP9Q86U38 636 aaKnown RBP10.29□□□□□ -0.76
CTDNEP1-202ENST00000570380 SERBP1Q8NC51 408 aaKnown RBP eCLIP10.29□□□□□ -0.76
CTDNEP1-202ENST00000570380 ST6GALNAC3Q8NDV1 305 aa10.29□□□□□ -0.76
CTDNEP1-202ENST00000570380 UBE2Q2Q8WVN8 375 aa10.29□□□□□ -0.76
CTDNEP1-202ENST00000570380 RSC1A1Q92681 617 aa10.29□□□□□ -0.76
CTDNEP1-202ENST00000570380 SCRN2Q96FV2 425 aa10.29□□□□□ -0.76
CTDNEP1-202ENST00000570380 FCRL4Q96PJ5 515 aa10.29□□□□□ -0.76
CTDNEP1-202ENST00000570380 PSKH2Q96QS6 385 aa10.29□□□□□ -0.76
CTDNEP1-202ENST00000570380 GDPD2Q9HCC8 539 aa10.29□□□□□ -0.76
CTDNEP1-202ENST00000570380 PDE7BQ9NP56 450 aa10.29□□□□□ -0.76
CTDNEP1-202ENST00000570380 SCHIP1Q9P0W5 487 aaPredicted RBP10.29□□□□□ -0.76
CTDNEP1-202ENST00000570380 C5AR2Q9P296 337 aa10.29□□□□□ -0.76
CTDNEP1-202ENST00000570380 RARRES3Q9UL19 164 aa10.29□□□□□ -0.76
CTDNEP1-202ENST00000570380 FZD10Q9ULW2 581 aa10.29□□□□□ -0.76
CTDNEP1-202ENST00000570380 OSGIN2Q9Y236 505 aa10.29□□□□□ -0.76
CTDNEP1-202ENST00000570380 ZDHHC9Q9Y397 364 aa10.29□□□□□ -0.76
CTDNEP1-202ENST00000570380 LOC107983988A0A1B0GUW6 1196 aaPredicted RBP10.28□□□□□ -0.76
CTDNEP1-202ENST00000570380 DIAPH2O60879 1101 aa10.28□□□□□ -0.76
CTDNEP1-202ENST00000570380 SOCS5O75159 536 aa10.28□□□□□ -0.76
CTDNEP1-202ENST00000570380 FOLR1P15328 257 aa10.28□□□□□ -0.76
CTDNEP1-202ENST00000570380 CTPS1P17812 591 aa10.28□□□□□ -0.76
CTDNEP1-202ENST00000570380 XRCC1P18887 633 aaPredicted RBP10.28□□□□□ -0.76
CTDNEP1-202ENST00000570380 MMP8P22894 467 aa10.28□□□□□ -0.76
CTDNEP1-202ENST00000570380 RFC1P35251 1148 aaPredicted RBP10.28□□□□□ -0.76
CTDNEP1-202ENST00000570380 PTSQ03393 145 aa10.28□□□□□ -0.76
CTDNEP1-202ENST00000570380 TRAF2Q12933 501 aa10.28□□□□□ -0.76
CTDNEP1-202ENST00000570380 PAK1Q13153 545 aa10.28□□□□□ -0.76
CTDNEP1-202ENST00000570380 TUBB3Q13509 450 aa10.28□□□□□ -0.76
CTDNEP1-202ENST00000570380 RFTN1Q14699 578 aaPredicted RBP10.28□□□□□ -0.76
CTDNEP1-202ENST00000570380 KCNAB1Q14722 419 aa10.28□□□□□ -0.76
CTDNEP1-202ENST00000570380 IZUMO3Q5VZ72 239 aa10.28□□□□□ -0.76
CTDNEP1-202ENST00000570380 LCN10Q6JVE6 187 aa10.28□□□□□ -0.76
CTDNEP1-202ENST00000570380 SCYL2Q6P3W7 929 aa10.28□□□□□ -0.76
CTDNEP1-202ENST00000570380 MED25Q71SY5 747 aa10.28□□□□□ -0.76
CTDNEP1-202ENST00000570380 GDF7Q7Z4P5 450 aa10.28□□□□□ -0.76
CTDNEP1-202ENST00000570380 NLRP8Q86W28 1048 aa10.28□□□□□ -0.76
CTDNEP1-202ENST00000570380 KCNMB4Q86W47 210 aa10.28□□□□□ -0.76
CTDNEP1-202ENST00000570380 CREBRFQ8IUR6 639 aa10.28□□□□□ -0.76
CTDNEP1-202ENST00000570380 ARHGAP12Q8IWW6 846 aa10.28□□□□□ -0.76
CTDNEP1-202ENST00000570380 ARFGAP1Q8N6T3 406 aa10.28□□□□□ -0.76
CTDNEP1-202ENST00000570380 TMEM102Q8N9M5 508 aaPredicted RBP10.28□□□□□ -0.76
CTDNEP1-202ENST00000570380 AVL9Q8NBF6 648 aa10.28□□□□□ -0.76
CTDNEP1-202ENST00000570380 EXD1Q8NHP7 514 aa10.28□□□□□ -0.76
CTDNEP1-202ENST00000570380 MR1Q95460 341 aa10.28□□□□□ -0.76
CTDNEP1-202ENST00000570380 SMIM14Q96QK8 99 aa10.28□□□□□ -0.76
CTDNEP1-202ENST00000570380 MCCC1Q96RQ3 725 aaPredicted RBP10.28□□□□□ -0.76
CTDNEP1-202ENST00000570380 CHST8Q9H2A9 424 aa10.28□□□□□ -0.76
CTDNEP1-202ENST00000570380 VPS18Q9P253 973 aa10.28□□□□□ -0.76
CTDNEP1-202ENST00000570380 KIAA1468Q9P260 1216 aa10.28□□□□□ -0.76
CTDNEP1-202ENST00000570380 ZNF624Q9P2J8 865 aaPredicted RBP10.28□□□□□ -0.76
CTDNEP1-202ENST00000570380 CNOT6Q9ULM6 557 aaKnown RBP10.28□□□□□ -0.76
CTDNEP1-202ENST00000570380 ANKRD12Q6UB98 2062 aa10.27□□□□□ -0.76
CTDNEP1-202ENST00000570380 CNTRLQ7Z7A1 2325 aa10.27□□□□□ -0.77
CTDNEP1-202ENST00000570380 IGHV5-51A0A0C4DH38 117 aa10.27□□□□□ -0.77
CTDNEP1-202ENST00000570380 VIPP01282 170 aa10.27□□□□□ -0.77
CTDNEP1-202ENST00000570380 HSP90AA1P07900 732 aaKnown RBP10.27□□□□□ -0.77
CTDNEP1-202ENST00000570380 GPD1P21695 349 aa10.27□□□□□ -0.77
CTDNEP1-202ENST00000570380 SLC19A1P41440 591 aa10.27□□□□□ -0.77
CTDNEP1-202ENST00000570380 CAPZBP47756 277 aa10.27□□□□□ -0.77
CTDNEP1-202ENST00000570380 GLRBP48167 497 aa10.27□□□□□ -0.77
CTDNEP1-202ENST00000570380 VAV2P52735 878 aa10.27□□□□□ -0.77
CTDNEP1-202ENST00000570380 TPI1P60174 286 aa10.27□□□□□ -0.77
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 56.3 ms