RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000566452.1

BBS2-215, Transcript of Bardet-Biedl syndrome 2, human

TSL 2

Gene BBS2, Length 299 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
BBS2-215	ENST00000566452	MEGF6	O75095	1541 aa		3.75	□□□□□ -1.81
BBS2-215	ENST00000566452	TTC21A	Q8NDW8	1320 aa		3.75	□□□□□ -1.81
BBS2-215	ENST00000566452	SLX4	Q8IY92	1834 aa		3.75	□□□□□ -1.81
BBS2-215	ENST00000566452	EDDM13	A0A1B0GTR0	161 aa		3.75	□□□□□ -1.81
BBS2-215	ENST00000566452	FAM157A	C9JC47	383 aa		3.75	□□□□□ -1.81
BBS2-215	ENST00000566452	BTBD19	C9JJ37	291 aa		3.75	□□□□□ -1.81
BBS2-215	ENST00000566452	RTCA	O00442	366 aa	Known RBP	3.75	□□□□□ -1.81
BBS2-215	ENST00000566452	GCAT	O75600	419 aa		3.75	□□□□□ -1.81
BBS2-215	ENST00000566452	DDN	O94850	711 aa	Predicted RBP	3.75	□□□□□ -1.81
BBS2-215	ENST00000566452	SIX3	O95343	332 aa	Predicted RBP	3.75	□□□□□ -1.81
BBS2-215	ENST00000566452	ELFN1	P0C7U0	828 aa		3.75	□□□□□ -1.81
BBS2-215	ENST00000566452	EGR2	P11161	476 aa	Predicted RBP	3.75	□□□□□ -1.81
BBS2-215	ENST00000566452	ATF7	P17544	494 aa	Predicted RBP	3.75	□□□□□ -1.81
BBS2-215	ENST00000566452	CTPS1	P17812	591 aa		3.75	□□□□□ -1.81
BBS2-215	ENST00000566452	ITGAX	P20702	1163 aa		3.75	□□□□□ -1.81
BBS2-215	ENST00000566452	DRD4	P21917	467 aa		3.75	□□□□□ -1.81
BBS2-215	ENST00000566452	TCEA1	P23193	301 aa	Known RBP	3.75	□□□□□ -1.81
BBS2-215	ENST00000566452	RYK	P34925	604 aa		3.75	□□□□□ -1.81
BBS2-215	ENST00000566452	AMPH	P49418	695 aa		3.75	□□□□□ -1.81
BBS2-215	ENST00000566452	CLCN3	P51790	818 aa		3.75	□□□□□ -1.81
BBS2-215	ENST00000566452	CLCNKB	P51801	687 aa		3.75	□□□□□ -1.81
BBS2-215	ENST00000566452	TAS2R40	P59535	323 aa		3.75	□□□□□ -1.81
BBS2-215	ENST00000566452	MRPS34	P82930	218 aa	Known RBP	3.75	□□□□□ -1.81
BBS2-215	ENST00000566452	SLC18A2	Q05940	514 aa		3.75	□□□□□ -1.81
BBS2-215	ENST00000566452	SLC14A1	Q13336	389 aa		3.75	□□□□□ -1.81
BBS2-215	ENST00000566452	TUBB2A	Q13885	445 aa		3.75	□□□□□ -1.81
BBS2-215	ENST00000566452	KPNB1	Q14974	876 aa	Known RBP	3.75	□□□□□ -1.81
BBS2-215	ENST00000566452	MEP1B	Q16820	701 aa		3.75	□□□□□ -1.81
BBS2-215	ENST00000566452	PFKFB3	Q16875	520 aa	Predicted RBP	3.75	□□□□□ -1.81
BBS2-215	ENST00000566452	PARP10	Q53GL7	1025 aa		3.75	□□□□□ -1.81
BBS2-215	ENST00000566452	CC2D1B	Q5T0F9	858 aa	Known RBP	3.75	□□□□□ -1.81
BBS2-215	ENST00000566452	LCTL	Q6UWM7	567 aa		3.75	□□□□□ -1.81
BBS2-215	ENST00000566452	TAOK1	Q7L7X3	1001 aa		3.75	□□□□□ -1.81
BBS2-215	ENST00000566452	AACS	Q86V21	672 aa		3.75	□□□□□ -1.81
BBS2-215	ENST00000566452	HSCB	Q8IWL3	235 aa		3.75	□□□□□ -1.81
BBS2-215	ENST00000566452	SCYL3	Q8IZE3	742 aa		3.75	□□□□□ -1.81
BBS2-215	ENST00000566452	CADM3	Q8N126	398 aa		3.75	□□□□□ -1.81
BBS2-215	ENST00000566452	ZNF619	Q8N2I2	560 aa		3.75	□□□□□ -1.81
BBS2-215	ENST00000566452	ZCCHC9	Q8N567	271 aa	Known RBP	3.75	□□□□□ -1.81
BBS2-215	ENST00000566452	TMEM217	Q8N7C4	229 aa		3.75	□□□□□ -1.81
BBS2-215	ENST00000566452	CAMKV	Q8NCB2	501 aa		3.75	□□□□□ -1.81
BBS2-215	ENST00000566452	OR4N2	Q8NGD1	307 aa		3.75	□□□□□ -1.81
BBS2-215	ENST00000566452	SLC25A43	Q8WUT9	341 aa	Predicted RBP	3.75	□□□□□ -1.81
BBS2-215	ENST00000566452	TEKT4	Q8WW24	435 aa		3.75	□□□□□ -1.81
BBS2-215	ENST00000566452	KCNE4	Q8WWG9	221 aa		3.75	□□□□□ -1.81
BBS2-215	ENST00000566452	IP6K1	Q92551	441 aa		3.75	□□□□□ -1.81
BBS2-215	ENST00000566452	KAT2B	Q92831	832 aa		3.75	□□□□□ -1.81
BBS2-215	ENST00000566452	DAZAP1	Q96EP5	407 aa	Known RBP	3.75	□□□□□ -1.81
BBS2-215	ENST00000566452	ZC3HAV1L	Q96H79	300 aa	Known RBP	3.75	□□□□□ -1.81
BBS2-215	ENST00000566452	HARBI1	Q96MB7	349 aa		3.75	□□□□□ -1.81
BBS2-215	ENST00000566452		Q96MF0	132 aa		3.75	□□□□□ -1.81
BBS2-215	ENST00000566452	ADO	Q96SZ5	270 aa		3.75	□□□□□ -1.81
BBS2-215	ENST00000566452	TUBB2B	Q9BVA1	445 aa		3.75	□□□□□ -1.81
BBS2-215	ENST00000566452	C1QTNF5	Q9BXJ0	243 aa		3.75	□□□□□ -1.81
BBS2-215	ENST00000566452	FAM129A	Q9BZQ8	928 aa		3.75	□□□□□ -1.81
BBS2-215	ENST00000566452	RTN4R	Q9BZR6	473 aa		3.75	□□□□□ -1.81
BBS2-215	ENST00000566452	ACTR5	Q9H9F9	607 aa	Predicted RBP	3.75	□□□□□ -1.81
BBS2-215	ENST00000566452	PAPOLB	Q9NRJ5	636 aa	Known RBP	3.75	□□□□□ -1.81
BBS2-215	ENST00000566452	PARPBP	Q9NWS1	579 aa		3.75	□□□□□ -1.81
BBS2-215	ENST00000566452	ASIC5	Q9NY37	505 aa		3.75	□□□□□ -1.81
BBS2-215	ENST00000566452	DDX25	Q9UHL0	483 aa	Known RBP	3.75	□□□□□ -1.81
BBS2-215	ENST00000566452	MAFF	Q9ULX9	164 aa		3.75	□□□□□ -1.81
BBS2-215	ENST00000566452	R3HDM2	Q9Y2K5	976 aa	Known RBP	3.75	□□□□□ -1.81
BBS2-215	ENST00000566452	SCN11A	Q9UI33	1791 aa		3.75	□□□□□ -1.81
BBS2-215	ENST00000566452	CENPJ	Q9HC77	1338 aa	Predicted RBP	3.74	□□□□□ -1.81
BBS2-215	ENST00000566452	THSD7B	Q9C0I4	1608 aa		3.74	□□□□□ -1.81
BBS2-215	ENST00000566452	ARFGEF2	Q9Y6D5	1785 aa		3.74	□□□□□ -1.81
BBS2-215	ENST00000566452		A0A0A0MQY5	61 aa		3.74	□□□□□ -1.81
BBS2-215	ENST00000566452	TYW5	A2RUC4	315 aa	Known RBP	3.74	□□□□□ -1.81
BBS2-215	ENST00000566452		A4D1N5	150 aa		3.74	□□□□□ -1.81
BBS2-215	ENST00000566452	CXorf65	A6NEN9	183 aa		3.74	□□□□□ -1.81
BBS2-215	ENST00000566452	OR6C76	A6NM76	312 aa		3.74	□□□□□ -1.81
BBS2-215	ENST00000566452	HSPB2	A8KAH6	182 aa		3.74	□□□□□ -1.81
BBS2-215	ENST00000566452	MAGEB17	A8MXT2	336 aa		3.74	□□□□□ -1.81
BBS2-215	ENST00000566452		H7C1Q1	480 aa		3.74	□□□□□ -1.81
BBS2-215	ENST00000566452	RNMT	O43148	476 aa	Known RBP	3.74	□□□□□ -1.81
BBS2-215	ENST00000566452	SLCO2B1	O94956	709 aa		3.74	□□□□□ -1.81
BBS2-215	ENST00000566452	TRUB2	O95900	331 aa	Known RBP	3.74	□□□□□ -1.81
BBS2-215	ENST00000566452	PENK	P01210	267 aa	Predicted RBP	3.74	□□□□□ -1.81
BBS2-215	ENST00000566452	HIST1H2AB	P04908	130 aa		3.74	□□□□□ -1.81
BBS2-215	ENST00000566452	SNRNP70	P08621	437 aa	Known RBP	3.74	□□□□□ -1.81
BBS2-215	ENST00000566452	VPREB1	P12018	145 aa		3.74	□□□□□ -1.81
BBS2-215	ENST00000566452	SRC	P12931	536 aa		3.74	□□□□□ -1.81
BBS2-215	ENST00000566452	P4HA1	P13674	534 aa		3.74	□□□□□ -1.81
BBS2-215	ENST00000566452	ANXA7	P20073	488 aa	Known RBP	3.74	□□□□□ -1.81
BBS2-215	ENST00000566452	HIST1H2AD	P20671	130 aa		3.74	□□□□□ -1.81
BBS2-215	ENST00000566452	NR4A1	P22736	598 aa		3.74	□□□□□ -1.81
BBS2-215	ENST00000566452	ACADL	P28330	430 aa		3.74	□□□□□ -1.81
BBS2-215	ENST00000566452	RFC4	P35249	363 aa		3.74	□□□□□ -1.81
BBS2-215	ENST00000566452	IDUA	P35475	653 aa		3.74	□□□□□ -1.81
BBS2-215	ENST00000566452	GRIA3	P42263	894 aa		3.74	□□□□□ -1.81
BBS2-215	ENST00000566452	GPR12	P47775	334 aa		3.74	□□□□□ -1.81
BBS2-215	ENST00000566452	SOX2	P48431	317 aa		3.74	□□□□□ -1.81
BBS2-215	ENST00000566452	CCT8	P50990	548 aa		3.74	□□□□□ -1.81
BBS2-215	ENST00000566452	CYP4F2	P78329	520 aa		3.74	□□□□□ -1.81
BBS2-215	ENST00000566452	ECT2L	Q008S8	904 aa		3.74	□□□□□ -1.81
BBS2-215	ENST00000566452	GRIK3	Q13003	919 aa		3.74	□□□□□ -1.81
BBS2-215	ENST00000566452	KLF10	Q13118	480 aa		3.74	□□□□□ -1.81
BBS2-215	ENST00000566452	ITPK1	Q13572	414 aa		3.74	□□□□□ -1.81
BBS2-215	ENST00000566452	ZNF273	Q14593	569 aa		3.74	□□□□□ -1.81

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