RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000549030.1

PACS2-209, Transcript of phosphofurin acidic cluster sorting protein 2, humanhuman

TSL 2

Gene PACS2, Length 1,925 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PACS2-209ENST00000549030 INTS10Q9NVR2 710 aaKnown RBP20.47■□□□□ 0.87
PACS2-209ENST00000549030 TMPRSS11EQ9UL52 423 aa20.47■□□□□ 0.87
PACS2-209ENST00000549030 RNASEH2AO75792 299 aaKnown RBP20.47■□□□□ 0.87
PACS2-209ENST00000549030 C6P13671 934 aa20.47■□□□□ 0.87
PACS2-209ENST00000549030 TTPAP49638 278 aa20.47■□□□□ 0.87
PACS2-209ENST00000549030 CDKN2DP55273 166 aa20.47■□□□□ 0.87
PACS2-209ENST00000549030 IFT88Q13099 833 aa20.47■□□□□ 0.87
PACS2-209ENST00000549030 TMEM52BQ4KMG9 183 aa20.47■□□□□ 0.87
PACS2-209ENST00000549030 HECTD2Q5U5R9 776 aa20.47■□□□□ 0.87
PACS2-209ENST00000549030 KYAT3Q6YP21 454 aaKnown RBP20.47■□□□□ 0.87
PACS2-209ENST00000549030 SPATA21Q7Z572 469 aa20.47■□□□□ 0.87
PACS2-209ENST00000549030 RIOK2Q9BVS4 552 aaKnown RBP20.47■□□□□ 0.87
PACS2-209ENST00000549030 FOXQ1Q9C009 403 aa20.47■□□□□ 0.87
PACS2-209ENST00000549030 C2orf42Q9NWW7 574 aa20.47■□□□□ 0.87
PACS2-209ENST00000549030 DCDC2Q9UHG0 476 aa20.47■□□□□ 0.87
PACS2-209ENST00000549030 CRLS1Q9UJA2 301 aa20.47■□□□□ 0.87
PACS2-209ENST00000549030 FBXL21Q9UKT6 434 aa20.47■□□□□ 0.87
PACS2-209ENST00000549030 H0Y858 1186 aa20.46■□□□□ 0.87
PACS2-209ENST00000549030 GLRA3O75311 464 aa20.46■□□□□ 0.87
PACS2-209ENST00000549030 FMO4P31512 558 aa20.46■□□□□ 0.87
PACS2-209ENST00000549030 SUOXP51687 545 aa20.46■□□□□ 0.87
PACS2-209ENST00000549030 TIAL1Q01085 375 aaKnown RBP eCLIP20.46■□□□□ 0.87
PACS2-209ENST00000549030 PRKCQQ04759 706 aa20.46■□□□□ 0.87
PACS2-209ENST00000549030 SF3A3Q12874 501 aaKnown RBP eCLIP20.46■□□□□ 0.873e-11■■■■■ 74.1
PACS2-209ENST00000549030 EOGTQ5NDL2 527 aa20.46■□□□□ 0.87
PACS2-209ENST00000549030 YTHDF3Q7Z739 585 aaKnown RBP20.46■□□□□ 0.87
PACS2-209ENST00000549030 PELI3Q8N2H9 469 aa20.46■□□□□ 0.87
PACS2-209ENST00000549030 ARMC2Q8NEN0 867 aa20.46■□□□□ 0.87
PACS2-209ENST00000549030 RAB7BQ96AH8 199 aa20.46■□□□□ 0.87
PACS2-209ENST00000549030 FAM136AQ96C01 138 aa20.46■□□□□ 0.87
PACS2-209ENST00000549030 MRGPRX1Q96LB2 322 aa20.46■□□□□ 0.87
PACS2-209ENST00000549030 BIRC8Q96P09 236 aa20.46■□□□□ 0.87
PACS2-209ENST00000549030 TCF12Q99081 682 aa20.46■□□□□ 0.87
PACS2-209ENST00000549030 SPATA16Q9BXB7 569 aa20.46■□□□□ 0.87
PACS2-209ENST00000549030 FAM83DQ9H4H8 585 aa20.46■□□□□ 0.87
PACS2-209ENST00000549030 FBXL12Q9NXK8 326 aa20.46■□□□□ 0.87
PACS2-209ENST00000549030 AGAP14A8MT82 685 aa20.45■□□□□ 0.86
PACS2-209ENST00000549030 DNAJC6O75061 913 aa20.45■□□□□ 0.86
PACS2-209ENST00000549030 DNTTP04053 509 aa20.45■□□□□ 0.86
PACS2-209ENST00000549030 C2P06681 752 aa20.45■□□□□ 0.86
PACS2-209ENST00000549030 NDUFV2P19404 249 aa20.45■□□□□ 0.86
PACS2-209ENST00000549030 ACRV1P26436 265 aa20.45■□□□□ 0.86
PACS2-209ENST00000549030 PTPN5P54829 565 aa20.45■□□□□ 0.86
PACS2-209ENST00000549030 DCDC1P59894 354 aa20.45■□□□□ 0.86
PACS2-209ENST00000549030 FZD5Q13467 585 aa20.45■□□□□ 0.86
PACS2-209ENST00000549030 UBXN2BQ14CS0 331 aa20.45■□□□□ 0.86
PACS2-209ENST00000549030 INSCQ1MX18 579 aa20.45■□□□□ 0.86
PACS2-209ENST00000549030 CTSL3PQ5NE16 218 aa20.45■□□□□ 0.86
PACS2-209ENST00000549030 HENMT1Q5T8I9 393 aaKnown RBP20.45■□□□□ 0.86
PACS2-209ENST00000549030 PIM3Q86V86 326 aa20.45■□□□□ 0.86
PACS2-209ENST00000549030 SIX5Q8N196 739 aa20.45■□□□□ 0.86
PACS2-209ENST00000549030 PLD6Q8N2A8 252 aaKnown RBP20.45■□□□□ 0.86
PACS2-209ENST00000549030 DTD2Q96FN9 168 aa20.45■□□□□ 0.86
PACS2-209ENST00000549030 FBRSQ9HAH7 460 aa20.45■□□□□ 0.86
PACS2-209ENST00000549030 LMAN1LQ9HAT1 526 aa20.45■□□□□ 0.86
PACS2-209ENST00000549030 ZNF358Q9NW07 568 aa20.45■□□□□ 0.86
PACS2-209ENST00000549030 WNT16Q9UBV4 365 aa20.45■□□□□ 0.86
PACS2-209ENST00000549030 A0A096LPK6 155 aa20.45■□□□□ 0.86
PACS2-209ENST00000549030 TCRBV21S2A2A0A5A6 115 aa20.45■□□□□ 0.86
PACS2-209ENST00000549030 FADS2P1A8MWK0 482 aa20.45■□□□□ 0.86
PACS2-209ENST00000549030 PSMD11O00231 422 aa20.45■□□□□ 0.86
PACS2-209ENST00000549030 RECQL5O94762 991 aaPredicted RBP20.45■□□□□ 0.86
PACS2-209ENST00000549030 SLC35E2BP0CK96 405 aa20.45■□□□□ 0.86
PACS2-209ENST00000549030 GAS6Q14393 721 aa20.45■□□□□ 0.86
PACS2-209ENST00000549030 CRY1Q16526 586 aa20.45■□□□□ 0.86
PACS2-209ENST00000549030 AARS2Q5JTZ9 985 aaKnown RBP20.45■□□□□ 0.86
PACS2-209ENST00000549030 ZDHHC20Q5W0Z9 365 aa20.45■□□□□ 0.86
PACS2-209ENST00000549030 NXPE1Q8N323 547 aa20.45■□□□□ 0.86
PACS2-209ENST00000549030 GANCQ8TET4 914 aa20.45■□□□□ 0.86
PACS2-209ENST00000549030 TBRG4Q969Z0 631 aaKnown RBP eCLIP20.45■□□□□ 0.861e-7■■■■■ 35.3
PACS2-209ENST00000549030 LTB4R2Q9NPC1 389 aa20.45■□□□□ 0.86
PACS2-209ENST00000549030 EMCNQ9ULC0 261 aa20.45■□□□□ 0.86
PACS2-209ENST00000549030 MED16Q9Y2X0 877 aa20.45■□□□□ 0.86
PACS2-209ENST00000549030 KLF11O14901 512 aa20.44■□□□□ 0.86
PACS2-209ENST00000549030 WNT9AO14904 365 aa20.44■□□□□ 0.86
PACS2-209ENST00000549030 STARD6P59095 220 aa20.44■□□□□ 0.86
PACS2-209ENST00000549030 RAB10P61026 200 aa20.44■□□□□ 0.86
PACS2-209ENST00000549030 POU4F1Q01851 419 aa20.44■□□□□ 0.86
PACS2-209ENST00000549030 GPR33Q49SQ1 333 aa20.44■□□□□ 0.86
PACS2-209ENST00000549030 HSF5Q4G112 596 aaPredicted RBP20.44■□□□□ 0.86
PACS2-209ENST00000549030 RAPH1Q70E73 1250 aa20.44■□□□□ 0.86
PACS2-209ENST00000549030 CXorf40AQ8TE69 158 aa20.44■□□□□ 0.86
PACS2-209ENST00000549030 SIPA1Q96FS4 1042 aa20.44■□□□□ 0.86
PACS2-209ENST00000549030 AARSD1Q9BTE6 412 aaKnown RBP20.44■□□□□ 0.86
PACS2-209ENST00000549030 CD320Q9NPF0 282 aa20.44■□□□□ 0.86
PACS2-209ENST00000549030 SIRPGQ9P1W8 387 aa20.44■□□□□ 0.86
PACS2-209ENST00000549030 NFKBIL1Q9UBC1 381 aaPredicted RBP20.44■□□□□ 0.86
PACS2-209ENST00000549030 VWA7Q9Y334 891 aa20.44■□□□□ 0.86
PACS2-209ENST00000549030 PRSS21Q9Y6M0 314 aa20.44■□□□□ 0.86
PACS2-209ENST00000549030 BIRC5O15392 142 aa20.43■□□□□ 0.86
PACS2-209ENST00000549030 MPOP05164 745 aa20.43■□□□□ 0.86
PACS2-209ENST00000549030 STMN1P16949 149 aa20.43■□□□□ 0.86
PACS2-209ENST00000549030 GABRG2P18507 467 aa20.43■□□□□ 0.86
PACS2-209ENST00000549030 BGNP21810 368 aa20.43■□□□□ 0.86
PACS2-209ENST00000549030 RNF187Q5TA31 235 aaPredicted RBP20.43■□□□□ 0.86
PACS2-209ENST00000549030 OTOAQ7RTW8 1153 aa20.43■□□□□ 0.86
PACS2-209ENST00000549030 SCG3Q8WXD2 468 aaKnown RBP20.43■□□□□ 0.86
PACS2-209ENST00000549030 FAM131CQ96AQ9 280 aa20.43■□□□□ 0.86
PACS2-209ENST00000549030 P2RY12Q9H244 342 aa20.43■□□□□ 0.86
PACS2-209ENST00000549030 GALPQ9UBC7 116 aa20.43■□□□□ 0.86
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