RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000516272.1

RNU6-277P-201, Transcript of RNA, U6 small nuclear 277, pseudogene, humanhuman

BASIC

Gene RNU6-277P, Length 106 nt, Biotype snRNA.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNU6-277P-201ENST00000516272 SLC44A1Q8WWI5 657 aa2.53□□□□□ -2
RNU6-277P-201ENST00000516272 DNAAF4Q8WXU2 420 aa2.53□□□□□ -2
RNU6-277P-201ENST00000516272 OXNAD1Q96HP4 312 aaPredicted RBP2.53□□□□□ -2
RNU6-277P-201ENST00000516272 SLC41A2Q96JW4 573 aa2.53□□□□□ -2
RNU6-277P-201ENST00000516272 FAM110AQ9BQ89 295 aa2.53□□□□□ -2
RNU6-277P-201ENST00000516272 VEZTQ9HBM0 779 aa2.53□□□□□ -2
RNU6-277P-201ENST00000516272 TRPC7Q9HCX4 862 aa2.53□□□□□ -2
RNU6-277P-201ENST00000516272 ACSS1Q9NUB1 689 aaPredicted RBP2.53□□□□□ -2
RNU6-277P-201ENST00000516272 PYGO1Q9Y3Y4 419 aa2.53□□□□□ -2
RNU6-277P-201ENST00000516272 PRRC2AP48634 2157 aaKnown RBP2.53□□□□□ -2
RNU6-277P-201ENST00000516272 SRSF10O75494 262 aaKnown RBP2.52□□□□□ -2.01
RNU6-277P-201ENST00000516272 PDE9AO76083 593 aa2.52□□□□□ -2.01
RNU6-277P-201ENST00000516272 URODP06132 367 aa2.52□□□□□ -2.01
RNU6-277P-201ENST00000516272 MCCP23508 829 aa2.52□□□□□ -2.01
RNU6-277P-201ENST00000516272 CHKAP35790 457 aa2.52□□□□□ -2.01
RNU6-277P-201ENST00000516272 FASLGP48023 281 aa2.52□□□□□ -2.01
RNU6-277P-201ENST00000516272 CLDN20P56880 219 aa2.52□□□□□ -2.01
RNU6-277P-201ENST00000516272 TBX4P57082 545 aa2.52□□□□□ -2.01
RNU6-277P-201ENST00000516272 TBX2Q13207 712 aaPredicted RBP2.52□□□□□ -2.01
RNU6-277P-201ENST00000516272 SLC12A1Q13621 1099 aa2.52□□□□□ -2.01
RNU6-277P-201ENST00000516272 TAF5Q15542 800 aa2.52□□□□□ -2.01
RNU6-277P-201ENST00000516272 KRTCAP3Q53RY4 240 aa2.52□□□□□ -2.01
RNU6-277P-201ENST00000516272 C18orf63Q68DL7 685 aa2.52□□□□□ -2.01
RNU6-277P-201ENST00000516272 TXNDC8Q6A555 127 aa2.52□□□□□ -2.01
RNU6-277P-201ENST00000516272 BHLHB9Q6PI77 547 aa2.52□□□□□ -2.01
RNU6-277P-201ENST00000516272 TRIM65Q6PJ69 517 aa2.52□□□□□ -2.01
RNU6-277P-201ENST00000516272 QSOX2Q6ZRP7 698 aa2.52□□□□□ -2.01
RNU6-277P-201ENST00000516272 MFSD6Q6ZSS7 791 aa2.52□□□□□ -2.01
RNU6-277P-201ENST00000516272 RRM2BQ7LG56 351 aa2.52□□□□□ -2.01
RNU6-277P-201ENST00000516272 LONP2Q86WA8 852 aa2.52□□□□□ -2.01
RNU6-277P-201ENST00000516272 MYCT1Q8N699 235 aa2.52□□□□□ -2.01
RNU6-277P-201ENST00000516272 RBM15BQ8NDT2 890 aaKnown RBP2.52□□□□□ -2.01
RNU6-277P-201ENST00000516272 KLHL29Q96CT2 875 aa2.52□□□□□ -2.01
RNU6-277P-201ENST00000516272 ELP4Q96EB1 424 aa2.52□□□□□ -2.01
RNU6-277P-201ENST00000516272 GMPPAQ96IJ6 420 aaPredicted RBP2.52□□□□□ -2.01
RNU6-277P-201ENST00000516272 PRMT6Q96LA8 375 aaPredicted RBP2.52□□□□□ -2.01
RNU6-277P-201ENST00000516272 H2AFJQ9BTM1 129 aa2.52□□□□□ -2.01
RNU6-277P-201ENST00000516272 TTYH1Q9H313 450 aaPredicted RBP2.52□□□□□ -2.01
RNU6-277P-201ENST00000516272 ATAD3AQ9NVI7 634 aa2.52□□□□□ -2.01
RNU6-277P-201ENST00000516272 PTTG2Q9NZH5 202 aa2.52□□□□□ -2.01
RNU6-277P-201ENST00000516272 CEPT1Q9Y6K0 416 aa2.52□□□□□ -2.01
RNU6-277P-201ENST00000516272 ADAMTS9Q9P2N4 1935 aa2.52□□□□□ -2.01
RNU6-277P-201ENST00000516272 DISP3Q9P2K9 1392 aa2.51□□□□□ -2.01
RNU6-277P-201ENST00000516272 CROCCQ5TZA2 2017 aa2.51□□□□□ -2.01
RNU6-277P-201ENST00000516272 TEX13CA0A0J9YWL9 993 aa2.51□□□□□ -2.01
RNU6-277P-201ENST00000516272 TMEM178BH3BS89 294 aa2.51□□□□□ -2.01
RNU6-277P-201ENST00000516272 SYNCRIPO60506 623 aaKnown RBP2.51□□□□□ -2.01
RNU6-277P-201ENST00000516272 DNAH10OSP0CZ25 163 aa2.51□□□□□ -2.01
RNU6-277P-201ENST00000516272 IGHV4-38-2P0DP08 117 aa2.51□□□□□ -2.01
RNU6-277P-201ENST00000516272 GATA2P23769 480 aaPredicted RBP2.51□□□□□ -2.01
RNU6-277P-201ENST00000516272 HTR3AP46098 478 aa2.51□□□□□ -2.01
RNU6-277P-201ENST00000516272 CDH15P55291 814 aa2.51□□□□□ -2.01
RNU6-277P-201ENST00000516272 NFIL3Q16649 462 aa2.51□□□□□ -2.01
RNU6-277P-201ENST00000516272 DECR1Q16698 335 aa2.51□□□□□ -2.01
RNU6-277P-201ENST00000516272 SNAI3Q3KNW1 292 aa2.51□□□□□ -2.01
RNU6-277P-201ENST00000516272 MAP9Q49MG5 647 aa2.51□□□□□ -2.01
RNU6-277P-201ENST00000516272 GTDC1Q4AE62 458 aa2.51□□□□□ -2.01
RNU6-277P-201ENST00000516272 TCTEX1D4Q5JR98 221 aa2.51□□□□□ -2.01
RNU6-277P-201ENST00000516272 SYCP2LQ5T4T6 812 aa2.51□□□□□ -2.01
RNU6-277P-201ENST00000516272 ADAMTSL4-AS1Q5T5F5 129 aa2.51□□□□□ -2.01
RNU6-277P-201ENST00000516272 ARHGEF16Q5VV41 709 aa2.51□□□□□ -2.01
RNU6-277P-201ENST00000516272 PWWP2BQ6NUJ5 590 aa2.51□□□□□ -2.01
RNU6-277P-201ENST00000516272 ZNF614Q8N883 585 aa2.51□□□□□ -2.01
RNU6-277P-201ENST00000516272 MRGPRDQ8TDS7 321 aa2.51□□□□□ -2.01
RNU6-277P-201ENST00000516272 APBB2Q92870 758 aa2.51□□□□□ -2.01
RNU6-277P-201ENST00000516272 PABPC5Q96DU9 382 aaKnown RBP2.51□□□□□ -2.01
RNU6-277P-201ENST00000516272 ZSCAN31Q96LW9 406 aaPredicted RBP2.51□□□□□ -2.01
RNU6-277P-201ENST00000516272 SIX2Q9NPC8 291 aa2.51□□□□□ -2.01
RNU6-277P-201ENST00000516272 SLC38A7Q9NVC3 462 aa2.51□□□□□ -2.01
RNU6-277P-201ENST00000516272 HSPB7Q9UBY9 170 aa2.51□□□□□ -2.01
RNU6-277P-201ENST00000516272 ATRXP46100 2492 aa2.51□□□□□ -2.01
RNU6-277P-201ENST00000516272 PCNX3Q9H6A9 2034 aa2.51□□□□□ -2.01
RNU6-277P-201ENST00000516272 FLT1P17948 1338 aa2.5□□□□□ -2.01
RNU6-277P-201ENST00000516272 IGLV7-46A0A075B6I9 117 aa2.5□□□□□ -2.01
RNU6-277P-201ENST00000516272 GOLGA6L10A0A0M3HER8 536 aa2.5□□□□□ -2.01
RNU6-277P-201ENST00000516272 MAGEB17A8MXT2 336 aa2.5□□□□□ -2.01
RNU6-277P-201ENST00000516272 H0YIN7 160 aa2.5□□□□□ -2.01
RNU6-277P-201ENST00000516272 TNPO2O14787 897 aaKnown RBP2.5□□□□□ -2.01
RNU6-277P-201ENST00000516272 IRAK2O43187 625 aa2.5□□□□□ -2.01
RNU6-277P-201ENST00000516272 EML2O95834 649 aa2.5□□□□□ -2.01
RNU6-277P-201ENST00000516272 CLPTM1O96005 669 aa2.5□□□□□ -2.01
RNU6-277P-201ENST00000516272 TPOP07202 933 aa2.5□□□□□ -2.01
RNU6-277P-201ENST00000516272 KRT19P08727 400 aa2.5□□□□□ -2.01
RNU6-277P-201ENST00000516272 SHC1P29353 583 aa2.5□□□□□ -2.01
RNU6-277P-201ENST00000516272 CCR10P46092 362 aa2.5□□□□□ -2.01
RNU6-277P-201ENST00000516272 SLC6A12P48065 614 aa2.5□□□□□ -2.01
RNU6-277P-201ENST00000516272 GNAQP50148 359 aa2.5□□□□□ -2.01
RNU6-277P-201ENST00000516272 MAD2L1Q13257 205 aaPredicted RBP2.5□□□□□ -2.01
RNU6-277P-201ENST00000516272 PEX6Q13608 980 aa2.5□□□□□ -2.01
RNU6-277P-201ENST00000516272 XKR6Q5GH73 641 aa2.5□□□□□ -2.01
RNU6-277P-201ENST00000516272 ZNF766Q5HY98 468 aa2.5□□□□□ -2.01
RNU6-277P-201ENST00000516272 WDR45BQ5MNZ6 344 aa2.5□□□□□ -2.01
RNU6-277P-201ENST00000516272 ALS2CLQ60I27 953 aa2.5□□□□□ -2.01
RNU6-277P-201ENST00000516272 ZNF613Q6PF04 617 aa2.5□□□□□ -2.01
RNU6-277P-201ENST00000516272 DOK6Q6PKX4 331 aa2.5□□□□□ -2.01
RNU6-277P-201ENST00000516272 CACNA2D4Q7Z3S7 1137 aa2.5□□□□□ -2.01
RNU6-277P-201ENST00000516272 CDC20BQ86Y33 519 aa2.5□□□□□ -2.01
RNU6-277P-201ENST00000516272 SUGP1Q8IWZ8 645 aaKnown RBP2.5□□□□□ -2.01
RNU6-277P-201ENST00000516272 LMNTD2Q8IXW0 634 aa2.5□□□□□ -2.01
RNU6-277P-201ENST00000516272 CCDC13Q8IYE1 715 aa2.5□□□□□ -2.01
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 59.2 ms