RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000516122.1

RNU6-871P-201, Transcript of RNA, U6 small nuclear 871, pseudogene, humanhuman

BASIC

Gene RNU6-871P, Length 100 nt, Biotype snRNA.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNU6-871P-201ENST00000516122 THAP10Q9P2Z0 257 aaPredicted RBP-0.93□□□□□ -2.56
RNU6-871P-201ENST00000516122 UPB1Q9UBR1 384 aa-0.93□□□□□ -2.56
RNU6-871P-201ENST00000516122 SLC12A4Q9UP95 1085 aa-0.93□□□□□ -2.56
RNU6-871P-201ENST00000516122 DNAJC16Q9Y2G8 782 aa-0.93□□□□□ -2.56
RNU6-871P-201ENST00000516122 A0A1W2PPL8 197 aa-0.94□□□□□ -2.56
RNU6-871P-201ENST00000516122 TMEM247A6NEH6 219 aa-0.94□□□□□ -2.56
RNU6-871P-201ENST00000516122 HNRNPRO43390 633 aaKnown RBP-0.94□□□□□ -2.56
RNU6-871P-201ENST00000516122 SNAI2O43623 268 aa-0.94□□□□□ -2.56
RNU6-871P-201ENST00000516122 IGSF3O75054 1194 aa-0.94□□□□□ -2.56
RNU6-871P-201ENST00000516122 VIL1P09327 827 aaKnown RBP-0.94□□□□□ -2.56
RNU6-871P-201ENST00000516122 ZCCHC18P0CG32 403 aa-0.94□□□□□ -2.56
RNU6-871P-201ENST00000516122 CD1EP15812 388 aa-0.94□□□□□ -2.56
RNU6-871P-201ENST00000516122 IBSPP21815 317 aaPredicted RBP-0.94□□□□□ -2.56
RNU6-871P-201ENST00000516122 AKAP5P24588 427 aa-0.94□□□□□ -2.56
RNU6-871P-201ENST00000516122 DDIT3P35638 169 aa-0.94□□□□□ -2.56
RNU6-871P-201ENST00000516122 EIF2S3P41091 472 aaKnown RBP-0.94□□□□□ -2.56
RNU6-871P-201ENST00000516122 MASP1P48740 699 aa-0.94□□□□□ -2.56
RNU6-871P-201ENST00000516122 KHKP50053 298 aa-0.94□□□□□ -2.56
RNU6-871P-201ENST00000516122 ILF2Q12905 390 aaKnown RBP-0.94□□□□□ -2.56
RNU6-871P-201ENST00000516122 KIAA0141Q14154 515 aaPredicted RBP-0.94□□□□□ -2.56
RNU6-871P-201ENST00000516122 MYLK3Q32MK0 819 aa-0.94□□□□□ -2.56
RNU6-871P-201ENST00000516122 P3H1Q32P28 736 aa-0.94□□□□□ -2.56
RNU6-871P-201ENST00000516122 PLEKHG6Q3KR16 790 aa-0.94□□□□□ -2.56
RNU6-871P-201ENST00000516122 NFRKBQ6P4R8 1299 aa-0.94□□□□□ -2.56
RNU6-871P-201ENST00000516122 PLXDC2Q6UX71 529 aa-0.94□□□□□ -2.56
RNU6-871P-201ENST00000516122 KIAA1324Q6UXG2 1013 aaKnown RBP-0.94□□□□□ -2.56
RNU6-871P-201ENST00000516122 KRTAP19-3Q7Z4W3 81 aa-0.94□□□□□ -2.56
RNU6-871P-201ENST00000516122 LACC1Q8IV20 430 aa-0.94□□□□□ -2.56
RNU6-871P-201ENST00000516122 RAB42Q8N4Z0 105 aa-0.94□□□□□ -2.56
RNU6-871P-201ENST00000516122 ENDOVQ8N8Q3 282 aaKnown RBP-0.94□□□□□ -2.56
RNU6-871P-201ENST00000516122 GOLGA6L2Q8N9W4 650 aaPredicted RBP-0.94□□□□□ -2.56
RNU6-871P-201ENST00000516122 MYRIPQ8NFW9 859 aa-0.94□□□□□ -2.56
RNU6-871P-201ENST00000516122 RASSF8Q8NHQ8 419 aa-0.94□□□□□ -2.56
RNU6-871P-201ENST00000516122 SLC38A5Q8WUX1 472 aa-0.94□□□□□ -2.56
RNU6-871P-201ENST00000516122 HPSE2Q8WWQ2 592 aa-0.94□□□□□ -2.56
RNU6-871P-201ENST00000516122 RNF183Q96D59 192 aa-0.94□□□□□ -2.56
RNU6-871P-201ENST00000516122 MVB12AQ96EY5 273 aa-0.94□□□□□ -2.56
RNU6-871P-201ENST00000516122 SLC47A1Q96FL8 570 aa-0.94□□□□□ -2.56
RNU6-871P-201ENST00000516122 ZNF597Q96LX8 424 aa-0.94□□□□□ -2.56
RNU6-871P-201ENST00000516122 WDFY2Q96P53 400 aa-0.94□□□□□ -2.56
RNU6-871P-201ENST00000516122 SMC6Q96SB8 1091 aa-0.94□□□□□ -2.56
RNU6-871P-201ENST00000516122 FAM126AQ9BYI3 521 aaPredicted RBP-0.94□□□□□ -2.56
RNU6-871P-201ENST00000516122 TKTL2Q9H0I9 626 aa-0.94□□□□□ -2.56
RNU6-871P-201ENST00000516122 ZBTB26Q9HCK0 441 aa-0.94□□□□□ -2.56
RNU6-871P-201ENST00000516122 SERINC1Q9NRX5 453 aa-0.94□□□□□ -2.56
RNU6-871P-201ENST00000516122 TEX10Q9NXF1 929 aaPredicted RBP-0.94□□□□□ -2.56
RNU6-871P-201ENST00000516122 NDE1Q9NXR1 346 aa-0.94□□□□□ -2.56
RNU6-871P-201ENST00000516122 PADI3Q9ULW8 664 aa-0.94□□□□□ -2.56
RNU6-871P-201ENST00000516122 PPP1R3CQ9UQK1 317 aa-0.94□□□□□ -2.56
RNU6-871P-201ENST00000516122 MAGED1Q9Y5V3 778 aaPredicted RBP-0.94□□□□□ -2.56
RNU6-871P-201ENST00000516122 UBIAD1Q9Y5Z9 338 aa-0.94□□□□□ -2.56
RNU6-871P-201ENST00000516122 NAV2Q8IVL1 2488 aa-0.94□□□□□ -2.56
RNU6-871P-201ENST00000516122 A0A1W2PQM1 296 aa-0.95□□□□□ -2.56
RNU6-871P-201ENST00000516122 C15orf61A6NNL5 157 aa-0.95□□□□□ -2.56
RNU6-871P-201ENST00000516122 ZNF195O14628 629 aa-0.95□□□□□ -2.56
RNU6-871P-201ENST00000516122 SNAP91O60641 907 aa-0.95□□□□□ -2.56
RNU6-871P-201ENST00000516122 TAF5LO75529 589 aa-0.95□□□□□ -2.56
RNU6-871P-201ENST00000516122 CELP19835 753 aa-0.95□□□□□ -2.56
RNU6-871P-201ENST00000516122 PRKACGP22612 351 aa-0.95□□□□□ -2.56
RNU6-871P-201ENST00000516122 SUMO3P55854 103 aaPredicted RBP-0.95□□□□□ -2.56
RNU6-871P-201ENST00000516122 CYCSP99999 105 aaKnown RBP-0.95□□□□□ -2.56
RNU6-871P-201ENST00000516122 ZNF543Q08ER8 600 aa-0.95□□□□□ -2.56
RNU6-871P-201ENST00000516122 KRTAP6-1Q3LI64 71 aa-0.95□□□□□ -2.56
RNU6-871P-201ENST00000516122 LINC00242Q5T6M2 205 aa-0.95□□□□□ -2.56
RNU6-871P-201ENST00000516122 ANKRD40Q6AI12 368 aa-0.95□□□□□ -2.56
RNU6-871P-201ENST00000516122 SLC36A4Q6YBV0 504 aa-0.95□□□□□ -2.56
RNU6-871P-201ENST00000516122 GDPGP1Q6ZNW5 385 aa-0.95□□□□□ -2.56
RNU6-871P-201ENST00000516122 PTAR1Q7Z6K3 402 aaPredicted RBP-0.95□□□□□ -2.56
RNU6-871P-201ENST00000516122 MIER2Q8N344 545 aa-0.95□□□□□ -2.56
RNU6-871P-201ENST00000516122 SCAIQ8N9R8 606 aa-0.95□□□□□ -2.56
RNU6-871P-201ENST00000516122 ATP8B4Q8TF62 1192 aa-0.95□□□□□ -2.56
RNU6-871P-201ENST00000516122 NPRL2Q8WTW4 380 aa-0.95□□□□□ -2.56
RNU6-871P-201ENST00000516122 SNAPC3Q92966 411 aa-0.95□□□□□ -2.56
RNU6-871P-201ENST00000516122 PSMB7Q99436 277 aa-0.95□□□□□ -2.56
RNU6-871P-201ENST00000516122 ATP13A3Q9H7F0 1226 aa-0.95□□□□□ -2.56
RNU6-871P-201ENST00000516122 SACM1LQ9NTJ5 587 aa-0.95□□□□□ -2.56
RNU6-871P-201ENST00000516122 INTS9Q9NV88 658 aaKnown RBP-0.95□□□□□ -2.56
RNU6-871P-201ENST00000516122 FLRT3Q9NZU0 649 aa-0.95□□□□□ -2.56
RNU6-871P-201ENST00000516122 THYN1Q9P016 225 aa-0.95□□□□□ -2.56
RNU6-871P-201ENST00000516122 GTF3C4Q9UKN8 822 aa-0.95□□□□□ -2.56
RNU6-871P-201ENST00000516122 RAB21Q9UL25 225 aa-0.95□□□□□ -2.56
RNU6-871P-201ENST00000516122 WDR37Q9Y2I8 494 aa-0.95□□□□□ -2.56
RNU6-871P-201ENST00000516122 PTPRCP08575 1304 aa-0.95□□□□□ -2.56
RNU6-871P-201ENST00000516122 A0A0G2JNG1 304 aa-0.96□□□□□ -2.56
RNU6-871P-201ENST00000516122 NPIPB13A6NJU9 1138 aa-0.96□□□□□ -2.56
RNU6-871P-201ENST00000516122 NCAM2O15394 837 aa-0.96□□□□□ -2.56
RNU6-871P-201ENST00000516122 WISP2O76076 250 aa-0.96□□□□□ -2.56
RNU6-871P-201ENST00000516122 NDUFB4O95168 129 aa-0.96□□□□□ -2.56
RNU6-871P-201ENST00000516122 LYPD3O95274 346 aa-0.96□□□□□ -2.56
RNU6-871P-201ENST00000516122 GPIP06744 558 aa-0.96□□□□□ -2.56
RNU6-871P-201ENST00000516122 SRD5A1P18405 259 aa-0.96□□□□□ -2.56
RNU6-871P-201ENST00000516122 MCCP23508 829 aa-0.96□□□□□ -2.56
RNU6-871P-201ENST00000516122 GRK5P34947 590 aa-0.96□□□□□ -2.56
RNU6-871P-201ENST00000516122 KIR2DS4P43632 304 aa-0.96□□□□□ -2.56
RNU6-871P-201ENST00000516122 CTSCP53634 463 aa-0.96□□□□□ -2.56
RNU6-871P-201ENST00000516122 OAZ1P54368 228 aa-0.96□□□□□ -2.56
RNU6-871P-201ENST00000516122 EGFEM1PQ0D2K5 195 aa-0.96□□□□□ -2.56
RNU6-871P-201ENST00000516122 KIR2DS5Q14953 304 aa-0.96□□□□□ -2.56
RNU6-871P-201ENST00000516122 RPE65Q16518 533 aa-0.96□□□□□ -2.56
RNU6-871P-201ENST00000516122 ME3Q16798 604 aa-0.96□□□□□ -2.56
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 10.4 ms