RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000515802.5

SH3BP2-229, Transcript of SH3 domain binding protein 2, humanhuman

TSL 2

Gene SH3BP2, Length 2,247 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SH3BP2-229ENST00000515802 CACNG1Q06432 222 aa14.97□□□□□ -0.01
SH3BP2-229ENST00000515802 CDKN3Q16667 212 aa14.97□□□□□ -0.01
SH3BP2-229ENST00000515802 PFKFB4Q16877 469 aa14.97□□□□□ -0.01
SH3BP2-229ENST00000515802 AARS2Q5JTZ9 985 aaKnown RBP14.97□□□□□ -0.01
SH3BP2-229ENST00000515802 TAS2R42Q7RTR8 314 aa14.97□□□□□ -0.01
SH3BP2-229ENST00000515802 CD200R1Q8TD46 325 aa14.97□□□□□ -0.01
SH3BP2-229ENST00000515802 PAPOLBQ9NRJ5 636 aaKnown RBP14.97□□□□□ -0.01
SH3BP2-229ENST00000515802 NOP53Q9NZM5 478 aaKnown RBP14.97□□□□□ -0.01
SH3BP2-229ENST00000515802 C5orf42Q9H799 3197 aa14.96□□□□□ -0.01
SH3BP2-229ENST00000515802 C1orf232A0A0U1RR37 186 aa14.96□□□□□ -0.01
SH3BP2-229ENST00000515802 CDC7O00311 574 aa14.96□□□□□ -0.01
SH3BP2-229ENST00000515802 IGSF6O95976 241 aa14.96□□□□□ -0.01
SH3BP2-229ENST00000515802 RHOP08100 348 aa14.96□□□□□ -0.01
SH3BP2-229ENST00000515802 HNF1BP35680 557 aa14.96□□□□□ -0.01
SH3BP2-229ENST00000515802 MAPK8P45983 427 aa14.96□□□□□ -0.01
SH3BP2-229ENST00000515802 ADARP55265 1226 aaKnown RBP14.96□□□□□ -0.01
SH3BP2-229ENST00000515802 RAD51Q06609 339 aa14.96□□□□□ -0.01
SH3BP2-229ENST00000515802 TSNQ15631 228 aaKnown RBP14.96□□□□□ -0.01
SH3BP2-229ENST00000515802 CLEC6AQ6EIG7 209 aa14.96□□□□□ -0.01
SH3BP2-229ENST00000515802 FAM151BQ6UXP7 276 aa14.96□□□□□ -0.01
SH3BP2-229ENST00000515802 CYHR1Q6ZMK1 362 aa14.96□□□□□ -0.01
SH3BP2-229ENST00000515802 UBE2Q1Q7Z7E8 422 aa14.96□□□□□ -0.01
SH3BP2-229ENST00000515802 OR2AP1Q8NGE2 309 aa14.96□□□□□ -0.01
SH3BP2-229ENST00000515802 FAR2Q96K12 515 aa14.96□□□□□ -0.01
SH3BP2-229ENST00000515802 C17orf80Q9BSJ5 609 aa14.96□□□□□ -0.01
SH3BP2-229ENST00000515802 TMEM106CQ9BVX2 250 aa14.96□□□□□ -0.01
SH3BP2-229ENST00000515802 YIPF3Q9GZM5 350 aa14.96□□□□□ -0.01
SH3BP2-229ENST00000515802 P2RY12Q9H244 342 aa14.96□□□□□ -0.01
SH3BP2-229ENST00000515802 ATP13A3Q9H7F0 1226 aa14.96□□□□□ -0.01
SH3BP2-229ENST00000515802 MEAF6Q9HAF1 191 aa14.96□□□□□ -0.01
SH3BP2-229ENST00000515802 SPATA7Q9P0W8 599 aa14.96□□□□□ -0.01
SH3BP2-229ENST00000515802 PIKFYVEQ9Y2I7 2098 aa14.96□□□□□ -0.01
SH3BP2-229ENST00000515802 PDLIM1O00151 329 aa14.96□□□□□ -0.02
SH3BP2-229ENST00000515802 PPP6CO00743 305 aa14.96□□□□□ -0.02
SH3BP2-229ENST00000515802 VPS26AO75436 327 aa14.96□□□□□ -0.02
SH3BP2-229ENST00000515802 KRT36O76013 467 aa14.96□□□□□ -0.02
SH3BP2-229ENST00000515802 GNAZP19086 355 aa14.96□□□□□ -0.02
SH3BP2-229ENST00000515802 CD9P21926 228 aa14.96□□□□□ -0.02
SH3BP2-229ENST00000515802 IRS1P35568 1242 aa14.96□□□□□ -0.02
SH3BP2-229ENST00000515802 PTGER3P43115 390 aa14.96□□□□□ -0.02
SH3BP2-229ENST00000515802 CDH13P55290 713 aa14.96□□□□□ -0.02
SH3BP2-229ENST00000515802 CUL3Q13618 768 aa14.96□□□□□ -0.02
SH3BP2-229ENST00000515802 CAMK1Q14012 370 aa14.96□□□□□ -0.02
SH3BP2-229ENST00000515802 METTL3Q86U44 580 aaKnown RBP14.96□□□□□ -0.02
SH3BP2-229ENST00000515802 PELI3Q8N2H9 469 aa14.96□□□□□ -0.02
SH3BP2-229ENST00000515802 STAG3L4Q8TBR4 150 aa14.96□□□□□ -0.02
SH3BP2-229ENST00000515802 MIPOL1Q8TD10 442 aa14.96□□□□□ -0.02
SH3BP2-229ENST00000515802 KCNJ9Q92806 393 aa14.96□□□□□ -0.02
SH3BP2-229ENST00000515802 FUBP1Q96AE4 644 aaKnown RBP14.96□□□□□ -0.02
SH3BP2-229ENST00000515802 PANX3Q96QZ0 392 aa14.96□□□□□ -0.02
SH3BP2-229ENST00000515802 DCLRE1BQ9H816 532 aa14.96□□□□□ -0.02
SH3BP2-229ENST00000515802 ZFYVE1Q9HBF4 777 aa14.96□□□□□ -0.02
SH3BP2-229ENST00000515802 UTP6Q9NYH9 597 aaKnown RBP14.96□□□□□ -0.02
SH3BP2-229ENST00000515802 HS3ST2Q9Y278 367 aa14.96□□□□□ -0.02
SH3BP2-229ENST00000515802 TRAF6Q9Y4K3 522 aa14.96□□□□□ -0.02
SH3BP2-229ENST00000515802 COPG1Q9Y678 874 aaKnown RBP14.96□□□□□ -0.02
SH3BP2-229ENST00000515802 NPEPPSL1A6NEC2 478 aa14.95□□□□□ -0.02
SH3BP2-229ENST00000515802 CAPN8A6NHC0 703 aa14.95□□□□□ -0.02
SH3BP2-229ENST00000515802 IQCF5A8MTL0 148 aa14.95□□□□□ -0.02
SH3BP2-229ENST00000515802 NEDD8-MDP1E9PL57 170 aa14.95□□□□□ -0.02
SH3BP2-229ENST00000515802 PFDN6O15212 129 aa14.95□□□□□ -0.02
SH3BP2-229ENST00000515802 SLC22A2O15244 555 aa14.95□□□□□ -0.02
SH3BP2-229ENST00000515802 ECI2O75521 394 aa14.95□□□□□ -0.02
SH3BP2-229ENST00000515802 CLDN7O95471 211 aa14.95□□□□□ -0.02
SH3BP2-229ENST00000515802 PRAMEF1O95521 474 aa14.95□□□□□ -0.02
SH3BP2-229ENST00000515802 EPCAMP16422 314 aa14.95□□□□□ -0.02
SH3BP2-229ENST00000515802 ATP6V0D1P61421 351 aa14.95□□□□□ -0.02
SH3BP2-229ENST00000515802 SH3BP2P78314 561 aa14.95□□□□□ -0.02
SH3BP2-229ENST00000515802 EML3Q32P44 896 aa14.95□□□□□ -0.02
SH3BP2-229ENST00000515802 NET1Q7Z628 596 aaPredicted RBP14.95□□□□□ -0.02
SH3BP2-229ENST00000515802 SNX32Q86XE0 403 aa14.95□□□□□ -0.02
SH3BP2-229ENST00000515802 GRIN3AQ8TCU5 1115 aa14.95□□□□□ -0.02
SH3BP2-229ENST00000515802 NAT14Q8WUY8 206 aa14.95□□□□□ -0.02
SH3BP2-229ENST00000515802 ZFAND2BQ8WV99 257 aa14.95□□□□□ -0.02
SH3BP2-229ENST00000515802 NSUN5Q96P11 429 aaKnown RBP14.95□□□□□ -0.02
SH3BP2-229ENST00000515802 RTKNQ9BST9 563 aa14.95□□□□□ -0.02
SH3BP2-229ENST00000515802 PRKAG2Q9UGJ0 569 aa14.95□□□□□ -0.02
SH3BP2-229ENST00000515802 TRMT6Q9UJA5 497 aaKnown RBP14.95□□□□□ -0.02
SH3BP2-229ENST00000515802 RNF112Q9ULX5 631 aa14.95□□□□□ -0.02
SH3BP2-229ENST00000515802 HCFC2Q9Y5Z7 792 aa14.95□□□□□ -0.02
SH3BP2-229ENST00000515802 SLC30A1Q9Y6M5 507 aa14.95□□□□□ -0.02
SH3BP2-229ENST00000515802 SLC4A7Q9Y6M7 1214 aa14.95□□□□□ -0.02
SH3BP2-229ENST00000515802 PLXNB3Q9ULL4 1909 aa14.95□□□□□ -0.02
SH3BP2-229ENST00000515802 LINC01553A4QN01 128 aa14.94□□□□□ -0.02
SH3BP2-229ENST00000515802 SUPT3HB4E1H0 165 aa14.94□□□□□ -0.02
SH3BP2-229ENST00000515802 SUPT3HO75486 399 aa14.94□□□□□ -0.02
SH3BP2-229ENST00000515802 ARHGEF15O94989 841 aa14.94□□□□□ -0.02
SH3BP2-229ENST00000515802 ESR1P03372 595 aa14.94□□□□□ -0.02
SH3BP2-229ENST00000515802 GFAPP14136 432 aa14.94□□□□□ -0.02
SH3BP2-229ENST00000515802 PTPN2P17706 415 aa14.94□□□□□ -0.02
SH3BP2-229ENST00000515802 DDX6P26196 483 aaKnown RBP eCLIP14.94□□□□□ -0.02
SH3BP2-229ENST00000515802 LBX1P52954 281 aa14.94□□□□□ -0.02
SH3BP2-229ENST00000515802 INHBCP55103 352 aa14.94□□□□□ -0.02
SH3BP2-229ENST00000515802 NTHL1P78549 312 aa14.94□□□□□ -0.02
SH3BP2-229ENST00000515802 C22orf39Q6P5X5 142 aa14.94□□□□□ -0.02
SH3BP2-229ENST00000515802 PSRC1Q6PGN9 363 aaPredicted RBP14.94□□□□□ -0.02
SH3BP2-229ENST00000515802 RIPOR1Q6ZS17 1223 aa14.94□□□□□ -0.02
SH3BP2-229ENST00000515802 NKAPQ8N5F7 415 aaKnown RBP14.94□□□□□ -0.02
SH3BP2-229ENST00000515802 CEP70Q8NHQ1 597 aa14.94□□□□□ -0.02
SH3BP2-229ENST00000515802 ACTRT2Q8TDY3 377 aa14.94□□□□□ -0.02
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 27.7 ms