RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000514183.5

RACK1-231, Transcript of receptor for activated C kinase 1, human

TSL 2

Gene RACK1, Length 1,439 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
RACK1-231	ENST00000514183	SMC6	Q96SB8	1091 aa		6.69	□□□□□ -1.34
RACK1-231	ENST00000514183	NAT9	Q9BTE0	207 aa		6.69	□□□□□ -1.34
RACK1-231	ENST00000514183	SLC25A51	Q9H1U9	297 aa		6.69	□□□□□ -1.34
RACK1-231	ENST00000514183	MAGEH1	Q9H213	219 aa		6.69	□□□□□ -1.34
RACK1-231	ENST00000514183	RABEP2	Q9H5N1	569 aa		6.69	□□□□□ -1.34
RACK1-231	ENST00000514183	RETREG1	Q9H6L5	497 aa		6.69	□□□□□ -1.34
RACK1-231	ENST00000514183	NT5M	Q9NPB1	228 aa		6.69	□□□□□ -1.34
RACK1-231	ENST00000514183	SMYD2	Q9NRG4	433 aa		6.69	□□□□□ -1.34
RACK1-231	ENST00000514183	THSD1	Q9NS62	852 aa		6.69	□□□□□ -1.34
RACK1-231	ENST00000514183	IGSF5	Q9NSI5	407 aa		6.69	□□□□□ -1.34
RACK1-231	ENST00000514183	INTS9	Q9NV88	658 aa	Known RBP	6.69	□□□□□ -1.34
RACK1-231	ENST00000514183	NKIRAS1	Q9NYS0	192 aa		6.69	□□□□□ -1.34
RACK1-231	ENST00000514183	NCKIPSD	Q9NZQ3	722 aa		6.69	□□□□□ -1.34
RACK1-231	ENST00000514183	SENP1	Q9P0U3	644 aa		6.69	□□□□□ -1.34
RACK1-231	ENST00000514183	STOML2	Q9UJZ1	356 aa		6.69	□□□□□ -1.34
RACK1-231	ENST00000514183	FZD4	Q9ULV1	537 aa		6.69	□□□□□ -1.34
RACK1-231	ENST00000514183	BTBD3	Q9Y2F9	522 aa		6.69	□□□□□ -1.34
RACK1-231	ENST00000514183	NUMA1	Q14980	2115 aa		6.69	□□□□□ -1.34
RACK1-231	ENST00000514183	TENM4	Q6N022	2769 aa		6.69	□□□□□ -1.34
RACK1-231	ENST00000514183		A0A0D9SEW6	157 aa		6.68	□□□□□ -1.34
RACK1-231	ENST00000514183	IQANK1	A0A1B0GTG1	560 aa		6.68	□□□□□ -1.34
RACK1-231	ENST00000514183		A0A1B0GVM2	712 aa		6.68	□□□□□ -1.34
RACK1-231	ENST00000514183	TYW5	A2RUC4	315 aa	Known RBP	6.68	□□□□□ -1.34
RACK1-231	ENST00000514183	TCAF2	A6NFQ2	919 aa		6.68	□□□□□ -1.34
RACK1-231	ENST00000514183	ERICH4	A6NGS2	130 aa		6.68	□□□□□ -1.34
RACK1-231	ENST00000514183	TRIM24	O15164	1050 aa		6.68	□□□□□ -1.34
RACK1-231	ENST00000514183	TLX3	O43711	291 aa	Predicted RBP	6.68	□□□□□ -1.34
RACK1-231	ENST00000514183	BRINP1	O60477	761 aa		6.68	□□□□□ -1.34
RACK1-231	ENST00000514183	GREM1	O60565	184 aa		6.68	□□□□□ -1.34
RACK1-231	ENST00000514183	UGT1A9	O60656	530 aa		6.68	□□□□□ -1.34
RACK1-231	ENST00000514183	SPAG7	O75391	227 aa		6.68	□□□□□ -1.34
RACK1-231	ENST00000514183	PMPCB	O75439	489 aa		6.68	□□□□□ -1.34
RACK1-231	ENST00000514183	FAM155B	O75949	473 aa		6.68	□□□□□ -1.34
RACK1-231	ENST00000514183	MT-ND3	P03897	115 aa		6.68	□□□□□ -1.34
RACK1-231	ENST00000514183	POLB	P06746	335 aa		6.68	□□□□□ -1.34
RACK1-231	ENST00000514183	RHOC	P08134	193 aa		6.68	□□□□□ -1.34
RACK1-231	ENST00000514183	ACP1	P24666	158 aa		6.68	□□□□□ -1.34
RACK1-231	ENST00000514183	MPST	P25325	297 aa		6.68	□□□□□ -1.34
RACK1-231	ENST00000514183	HOXD9	P28356	352 aa	Predicted RBP	6.68	□□□□□ -1.34
RACK1-231	ENST00000514183	ACSL1	P33121	698 aa		6.68	□□□□□ -1.34
RACK1-231	ENST00000514183	ADRA1A	P35348	466 aa		6.68	□□□□□ -1.34
RACK1-231	ENST00000514183	RXRG	P48443	463 aa		6.68	□□□□□ -1.34
RACK1-231	ENST00000514183	ACADVL	P49748	655 aa		6.68	□□□□□ -1.34
RACK1-231	ENST00000514183	NUMB	P49757	651 aa		6.68	□□□□□ -1.34
RACK1-231	ENST00000514183	DUSP3	P51452	185 aa	Predicted RBP	6.68	□□□□□ -1.34
RACK1-231	ENST00000514183	CCR5	P51681	352 aa		6.68	□□□□□ -1.34
RACK1-231	ENST00000514183	OXCT1	P55809	520 aa		6.68	□□□□□ -1.34
RACK1-231	ENST00000514183	WNT3A	P56704	352 aa		6.68	□□□□□ -1.34
RACK1-231	ENST00000514183	MAX	P61244	160 aa		6.68	□□□□□ -1.34
RACK1-231	ENST00000514183	DSC2	Q02487	901 aa		6.68	□□□□□ -1.34
RACK1-231	ENST00000514183	MGAT5	Q09328	741 aa		6.68	□□□□□ -1.34
RACK1-231	ENST00000514183	NIPAL4	Q0D2K0	466 aa		6.68	□□□□□ -1.34
RACK1-231	ENST00000514183	CCDC15	Q0P6D6	951 aa		6.68	□□□□□ -1.34
RACK1-231	ENST00000514183	CDH17	Q12864	832 aa		6.68	□□□□□ -1.34
RACK1-231	ENST00000514183	MPP3	Q13368	585 aa		6.68	□□□□□ -1.34
RACK1-231	ENST00000514183	NAB1	Q13506	487 aa		6.68	□□□□□ -1.34
RACK1-231	ENST00000514183	MPP2	Q14168	576 aa		6.68	□□□□□ -1.34
RACK1-231	ENST00000514183	LBR	Q14739	615 aa	Known RBP	6.68	□□□□□ -1.34
RACK1-231	ENST00000514183	LRRC14	Q15048	493 aa		6.68	□□□□□ -1.34
RACK1-231	ENST00000514183	PCSK7	Q16549	785 aa		6.68	□□□□□ -1.34
RACK1-231	ENST00000514183	TTC39B	Q5VTQ0	682 aa	Predicted RBP	6.68	□□□□□ -1.34
RACK1-231	ENST00000514183	FYB2	Q5VWT5	728 aa		6.68	□□□□□ -1.34
RACK1-231	ENST00000514183	KDELC1	Q6UW63	502 aa		6.68	□□□□□ -1.34
RACK1-231	ENST00000514183	CYS1	Q717R9	158 aa		6.68	□□□□□ -1.34
RACK1-231	ENST00000514183	MARK2	Q7KZI7	788 aa	Known RBP	6.68	□□□□□ -1.34
RACK1-231	ENST00000514183	FAM124A	Q86V42	546 aa		6.68	□□□□□ -1.34
RACK1-231	ENST00000514183	LRRC6	Q86X45	466 aa		6.68	□□□□□ -1.34
RACK1-231	ENST00000514183	UNC5B	Q8IZJ1	945 aa		6.68	□□□□□ -1.34
RACK1-231	ENST00000514183	C4orf33	Q8N1A6	199 aa		6.68	□□□□□ -1.34
RACK1-231	ENST00000514183	PGBD5	Q8N414	524 aa		6.68	□□□□□ -1.34
RACK1-231	ENST00000514183	DCBLD1	Q8N8Z6	715 aa		6.68	□□□□□ -1.34
RACK1-231	ENST00000514183	FAM181A	Q8N9Y4	354 aa		6.68	□□□□□ -1.34
RACK1-231	ENST00000514183	OR52K2	Q8NGK3	314 aa		6.68	□□□□□ -1.34
RACK1-231	ENST00000514183	OR2T34	Q8NGX1	318 aa		6.68	□□□□□ -1.34
RACK1-231	ENST00000514183	SAP25	Q8TEE9	199 aa		6.68	□□□□□ -1.34
RACK1-231	ENST00000514183	GANC	Q8TET4	914 aa		6.68	□□□□□ -1.34
RACK1-231	ENST00000514183	MZB1	Q8WU39	189 aa		6.68	□□□□□ -1.34
RACK1-231	ENST00000514183	KCNE4	Q8WWG9	221 aa		6.68	□□□□□ -1.34
RACK1-231	ENST00000514183	RNF166	Q96A37	237 aa	Predicted RBP	6.68	□□□□□ -1.34
RACK1-231	ENST00000514183	ZNF669	Q96BR6	464 aa	Predicted RBP	6.68	□□□□□ -1.34
RACK1-231	ENST00000514183	IMP4	Q96G21	291 aa	Known RBP	6.68	□□□□□ -1.34
RACK1-231	ENST00000514183	MRGPRX2	Q96LB1	330 aa		6.68	□□□□□ -1.34
RACK1-231	ENST00000514183	ZNF599	Q96NL3	588 aa		6.68	□□□□□ -1.34
RACK1-231	ENST00000514183	SPON2	Q9BUD6	331 aa		6.68	□□□□□ -1.34
RACK1-231	ENST00000514183	FSD1L	Q9BXM9	530 aa		6.68	□□□□□ -1.34
RACK1-231	ENST00000514183	IL22	Q9GZX6	179 aa		6.68	□□□□□ -1.34
RACK1-231	ENST00000514183	SLC6A17	Q9H1V8	727 aa		6.68	□□□□□ -1.34
RACK1-231	ENST00000514183	EPN3	Q9H201	632 aa		6.68	□□□□□ -1.34
RACK1-231	ENST00000514183	C6orf106	Q9H6K1	298 aa	Predicted RBP	6.68	□□□□□ -1.34
RACK1-231	ENST00000514183	UGT1A7	Q9HAW7	530 aa		6.68	□□□□□ -1.34
RACK1-231	ENST00000514183	UGT1A10	Q9HAW8	530 aa		6.68	□□□□□ -1.34
RACK1-231	ENST00000514183	UGT1A8	Q9HAW9	530 aa		6.68	□□□□□ -1.34
RACK1-231	ENST00000514183	PDF	Q9HBH1	243 aa		6.68	□□□□□ -1.34
RACK1-231	ENST00000514183	PPAN	Q9NQ55	473 aa	Known RBP	6.68	□□□□□ -1.34
RACK1-231	ENST00000514183	AASDHPPT	Q9NRN7	309 aa		6.68	□□□□□ -1.34
RACK1-231	ENST00000514183	MOCS1	Q9NZB8	636 aa		6.68	□□□□□ -1.34
RACK1-231	ENST00000514183	ZNF180	Q9UJW8	692 aa		6.68	□□□□□ -1.34
RACK1-231	ENST00000514183	ARID1B	Q8NFD5	2236 aa	Predicted RBP	6.68	□□□□□ -1.34
RACK1-231	ENST00000514183	FAM237B	A0A1B0GVD1	139 aa		6.67	□□□□□ -1.34
RACK1-231	ENST00000514183	ILVBL	A1L0T0	632 aa		6.67	□□□□□ -1.34

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