RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000497511.5

SKAP2-209, Transcript of src kinase associated phosphoprotein 2, human

TSL 4

Gene SKAP2, Length 585 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Nucleus .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
SKAP2-209	ENST00000497511	IGHV1OR21-1	A0A087WYE8	117 aa		10.8	□□□□□ -0.68
SKAP2-209	ENST00000497511	KIR2DP1	A0A0G2JNF4	349 aa	Predicted RBP	10.8	□□□□□ -0.68
SKAP2-209	ENST00000497511	LOC101059948	A0A1B0GTJ6	334 aa		10.8	□□□□□ -0.68
SKAP2-209	ENST00000497511	FAM95C	A0A1B0GW59	222 aa		10.8	□□□□□ -0.68
SKAP2-209	ENST00000497511	GTPBP10	A4D1E9	387 aa	Known RBP	10.8	□□□□□ -0.68
SKAP2-209	ENST00000497511	CFAP69	A5D8W1	941 aa		10.8	□□□□□ -0.68
SKAP2-209	ENST00000497511	PES1	O00541	588 aa	Known RBP	10.8	□□□□□ -0.68
SKAP2-209	ENST00000497511	HOXC4	P09017	264 aa	Predicted RBP	10.8	□□□□□ -0.68
SKAP2-209	ENST00000497511	MYCLP1	P12525	358 aa	Predicted RBP	10.8	□□□□□ -0.68
SKAP2-209	ENST00000497511	NR1D1	P20393	614 aa		10.8	□□□□□ -0.68
SKAP2-209	ENST00000497511	BMP6	P22004	513 aa		10.8	□□□□□ -0.68
SKAP2-209	ENST00000497511	CDH5	P33151	784 aa	Predicted RBP	10.8	□□□□□ -0.68
SKAP2-209	ENST00000497511	YBEY	P58557	167 aa	Predicted RBP	10.8	□□□□□ -0.68
SKAP2-209	ENST00000497511	BCL2L1	Q07817	233 aa		10.8	□□□□□ -0.68
SKAP2-209	ENST00000497511	NR1D2	Q14995	579 aa		10.8	□□□□□ -0.68
SKAP2-209	ENST00000497511	CYTH1	Q15438	398 aa		10.8	□□□□□ -0.68
SKAP2-209	ENST00000497511	TPD52L1	Q16890	204 aa	Predicted RBP	10.8	□□□□□ -0.68
SKAP2-209	ENST00000497511	CCDC14	Q49A88	953 aa		10.8	□□□□□ -0.68
SKAP2-209	ENST00000497511	ATP1A1-AS1	Q5TC04	95 aa		10.8	□□□□□ -0.68
SKAP2-209	ENST00000497511	DENND2C	Q68D51	928 aa		10.8	□□□□□ -0.68
SKAP2-209	ENST00000497511	SCYL2	Q6P3W7	929 aa		10.8	□□□□□ -0.68
SKAP2-209	ENST00000497511	TMEM71	Q6P5X7	295 aa		10.8	□□□□□ -0.68
SKAP2-209	ENST00000497511	CEACAM20	Q6UY09	585 aa		10.8	□□□□□ -0.68
SKAP2-209	ENST00000497511	LIPI	Q6XZB0	460 aa		10.8	□□□□□ -0.68
SKAP2-209	ENST00000497511	DNAJC14	Q6Y2X3	702 aa	Predicted RBP	10.8	□□□□□ -0.68
SKAP2-209	ENST00000497511	BNIPL	Q7Z465	357 aa		10.8	□□□□□ -0.68
SKAP2-209	ENST00000497511	HEATR4	Q86WZ0	1026 aa		10.8	□□□□□ -0.68
SKAP2-209	ENST00000497511	FAM71A	Q8IYT1	594 aa		10.8	□□□□□ -0.68
SKAP2-209	ENST00000497511	CCDC185	Q8N715	623 aa		10.8	□□□□□ -0.68
SKAP2-209	ENST00000497511	OR10G6	Q8NH81	332 aa		10.8	□□□□□ -0.68
SKAP2-209	ENST00000497511	GPT2	Q8TD30	523 aa		10.8	□□□□□ -0.68
SKAP2-209	ENST00000497511	FAM172A	Q8WUF8	416 aa		10.8	□□□□□ -0.68
SKAP2-209	ENST00000497511	NUS1	Q96E22	293 aa		10.8	□□□□□ -0.68
SKAP2-209	ENST00000497511	SLC38A3	Q99624	504 aa		10.8	□□□□□ -0.68
SKAP2-209	ENST00000497511	MAGEB5	Q9BZ81	275 aa		10.8	□□□□□ -0.68
SKAP2-209	ENST00000497511	TRIT1	Q9H3H1	467 aa	Known RBP	10.8	□□□□□ -0.68
SKAP2-209	ENST00000497511	CATSPERB	Q9H7T0	1116 aa		10.8	□□□□□ -0.68
SKAP2-209	ENST00000497511	TRNAU1AP	Q9NX07	287 aa	Known RBP	10.8	□□□□□ -0.68
SKAP2-209	ENST00000497511	TMEM9	Q9P0T7	183 aa		10.8	□□□□□ -0.68
SKAP2-209	ENST00000497511	AP4E1	Q9UPM8	1137 aa		10.8	□□□□□ -0.68
SKAP2-209	ENST00000497511	KCTD3	Q9Y597	815 aa		10.8	□□□□□ -0.68
SKAP2-209	ENST00000497511	CREBBP	Q92793	2442 aa		10.8	□□□□□ -0.68
SKAP2-209	ENST00000497511	SDK2	Q58EX2	2172 aa		10.79	□□□□□ -0.68
SKAP2-209	ENST00000497511	ERCC5	P28715	1186 aa	Predicted RBP	10.79	□□□□□ -0.68
SKAP2-209	ENST00000497511	CSF2RB	P32927	897 aa		10.79	□□□□□ -0.68
SKAP2-209	ENST00000497511	TRIM23	P36406	574 aa		10.79	□□□□□ -0.68
SKAP2-209	ENST00000497511	ACTR1B	P42025	376 aa		10.79	□□□□□ -0.68
SKAP2-209	ENST00000497511	CD97	P48960	835 aa		10.79	□□□□□ -0.68
SKAP2-209	ENST00000497511	ACTR1A	P61163	376 aa		10.79	□□□□□ -0.68
SKAP2-209	ENST00000497511	ABHD18	Q0P651	414 aa		10.79	□□□□□ -0.68
SKAP2-209	ENST00000497511	RALGDS	Q12967	914 aa		10.79	□□□□□ -0.68
SKAP2-209	ENST00000497511	DOK6	Q6PKX4	331 aa		10.79	□□□□□ -0.68
SKAP2-209	ENST00000497511	ASB18	Q6ZVZ8	466 aa		10.79	□□□□□ -0.68
SKAP2-209	ENST00000497511	ARC	Q7LC44	396 aa		10.79	□□□□□ -0.68
SKAP2-209	ENST00000497511	STRADA	Q7RTN6	431 aa		10.79	□□□□□ -0.68
SKAP2-209	ENST00000497511	SLFN11	Q7Z7L1	901 aa		10.79	□□□□□ -0.68
SKAP2-209	ENST00000497511	SRL	Q86TD4	932 aa		10.79	□□□□□ -0.68
SKAP2-209	ENST00000497511	C17orf82	Q86X59	251 aa	Predicted RBP	10.79	□□□□□ -0.68
SKAP2-209	ENST00000497511	ZSWIM9	Q86XI8	627 aa		10.79	□□□□□ -0.68
SKAP2-209	ENST00000497511	ZNF761	Q86XN6	746 aa	Predicted RBP	10.79	□□□□□ -0.68
SKAP2-209	ENST00000497511	NRROS	Q86YC3	692 aa		10.79	□□□□□ -0.68
SKAP2-209	ENST00000497511	CCDC13	Q8IYE1	715 aa		10.79	□□□□□ -0.68
SKAP2-209	ENST00000497511	PYROXD2	Q8N2H3	581 aa		10.79	□□□□□ -0.68
SKAP2-209	ENST00000497511		Q8N3U1	123 aa		10.79	□□□□□ -0.68
SKAP2-209	ENST00000497511	RTP4	Q96DX8	246 aa		10.79	□□□□□ -0.68
SKAP2-209	ENST00000497511	ZPBP	Q9BS86	351 aa		10.79	□□□□□ -0.68
SKAP2-209	ENST00000497511	CINP	Q9BW66	212 aa	Predicted RBP	10.79	□□□□□ -0.68
SKAP2-209	ENST00000497511	NOL6	Q9H6R4	1146 aa	Known RBP	10.79	□□□□□ -0.68
SKAP2-209	ENST00000497511	SIX2	Q9NPC8	291 aa		10.79	□□□□□ -0.68
SKAP2-209	ENST00000497511	PRDM8	Q9NQV8	689 aa		10.79	□□□□□ -0.68
SKAP2-209	ENST00000497511	KLHL3	Q9UH77	587 aa		10.79	□□□□□ -0.68
SKAP2-209	ENST00000497511	SUFU	Q9UMX1	484 aa		10.79	□□□□□ -0.68
SKAP2-209	ENST00000497511	ACTL7B	Q9Y614	415 aa		10.79	□□□□□ -0.68
SKAP2-209	ENST00000497511	UNC79	Q9P2D8	2635 aa		10.79	□□□□□ -0.68
SKAP2-209	ENST00000497511	CHD5	Q8TDI0	1954 aa		10.79	□□□□□ -0.68
SKAP2-209	ENST00000497511	NBPF19	A0A087WUL8	3843 aa		10.78	□□□□□ -0.68
SKAP2-209	ENST00000497511	TRBV23OR9-2	A0A075B6M9	112 aa		10.78	□□□□□ -0.68
SKAP2-209	ENST00000497511		A1L4Q6	167 aa		10.78	□□□□□ -0.68
SKAP2-209	ENST00000497511	POLR1C	O15160	346 aa	Predicted RBP	10.78	□□□□□ -0.68
SKAP2-209	ENST00000497511	PPM1D	O15297	605 aa		10.78	□□□□□ -0.68
SKAP2-209	ENST00000497511	INPP4B	O15327	924 aa		10.78	□□□□□ -0.68
SKAP2-209	ENST00000497511	BUB1B	O60566	1050 aa	Predicted RBP	10.78	□□□□□ -0.68
SKAP2-209	ENST00000497511	PALM	O75781	387 aa		10.78	□□□□□ -0.68
SKAP2-209	ENST00000497511	STK17B	O94768	372 aa		10.78	□□□□□ -0.68
SKAP2-209	ENST00000497511	MME	P08473	750 aa		10.78	□□□□□ -0.68
SKAP2-209	ENST00000497511	GNLY	P22749	145 aa		10.78	□□□□□ -0.68
SKAP2-209	ENST00000497511	NFKBIA	P25963	317 aa		10.78	□□□□□ -0.68
SKAP2-209	ENST00000497511	MAPK9	P45984	424 aa		10.78	□□□□□ -0.68
SKAP2-209	ENST00000497511	UQCRFS1	P47985	274 aa		10.78	□□□□□ -0.68
SKAP2-209	ENST00000497511	HDAC4	P56524	1084 aa		10.78	□□□□□ -0.68
SKAP2-209	ENST00000497511	NOMO3	P69849	1222 aa		10.78	□□□□□ -0.68
SKAP2-209	ENST00000497511	LRP8	Q14114	963 aa		10.78	□□□□□ -0.68
SKAP2-209	ENST00000497511	MAP7	Q14244	749 aa		10.78	□□□□□ -0.68
SKAP2-209	ENST00000497511	RAET1G	Q6H3X3	334 aa		10.78	□□□□□ -0.68
SKAP2-209	ENST00000497511	CDPF1	Q6NVV7	123 aa		10.78	□□□□□ -0.68
SKAP2-209	ENST00000497511	DPPA4	Q7L190	304 aa		10.78	□□□□□ -0.68
SKAP2-209	ENST00000497511	NOP9	Q86U38	636 aa	Known RBP	10.78	□□□□□ -0.68
SKAP2-209	ENST00000497511	NAGS	Q8N159	534 aa		10.78	□□□□□ -0.68
SKAP2-209	ENST00000497511	ESX1	Q8N693	406 aa		10.78	□□□□□ -0.68
SKAP2-209	ENST00000497511	SSC4D	Q8WTU2	575 aa		10.78	□□□□□ -0.68

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