RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000486357.1

APOBEC3G-206, Transcript of apolipoprotein B mRNA editing enzyme catalytic subunit 3G, humanhuman

TSL 4

Gene APOBEC3G, Length 543 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APOBEC3G-206ENST00000486357 MED8Q96G25 268 aa7.25□□□□□ -1.25
APOBEC3G-206ENST00000486357 VCPIP1Q96JH7 1222 aa7.25□□□□□ -1.25
APOBEC3G-206ENST00000486357 RPL10LQ96L21 214 aaKnown RBP7.25□□□□□ -1.25
APOBEC3G-206ENST00000486357 MYOCQ99972 504 aa7.25□□□□□ -1.25
APOBEC3G-206ENST00000486357 DPH1Q9BZG8 443 aa7.25□□□□□ -1.25
APOBEC3G-206ENST00000486357 POLR1BQ9H9Y6 1135 aa7.25□□□□□ -1.25
APOBEC3G-206ENST00000486357 PRDM7Q9NQW5 492 aa7.25□□□□□ -1.25
APOBEC3G-206ENST00000486357 CISHQ9NSE2 258 aa7.25□□□□□ -1.25
APOBEC3G-206ENST00000486357 SLCO3A1Q9UIG8 710 aa7.25□□□□□ -1.25
APOBEC3G-206ENST00000486357 STOML2Q9UJZ1 356 aa7.25□□□□□ -1.25
APOBEC3G-206ENST00000486357 CA5BQ9Y2D0 317 aa7.25□□□□□ -1.25
APOBEC3G-206ENST00000486357 PTPRQQ9UMZ3 2332 aa7.25□□□□□ -1.25
APOBEC3G-206ENST00000486357 CKAP5Q14008 2032 aa7.25□□□□□ -1.25
APOBEC3G-206ENST00000486357 ASH1LQ9NR48 2969 aaKnown RBP7.24□□□□□ -1.25
APOBEC3G-206ENST00000486357 MUC22E2RYF6 1773 aaPredicted RBP7.24□□□□□ -1.25
APOBEC3G-206ENST00000486357 PRAMEF26H0Y7S4 382 aa7.24□□□□□ -1.25
APOBEC3G-206ENST00000486357 SLC31A1O15431 190 aa7.24□□□□□ -1.25
APOBEC3G-206ENST00000486357 RTN2O75298 545 aa7.24□□□□□ -1.25
APOBEC3G-206ENST00000486357 SRPRAP08240 638 aaKnown RBP7.24□□□□□ -1.25
APOBEC3G-206ENST00000486357 THEGLP0DJG4 465 aa7.24□□□□□ -1.25
APOBEC3G-206ENST00000486357 NR2F2P24468 414 aa7.24□□□□□ -1.25
APOBEC3G-206ENST00000486357 RPL13P26373 211 aaKnown RBP7.24□□□□□ -1.25
APOBEC3G-206ENST00000486357 ADSLP30566 484 aaPredicted RBP7.24□□□□□ -1.25
APOBEC3G-206ENST00000486357 SLC6A4P31645 630 aa7.24□□□□□ -1.25
APOBEC3G-206ENST00000486357 ME1P48163 572 aa7.24□□□□□ -1.25
APOBEC3G-206ENST00000486357 RGS7P49802 495 aa7.24□□□□□ -1.25
APOBEC3G-206ENST00000486357 DUSP3P51452 185 aaPredicted RBP7.24□□□□□ -1.25
APOBEC3G-206ENST00000486357 ARL4CP56559 192 aa7.24□□□□□ -1.25
APOBEC3G-206ENST00000486357 ERVPABLB-1P60509 514 aa7.24□□□□□ -1.25
APOBEC3G-206ENST00000486357 CD83Q01151 205 aa7.24□□□□□ -1.25
APOBEC3G-206ENST00000486357 BST2Q10589 180 aaKnown RBP7.24□□□□□ -1.25
APOBEC3G-206ENST00000486357 FOXO1Q12778 655 aa7.24□□□□□ -1.25
APOBEC3G-206ENST00000486357 OVGP1Q12889 678 aa7.24□□□□□ -1.25
APOBEC3G-206ENST00000486357 ZSCAN23Q3MJ62 389 aa7.24□□□□□ -1.25
APOBEC3G-206ENST00000486357 SETMARQ53H47 684 aaPredicted RBP7.24□□□□□ -1.25
APOBEC3G-206ENST00000486357 FSCBQ5H9T9 825 aa7.24□□□□□ -1.25
APOBEC3G-206ENST00000486357 C1orf220Q5T0J3 134 aa7.24□□□□□ -1.25
APOBEC3G-206ENST00000486357 ARHGAP17Q68EM7 881 aa7.24□□□□□ -1.25
APOBEC3G-206ENST00000486357 KRT39Q6A163 491 aa7.24□□□□□ -1.25
APOBEC3G-206ENST00000486357 JMJD6Q6NYC1 403 aaPredicted RBP7.24□□□□□ -1.25
APOBEC3G-206ENST00000486357 DSG4Q86SJ6 1040 aa7.24□□□□□ -1.25
APOBEC3G-206ENST00000486357 IQCHQ86VS3 1027 aa7.24□□□□□ -1.25
APOBEC3G-206ENST00000486357 FAM90A1Q86YD7 464 aa7.24□□□□□ -1.25
APOBEC3G-206ENST00000486357 SLC25A45Q8N413 288 aa7.24□□□□□ -1.25
APOBEC3G-206ENST00000486357 DTX3Q8N9I9 347 aa7.24□□□□□ -1.25
APOBEC3G-206ENST00000486357 KIAA0895Q8NCT3 520 aa7.24□□□□□ -1.25
APOBEC3G-206ENST00000486357 OR4C6Q8NH72 309 aa7.24□□□□□ -1.25
APOBEC3G-206ENST00000486357 MAPK15Q8TD08 544 aa7.24□□□□□ -1.25
APOBEC3G-206ENST00000486357 KLK6Q92876 244 aa7.24□□□□□ -1.25
APOBEC3G-206ENST00000486357 CCDC47Q96A33 483 aaKnown RBP7.24□□□□□ -1.25
APOBEC3G-206ENST00000486357 NMD3Q96D46 503 aaKnown RBP7.24□□□□□ -1.25
APOBEC3G-206ENST00000486357 HIC2Q96JB3 615 aa7.24□□□□□ -1.25
APOBEC3G-206ENST00000486357 CALN1Q9BXU9 219 aa7.24□□□□□ -1.25
APOBEC3G-206ENST00000486357 TRIM54Q9BYV2 358 aa7.24□□□□□ -1.25
APOBEC3G-206ENST00000486357 TRIM4Q9C037 500 aa7.24□□□□□ -1.25
APOBEC3G-206ENST00000486357 TMEM8AQ9HCN3 771 aa7.24□□□□□ -1.25
APOBEC3G-206ENST00000486357 OBP2BQ9NPH6 170 aa7.24□□□□□ -1.25
APOBEC3G-206ENST00000486357 CYTH4Q9UIA0 394 aa7.24□□□□□ -1.25
APOBEC3G-206ENST00000486357 MAGEL2Q9UJ55 1249 aa7.24□□□□□ -1.25
APOBEC3G-206ENST00000486357 TSPAN16Q9UKR8 245 aa7.24□□□□□ -1.25
APOBEC3G-206ENST00000486357 INTS6Q9UL03 887 aaKnown RBP7.24□□□□□ -1.25
APOBEC3G-206ENST00000486357 MTMR6Q9Y217 621 aa7.24□□□□□ -1.25
APOBEC3G-206ENST00000486357 ZNF462Q96JM2 2506 aa7.24□□□□□ -1.25
APOBEC3G-206ENST00000486357 COL5A1P20908 1838 aaPredicted RBP7.23□□□□□ -1.25
APOBEC3G-206ENST00000486357 A0A1B0GVM2 712 aa7.23□□□□□ -1.25
APOBEC3G-206ENST00000486357 CPED1A4D0V7 1026 aa7.23□□□□□ -1.25
APOBEC3G-206ENST00000486357 NEMP2A6NFY4 417 aa7.23□□□□□ -1.25
APOBEC3G-206ENST00000486357 LGALS16A8MUM7 142 aa7.23□□□□□ -1.25
APOBEC3G-206ENST00000486357 C1QTNF3-AMACRE9PGA6 284 aa7.23□□□□□ -1.25
APOBEC3G-206ENST00000486357 LATO43561 262 aa7.23□□□□□ -1.25
APOBEC3G-206ENST00000486357 LUC7L3O95232 432 aaKnown RBP7.23□□□□□ -1.25
APOBEC3G-206ENST00000486357 YEATS4O95619 227 aa7.23□□□□□ -1.25
APOBEC3G-206ENST00000486357 LTA4HP09960 611 aaKnown RBP7.23□□□□□ -1.25
APOBEC3G-206ENST00000486357 PRLRP16471 622 aa7.23□□□□□ -1.25
APOBEC3G-206ENST00000486357 DGKAP23743 735 aa7.23□□□□□ -1.25
APOBEC3G-206ENST00000486357 PSMC2P35998 433 aaKnown RBP7.23□□□□□ -1.25
APOBEC3G-206ENST00000486357 NUDT1P36639 197 aa7.23□□□□□ -1.25
APOBEC3G-206ENST00000486357 ARL4AP40617 200 aa7.23□□□□□ -1.25
APOBEC3G-206ENST00000486357 STK19P49842 368 aaPredicted RBP7.23□□□□□ -1.25
APOBEC3G-206ENST00000486357 CSRP3P50461 194 aa7.23□□□□□ -1.25
APOBEC3G-206ENST00000486357 ITGA8P53708 1063 aa7.23□□□□□ -1.25
APOBEC3G-206ENST00000486357 ADAM9Q13443 819 aa7.23□□□□□ -1.25
APOBEC3G-206ENST00000486357 CUL4AQ13619 759 aa7.23□□□□□ -1.25
APOBEC3G-206ENST00000486357 ELAVL3Q14576 367 aaKnown RBP7.23□□□□□ -1.25
APOBEC3G-206ENST00000486357 SKIDA1Q1XH10 827 aa7.23□□□□□ -1.25
APOBEC3G-206ENST00000486357 FAM133BQ5BKY9 247 aaKnown RBP7.23□□□□□ -1.25
APOBEC3G-206ENST00000486357 FAM46CQ5VWP2 391 aa7.23□□□□□ -1.25
APOBEC3G-206ENST00000486357 NADSYN1Q6IA69 706 aa7.23□□□□□ -1.25
APOBEC3G-206ENST00000486357 FAM180AQ6UWF9 173 aa7.23□□□□□ -1.25
APOBEC3G-206ENST00000486357 RPTNQ6XPR3 784 aa7.23□□□□□ -1.25
APOBEC3G-206ENST00000486357 ZNF574Q6ZN55 896 aaPredicted RBP7.23□□□□□ -1.25
APOBEC3G-206ENST00000486357 APCDD1Q8J025 514 aa7.23□□□□□ -1.25
APOBEC3G-206ENST00000486357 LGI2Q8N0V4 545 aa7.23□□□□□ -1.25
APOBEC3G-206ENST00000486357 FAM26EQ8N5C1 309 aa7.23□□□□□ -1.25
APOBEC3G-206ENST00000486357 ATG16L2Q8NAA4 619 aa7.23□□□□□ -1.25
APOBEC3G-206ENST00000486357 KDM1BQ8NB78 822 aa7.23□□□□□ -1.25
APOBEC3G-206ENST00000486357 SNX33Q8WV41 574 aa7.23□□□□□ -1.25
APOBEC3G-206ENST00000486357 OR8D1Q8WZ84 308 aa7.23□□□□□ -1.25
APOBEC3G-206ENST00000486357 SEMA4DQ92854 862 aa7.23□□□□□ -1.25
APOBEC3G-206ENST00000486357 ZNF566Q969W8 418 aa7.23□□□□□ -1.25
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 64.8 ms