RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000485532.1

PRAME-212, Transcript of preferentially expressed antigen in melanoma, humanhuman

TSL 3

Gene PRAME, Length 709 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRAME-212ENST00000485532 GALNT13Q8IUC8 556 aa12.53□□□□□ -0.4
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PRAME-212ENST00000485532 CALR3Q96L12 384 aaKnown RBP12.53□□□□□ -0.4
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PRAME-212ENST00000485532 HENMT1Q5T8I9 393 aaKnown RBP12.51□□□□□ -0.41
PRAME-212ENST00000485532 TMEM164Q5U3C3 297 aa12.51□□□□□ -0.41
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PRAME-212ENST00000485532 NLRP8Q86W28 1048 aa12.51□□□□□ -0.41
PRAME-212ENST00000485532 CNTD1Q8N815 330 aa12.51□□□□□ -0.41
PRAME-212ENST00000485532 FAF2Q96CS3 445 aa12.51□□□□□ -0.41
PRAME-212ENST00000485532 RNF31Q96EP0 1072 aa12.51□□□□□ -0.41
PRAME-212ENST00000485532 ZNF670Q9BS34 389 aa12.51□□□□□ -0.41
PRAME-212ENST00000485532 ZMYND15Q9H091 742 aa12.51□□□□□ -0.41
PRAME-212ENST00000485532 SLC39A1Q9NY26 324 aa12.51□□□□□ -0.41
PRAME-212ENST00000485532 LCMT1Q9UIC8 334 aa12.51□□□□□ -0.41
PRAME-212ENST00000485532 ALG6Q9Y672 507 aa12.51□□□□□ -0.41
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PRAME-212ENST00000485532 ITGB2P05107 769 aa12.5□□□□□ -0.41
PRAME-212ENST00000485532 LIFP15018 202 aa12.5□□□□□ -0.41
PRAME-212ENST00000485532 COMTP21964 271 aa12.5□□□□□ -0.41
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PRAME-212ENST00000485532 FASLGP48023 281 aa12.5□□□□□ -0.41
PRAME-212ENST00000485532 HHEXQ03014 270 aa12.5□□□□□ -0.41
PRAME-212ENST00000485532 SQSTM1Q13501 440 aa12.5□□□□□ -0.41
PRAME-212ENST00000485532 TRA2AQ13595 282 aaKnown RBP eCLIP12.5□□□□□ -0.41
PRAME-212ENST00000485532 PDK2Q15119 407 aa12.5□□□□□ -0.41
PRAME-212ENST00000485532 CLPPQ16740 277 aaPredicted RBP12.5□□□□□ -0.41
PRAME-212ENST00000485532 ZFYVE27Q5T4F4 411 aa12.5□□□□□ -0.41
PRAME-212ENST00000485532 ALS2CLQ60I27 953 aa12.5□□□□□ -0.41
PRAME-212ENST00000485532 ANKS6Q68DC2 871 aa12.5□□□□□ -0.41
PRAME-212ENST00000485532 TMEM71Q6P5X7 295 aa12.5□□□□□ -0.41
PRAME-212ENST00000485532 NPNTQ6UXI9 565 aa12.5□□□□□ -0.41
PRAME-212ENST00000485532 SYT10Q6XYQ8 523 aa12.5□□□□□ -0.41
PRAME-212ENST00000485532 LYSMD3Q7Z3D4 306 aa12.5□□□□□ -0.41
PRAME-212ENST00000485532 CCDC13Q8IYE1 715 aa12.5□□□□□ -0.41
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