RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000483092.1

CCSAP-204, Transcript of centriole, cilia and spindle associated protein, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene CCSAP, Length 3,492 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCSAP-204ENST00000483092 PNPLA4P41247 253 aa16.13■□□□□ 0.17
CCSAP-204ENST00000483092 VAC14Q08AM6 782 aa16.13■□□□□ 0.17
CCSAP-204ENST00000483092 FAM214AQ32MH5 1076 aa16.13■□□□□ 0.17
CCSAP-204ENST00000483092 SDHAF4Q5VUM1 108 aa16.13■□□□□ 0.17
CCSAP-204ENST00000483092 SPESP1Q6UW49 350 aa16.13■□□□□ 0.17
CCSAP-204ENST00000483092 THAP5Q7Z6K1 395 aa16.13■□□□□ 0.17
CCSAP-204ENST00000483092 PSTKQ8IV42 348 aaKnown RBP16.13■□□□□ 0.17
CCSAP-204ENST00000483092 HS3ST5Q8IZT8 346 aa16.13■□□□□ 0.17
CCSAP-204ENST00000483092 MFSD2AQ8NA29 543 aa16.13■□□□□ 0.17
CCSAP-204ENST00000483092 CEP295NLQ96MC4 621 aa16.13■□□□□ 0.17
CCSAP-204ENST00000483092 TMEM209Q96SK2 561 aa16.13■□□□□ 0.17
CCSAP-204ENST00000483092 C17orf80Q9BSJ5 609 aa16.13■□□□□ 0.17
CCSAP-204ENST00000483092 ALG9Q9H6U8 611 aa16.13■□□□□ 0.17
CCSAP-204ENST00000483092 PRDM8Q9NQV8 689 aa16.13■□□□□ 0.17
CCSAP-204ENST00000483092 ZNF638Q14966 1978 aaKnown RBP16.13■□□□□ 0.17
CCSAP-204ENST00000483092 KPNA6O60684 536 aa16.13■□□□□ 0.17
CCSAP-204ENST00000483092 PMPCBO75439 489 aa16.13■□□□□ 0.17
CCSAP-204ENST00000483092 RASAL1O95294 804 aa16.13■□□□□ 0.17
CCSAP-204ENST00000483092 MT-CYBP00156 380 aaPredicted RBP16.13■□□□□ 0.17
CCSAP-204ENST00000483092 LINC00032P0C843 101 aa16.13■□□□□ 0.17
CCSAP-204ENST00000483092 PTPN3P26045 913 aa16.13■□□□□ 0.17
CCSAP-204ENST00000483092 GTF2E2P29084 291 aaKnown RBP16.13■□□□□ 0.17
CCSAP-204ENST00000483092 RAB10P61026 200 aa16.13■□□□□ 0.17
CCSAP-204ENST00000483092 KIAA0408Q6ZU52 694 aa16.13■□□□□ 0.17
CCSAP-204ENST00000483092 USP43Q70EL4 1123 aa16.13■□□□□ 0.17
CCSAP-204ENST00000483092 SCML4Q8N228 414 aa16.13■□□□□ 0.17
CCSAP-204ENST00000483092 RDH11Q8TC12 318 aa16.13■□□□□ 0.17
CCSAP-204ENST00000483092 FIG4Q92562 907 aa16.13■□□□□ 0.17
CCSAP-204ENST00000483092 NPY6RQ99463 290 aa16.13■□□□□ 0.17
CCSAP-204ENST00000483092 CTRCQ99895 268 aa16.13■□□□□ 0.17
CCSAP-204ENST00000483092 AGPAT4Q9NRZ5 378 aa16.13■□□□□ 0.17
CCSAP-204ENST00000483092 CARD8Q9Y2G2 431 aa16.13■□□□□ 0.17
CCSAP-204ENST00000483092 GLTPD2A6NH11 291 aa16.12■□□□□ 0.17
CCSAP-204ENST00000483092 CYP4B1P13584 511 aa16.12■□□□□ 0.17
CCSAP-204ENST00000483092 NAT1P18440 290 aa16.12■□□□□ 0.17
CCSAP-204ENST00000483092 PRKACGP22612 351 aa16.12■□□□□ 0.17
CCSAP-204ENST00000483092 MAGEA6P43360 314 aa16.12■□□□□ 0.17
CCSAP-204ENST00000483092 NCS1P62166 190 aa16.12■□□□□ 0.17
CCSAP-204ENST00000483092 YWHAHQ04917 246 aaPredicted RBP16.12■□□□□ 0.17
CCSAP-204ENST00000483092 LIPEQ05469 1076 aa16.12■□□□□ 0.17
CCSAP-204ENST00000483092 PCSK7Q16549 785 aa16.12■□□□□ 0.17
CCSAP-204ENST00000483092 FSCN1Q16658 493 aaKnown RBP16.12■□□□□ 0.17
CCSAP-204ENST00000483092 INTS11Q5TA45 600 aaKnown RBP16.12■□□□□ 0.17
CCSAP-204ENST00000483092 ARMC8Q8IUR7 673 aa16.12■□□□□ 0.17
CCSAP-204ENST00000483092 DEPDC4Q8N2C3 294 aa16.12■□□□□ 0.17
CCSAP-204ENST00000483092 OR6P1Q8NGX9 317 aa16.12■□□□□ 0.17
CCSAP-204ENST00000483092 STYXQ8WUJ0 223 aa16.12■□□□□ 0.17
CCSAP-204ENST00000483092 MAGED4Q96JG8 741 aa16.12■□□□□ 0.17
CCSAP-204ENST00000483092 IL22Q9GZX6 179 aa16.12■□□□□ 0.17
CCSAP-204ENST00000483092 TRIT1Q9H3H1 467 aaKnown RBP16.12■□□□□ 0.17
CCSAP-204ENST00000483092 HPS4Q9NQG7 708 aa16.12■□□□□ 0.17
CCSAP-204ENST00000483092 KLHL3Q9UH77 587 aa16.12■□□□□ 0.17
CCSAP-204ENST00000483092 PDE10AQ9Y233 779 aa16.12■□□□□ 0.17
CCSAP-204ENST00000483092 PRELID1Q9Y255 219 aa16.12■□□□□ 0.17
CCSAP-204ENST00000483092 GPSM3Q9Y4H4 160 aa16.12■□□□□ 0.17
CCSAP-204ENST00000483092 PDE4DIPQ5VU43 2346 aa16.12■□□□□ 0.17
CCSAP-204ENST00000483092 ILVBLA1L0T0 632 aa16.12■□□□□ 0.17
CCSAP-204ENST00000483092 H0Y626 953 aa16.12■□□□□ 0.17
CCSAP-204ENST00000483092 SLC22A2O15244 555 aa16.12■□□□□ 0.17
CCSAP-204ENST00000483092 ABCB7O75027 752 aa16.12■□□□□ 0.17
CCSAP-204ENST00000483092 NDUFS2O75306 463 aa16.12■□□□□ 0.17
CCSAP-204ENST00000483092 TRIM16O95361 564 aa16.12■□□□□ 0.17
CCSAP-204ENST00000483092 THP07101 528 aa16.12■□□□□ 0.17
CCSAP-204ENST00000483092 OR4Q2P0C623 313 aa16.12■□□□□ 0.17
CCSAP-204ENST00000483092 ATP5F1P24539 256 aaPredicted RBP16.12■□□□□ 0.17
CCSAP-204ENST00000483092 NSUN2Q08J23 767 aaKnown RBP eCLIP16.12■□□□□ 0.17
CCSAP-204ENST00000483092 LDB1Q86U70 411 aaPredicted RBP16.12■□□□□ 0.17
CCSAP-204ENST00000483092 ZC3HC1Q86WB0 502 aaKnown RBP16.12■□□□□ 0.17
CCSAP-204ENST00000483092 CENPLQ8N0S6 344 aaPredicted RBP16.12■□□□□ 0.17
CCSAP-204ENST00000483092 C2orf69Q8N8R5 385 aa16.12■□□□□ 0.17
CCSAP-204ENST00000483092 PDPRQ8NCN5 879 aa16.12■□□□□ 0.17
CCSAP-204ENST00000483092 FEM1AQ9BSK4 669 aa16.12■□□□□ 0.17
CCSAP-204ENST00000483092 RHOJQ9H4E5 214 aa16.12■□□□□ 0.17
CCSAP-204ENST00000483092 TMEM181Q9P2C4 612 aa16.12■□□□□ 0.17
CCSAP-204ENST00000483092 ANKMY1Q9P2S6 941 aa16.12■□□□□ 0.17
CCSAP-204ENST00000483092 PCDHB3Q9Y5E6 796 aa16.12■□□□□ 0.17
CCSAP-204ENST00000483092 GSTA4O15217 222 aa16.11■□□□□ 0.17
CCSAP-204ENST00000483092 JRKO75564 520 aa16.11■□□□□ 0.17
CCSAP-204ENST00000483092 DBTP11182 482 aaKnown RBP16.11■□□□□ 0.17
CCSAP-204ENST00000483092 BMP4P12644 408 aa16.11■□□□□ 0.17
CCSAP-204ENST00000483092 HGFP14210 728 aa16.11■□□□□ 0.17
CCSAP-204ENST00000483092 CLK3P49761 638 aaKnown RBP16.11■□□□□ 0.17
CCSAP-204ENST00000483092 HUNKP57058 714 aa16.11■□□□□ 0.17
CCSAP-204ENST00000483092 FAM110CQ1W6H9 321 aa16.11■□□□□ 0.17
CCSAP-204ENST00000483092 ZDHHC13Q8IUH4 622 aa16.11■□□□□ 0.17
CCSAP-204ENST00000483092 MMAAQ8IVH4 418 aaKnown RBP16.11■□□□□ 0.17
CCSAP-204ENST00000483092 SCN4BQ8IWT1 228 aa16.11■□□□□ 0.17
CCSAP-204ENST00000483092 TOP1MTQ969P6 601 aa16.11■□□□□ 0.17
CCSAP-204ENST00000483092 NSMCE2Q96MF7 247 aa16.11■□□□□ 0.17
CCSAP-204ENST00000483092 DEPDC7Q96QD5 511 aa16.11■□□□□ 0.17
CCSAP-204ENST00000483092 ALG2Q9H553 416 aa16.11■□□□□ 0.17
CCSAP-204ENST00000483092 MID1IP1Q9NPA3 183 aa16.11■□□□□ 0.17
CCSAP-204ENST00000483092 FAM155AB1AL88 458 aaPredicted RBP16.11■□□□□ 0.17
CCSAP-204ENST00000483092 LRIG2O94898 1065 aa16.11■□□□□ 0.17
CCSAP-204ENST00000483092 THRBP10828 461 aa16.11■□□□□ 0.17
CCSAP-204ENST00000483092 FCGR1AP12314 374 aa16.11■□□□□ 0.17
CCSAP-204ENST00000483092 FSHRP23945 695 aa16.11■□□□□ 0.17
CCSAP-204ENST00000483092 CCT8P50990 548 aa16.11■□□□□ 0.17
CCSAP-204ENST00000483092 ATP6AP1Q15904 470 aa16.11■□□□□ 0.17
CCSAP-204ENST00000483092 ADGRG5Q8IZF4 528 aa16.11■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 66.1 ms