RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000462335.1

PKP4-208, Transcript of plakophilin 4, humanhuman

TSL 4

Gene PKP4, Length 561 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PKP4-208ENST00000462335 FGF22Q9HCT0 170 aa9.49□□□□□ -0.89
PKP4-208ENST00000462335 ARFGAP3Q9NP61 516 aa9.49□□□□□ -0.89
PKP4-208ENST00000462335 IL26Q9NPH9 171 aa9.49□□□□□ -0.89
PKP4-208ENST00000462335 GPR27Q9NS67 375 aa9.49□□□□□ -0.89
PKP4-208ENST00000462335 IL17CQ9P0M4 197 aa9.49□□□□□ -0.89
PKP4-208ENST00000462335 VPS18Q9P253 973 aa9.49□□□□□ -0.89
PKP4-208ENST00000462335 KLF15Q9UIH9 416 aa9.49□□□□□ -0.89
PKP4-208ENST00000462335 PCNX2A6NKB5 2137 aa9.49□□□□□ -0.89
PKP4-208ENST00000462335 SPTBN4Q9H254 2564 aa9.48□□□□□ -0.89
PKP4-208ENST00000462335 CCDC78A2IDD5 438 aa9.48□□□□□ -0.89
PKP4-208ENST00000462335 FADS2P1A8MWK0 482 aa9.48□□□□□ -0.89
PKP4-208ENST00000462335 GPR89AB7ZAQ6 455 aa9.48□□□□□ -0.89
PKP4-208ENST00000462335 CCDC188H7C350 402 aa9.48□□□□□ -0.89
PKP4-208ENST00000462335 PFDN6O15212 129 aa9.48□□□□□ -0.89
PKP4-208ENST00000462335 KMOO15229 486 aa9.48□□□□□ -0.89
PKP4-208ENST00000462335 UGT1A9O60656 530 aa9.48□□□□□ -0.89
PKP4-208ENST00000462335 RFPL3O75679 317 aa9.48□□□□□ -0.89
PKP4-208ENST00000462335 SRP72O76094 671 aaKnown RBP9.48□□□□□ -0.89
PKP4-208ENST00000462335 PRAMEF1O95521 474 aa9.48□□□□□ -0.89
PKP4-208ENST00000462335 GPR89BP0CG08 455 aa9.48□□□□□ -0.89
PKP4-208ENST00000462335 ACP5P13686 325 aa9.48□□□□□ -0.89
PKP4-208ENST00000462335 UGT1A6P19224 532 aa9.48□□□□□ -0.89
PKP4-208ENST00000462335 UGT1A1P22309 533 aa9.48□□□□□ -0.89
PKP4-208ENST00000462335 UGT1A4P22310 534 aa9.48□□□□□ -0.89
PKP4-208ENST00000462335 ADRA1DP25100 572 aa9.48□□□□□ -0.89
PKP4-208ENST00000462335 UGT1A3P35503 534 aa9.48□□□□□ -0.89
PKP4-208ENST00000462335 UGT1A5P35504 534 aa9.48□□□□□ -0.89
PKP4-208ENST00000462335 ACTR1BP42025 376 aa9.48□□□□□ -0.89
PKP4-208ENST00000462335 ACTR1AP61163 376 aa9.48□□□□□ -0.89
PKP4-208ENST00000462335 ETF1P62495 437 aaKnown RBP9.48□□□□□ -0.89
PKP4-208ENST00000462335 TMEM115Q12893 351 aaPredicted RBP9.48□□□□□ -0.89
PKP4-208ENST00000462335 DNAJC3Q13217 504 aa9.48□□□□□ -0.89
PKP4-208ENST00000462335 LRP8Q14114 963 aa9.48□□□□□ -0.89
PKP4-208ENST00000462335 SIX1Q15475 284 aaPredicted RBP9.48□□□□□ -0.89
PKP4-208ENST00000462335 ATP13A5Q4VNC0 1218 aa9.48□□□□□ -0.89
PKP4-208ENST00000462335 CCDC38Q502W7 563 aa9.48□□□□□ -0.89
PKP4-208ENST00000462335 C6orf132Q5T0Z8 1188 aa9.48□□□□□ -0.89
PKP4-208ENST00000462335 PAPD7Q5XG87 772 aaKnown RBP9.48□□□□□ -0.89
PKP4-208ENST00000462335 CRTC3Q6UUV7 619 aa9.48□□□□□ -0.89
PKP4-208ENST00000462335 SYDE1Q6ZW31 735 aaPredicted RBP9.48□□□□□ -0.89
PKP4-208ENST00000462335 EFL1Q7Z2Z2 1120 aaKnown RBP9.48□□□□□ -0.89
PKP4-208ENST00000462335 GLRX5Q86SX6 157 aa9.48□□□□□ -0.89
PKP4-208ENST00000462335 LRRTM4Q86VH4 590 aa9.48□□□□□ -0.89
PKP4-208ENST00000462335 TRIM48Q8IWZ4 208 aa9.48□□□□□ -0.89
PKP4-208ENST00000462335 PELI3Q8N2H9 469 aa9.48□□□□□ -0.89
PKP4-208ENST00000462335 C17orf53Q8N3J3 647 aaPredicted RBP9.48□□□□□ -0.89
PKP4-208ENST00000462335 GALNT15Q8N3T1 639 aa9.48□□□□□ -0.89
PKP4-208ENST00000462335 TTC30BQ8N4P2 665 aa9.48□□□□□ -0.89
PKP4-208ENST00000462335 ARL10Q8N8L6 244 aa9.48□□□□□ -0.89
PKP4-208ENST00000462335 PNPLA1Q8N8W4 532 aa9.48□□□□□ -0.89
PKP4-208ENST00000462335 MAPK15Q8TD08 544 aa9.48□□□□□ -0.89
PKP4-208ENST00000462335 ZDHHC1Q8WTX9 485 aa9.48□□□□□ -0.89
PKP4-208ENST00000462335 VPS37BQ9H9H4 285 aa9.48□□□□□ -0.89
PKP4-208ENST00000462335 UGT1A7Q9HAW7 530 aa9.48□□□□□ -0.89
PKP4-208ENST00000462335 UGT1A10Q9HAW8 530 aa9.48□□□□□ -0.89
PKP4-208ENST00000462335 UGT1A8Q9HAW9 530 aa9.48□□□□□ -0.89
PKP4-208ENST00000462335 EIF2B3Q9NR50 452 aaKnown RBP9.48□□□□□ -0.89
PKP4-208ENST00000462335 SMARCAL1Q9NZC9 954 aa9.48□□□□□ -0.89
PKP4-208ENST00000462335 FKBPLQ9UIM3 349 aa9.48□□□□□ -0.89
PKP4-208ENST00000462335 PADI4Q9UM07 663 aa9.48□□□□□ -0.89
PKP4-208ENST00000462335 SLC17A4Q9Y2C5 497 aa9.48□□□□□ -0.89
PKP4-208ENST00000462335 PRKAB1Q9Y478 270 aa9.48□□□□□ -0.89
PKP4-208ENST00000462335 PCDHGA1Q9Y5H4 931 aa9.48□□□□□ -0.89
PKP4-208ENST00000462335 LAMA1P25391 3075 aa9.48□□□□□ -0.89
PKP4-208ENST00000462335 CNOT1A5YKK6 2376 aaKnown RBP9.48□□□□□ -0.89
PKP4-208ENST00000462335 PDZK1P1A8MUH7 402 aa9.47□□□□□ -0.89
PKP4-208ENST00000462335 KIF2AO00139 706 aaPredicted RBP9.47□□□□□ -0.89
PKP4-208ENST00000462335 NDC80O14777 642 aa9.47□□□□□ -0.89
PKP4-208ENST00000462335 CBFA2T3O75081 653 aa9.47□□□□□ -0.89
PKP4-208ENST00000462335 URI1O94763 535 aaPredicted RBP9.47□□□□□ -0.89
PKP4-208ENST00000462335 SUN1O94901 812 aa9.47□□□□□ -0.89
PKP4-208ENST00000462335 TUBB4AP04350 444 aa9.47□□□□□ -0.89
PKP4-208ENST00000462335 CKMT1AP12532 417 aa9.47□□□□□ -0.89
PKP4-208ENST00000462335 PAMP19021 973 aa9.47□□□□□ -0.89
PKP4-208ENST00000462335 PMLP29590 882 aa9.47□□□□□ -0.89
PKP4-208ENST00000462335 MC4RP32245 332 aa9.47□□□□□ -0.89
PKP4-208ENST00000462335 CTBSQ01459 385 aa9.47□□□□□ -0.89
PKP4-208ENST00000462335 DR1Q01658 176 aa9.47□□□□□ -0.89
PKP4-208ENST00000462335 CACNG1Q06432 222 aa9.47□□□□□ -0.89
PKP4-208ENST00000462335 CKAP4Q07065 602 aaKnown RBP9.47□□□□□ -0.89
PKP4-208ENST00000462335 KRT33BQ14525 404 aa9.47□□□□□ -0.89
PKP4-208ENST00000462335 PTPRCAPQ14761 206 aa9.47□□□□□ -0.89
PKP4-208ENST00000462335 GPR33Q49SQ1 333 aa9.47□□□□□ -0.89
PKP4-208ENST00000462335 PYCR3Q53H96 274 aa9.47□□□□□ -0.89
PKP4-208ENST00000462335 FASTKD1Q53R41 847 aaKnown RBP9.47□□□□□ -0.89
PKP4-208ENST00000462335 PCID2Q5JVF3 399 aa9.47□□□□□ -0.89
PKP4-208ENST00000462335 CERCAMQ5T4B2 595 aa9.47□□□□□ -0.89
PKP4-208ENST00000462335 ZNF648Q5T619 568 aaPredicted RBP9.47□□□□□ -0.89
PKP4-208ENST00000462335 LYPLAL1Q5VWZ2 237 aa9.47□□□□□ -0.89
PKP4-208ENST00000462335 KCTD11Q693B1 232 aa9.47□□□□□ -0.89
PKP4-208ENST00000462335 DHRS13Q6UX07 377 aa9.47□□□□□ -0.89
PKP4-208ENST00000462335 MAATS1Q7Z4T9 603 aa9.47□□□□□ -0.89
PKP4-208ENST00000462335 SNX20Q7Z614 316 aa9.47□□□□□ -0.89
PKP4-208ENST00000462335 FAM181AQ8N9Y4 354 aa9.47□□□□□ -0.89
PKP4-208ENST00000462335 GABPB2Q8TAK5 448 aaPredicted RBP9.47□□□□□ -0.89
PKP4-208ENST00000462335 IFI44Q8TCB0 444 aa9.47□□□□□ -0.89
PKP4-208ENST00000462335 COX14Q96I36 57 aa9.47□□□□□ -0.89
PKP4-208ENST00000462335 ZNF514Q96K75 400 aaPredicted RBP9.47□□□□□ -0.89
PKP4-208ENST00000462335 DNAJC1Q96KC8 554 aaKnown RBP9.47□□□□□ -0.89
PKP4-208ENST00000462335 C16orf45Q96MC5 204 aaPredicted RBP9.47□□□□□ -0.89
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 31.7 ms