RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000429017.2

HOXD8-202, Transcript of homeobox D8, humanhuman

TSL 2 BASIC

Gene HOXD8, Length 1,608 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXD8-202ENST00000429017 MAP9Q49MG5 647 aa6.54□□□□□ -1.36
HOXD8-202ENST00000429017 CDKAL1Q5VV42 579 aa6.54□□□□□ -1.36
HOXD8-202ENST00000429017 TRIM72Q6ZMU5 477 aa6.54□□□□□ -1.36
HOXD8-202ENST00000429017 RFLNAQ6ZTI6 216 aa6.54□□□□□ -1.36
HOXD8-202ENST00000429017 CYP4V2Q6ZWL3 525 aaPredicted RBP6.54□□□□□ -1.36
HOXD8-202ENST00000429017 NAGSQ8N159 534 aa6.54□□□□□ -1.36
HOXD8-202ENST00000429017 CBARPQ8N350 705 aaPredicted RBP6.54□□□□□ -1.36
HOXD8-202ENST00000429017 PGBD5Q8N414 524 aa6.54□□□□□ -1.36
HOXD8-202ENST00000429017 ATL2Q8NHH9 583 aa6.54□□□□□ -1.36
HOXD8-202ENST00000429017 TMEM159Q96B96 161 aa6.54□□□□□ -1.36
HOXD8-202ENST00000429017 FRMD8Q9BZ67 464 aaPredicted RBP6.54□□□□□ -1.36
HOXD8-202ENST00000429017 SLC25A18Q9H1K4 315 aa6.54□□□□□ -1.36
HOXD8-202ENST00000429017 SOX17Q9H6I2 414 aaPredicted RBP6.54□□□□□ -1.36
HOXD8-202ENST00000429017 CATSPERBQ9H7T0 1116 aa6.54□□□□□ -1.36
HOXD8-202ENST00000429017 CARS2Q9HA77 564 aaKnown RBP6.54□□□□□ -1.36
HOXD8-202ENST00000429017 OCIAD1Q9NX40 245 aa6.54□□□□□ -1.36
HOXD8-202ENST00000429017 TAS2R14Q9NYV8 317 aa6.54□□□□□ -1.36
HOXD8-202ENST00000429017 SEPT10Q9P0V9 454 aa6.54□□□□□ -1.36
HOXD8-202ENST00000429017 TAAR2Q9P1P5 351 aa6.54□□□□□ -1.36
HOXD8-202ENST00000429017 B4GALT6Q9UBX8 382 aa6.54□□□□□ -1.36
HOXD8-202ENST00000429017 B3GALT1Q9Y5Z6 326 aa6.54□□□□□ -1.36
HOXD8-202ENST00000429017 SPTA1P02549 2419 aa6.53□□□□□ -1.36
HOXD8-202ENST00000429017 TLN1Q9Y490 2541 aaKnown RBP6.53□□□□□ -1.36
HOXD8-202ENST00000429017 PTPN13Q12923 2485 aa6.53□□□□□ -1.36
HOXD8-202ENST00000429017 PDE2AO00408 941 aaPredicted RBP6.53□□□□□ -1.36
HOXD8-202ENST00000429017 FGF10O15520 208 aaPredicted RBP6.53□□□□□ -1.36
HOXD8-202ENST00000429017 PRMT3O60678 531 aa6.53□□□□□ -1.36
HOXD8-202ENST00000429017 PPFIA2O75334 1257 aa6.53□□□□□ -1.36
HOXD8-202ENST00000429017 PALMO75781 387 aa6.53□□□□□ -1.36
HOXD8-202ENST00000429017 PEX11BO96011 259 aa6.53□□□□□ -1.36
HOXD8-202ENST00000429017 CALB1P05937 261 aa6.53□□□□□ -1.36
HOXD8-202ENST00000429017 ELFN1P0C7U0 828 aa6.53□□□□□ -1.36
HOXD8-202ENST00000429017 MYCLP1P12525 358 aaPredicted RBP6.53□□□□□ -1.36
HOXD8-202ENST00000429017 LIFP15018 202 aa6.53□□□□□ -1.36
HOXD8-202ENST00000429017 ERCC2P18074 760 aa6.53□□□□□ -1.36
HOXD8-202ENST00000429017 TNFAIP3P21580 790 aa6.53□□□□□ -1.36
HOXD8-202ENST00000429017 LHCGRP22888 699 aa6.53□□□□□ -1.36
HOXD8-202ENST00000429017 EEF1GP26641 437 aaKnown RBP6.53□□□□□ -1.36
HOXD8-202ENST00000429017 SERPINA4P29622 427 aa6.53□□□□□ -1.36
HOXD8-202ENST00000429017 ALDH4A1P30038 563 aa6.53□□□□□ -1.36
HOXD8-202ENST00000429017 UGT1A3P35503 534 aa6.53□□□□□ -1.36
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HOXD8-202ENST00000429017 GNPDA1P46926 289 aa6.53□□□□□ -1.36
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HOXD8-202ENST00000429017 BCL2L1Q07817 233 aa6.53□□□□□ -1.36
HOXD8-202ENST00000429017 GRM3Q14832 879 aa6.53□□□□□ -1.36
HOXD8-202ENST00000429017 ACOX1Q15067 660 aa6.53□□□□□ -1.36
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HOXD8-202ENST00000429017 CAPN12Q6ZSI9 719 aa6.53□□□□□ -1.36
HOXD8-202ENST00000429017 HSD11B1LQ7Z5J1 315 aa6.53□□□□□ -1.36
HOXD8-202ENST00000429017 ATG4DQ86TL0 474 aaPredicted RBP6.53□□□□□ -1.36
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HOXD8-202ENST00000429017 ZNF761Q86XN6 746 aaPredicted RBP6.53□□□□□ -1.36
HOXD8-202ENST00000429017 MCOLN2Q8IZK6 566 aa6.53□□□□□ -1.36
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HOXD8-202ENST00000429017 SPRY4Q9C004 299 aa6.53□□□□□ -1.36
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HOXD8-202ENST00000429017 B3GNT4Q9C0J1 378 aa6.53□□□□□ -1.36
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HOXD8-202ENST00000429017 WDR26Q9H7D7 661 aa6.53□□□□□ -1.36
HOXD8-202ENST00000429017 ATP13A3Q9H7F0 1226 aa6.53□□□□□ -1.36
HOXD8-202ENST00000429017 SUFUQ9UMX1 484 aa6.53□□□□□ -1.36
HOXD8-202ENST00000429017 AP4E1Q9UPM8 1137 aa6.53□□□□□ -1.36
HOXD8-202ENST00000429017 PCYT1BQ9Y5K3 369 aaPredicted RBP6.53□□□□□ -1.36
HOXD8-202ENST00000429017 DOPEY2Q9Y3R5 2298 aa6.52□□□□□ -1.37
HOXD8-202ENST00000429017 IGHV1OR21-1A0A087WYE8 117 aa6.52□□□□□ -1.37
HOXD8-202ENST00000429017 ARHGAP42A6NI28 874 aa6.52□□□□□ -1.37
HOXD8-202ENST00000429017 RHPN2P1A8MT19 583 aa6.52□□□□□ -1.37
HOXD8-202ENST00000429017 STMND1H3BQB6 276 aa6.52□□□□□ -1.37
HOXD8-202ENST00000429017 DFFAO00273 331 aa6.52□□□□□ -1.37
HOXD8-202ENST00000429017 EEF2KO00418 725 aaKnown RBP6.52□□□□□ -1.37
HOXD8-202ENST00000429017 NKX2-8O15522 239 aa6.52□□□□□ -1.37
HOXD8-202ENST00000429017 HTRA2O43464 458 aaPredicted RBP6.52□□□□□ -1.37
HOXD8-202ENST00000429017 DUX1O43812 170 aa6.52□□□□□ -1.37
HOXD8-202ENST00000429017 HEXIM1O94992 359 aaKnown RBP6.52□□□□□ -1.37
HOXD8-202ENST00000429017 EML2O95834 649 aa6.52□□□□□ -1.37
HOXD8-202ENST00000429017 SOD1P00441 154 aa6.52□□□□□ -1.37
HOXD8-202ENST00000429017 THRAP10827 490 aa6.52□□□□□ -1.37
HOXD8-202ENST00000429017 CR2P20023 1033 aa6.52□□□□□ -1.37
HOXD8-202ENST00000429017 KELP23276 732 aa6.52□□□□□ -1.37
HOXD8-202ENST00000429017 CD82P27701 267 aa6.52□□□□□ -1.37
HOXD8-202ENST00000429017 ADCY8P40145 1251 aa6.52□□□□□ -1.37
HOXD8-202ENST00000429017 ETV3P41162 512 aa6.52□□□□□ -1.37
HOXD8-202ENST00000429017 SCNN1BP51168 640 aa6.52□□□□□ -1.37
HOXD8-202ENST00000429017 AIF1P55008 147 aa6.52□□□□□ -1.37
HOXD8-202ENST00000429017 POLE2P56282 527 aa6.52□□□□□ -1.37
HOXD8-202ENST00000429017 CDK3Q00526 305 aa6.52□□□□□ -1.37
HOXD8-202ENST00000429017 NSUN2Q08J23 767 aaKnown RBP eCLIP6.52□□□□□ -1.37
HOXD8-202ENST00000429017 SLC10A7Q0GE19 358 aa6.52□□□□□ -1.37
HOXD8-202ENST00000429017 TRAF2Q12933 501 aa6.52□□□□□ -1.37
HOXD8-202ENST00000429017 IHHQ14623 411 aa6.52□□□□□ -1.37
HOXD8-202ENST00000429017 SYCP1Q15431 976 aa6.52□□□□□ -1.37
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