RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000428394.6

HCLS1-202, Transcript of hematopoietic cell-specific Lyn substrate 1, humanhuman

TSL 2 BASIC

Gene HCLS1, Length 1,560 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HCLS1-202ENST00000428394 RPF2Q9H7B2 306 aaKnown RBP16.75■□□□□ 0.27
HCLS1-202ENST00000428394 HEBP1Q9NRV9 189 aa16.75■□□□□ 0.27
HCLS1-202ENST00000428394 NLE1Q9NVX2 485 aaPredicted RBP16.75■□□□□ 0.27
HCLS1-202ENST00000428394 MIOSQ9NXC5 875 aa16.75■□□□□ 0.27
HCLS1-202ENST00000428394 SEPT3Q9UH03 358 aa16.75■□□□□ 0.27
HCLS1-202ENST00000428394 ATP6AP2A0A1C7CYW4 349 aa16.74■□□□□ 0.27
HCLS1-202ENST00000428394 CCDC154A6NI56 674 aa16.74■□□□□ 0.27
HCLS1-202ENST00000428394 C16orf96A6NNT2 1141 aa16.74■□□□□ 0.27
HCLS1-202ENST00000428394 ATP6AP2O75787 350 aa16.74■□□□□ 0.27
HCLS1-202ENST00000428394 NDST3O95803 873 aa16.74■□□□□ 0.27
HCLS1-202ENST00000428394 GOT2P00505 430 aaKnown RBP16.74■□□□□ 0.27
HCLS1-202ENST00000428394 GRIK1P39086 918 aa16.74■□□□□ 0.27
HCLS1-202ENST00000428394 MAGEA11P43364 429 aa16.74■□□□□ 0.27
HCLS1-202ENST00000428394 GALK1P51570 392 aa16.74■□□□□ 0.27
HCLS1-202ENST00000428394 KPNA1P52294 538 aaPredicted RBP16.74■□□□□ 0.27
HCLS1-202ENST00000428394 TIAL1Q01085 375 aaKnown RBP eCLIP16.74■□□□□ 0.27
HCLS1-202ENST00000428394 RING1Q06587 406 aa16.74■□□□□ 0.27
HCLS1-202ENST00000428394 ITKQ08881 620 aa16.74■□□□□ 0.27
HCLS1-202ENST00000428394 SERINC3Q13530 473 aa16.74■□□□□ 0.27
HCLS1-202ENST00000428394 GRB7Q14451 532 aa16.74■□□□□ 0.27
HCLS1-202ENST00000428394 OR4D1Q15615 310 aa16.74■□□□□ 0.27
HCLS1-202ENST00000428394 PFKFB4Q16877 469 aa16.74■□□□□ 0.27
HCLS1-202ENST00000428394 CTU1Q7Z7A3 348 aaKnown RBP16.74■□□□□ 0.27
HCLS1-202ENST00000428394 HID1Q8IV36 788 aa16.74■□□□□ 0.27
HCLS1-202ENST00000428394 OR52K2Q8NGK3 314 aa16.74■□□□□ 0.27
HCLS1-202ENST00000428394 OR10T2Q8NGX3 314 aa16.74■□□□□ 0.27
HCLS1-202ENST00000428394 SCAMP5Q8TAC9 235 aa16.74■□□□□ 0.27
HCLS1-202ENST00000428394 THAP11Q96EK4 314 aa16.74■□□□□ 0.27
HCLS1-202ENST00000428394 ZNF382Q96SR6 550 aa16.74■□□□□ 0.27
HCLS1-202ENST00000428394 SLC39A3Q9BRY0 314 aa16.74■□□□□ 0.27
HCLS1-202ENST00000428394 TDRD1Q9BXT4 1180 aaKnown RBP16.74■□□□□ 0.27
HCLS1-202ENST00000428394 TMLHEQ9NVH6 421 aa16.74■□□□□ 0.27
HCLS1-202ENST00000428394 IL37Q9NZH6 218 aa16.74■□□□□ 0.27
HCLS1-202ENST00000428394 GNPTGQ9UJJ9 305 aa16.74■□□□□ 0.27
HCLS1-202ENST00000428394 RNF112Q9ULX5 631 aa16.74■□□□□ 0.27
HCLS1-202ENST00000428394 CCDC162PA2VCL2 907 aa16.73■□□□□ 0.27
HCLS1-202ENST00000428394 CASTOR2A6NHX0 329 aa16.73■□□□□ 0.27
HCLS1-202ENST00000428394 H3BMQ9 156 aa16.73■□□□□ 0.27
HCLS1-202ENST00000428394 INPP4BO15327 924 aa16.73■□□□□ 0.27
HCLS1-202ENST00000428394 MSI1O43347 362 aaKnown RBP16.73■□□□□ 0.27
HCLS1-202ENST00000428394 PRAMEF11O60813 436 aa16.73■□□□□ 0.27
HCLS1-202ENST00000428394 RAMP2O60895 175 aa16.73■□□□□ 0.27
HCLS1-202ENST00000428394 B3GAT3O94766 335 aa16.73■□□□□ 0.27
HCLS1-202ENST00000428394 BAIAP3O94812 1187 aa16.73■□□□□ 0.27
HCLS1-202ENST00000428394 ALBP02768 609 aa16.73■□□□□ 0.27
HCLS1-202ENST00000428394 EEF1DP29692 281 aaKnown RBP16.73■□□□□ 0.27
HCLS1-202ENST00000428394 VEGFBP49765 207 aa16.73■□□□□ 0.27
HCLS1-202ENST00000428394 ALDH3A2P51648 485 aa16.73■□□□□ 0.27
HCLS1-202ENST00000428394 POLR2JP52435 117 aaKnown RBP16.73■□□□□ 0.27
HCLS1-202ENST00000428394 PRKG2Q13237 762 aa16.73■□□□□ 0.27
HCLS1-202ENST00000428394 TOP3AQ13472 1001 aaPredicted RBP16.73■□□□□ 0.27
HCLS1-202ENST00000428394 MS4A13Q5J8X5 152 aa16.73■□□□□ 0.27
HCLS1-202ENST00000428394 BROXQ5VW32 411 aa16.73■□□□□ 0.27
HCLS1-202ENST00000428394 CST9Q5W186 159 aa16.73■□□□□ 0.27
HCLS1-202ENST00000428394 TTC23Q5W5X9 447 aa16.73■□□□□ 0.27
HCLS1-202ENST00000428394 CD300LGQ6UXG3 332 aa16.73■□□□□ 0.27
HCLS1-202ENST00000428394 ZC3H8Q8N5P1 291 aaKnown RBP eCLIP16.73■□□□□ 0.27
HCLS1-202ENST00000428394 OR8J3Q8NGG0 315 aa16.73■□□□□ 0.27
HCLS1-202ENST00000428394 RAB2BQ8WUD1 216 aa16.73■□□□□ 0.27
HCLS1-202ENST00000428394 CYGBQ8WWM9 190 aa16.73■□□□□ 0.27
HCLS1-202ENST00000428394 BRI3BPQ8WY22 251 aa16.73■□□□□ 0.27
HCLS1-202ENST00000428394 AURKBQ96GD4 344 aaPredicted RBP16.73■□□□□ 0.27
HCLS1-202ENST00000428394 COG8Q96MW5 612 aa16.73■□□□□ 0.27
HCLS1-202ENST00000428394 C1orf50Q9BV19 199 aa16.73■□□□□ 0.27
HCLS1-202ENST00000428394 GPN2Q9H9Y4 310 aaPredicted RBP16.73■□□□□ 0.27
HCLS1-202ENST00000428394 MPP6Q9NZW5 540 aa16.73■□□□□ 0.27
HCLS1-202ENST00000428394 SFMBT1Q9UHJ3 866 aa16.73■□□□□ 0.27
HCLS1-202ENST00000428394 BLOC1S6Q9UL45 172 aa16.73■□□□□ 0.27
HCLS1-202ENST00000428394 ZNF510Q9Y2H8 683 aa16.73■□□□□ 0.27
HCLS1-202ENST00000428394 FAM92AA1XBS5 289 aa16.72■□□□□ 0.27
HCLS1-202ENST00000428394 SUPT3HB4E1H0 165 aa16.72■□□□□ 0.27
HCLS1-202ENST00000428394 TMEM189-UBE2V1I3L0A0 370 aa16.72■□□□□ 0.27
HCLS1-202ENST00000428394 EI24O14681 340 aa16.72■□□□□ 0.27
HCLS1-202ENST00000428394 SUPT3HO75486 399 aa16.72■□□□□ 0.27
HCLS1-202ENST00000428394 SERPINF2P08697 491 aa16.72■□□□□ 0.27
HCLS1-202ENST00000428394 VARSP26640 1264 aaKnown RBP16.72■□□□□ 0.27
HCLS1-202ENST00000428394 CLCN4P51793 760 aa16.72■□□□□ 0.27
HCLS1-202ENST00000428394 CDH13P55290 713 aa16.72■□□□□ 0.27
HCLS1-202ENST00000428394 TMED1Q13445 227 aa16.72■□□□□ 0.27
HCLS1-202ENST00000428394 RAB39AQ14964 217 aa16.72■□□□□ 0.27
HCLS1-202ENST00000428394 FAM117BQ6P1L5 589 aa16.72■□□□□ 0.27
HCLS1-202ENST00000428394 PIM3Q86V86 326 aa16.72■□□□□ 0.27
HCLS1-202ENST00000428394 ZFAND4Q86XD8 727 aa16.72■□□□□ 0.27
HCLS1-202ENST00000428394 RIMKLAQ8IXN7 391 aa16.72■□□□□ 0.27
HCLS1-202ENST00000428394 CARNMT1Q8N4J0 409 aa16.72■□□□□ 0.27
HCLS1-202ENST00000428394 C2orf69Q8N8R5 385 aa16.72■□□□□ 0.27
HCLS1-202ENST00000428394 OR13F1Q8NGS4 319 aa16.72■□□□□ 0.27
HCLS1-202ENST00000428394 DNAJB8Q8NHS0 232 aa16.72■□□□□ 0.27
HCLS1-202ENST00000428394 ISG20Q96AZ6 181 aaKnown RBP16.72■□□□□ 0.27
HCLS1-202ENST00000428394 PABPC5Q96DU9 382 aaKnown RBP16.72■□□□□ 0.27
HCLS1-202ENST00000428394 TBATAQ96M53 351 aa16.72■□□□□ 0.27
HCLS1-202ENST00000428394 NSMCE2Q96MF7 247 aa16.72■□□□□ 0.27
HCLS1-202ENST00000428394 MTG1Q9BT17 334 aaPredicted RBP16.72■□□□□ 0.27
HCLS1-202ENST00000428394 POLR1BQ9H9Y6 1135 aa16.72■□□□□ 0.27
HCLS1-202ENST00000428394 WBP1LQ9NX94 342 aa16.72■□□□□ 0.27
HCLS1-202ENST00000428394 SCN10AQ9Y5Y9 1956 aa16.72■□□□□ 0.27
HCLS1-202ENST00000428394 A0A1W2PQH9 124 aa16.72■□□□□ 0.27
HCLS1-202ENST00000428394 GOLGA8CPA6NN73 597 aa16.72■□□□□ 0.27
HCLS1-202ENST00000428394 J3KR12 359 aa16.72■□□□□ 0.27
HCLS1-202ENST00000428394 VPS26AO75436 327 aa16.72■□□□□ 0.27
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