RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000409300.5

RAD9B-204, Transcript of RAD9 checkpoint clamp component B, human

APPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC

Gene RAD9B, Length 2,732 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
RAD9B-204	ENST00000409300	IGSF5	Q9NSI5	407 aa		11.17	□□□□□ -0.62
RAD9B-204	ENST00000409300	TSR3	Q9UJK0	312 aa	Known RBP	11.17	□□□□□ -0.62
RAD9B-204	ENST00000409300	DNAH14	Q0VDD8	3507 aa		11.17	□□□□□ -0.62
RAD9B-204	ENST00000409300	MUC3A	Q02505	3323 aa		11.17	□□□□□ -0.62
RAD9B-204	ENST00000409300	MID1	O15344	667 aa		11.16	□□□□□ -0.62
RAD9B-204	ENST00000409300	ZNF37A	P17032	561 aa	Predicted RBP	11.16	□□□□□ -0.62
RAD9B-204	ENST00000409300	P2RY2	P41231	377 aa		11.16	□□□□□ -0.62
RAD9B-204	ENST00000409300	SATB1	Q01826	763 aa		11.16	□□□□□ -0.62
RAD9B-204	ENST00000409300	BST1	Q10588	318 aa		11.16	□□□□□ -0.62
RAD9B-204	ENST00000409300	CNTN1	Q12860	1018 aa		11.16	□□□□□ -0.62
RAD9B-204	ENST00000409300	ITGA9	Q13797	1035 aa		11.16	□□□□□ -0.62
RAD9B-204	ENST00000409300	ZSCAN26	Q16670	478 aa		11.16	□□□□□ -0.62
RAD9B-204	ENST00000409300	GPR33	Q49SQ1	333 aa		11.16	□□□□□ -0.62
RAD9B-204	ENST00000409300	AGAP9	Q5VTM2	703 aa		11.16	□□□□□ -0.62
RAD9B-204	ENST00000409300	CES4A	Q5XG92	561 aa		11.16	□□□□□ -0.62
RAD9B-204	ENST00000409300	ERN2	Q76MJ5	926 aa	Known RBP	11.16	□□□□□ -0.62
RAD9B-204	ENST00000409300	DPPA4	Q7L190	304 aa		11.16	□□□□□ -0.62
RAD9B-204	ENST00000409300	TMEM151A	Q8N4L1	468 aa		11.16	□□□□□ -0.62
RAD9B-204	ENST00000409300	SLC30A3	Q99726	388 aa		11.16	□□□□□ -0.62
RAD9B-204	ENST00000409300	RIOK2	Q9BVS4	552 aa	Known RBP	11.16	□□□□□ -0.62
RAD9B-204	ENST00000409300	TSSK1B	Q9BXA7	367 aa		11.16	□□□□□ -0.62
RAD9B-204	ENST00000409300	SIRPG	Q9P1W8	387 aa		11.16	□□□□□ -0.62
RAD9B-204	ENST00000409300	PRSS21	Q9Y6M0	314 aa		11.16	□□□□□ -0.62
RAD9B-204	ENST00000409300	PIKFYVE	Q9Y2I7	2098 aa		11.16	□□□□□ -0.62
RAD9B-204	ENST00000409300		G3V2L1	256 aa		11.16	□□□□□ -0.62
RAD9B-204	ENST00000409300	BIRC5	O15392	142 aa		11.16	□□□□□ -0.62
RAD9B-204	ENST00000409300	SPINT1	O43278	529 aa		11.16	□□□□□ -0.62
RAD9B-204	ENST00000409300	MMP20	O60882	483 aa		11.16	□□□□□ -0.62
RAD9B-204	ENST00000409300	VPS26A	O75436	327 aa		11.16	□□□□□ -0.62
RAD9B-204	ENST00000409300	TRIM16	O95361	564 aa		11.16	□□□□□ -0.62
RAD9B-204	ENST00000409300	ESR1	P03372	595 aa		11.16	□□□□□ -0.62
RAD9B-204	ENST00000409300	SBK3	P0C264	359 aa		11.16	□□□□□ -0.62
RAD9B-204	ENST00000409300	TFF2	Q03403	129 aa		11.16	□□□□□ -0.62
RAD9B-204	ENST00000409300	GRSF1	Q12849	480 aa	Known RBP eCLIP	11.16	□□□□□ -0.62
RAD9B-204	ENST00000409300	KLC3	Q6P597	504 aa		11.16	□□□□□ -0.62
RAD9B-204	ENST00000409300	RGS9BP	Q6ZS82	235 aa		11.16	□□□□□ -0.62
RAD9B-204	ENST00000409300	DET1	Q7L5Y6	550 aa		11.16	□□□□□ -0.62
RAD9B-204	ENST00000409300	OTOA	Q7RTW8	1153 aa		11.16	□□□□□ -0.62
RAD9B-204	ENST00000409300	RALGPS2	Q86X27	583 aa	Predicted RBP	11.16	□□□□□ -0.62
RAD9B-204	ENST00000409300	RBFA	Q8N0V3	343 aa		11.16	□□□□□ -0.62
RAD9B-204	ENST00000409300	DEFB123	Q8N688	67 aa		11.16	□□□□□ -0.62
RAD9B-204	ENST00000409300	IL17RC	Q8NAC3	791 aa		11.16	□□□□□ -0.62
RAD9B-204	ENST00000409300	TXNDC5	Q8NBS9	432 aa	Known RBP	11.16	□□□□□ -0.62
RAD9B-204	ENST00000409300	MKRN2	Q9H000	416 aa	Known RBP	11.16	□□□□□ -0.62
RAD9B-204	ENST00000409300	SLC6A17	Q9H1V8	727 aa		11.16	□□□□□ -0.62
RAD9B-204	ENST00000409300	ALG9	Q9H6U8	611 aa		11.16	□□□□□ -0.62
RAD9B-204	ENST00000409300	ANKRD12	Q6UB98	2062 aa		11.16	□□□□□ -0.62
RAD9B-204	ENST00000409300	TRBV5-4	A0A0C4DH59	114 aa		11.15	□□□□□ -0.62
RAD9B-204	ENST00000409300	ZBTB14	O43829	449 aa		11.15	□□□□□ -0.62
RAD9B-204	ENST00000409300	EDF1	O60869	148 aa	Known RBP	11.15	□□□□□ -0.62
RAD9B-204	ENST00000409300	RNASEH1	O60930	286 aa	Known RBP	11.15	□□□□□ -0.62
RAD9B-204	ENST00000409300	MYL2	P10916	166 aa		11.15	□□□□□ -0.62
RAD9B-204	ENST00000409300	TFEB	P19484	476 aa		11.15	□□□□□ -0.62
RAD9B-204	ENST00000409300	NTSR1	P30989	418 aa		11.15	□□□□□ -0.62
RAD9B-204	ENST00000409300	AKT1	P31749	480 aa		11.15	□□□□□ -0.62
RAD9B-204	ENST00000409300	CST6	Q15828	149 aa		11.15	□□□□□ -0.62
RAD9B-204	ENST00000409300	TSNAXIP1	Q2TAA8	658 aa		11.15	□□□□□ -0.62
RAD9B-204	ENST00000409300	SETMAR	Q53H47	684 aa	Predicted RBP	11.15	□□□□□ -0.62
RAD9B-204	ENST00000409300	TMEM196	Q5HYL7	178 aa		11.15	□□□□□ -0.62
RAD9B-204	ENST00000409300	FAM46C	Q5VWP2	391 aa		11.15	□□□□□ -0.62
RAD9B-204	ENST00000409300	ZDHHC20	Q5W0Z9	365 aa		11.15	□□□□□ -0.62
RAD9B-204	ENST00000409300	SDE2	Q6IQ49	451 aa		11.15	□□□□□ -0.62
RAD9B-204	ENST00000409300	CGB2	Q6NT52	195 aa		11.15	□□□□□ -0.62
RAD9B-204	ENST00000409300	RAB11FIP1	Q6WKZ4	1283 aa	Predicted RBP	11.15	□□□□□ -0.62
RAD9B-204	ENST00000409300	NAPRT	Q6XQN6	538 aa		11.15	□□□□□ -0.62
RAD9B-204	ENST00000409300	SUGP1	Q8IWZ8	645 aa	Known RBP	11.15	□□□□□ -0.62
RAD9B-204	ENST00000409300	EXT2	Q93063	718 aa		11.15	□□□□□ -0.62
RAD9B-204	ENST00000409300	SEC16B	Q96JE7	1060 aa		11.15	□□□□□ -0.62
RAD9B-204	ENST00000409300	COPS8	Q99627	209 aa		11.15	□□□□□ -0.62
RAD9B-204	ENST00000409300	C19orf43	Q9BQ61	176 aa		11.15	□□□□□ -0.62
RAD9B-204	ENST00000409300	C20orf27	Q9GZN8	174 aa		11.15	□□□□□ -0.62
RAD9B-204	ENST00000409300	P2RY12	Q9H244	342 aa		11.15	□□□□□ -0.62
RAD9B-204	ENST00000409300	MRPL46	Q9H2W6	279 aa	Known RBP	11.15	□□□□□ -0.62
RAD9B-204	ENST00000409300	NUMA1	Q14980	2115 aa		11.15	□□□□□ -0.62
RAD9B-204	ENST00000409300		A0A1W2PP55	124 aa		11.15	□□□□□ -0.62
RAD9B-204	ENST00000409300	NEMP2	A6NFY4	417 aa		11.15	□□□□□ -0.62
RAD9B-204	ENST00000409300	WNT9A	O14904	365 aa		11.15	□□□□□ -0.62
RAD9B-204	ENST00000409300	KLF8	O95600	359 aa	Predicted RBP	11.15	□□□□□ -0.62
RAD9B-204	ENST00000409300	PYGL	P06737	847 aa		11.15	□□□□□ -0.62
RAD9B-204	ENST00000409300	RALB	P11234	206 aa		11.15	□□□□□ -0.62
RAD9B-204	ENST00000409300	FGF3	P11487	239 aa	Predicted RBP	11.15	□□□□□ -0.62
RAD9B-204	ENST00000409300	PTPN5	P54829	565 aa		11.15	□□□□□ -0.62
RAD9B-204	ENST00000409300	ADAR	P55265	1226 aa	Known RBP	11.15	□□□□□ -0.62
RAD9B-204	ENST00000409300	ELP6	Q0PNE2	266 aa		11.15	□□□□□ -0.62
RAD9B-204	ENST00000409300	STX3	Q13277	289 aa		11.15	□□□□□ -0.62
RAD9B-204	ENST00000409300	CAMK2G	Q13555	558 aa	Predicted RBP	11.15	□□□□□ -0.62
RAD9B-204	ENST00000409300	ENPP2	Q13822	863 aa		11.15	□□□□□ -0.62
RAD9B-204	ENST00000409300	SMAD2	Q15796	467 aa	Known RBP	11.15	□□□□□ -0.62
RAD9B-204	ENST00000409300	ATG16L1	Q676U5	607 aa		11.15	□□□□□ -0.62
RAD9B-204	ENST00000409300	PTCRA	Q6ISU1	281 aa	Predicted RBP	11.15	□□□□□ -0.62
RAD9B-204	ENST00000409300	AADAT	Q8N5Z0	425 aa		11.15	□□□□□ -0.62
RAD9B-204	ENST00000409300	GANC	Q8TET4	914 aa		11.15	□□□□□ -0.62
RAD9B-204	ENST00000409300	KCNJ9	Q92806	393 aa		11.15	□□□□□ -0.62
RAD9B-204	ENST00000409300	AP2M1	Q96CW1	435 aa		11.15	□□□□□ -0.62
RAD9B-204	ENST00000409300	GUCD1	Q96NT3	240 aa		11.15	□□□□□ -0.62
RAD9B-204	ENST00000409300	SERGEF	Q9UGK8	458 aa		11.15	□□□□□ -0.62
RAD9B-204	ENST00000409300	TRMT6	Q9UJA5	497 aa	Known RBP	11.15	□□□□□ -0.62
RAD9B-204	ENST00000409300	AGAP14	A8MT82	685 aa		11.15	□□□□□ -0.63
RAD9B-204	ENST00000409300		H3BMM5	538 aa		11.15	□□□□□ -0.63
RAD9B-204	ENST00000409300	AREL1	O15033	823 aa		11.15	□□□□□ -0.63

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