RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000402096.5

ATG4B-204, Transcript of autophagy related 4B cysteine peptidase, humanhuman

TSL 2 BASIC

Gene ATG4B, Length 1,685 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATG4B-204ENST00000402096 PLD6Q8N2A8 252 aaKnown RBP20.34■□□□□ 0.85
ATG4B-204ENST00000402096 TRAM1L1Q8N609 369 aa20.34■□□□□ 0.85
ATG4B-204ENST00000402096 ARMC2Q8NEN0 867 aa20.34■□□□□ 0.85
ATG4B-204ENST00000402096 NUS1Q96E22 293 aa20.34■□□□□ 0.85
ATG4B-204ENST00000402096 COQ10AQ96MF6 247 aa20.34■□□□□ 0.85
ATG4B-204ENST00000402096 GPAMQ9HCL2 828 aa20.34■□□□□ 0.85
ATG4B-204ENST00000402096 SERGEFQ9UGK8 458 aa20.34■□□□□ 0.85
ATG4B-204ENST00000402096 MMP17Q9ULZ9 603 aa20.34■□□□□ 0.85
ATG4B-204ENST00000402096 PRUNE2Q8WUY3 3088 aa20.34■□□□□ 0.85
ATG4B-204ENST00000402096 PRMT5O14744 637 aaPredicted RBP20.33■□□□□ 0.85
ATG4B-204ENST00000402096 ASMTLO95671 621 aa20.33■□□□□ 0.85
ATG4B-204ENST00000402096 GM2AP17900 193 aa20.33■□□□□ 0.85
ATG4B-204ENST00000402096 PDAP1Q13442 181 aaKnown RBP20.33■□□□□ 0.85
ATG4B-204ENST00000402096 INSCQ1MX18 579 aa20.33■□□□□ 0.85
ATG4B-204ENST00000402096 TTC31Q49AM3 519 aaPredicted RBP20.33■□□□□ 0.85
ATG4B-204ENST00000402096 KCTD4Q8WVF5 259 aa20.33■□□□□ 0.85
ATG4B-204ENST00000402096 DTD2Q96FN9 168 aa20.33■□□□□ 0.85
ATG4B-204ENST00000402096 SIPA1Q96FS4 1042 aa20.33■□□□□ 0.85
ATG4B-204ENST00000402096 BIRC8Q96P09 236 aa20.33■□□□□ 0.85
ATG4B-204ENST00000402096 ZSCAN5AQ9BUG6 496 aa20.33■□□□□ 0.85
ATG4B-204ENST00000402096 BOCQ9BWV1 1114 aa20.33■□□□□ 0.85
ATG4B-204ENST00000402096 ZNF358Q9NW07 568 aa20.33■□□□□ 0.85
ATG4B-204ENST00000402096 ZDHHC3Q9NYG2 299 aa20.33■□□□□ 0.85
ATG4B-204ENST00000402096 NFKBIL1Q9UBC1 381 aaPredicted RBP20.33■□□□□ 0.85
ATG4B-204ENST00000402096 WDR91A4D1P6 747 aa20.32■□□□□ 0.84
ATG4B-204ENST00000402096 E5RI56 91 aa20.32■□□□□ 0.84
ATG4B-204ENST00000402096 TSPAN6O43657 245 aa20.32■□□□□ 0.84
ATG4B-204ENST00000402096 RECQL5O94762 991 aaPredicted RBP20.32■□□□□ 0.84
ATG4B-204ENST00000402096 ESR1P03372 595 aa20.32■□□□□ 0.84
ATG4B-204ENST00000402096 GSTA1P08263 222 aa20.32■□□□□ 0.84
ATG4B-204ENST00000402096 CSRP3P50461 194 aa20.32■□□□□ 0.84
ATG4B-204ENST00000402096 SETMARQ53H47 684 aaPredicted RBP20.32■□□□□ 0.84
ATG4B-204ENST00000402096 CTSL3PQ5NE16 218 aa20.32■□□□□ 0.84
ATG4B-204ENST00000402096 HENMT1Q5T8I9 393 aaKnown RBP20.32■□□□□ 0.84
ATG4B-204ENST00000402096 PTRHD1Q6GMV3 140 aaKnown RBP20.32■□□□□ 0.84
ATG4B-204ENST00000402096 KIAA1324Q6UXG2 1013 aaKnown RBP20.32■□□□□ 0.84
ATG4B-204ENST00000402096 TMEM92Q6UXU6 159 aa20.32■□□□□ 0.84
ATG4B-204ENST00000402096 Q6ZS52 159 aa20.32■□□□□ 0.84
ATG4B-204ENST00000402096 CLEC14AQ86T13 490 aa20.32■□□□□ 0.84
ATG4B-204ENST00000402096 FLCNQ8NFG4 579 aa20.32■□□□□ 0.84
ATG4B-204ENST00000402096 CCDC97Q96F63 343 aaPredicted RBP20.32■□□□□ 0.84
ATG4B-204ENST00000402096 COPS8Q99627 209 aa20.32■□□□□ 0.84
ATG4B-204ENST00000402096 P2RY12Q9H244 342 aa20.32■□□□□ 0.84
ATG4B-204ENST00000402096 TAS2R13Q9NYV9 303 aa20.32■□□□□ 0.84
ATG4B-204ENST00000402096 TMEM216Q9P0N5 145 aa20.32■□□□□ 0.84
ATG4B-204ENST00000402096 GNPTGQ9UJJ9 305 aa20.32■□□□□ 0.84
ATG4B-204ENST00000402096 RUVBL2Q9Y230 463 aaKnown RBP20.32■□□□□ 0.84
ATG4B-204ENST00000402096 MRPS17Q9Y2R5 130 aaKnown RBP20.32■□□□□ 0.84
ATG4B-204ENST00000402096 PCDHB1Q9Y5F3 818 aa20.32■□□□□ 0.84
ATG4B-204ENST00000402096 COMMD10Q9Y6G5 202 aa20.32■□□□□ 0.84
ATG4B-204ENST00000402096 TRPM6Q9BX84 2022 aa20.32■□□□□ 0.84
ATG4B-204ENST00000402096 PIKFYVEQ9Y2I7 2098 aa20.32■□□□□ 0.84
ATG4B-204ENST00000402096 TCRBV21S2A2A0A5A6 115 aa20.32■□□□□ 0.84
ATG4B-204ENST00000402096 AGAP14A8MT82 685 aa20.32■□□□□ 0.84
ATG4B-204ENST00000402096 AP1G1O43747 822 aa20.32■□□□□ 0.84
ATG4B-204ENST00000402096 NIPSNAP2O75323 286 aa20.32■□□□□ 0.84
ATG4B-204ENST00000402096 VPS26AO75436 327 aa20.32■□□□□ 0.84
ATG4B-204ENST00000402096 ACADMP11310 421 aa20.32■□□□□ 0.84
ATG4B-204ENST00000402096 CHRM3P20309 590 aa20.32■□□□□ 0.84
ATG4B-204ENST00000402096 AKT1P31749 480 aa20.32■□□□□ 0.84
ATG4B-204ENST00000402096 LSP1P33241 339 aa20.32■□□□□ 0.84
ATG4B-204ENST00000402096 ADARP55265 1226 aaKnown RBP20.32■□□□□ 0.84
ATG4B-204ENST00000402096 TAS2R38P59533 333 aa20.32■□□□□ 0.84
ATG4B-204ENST00000402096 CSHL1Q14406 222 aa20.32■□□□□ 0.84
ATG4B-204ENST00000402096 ITIH4Q14624 930 aa20.32■□□□□ 0.84
ATG4B-204ENST00000402096 UBXN2BQ14CS0 331 aa20.32■□□□□ 0.84
ATG4B-204ENST00000402096 KYAT3Q6YP21 454 aaKnown RBP20.32■□□□□ 0.84
ATG4B-204ENST00000402096 CYP2U1Q7Z449 544 aa20.32■□□□□ 0.84
ATG4B-204ENST00000402096 SPATA6LQ8N4H0 392 aa20.32■□□□□ 0.84
ATG4B-204ENST00000402096 NAT14Q8WUY8 206 aa20.32■□□□□ 0.84
ATG4B-204ENST00000402096 SCYL1Q96KG9 808 aa20.32■□□□□ 0.84
ATG4B-204ENST00000402096 SCML1Q9UN30 329 aa20.32■□□□□ 0.84
ATG4B-204ENST00000402096 PYGLP06737 847 aa20.31■□□□□ 0.84
ATG4B-204ENST00000402096 CHRNB1P11230 501 aa20.31■□□□□ 0.84
ATG4B-204ENST00000402096 NEFHP12036 1026 aa20.31■□□□□ 0.84
ATG4B-204ENST00000402096 COL6A2P12110 1019 aa20.31■□□□□ 0.84
ATG4B-204ENST00000402096 RPS3P23396 243 aaKnown RBP eCLIP20.31■□□□□ 0.84
ATG4B-204ENST00000402096 ETV4P43268 484 aa20.31■□□□□ 0.84
ATG4B-204ENST00000402096 GLRBP48167 497 aa20.31■□□□□ 0.84
ATG4B-204ENST00000402096 LRRC32Q14392 662 aa20.31■□□□□ 0.84
ATG4B-204ENST00000402096 GPRC6AQ5T6X5 926 aa20.31■□□□□ 0.84
ATG4B-204ENST00000402096 SPNS2Q8IVW8 549 aa20.31■□□□□ 0.84
ATG4B-204ENST00000402096 RAVER1Q8IY67 606 aaKnown RBP20.31■□□□□ 0.84
ATG4B-204ENST00000402096 OR14C36Q8NHC7 312 aa20.31■□□□□ 0.84
ATG4B-204ENST00000402096 SHDQ96IW2 340 aa20.31■□□□□ 0.84
ATG4B-204ENST00000402096 GPR21Q99679 349 aa20.31■□□□□ 0.84
ATG4B-204ENST00000402096 UNKQ9C0B0 810 aaKnown RBP20.31■□□□□ 0.84
ATG4B-204ENST00000402096 LMAN1LQ9HAT1 526 aa20.31■□□□□ 0.84
ATG4B-204ENST00000402096 CD248Q9HCU0 757 aa20.31■□□□□ 0.84
ATG4B-204ENST00000402096 SARS2Q9NP81 518 aaKnown RBP20.31■□□□□ 0.84
ATG4B-204ENST00000402096 WNT16Q9UBV4 365 aa20.31■□□□□ 0.84
ATG4B-204ENST00000402096 EMCNQ9ULC0 261 aa20.31■□□□□ 0.84
ATG4B-204ENST00000402096 NCKAP1Q9Y2A7 1128 aa20.31■□□□□ 0.84
ATG4B-204ENST00000402096 PRSS21Q9Y6M0 314 aa20.31■□□□□ 0.84
ATG4B-204ENST00000402096 KRBA1A5PL33 1030 aa20.3■□□□□ 0.84
ATG4B-204ENST00000402096 PRR23AA6NEV1 266 aa20.3■□□□□ 0.84
ATG4B-204ENST00000402096 FADS2P1A8MWK0 482 aa20.3■□□□□ 0.84
ATG4B-204ENST00000402096 SHOX2O60902 331 aaPredicted RBP20.3■□□□□ 0.84
ATG4B-204ENST00000402096 CCDC166P0CW27 439 aa20.3■□□□□ 0.84
ATG4B-204ENST00000402096 TARSP26639 723 aaKnown RBP20.3■□□□□ 0.84
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 38.1 ms