RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000384154.1

RNU6-190P-201, Transcript of RNA, U6 small nuclear 190, pseudogene, humanhuman

BASIC

Gene RNU6-190P, Length 102 nt, Biotype snRNA.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNU6-190P-201ENST00000384154 ZNF12P17014 697 aa3.09□□□□□ -1.91
RNU6-190P-201ENST00000384154 HOXB6P17509 224 aaKnown RBP3.09□□□□□ -1.91
RNU6-190P-201ENST00000384154 SSTR2P30874 369 aa3.09□□□□□ -1.91
RNU6-190P-201ENST00000384154 MSH2P43246 934 aa3.09□□□□□ -1.91
RNU6-190P-201ENST00000384154 THBS3P49746 956 aa3.09□□□□□ -1.91
RNU6-190P-201ENST00000384154 NANOS2P60321 138 aaKnown RBP3.09□□□□□ -1.91
RNU6-190P-201ENST00000384154 SEC61A1P61619 476 aaKnown RBP3.09□□□□□ -1.91
RNU6-190P-201ENST00000384154 MRPS5P82675 430 aaKnown RBP3.09□□□□□ -1.91
RNU6-190P-201ENST00000384154 NUCB1Q02818 461 aa3.09□□□□□ -1.91
RNU6-190P-201ENST00000384154 TNFAIP1Q13829 316 aa3.09□□□□□ -1.91
RNU6-190P-201ENST00000384154 KCNC3Q14003 757 aa3.09□□□□□ -1.91
RNU6-190P-201ENST00000384154 XKR9Q5GH70 373 aa3.09□□□□□ -1.91
RNU6-190P-201ENST00000384154 KCNT1Q5JUK3 1230 aa3.09□□□□□ -1.91
RNU6-190P-201ENST00000384154 NSUN5P2Q63ZY6 315 aa3.09□□□□□ -1.91
RNU6-190P-201ENST00000384154 TMEM198Q66K66 360 aa3.09□□□□□ -1.91
RNU6-190P-201ENST00000384154 DUS1LQ6P1R4 473 aaKnown RBP3.09□□□□□ -1.91
RNU6-190P-201ENST00000384154 PDXDC1Q6P996 788 aa3.09□□□□□ -1.91
RNU6-190P-201ENST00000384154 BRAT1Q6PJG6 821 aa3.09□□□□□ -1.91
RNU6-190P-201ENST00000384154 KRT74Q7RTS7 529 aa3.09□□□□□ -1.91
RNU6-190P-201ENST00000384154 KBTBD6Q86V97 674 aa3.09□□□□□ -1.91
RNU6-190P-201ENST00000384154 PM20D2Q8IYS1 436 aa3.09□□□□□ -1.91
RNU6-190P-201ENST00000384154 SCYL3Q8IZE3 742 aa3.09□□□□□ -1.91
RNU6-190P-201ENST00000384154 RBMXL3Q8N7X1 1067 aaKnown RBP3.09□□□□□ -1.91
RNU6-190P-201ENST00000384154 ZNF114Q8NC26 417 aa3.09□□□□□ -1.91
RNU6-190P-201ENST00000384154 ACVR1CQ8NER5 493 aa3.09□□□□□ -1.91
RNU6-190P-201ENST00000384154 OR8K5Q8NH50 307 aa3.09□□□□□ -1.91
RNU6-190P-201ENST00000384154 THAP6Q8TBB0 222 aa3.09□□□□□ -1.91
RNU6-190P-201ENST00000384154 TMED6Q8WW62 240 aa3.09□□□□□ -1.91
RNU6-190P-201ENST00000384154 LRRC59Q96AG4 307 aaKnown RBP3.09□□□□□ -1.91
RNU6-190P-201ENST00000384154 ERP27Q96DN0 273 aa3.09□□□□□ -1.91
RNU6-190P-201ENST00000384154 SAT2Q96F10 170 aaPredicted RBP3.09□□□□□ -1.91
RNU6-190P-201ENST00000384154 NUDCD1Q96RS6 583 aa3.09□□□□□ -1.91
RNU6-190P-201ENST00000384154 TMEM204Q9BSN7 226 aa3.09□□□□□ -1.91
RNU6-190P-201ENST00000384154 SEZ6LQ9BYH1 1024 aa3.09□□□□□ -1.91
RNU6-190P-201ENST00000384154 GIMAP4Q9NUV9 329 aa3.09□□□□□ -1.91
RNU6-190P-201ENST00000384154 PSD3Q9NYI0 1048 aa3.09□□□□□ -1.91
RNU6-190P-201ENST00000384154 NKIRAS2Q9NYR9 191 aa3.09□□□□□ -1.91
RNU6-190P-201ENST00000384154 POLG2Q9UHN1 485 aa3.09□□□□□ -1.91
RNU6-190P-201ENST00000384154 RPS6KA6Q9UK32 745 aa3.09□□□□□ -1.91
RNU6-190P-201ENST00000384154 WBP11Q9Y2W2 641 aaKnown RBP3.09□□□□□ -1.91
RNU6-190P-201ENST00000384154 AMDHD2Q9Y303 409 aa3.09□□□□□ -1.91
RNU6-190P-201ENST00000384154 PTRH2Q9Y3E5 179 aaKnown RBP3.09□□□□□ -1.91
RNU6-190P-201ENST00000384154 RSF1Q96T23 1441 aaPredicted RBP3.09□□□□□ -1.92
RNU6-190P-201ENST00000384154 LOC100509620A0A075B734 347 aa3.08□□□□□ -1.92
RNU6-190P-201ENST00000384154 LOC102723996A0A087X1L8 192 aa3.08□□□□□ -1.92
RNU6-190P-201ENST00000384154 A0A1W2PP11 408 aa3.08□□□□□ -1.92
RNU6-190P-201ENST00000384154 LRRC72A6NJI9 287 aa3.08□□□□□ -1.92
RNU6-190P-201ENST00000384154 SH2B2O14492 632 aaPredicted RBP3.08□□□□□ -1.92
RNU6-190P-201ENST00000384154 ANKRD28O15084 1053 aa3.08□□□□□ -1.92
RNU6-190P-201ENST00000384154 P4HA2O15460 535 aa3.08□□□□□ -1.92
RNU6-190P-201ENST00000384154 KCNN4O15554 427 aa3.08□□□□□ -1.92
RNU6-190P-201ENST00000384154 GPC4O75487 556 aa3.08□□□□□ -1.92
RNU6-190P-201ENST00000384154 ERAL1O75616 437 aaKnown RBP3.08□□□□□ -1.92
RNU6-190P-201ENST00000384154 KDM4BO94953 1096 aa3.08□□□□□ -1.92
RNU6-190P-201ENST00000384154 NTN1O95631 604 aa3.08□□□□□ -1.92
RNU6-190P-201ENST00000384154 UGT1A1P22309 533 aa3.08□□□□□ -1.92
RNU6-190P-201ENST00000384154 HSD17B4P51659 736 aa3.08□□□□□ -1.92
RNU6-190P-201ENST00000384154 CLDN20P56880 219 aa3.08□□□□□ -1.92
RNU6-190P-201ENST00000384154 LTBQ06643 244 aa3.08□□□□□ -1.92
RNU6-190P-201ENST00000384154 DDR1Q08345 913 aa3.08□□□□□ -1.92
RNU6-190P-201ENST00000384154 KIF5AQ12840 1032 aa3.08□□□□□ -1.92
RNU6-190P-201ENST00000384154 GRSF1Q12849 480 aaKnown RBP eCLIP3.08□□□□□ -1.92
RNU6-190P-201ENST00000384154 GRIK2Q13002 908 aa3.08□□□□□ -1.92
RNU6-190P-201ENST00000384154 MYBPHQ13203 477 aa3.08□□□□□ -1.92
RNU6-190P-201ENST00000384154 BAATQ14032 418 aaPredicted RBP3.08□□□□□ -1.92
RNU6-190P-201ENST00000384154 C15orf59Q2T9L4 293 aaPredicted RBP3.08□□□□□ -1.92
RNU6-190P-201ENST00000384154 MYLK3Q32MK0 819 aa3.08□□□□□ -1.92
RNU6-190P-201ENST00000384154 KRTCAP3Q53RY4 240 aa3.08□□□□□ -1.92
RNU6-190P-201ENST00000384154 RGMBQ6NW40 437 aa3.08□□□□□ -1.92
RNU6-190P-201ENST00000384154 KRBA2Q6ZNG9 492 aa3.08□□□□□ -1.92
RNU6-190P-201ENST00000384154 CCDC190Q86UF4 302 aa3.08□□□□□ -1.92
RNU6-190P-201ENST00000384154 DNAAF5Q86Y56 855 aa3.08□□□□□ -1.92
RNU6-190P-201ENST00000384154 OR8H2Q8N162 312 aa3.08□□□□□ -1.92
RNU6-190P-201ENST00000384154 PGBD5Q8N414 524 aa3.08□□□□□ -1.92
RNU6-190P-201ENST00000384154 MINDY1Q8N5J2 469 aa3.08□□□□□ -1.92
RNU6-190P-201ENST00000384154 IQCF1Q8N6M8 205 aa3.08□□□□□ -1.92
RNU6-190P-201ENST00000384154 SLC38A9Q8NBW4 561 aa3.08□□□□□ -1.92
RNU6-190P-201ENST00000384154 SLC38A5Q8WUX1 472 aa3.08□□□□□ -1.92
RNU6-190P-201ENST00000384154 ZNF622Q969S3 477 aaKnown RBP eCLIP3.08□□□□□ -1.92
RNU6-190P-201ENST00000384154 MTBPQ96DY7 904 aa3.08□□□□□ -1.92
RNU6-190P-201ENST00000384154 CSF3RQ99062 836 aa3.08□□□□□ -1.92
RNU6-190P-201ENST00000384154 PAFAH2Q99487 392 aa3.08□□□□□ -1.92
RNU6-190P-201ENST00000384154 SLF1Q9BQI6 1058 aa3.08□□□□□ -1.92
RNU6-190P-201ENST00000384154 KIFC3Q9BVG8 833 aa3.08□□□□□ -1.92
RNU6-190P-201ENST00000384154 IL25Q9H293 177 aa3.08□□□□□ -1.92
RNU6-190P-201ENST00000384154 DNAJC18Q9H819 358 aa3.08□□□□□ -1.92
RNU6-190P-201ENST00000384154 CD93Q9NPY3 652 aa3.08□□□□□ -1.92
RNU6-190P-201ENST00000384154 EXOSC5Q9NQT4 235 aaKnown RBP eCLIP3.08□□□□□ -1.92
RNU6-190P-201ENST00000384154 DNAJB4Q9UDY4 337 aa3.08□□□□□ -1.92
RNU6-190P-201ENST00000384154 NRBP1Q9UHY1 535 aa3.08□□□□□ -1.92
RNU6-190P-201ENST00000384154 LOXL2Q9Y4K0 774 aa3.08□□□□□ -1.92
RNU6-190P-201ENST00000384154 NFS1Q9Y697 457 aa3.08□□□□□ -1.92
RNU6-190P-201ENST00000384154 A8MV72 311 aaPredicted RBP3.07□□□□□ -1.92
RNU6-190P-201ENST00000384154 LACTBL1A8MY62 500 aa3.07□□□□□ -1.92
RNU6-190P-201ENST00000384154 IKBKBO14920 756 aa3.07□□□□□ -1.92
RNU6-190P-201ENST00000384154 MID1O15344 667 aa3.07□□□□□ -1.92
RNU6-190P-201ENST00000384154 INSIG1O15503 277 aa3.07□□□□□ -1.92
RNU6-190P-201ENST00000384154 KCNK5O95279 499 aa3.07□□□□□ -1.92
RNU6-190P-201ENST00000384154 ALPLP05186 524 aa3.07□□□□□ -1.92
RNU6-190P-201ENST00000384154 NGFRP08138 427 aa3.07□□□□□ -1.92
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 48.9 ms