RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000382723.4

MSX1-201, Transcript of msh homeobox 1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene MSX1, Length 1,939 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MSX1-201ENST00000382723 TSNARE1Q96NA8 513 aa26.61■■□□□ 1.85
MSX1-201ENST00000382723 RABEP2Q9H5N1 569 aa26.61■■□□□ 1.85
MSX1-201ENST00000382723 RUVBL2Q9Y230 463 aaKnown RBP26.61■■□□□ 1.85
MSX1-201ENST00000382723 A0A087X1B8 175 aa26.61■■□□□ 1.85
MSX1-201ENST00000382723 RGSL1A5PLK6 1076 aa26.61■■□□□ 1.85
MSX1-201ENST00000382723 AGAP14A8MT82 685 aa26.61■■□□□ 1.85
MSX1-201ENST00000382723 PRMT5O14744 637 aaPredicted RBP26.61■■□□□ 1.85
MSX1-201ENST00000382723 LZTS3O60299 673 aaPredicted RBP26.61■■□□□ 1.85
MSX1-201ENST00000382723 GSTA1P08263 222 aa26.61■■□□□ 1.85
MSX1-201ENST00000382723 ZNF284Q2VY69 593 aa26.61■■□□□ 1.85
MSX1-201ENST00000382723 KYAT3Q6YP21 454 aaKnown RBP26.61■■□□□ 1.85
MSX1-201ENST00000382723 ZNF852Q6ZMS4 543 aa26.61■■□□□ 1.85
MSX1-201ENST00000382723 TBC1D1Q86TI0 1168 aaPredicted RBP26.61■■□□□ 1.85
MSX1-201ENST00000382723 CENPLQ8N0S6 344 aaPredicted RBP26.61■■□□□ 1.85
MSX1-201ENST00000382723 C1QTNF1Q9BXJ1 281 aa26.61■■□□□ 1.85
MSX1-201ENST00000382723 CLPBQ9H078 707 aa26.61■■□□□ 1.85
MSX1-201ENST00000382723 P2RY12Q9H244 342 aa26.61■■□□□ 1.85
MSX1-201ENST00000382723 NIPSNAP2O75323 286 aa26.6■■□□□ 1.85
MSX1-201ENST00000382723 RECQL5O94762 991 aaPredicted RBP26.6■■□□□ 1.85
MSX1-201ENST00000382723 DNTTP04053 509 aa26.6■■□□□ 1.85
MSX1-201ENST00000382723 SEC24CP53992 1094 aa26.6■■□□□ 1.85
MSX1-201ENST00000382723 ZP2Q05996 745 aa26.6■■□□□ 1.85
MSX1-201ENST00000382723 HENMT1Q5T8I9 393 aaKnown RBP26.6■■□□□ 1.85
MSX1-201ENST00000382723 AP2M1Q96CW1 435 aa26.6■■□□□ 1.85
MSX1-201ENST00000382723 FBRSQ9HAH7 460 aa26.6■■□□□ 1.85
MSX1-201ENST00000382723 FBXL12Q9NXK8 326 aa26.6■■□□□ 1.85
MSX1-201ENST00000382723 PSD3Q9NYI0 1048 aa26.6■■□□□ 1.85
MSX1-201ENST00000382723 TMPRSS11EQ9UL52 423 aa26.6■■□□□ 1.85
MSX1-201ENST00000382723 CKAP5Q14008 2032 aa26.6■■□□□ 1.85
MSX1-201ENST00000382723 ZNF106Q9H2Y7 1883 aaKnown RBP26.6■■□□□ 1.85
MSX1-201ENST00000382723 ESR1P03372 595 aa26.59■■□□□ 1.85
MSX1-201ENST00000382723 DHRS4L1P0CG22 281 aa26.59■■□□□ 1.85
MSX1-201ENST00000382723 GLRBP48167 497 aa26.59■■□□□ 1.85
MSX1-201ENST00000382723 ADARP55265 1226 aaKnown RBP26.59■■□□□ 1.85
MSX1-201ENST00000382723 TAS2R38P59533 333 aa26.59■■□□□ 1.85
MSX1-201ENST00000382723 DLG1Q12959 904 aa26.59■■□□□ 1.85
MSX1-201ENST00000382723 PDAP1Q13442 181 aaKnown RBP26.59■■□□□ 1.85
MSX1-201ENST00000382723 TERF2Q15554 542 aa26.59■■□□□ 1.85
MSX1-201ENST00000382723 EOGTQ5NDL2 527 aa26.59■■□□□ 1.85
MSX1-201ENST00000382723 NRSN1Q8IZ57 195 aa26.59■■□□□ 1.85
MSX1-201ENST00000382723 TRAM1L1Q8N609 369 aa26.59■■□□□ 1.85
MSX1-201ENST00000382723 CLDN19Q8N6F1 224 aa26.59■■□□□ 1.85
MSX1-201ENST00000382723 ULK4Q96C45 1275 aa26.59■■□□□ 1.85
MSX1-201ENST00000382723 NXNL1Q96CM4 212 aa26.59■■□□□ 1.85
MSX1-201ENST00000382723 DTD2Q96FN9 168 aa26.59■■□□□ 1.85
MSX1-201ENST00000382723 CDH19Q9H159 772 aa26.59■■□□□ 1.85
MSX1-201ENST00000382723 CD248Q9HCU0 757 aa26.59■■□□□ 1.85
MSX1-201ENST00000382723 ZDHHC3Q9NYG2 299 aa26.59■■□□□ 1.85
MSX1-201ENST00000382723 TAS2R13Q9NYV9 303 aa26.59■■□□□ 1.85
MSX1-201ENST00000382723 SORCS3Q9UPU3 1222 aa26.59■■□□□ 1.85
MSX1-201ENST00000382723 MED16Q9Y2X0 877 aa26.59■■□□□ 1.85
MSX1-201ENST00000382723 PRSS21Q9Y6M0 314 aa26.59■■□□□ 1.85
MSX1-201ENST00000382723 IQCF5A8MTL0 148 aa26.59■■□□□ 1.85
MSX1-201ENST00000382723 PLIN3O60664 434 aa26.59■■□□□ 1.85
MSX1-201ENST00000382723 CCDC166P0CW27 439 aa26.59■■□□□ 1.85
MSX1-201ENST00000382723 SERPINB4P48594 390 aa26.59■■□□□ 1.85
MSX1-201ENST00000382723 GABPB1Q06547 395 aaPredicted RBP26.59■■□□□ 1.85
MSX1-201ENST00000382723 CSHL1Q14406 222 aa26.59■■□□□ 1.85
MSX1-201ENST00000382723 TMEM207Q6UWW9 146 aa26.59■■□□□ 1.85
MSX1-201ENST00000382723 TMEM92Q6UXU6 159 aa26.59■■□□□ 1.85
MSX1-201ENST00000382723 COPS8Q99627 209 aa26.59■■□□□ 1.85
MSX1-201ENST00000382723 ZSCAN5AQ9BUG6 496 aa26.59■■□□□ 1.85
MSX1-201ENST00000382723 MECRQ9BV79 373 aa26.59■■□□□ 1.85
MSX1-201ENST00000382723 ARHGEF3Q9NR81 526 aa26.59■■□□□ 1.85
MSX1-201ENST00000382723 GALPQ9UBC7 116 aa26.59■■□□□ 1.85
MSX1-201ENST00000382723 FADS2P1A8MWK0 482 aa26.58■■□□□ 1.85
MSX1-201ENST00000382723 PCDH8O95206 1070 aa26.58■■□□□ 1.85
MSX1-201ENST00000382723 PROCP04070 461 aa26.58■■□□□ 1.85
MSX1-201ENST00000382723 COL6A2P12110 1019 aa26.58■■□□□ 1.85
MSX1-201ENST00000382723 CHRM3P20309 590 aa26.58■■□□□ 1.85
MSX1-201ENST00000382723 PTRHD1Q6GMV3 140 aaKnown RBP26.58■■□□□ 1.85
MSX1-201ENST00000382723 Q6ZS52 159 aa26.58■■□□□ 1.85
MSX1-201ENST00000382723 ANKRD49Q8WVL7 239 aa26.58■■□□□ 1.85
MSX1-201ENST00000382723 NUS1Q96E22 293 aa26.58■■□□□ 1.85
MSX1-201ENST00000382723 SCYL1Q96KG9 808 aa26.58■■□□□ 1.85
MSX1-201ENST00000382723 MAGEB18Q96M61 343 aa26.58■■□□□ 1.85
MSX1-201ENST00000382723 GPR21Q99679 349 aa26.58■■□□□ 1.85
MSX1-201ENST00000382723 CAMSAP3Q9P1Y5 1249 aaPredicted RBP26.58■■□□□ 1.85
MSX1-201ENST00000382723 NFKBIL1Q9UBC1 381 aaPredicted RBP26.58■■□□□ 1.85
MSX1-201ENST00000382723 E5RI56 91 aa26.57■■□□□ 1.84
MSX1-201ENST00000382723 VPS26AO75436 327 aa26.57■■□□□ 1.84
MSX1-201ENST00000382723 KLHL2O95198 593 aa26.57■■□□□ 1.84
MSX1-201ENST00000382723 CCDC15Q0P6D6 951 aa26.57■■□□□ 1.84
MSX1-201ENST00000382723 GPRC6AQ5T6X5 926 aa26.57■■□□□ 1.84
MSX1-201ENST00000382723 SIPA1Q96FS4 1042 aa26.57■■□□□ 1.84
MSX1-201ENST00000382723 CCDC134Q9H6E4 229 aa26.57■■□□□ 1.84
MSX1-201ENST00000382723 NMRAL1Q9HBL8 299 aa26.57■■□□□ 1.84
MSX1-201ENST00000382723 SARS2Q9NP81 518 aaKnown RBP26.57■■□□□ 1.84
MSX1-201ENST00000382723 FBXL21Q9UKT6 434 aa26.57■■□□□ 1.84
MSX1-201ENST00000382723 MMP17Q9ULZ9 603 aa26.57■■□□□ 1.84
MSX1-201ENST00000382723 PCDHB1Q9Y5F3 818 aa26.57■■□□□ 1.84
MSX1-201ENST00000382723 NEFHP12036 1026 aa26.57■■□□□ 1.84
MSX1-201ENST00000382723 CCDC153Q494R4 210 aa26.57■■□□□ 1.84
MSX1-201ENST00000382723 SETMARQ53H47 684 aaPredicted RBP26.57■■□□□ 1.84
MSX1-201ENST00000382723 FLCNQ8NFG4 579 aa26.57■■□□□ 1.84
MSX1-201ENST00000382723 HEXDCQ8WVB3 486 aa26.57■■□□□ 1.84
MSX1-201ENST00000382723 IGSF5Q9NSI5 407 aa26.57■■□□□ 1.84
MSX1-201ENST00000382723 GNPTGQ9UJJ9 305 aa26.57■■□□□ 1.84
MSX1-201ENST00000382723 COMMD10Q9Y6G5 202 aa26.57■■□□□ 1.84
MSX1-201ENST00000382723 TCP11X1B4DZS4 312 aa26.56■■□□□ 1.84
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 31.7 ms