RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000379615.3

PGGT1B-202, Transcript of protein geranylgeranyltransferase type I subunit beta, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene PGGT1B, Length 903 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PGGT1B-202ENST00000379615 PRAMEF1O95521 474 aa15.24■□□□□ 0.03
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PGGT1B-202ENST00000379615 POLD2P49005 469 aa15.24■□□□□ 0.03
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PGGT1B-202ENST00000379615 ADGRG6Q86SQ4 1221 aa15.23■□□□□ 0.03
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PGGT1B-202ENST00000379615 PTPRCAPQ14761 206 aa15.22■□□□□ 0.03
PGGT1B-202ENST00000379615 NR0B2Q15466 257 aa15.22■□□□□ 0.03
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PGGT1B-202ENST00000379615 SNX20Q7Z614 316 aa15.22■□□□□ 0.03
PGGT1B-202ENST00000379615 ARL10Q8N8L6 244 aa15.22■□□□□ 0.03
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PGGT1B-202ENST00000379615 TBRG4Q969Z0 631 aaKnown RBP eCLIP15.22■□□□□ 0.03
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PGGT1B-202ENST00000379615 CDKN2AIPNLQ96HQ2 116 aa15.22■□□□□ 0.03
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PGGT1B-202ENST00000379615 BOCQ9BWV1 1114 aa15.22■□□□□ 0.03
PGGT1B-202ENST00000379615 DPEP2Q9H4A9 486 aa15.22■□□□□ 0.03
PGGT1B-202ENST00000379615 UGT1A7Q9HAW7 530 aa15.22■□□□□ 0.03
PGGT1B-202ENST00000379615 UGT1A10Q9HAW8 530 aa15.22■□□□□ 0.03
PGGT1B-202ENST00000379615 UGT1A8Q9HAW9 530 aa15.22■□□□□ 0.03
PGGT1B-202ENST00000379615 XAB2Q9HCS7 855 aaKnown RBP15.22■□□□□ 0.03
PGGT1B-202ENST00000379615 CRLS1Q9UJA2 301 aa15.22■□□□□ 0.03
PGGT1B-202ENST00000379615 TCAF1Q9Y4C2 921 aa15.22■□□□□ 0.03
PGGT1B-202ENST00000379615 COL5A1P20908 1838 aaPredicted RBP15.22■□□□□ 0.03
PGGT1B-202ENST00000379615 CFAP99D6REC4 459 aa15.21■□□□□ 0.03
PGGT1B-202ENST00000379615 GAPDHSO14556 408 aaPredicted RBP15.21■□□□□ 0.03
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