RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000356384.4

RXRA-201, Transcript of retinoid X receptor alpha, humanhuman

TSL 5

Gene RXRA, Length 5,770 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RXRA-201ENST00000356384 ZNF697Q5TEC3 545 aa15.98■□□□□ 0.15
RXRA-201ENST00000356384 POTEHQ6S545 545 aa15.98■□□□□ 0.15
RXRA-201ENST00000356384 ZNF554Q86TJ5 538 aa15.98■□□□□ 0.15
RXRA-201ENST00000356384 SNX33Q8WV41 574 aa15.98■□□□□ 0.15
RXRA-201ENST00000356384 DGCR14Q96DF8 476 aaKnown RBP15.98■□□□□ 0.15
RXRA-201ENST00000356384 GULP1Q9UBP9 304 aa15.98■□□□□ 0.15
RXRA-201ENST00000356384 HBS1LQ9Y450 684 aaKnown RBP15.98■□□□□ 0.15
RXRA-201ENST00000356384 MAP4K5Q9Y4K4 846 aa15.98■□□□□ 0.15
RXRA-201ENST00000356384 PCDHGB3Q9Y5G1 929 aa15.98■□□□□ 0.15
RXRA-201ENST00000356384 UBR1Q8IWV7 1749 aa15.98■□□□□ 0.15
RXRA-201ENST00000356384 CPSF4LA6NMK7 179 aaKnown RBP15.98■□□□□ 0.15
RXRA-201ENST00000356384 FPGTO14772 594 aa15.98■□□□□ 0.15
RXRA-201ENST00000356384 POLR2JP52435 117 aaKnown RBP15.98■□□□□ 0.15
RXRA-201ENST00000356384 EGFLAMQ63HQ2 1017 aa15.98■□□□□ 0.15
RXRA-201ENST00000356384 FRRS1Q6ZNA5 592 aa15.98■□□□□ 0.15
RXRA-201ENST00000356384 GPR135Q8IZ08 494 aa15.98■□□□□ 0.15
RXRA-201ENST00000356384 P2RY11Q96G91 374 aa15.98■□□□□ 0.15
RXRA-201ENST00000356384 AIF1LQ9BQI0 150 aa15.98■□□□□ 0.15
RXRA-201ENST00000356384 LRTM1Q9HBL6 345 aa15.98■□□□□ 0.15
RXRA-201ENST00000356384 MARK1Q9P0L2 795 aa15.98■□□□□ 0.15
RXRA-201ENST00000356384 GNEQ9Y223 722 aaKnown RBP15.98■□□□□ 0.15
RXRA-201ENST00000356384 NEDD8-MDP1E9PL57 170 aa15.98■□□□□ 0.15
RXRA-201ENST00000356384 BPGMP07738 259 aa15.98■□□□□ 0.15
RXRA-201ENST00000356384 GALK1P51570 392 aa15.98■□□□□ 0.15
RXRA-201ENST00000356384 ZNF155Q12901 538 aaPredicted RBP15.98■□□□□ 0.15
RXRA-201ENST00000356384 UBR7Q8N806 425 aa15.98■□□□□ 0.15
RXRA-201ENST00000356384 OR5B17Q8NGF7 314 aa15.98■□□□□ 0.15
RXRA-201ENST00000356384 OR52J3Q8NH60 311 aa15.98■□□□□ 0.15
RXRA-201ENST00000356384 SP140LQ9H930 580 aa15.98■□□□□ 0.15
RXRA-201ENST00000356384 R3HDM2Q9Y2K5 976 aaKnown RBP15.98■□□□□ 0.15
RXRA-201ENST00000356384 EDF1O60869 148 aaKnown RBP15.98■□□□□ 0.15
RXRA-201ENST00000356384 ADH1AP07327 375 aa15.98■□□□□ 0.15
RXRA-201ENST00000356384 PSMD5Q16401 504 aa15.98■□□□□ 0.15
RXRA-201ENST00000356384 MREGQ8N565 214 aa15.98■□□□□ 0.15
RXRA-201ENST00000356384 C12orf50Q8NA57 414 aaPredicted RBP15.98■□□□□ 0.15
RXRA-201ENST00000356384 TMEM161BQ8NDZ6 487 aa15.98■□□□□ 0.15
RXRA-201ENST00000356384 KAZALD1Q96I82 304 aa15.98■□□□□ 0.15
RXRA-201ENST00000356384 PHF12Q96QT6 1004 aa15.98■□□□□ 0.15
RXRA-201ENST00000356384 TRNAU1APQ9NX07 287 aaKnown RBP15.98■□□□□ 0.15
RXRA-201ENST00000356384 C2orf71A6NGG8 1288 aa15.98■□□□□ 0.15
RXRA-201ENST00000356384 EPHB6O15197 1021 aa15.98■□□□□ 0.15
RXRA-201ENST00000356384 CES1P23141 567 aa15.98■□□□□ 0.15
RXRA-201ENST00000356384 GNPDA1P46926 289 aa15.98■□□□□ 0.15
RXRA-201ENST00000356384 VBP1P61758 197 aa15.98■□□□□ 0.15
RXRA-201ENST00000356384 TNFAIP8L1Q8WVP5 186 aa15.98■□□□□ 0.15
RXRA-201ENST00000356384 ATG10Q9H0Y0 220 aa15.98■□□□□ 0.15
RXRA-201ENST00000356384 OSER1Q9NX31 292 aa15.98■□□□□ 0.15
RXRA-201ENST00000356384 ZNF224Q9NZL3 707 aa15.98■□□□□ 0.15
RXRA-201ENST00000356384 TNFRSF11BO00300 401 aa15.97■□□□□ 0.15
RXRA-201ENST00000356384 C22orf31O95567 290 aa15.97■□□□□ 0.15
RXRA-201ENST00000356384 FABP3P05413 133 aa15.97■□□□□ 0.15
RXRA-201ENST00000356384 LAMP2P13473 410 aa15.97■□□□□ 0.15
RXRA-201ENST00000356384 ATXN1P54253 815 aaKnown RBP15.97■□□□□ 0.15
RXRA-201ENST00000356384 XIAPP98170 497 aa15.97■□□□□ 0.15
RXRA-201ENST00000356384 CAPSQ13938 189 aa15.97■□□□□ 0.15
RXRA-201ENST00000356384 PHYKPLQ8IUZ5 450 aa15.97■□□□□ 0.15
RXRA-201ENST00000356384 SLC43A3Q8NBI5 491 aa15.97■□□□□ 0.15
RXRA-201ENST00000356384 CST11Q9H112 138 aa15.97■□□□□ 0.15
RXRA-201ENST00000356384 CAPN8A6NHC0 703 aa15.97■□□□□ 0.15
RXRA-201ENST00000356384 IQCF5A8MTL0 148 aa15.97■□□□□ 0.15
RXRA-201ENST00000356384 ALOX15BO15296 676 aa15.97■□□□□ 0.15
RXRA-201ENST00000356384 NT5EP21589 574 aa15.97■□□□□ 0.15
RXRA-201ENST00000356384 EIF2S3P41091 472 aaKnown RBP15.97■□□□□ 0.15
RXRA-201ENST00000356384 CCDC80Q76M96 950 aa15.97■□□□□ 0.15
RXRA-201ENST00000356384 FIBCD1Q8N539 461 aa15.97■□□□□ 0.15
RXRA-201ENST00000356384 C12orf4Q9NQ89 552 aa15.97■□□□□ 0.15
RXRA-201ENST00000356384 PXDNQ92626 1479 aa15.97■□□□□ 0.15
RXRA-201ENST00000356384 TRBV23OR9-2A0A075B6M9 112 aa15.97■□□□□ 0.15
RXRA-201ENST00000356384 PAGE1O75459 146 aa15.97■□□□□ 0.15
RXRA-201ENST00000356384 KIR3DL1P43629 444 aa15.97■□□□□ 0.15
RXRA-201ENST00000356384 C6orf52Q5T4I8 152 aa15.97■□□□□ 0.15
RXRA-201ENST00000356384 GCNT6Q5T4J0 391 aa15.97■□□□□ 0.15
RXRA-201ENST00000356384 HECTD2Q5U5R9 776 aa15.97■□□□□ 0.15
RXRA-201ENST00000356384 ERICH5Q6P6B1 374 aa15.97■□□□□ 0.15
RXRA-201ENST00000356384 THAP5Q7Z6K1 395 aa15.97■□□□□ 0.15
RXRA-201ENST00000356384 ILDR1Q86SU0 546 aaPredicted RBP15.97■□□□□ 0.15
RXRA-201ENST00000356384 RBM23Q86U06 439 aaKnown RBP15.97■□□□□ 0.15
RXRA-201ENST00000356384 SUPV3L1Q8IYB8 786 aaKnown RBP eCLIP15.97■□□□□ 0.15
RXRA-201ENST00000356384 MED28Q9H204 178 aa15.97■□□□□ 0.15
RXRA-201ENST00000356384 RHOJQ9H4E5 214 aa15.97■□□□□ 0.15
RXRA-201ENST00000356384 S100A14Q9HCY8 104 aa15.97■□□□□ 0.15
RXRA-201ENST00000356384 CORO1CQ9ULV4 474 aaPredicted RBP15.97■□□□□ 0.15
RXRA-201ENST00000356384 C3P01024 1663 aa15.97■□□□□ 0.15
RXRA-201ENST00000356384 CCDC85CA6NKD9 419 aa15.97■□□□□ 0.15
RXRA-201ENST00000356384 LDOC1O95751 146 aaPredicted RBP15.97■□□□□ 0.15
RXRA-201ENST00000356384 LARS2Q15031 903 aaKnown RBP15.97■□□□□ 0.15
RXRA-201ENST00000356384 PTPN20Q4JDL3 420 aa15.97■□□□□ 0.15
RXRA-201ENST00000356384 RFTN2Q52LD8 501 aaPredicted RBP15.97■□□□□ 0.15
RXRA-201ENST00000356384 TRABD2AQ86V40 505 aa15.97■□□□□ 0.15
RXRA-201ENST00000356384 GAL3ST3Q96A11 431 aa15.97■□□□□ 0.15
RXRA-201ENST00000356384 TRIM2Q9C040 744 aa15.97■□□□□ 0.15
RXRA-201ENST00000356384 CHMP1AQ9HD42 196 aaPredicted RBP15.97■□□□□ 0.15
RXRA-201ENST00000356384 MYOM1P52179 1685 aa15.97■□□□□ 0.15
RXRA-201ENST00000356384 PLK4O00444 970 aa15.96■□□□□ 0.15
RXRA-201ENST00000356384 FFAR2O15552 330 aa15.96■□□□□ 0.15
RXRA-201ENST00000356384 PSMD10O75832 226 aa15.96■□□□□ 0.15
RXRA-201ENST00000356384 APOC1P02654 83 aa15.96■□□□□ 0.15
RXRA-201ENST00000356384 PSMA1P25786 263 aaKnown RBP15.96■□□□□ 0.15
RXRA-201ENST00000356384 CD52P31358 61 aa15.96■□□□□ 0.15
RXRA-201ENST00000356384 GNALP38405 381 aa15.96■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 64.1 ms