RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000355560.4

CLK2-201, Transcript of CDC like kinase 2, humanhuman

APPRIS ALT1 TSL 5 BASIC

Gene CLK2, Length 2,120 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLK2-201ENST00000355560 UBXN8O00124 270 aa25.49■■□□□ 1.67
CLK2-201ENST00000355560 ESRRAP11474 423 aaPredicted RBP25.49■■□□□ 1.67
CLK2-201ENST00000355560 UGT1A6P19224 532 aa25.49■■□□□ 1.67
CLK2-201ENST00000355560 IMPDH1P20839 514 aa25.49■■□□□ 1.67
CLK2-201ENST00000355560 UGT1A1P22309 533 aa25.49■■□□□ 1.67
CLK2-201ENST00000355560 UGT1A4P22310 534 aa25.49■■□□□ 1.67
CLK2-201ENST00000355560 PTPN4P29074 926 aa25.49■■□□□ 1.67
CLK2-201ENST00000355560 UGT1A3P35503 534 aa25.49■■□□□ 1.67
CLK2-201ENST00000355560 UGT1A5P35504 534 aa25.49■■□□□ 1.67
CLK2-201ENST00000355560 ELF3P78545 371 aaPredicted RBP25.49■■□□□ 1.67
CLK2-201ENST00000355560 PTSQ03393 145 aa25.49■■□□□ 1.67
CLK2-201ENST00000355560 SH2D4BQ5SQS7 431 aa25.49■■□□□ 1.67
CLK2-201ENST00000355560 FRMD7Q6ZUT3 714 aa25.49■■□□□ 1.67
CLK2-201ENST00000355560 RBFAQ8N0V3 343 aa25.49■■□□□ 1.67
CLK2-201ENST00000355560 STAG3L4Q8TBR4 150 aa25.49■■□□□ 1.67
CLK2-201ENST00000355560 WFIKKN2Q8TEU8 576 aa25.49■■□□□ 1.67
CLK2-201ENST00000355560 CDCA3Q99618 268 aaPredicted RBP25.49■■□□□ 1.67
CLK2-201ENST00000355560 MTG2Q9H4K7 406 aa25.49■■□□□ 1.67
CLK2-201ENST00000355560 GTSE1Q9NYZ3 720 aa25.49■■□□□ 1.67
CLK2-201ENST00000355560 B4GALT6Q9UBX8 382 aa25.49■■□□□ 1.67
CLK2-201ENST00000355560 IKZF3Q9UKT9 509 aa25.49■■□□□ 1.67
CLK2-201ENST00000355560 STK38LQ9Y2H1 464 aa25.49■■□□□ 1.67
CLK2-201ENST00000355560 EPB41L3Q9Y2J2 1087 aaPredicted RBP25.49■■□□□ 1.67
CLK2-201ENST00000355560 WASF2Q9Y6W5 498 aa25.49■■□□□ 1.67
CLK2-201ENST00000355560 MYO9BQ13459 2157 aa25.49■■□□□ 1.67
CLK2-201ENST00000355560 TRBV5-4A0A0C4DH59 114 aa25.48■■□□□ 1.67
CLK2-201ENST00000355560 PRR5-ARHGAP8B1AHC4 643 aa25.48■■□□□ 1.67
CLK2-201ENST00000355560 SLCO1B7G3V0H7 640 aa25.48■■□□□ 1.67
CLK2-201ENST00000355560 KERAO60938 352 aa25.48■■□□□ 1.67
CLK2-201ENST00000355560 LEFTY1O75610 366 aa25.48■■□□□ 1.67
CLK2-201ENST00000355560 NFATC1O95644 943 aa25.48■■□□□ 1.67
CLK2-201ENST00000355560 ENO1P06733 434 aaKnown RBP25.48■■□□□ 1.67
CLK2-201ENST00000355560 MTHFD2P13995 350 aa25.48■■□□□ 1.67
CLK2-201ENST00000355560 ACRV1P26436 265 aa25.48■■□□□ 1.67
CLK2-201ENST00000355560 POLR2LP62875 67 aaKnown RBP25.48■■□□□ 1.67
CLK2-201ENST00000355560 ARHGAP8P85298 464 aa25.48■■□□□ 1.67
CLK2-201ENST00000355560 TBCCQ15814 346 aa25.48■■□□□ 1.67
CLK2-201ENST00000355560 BRAT1Q6PJG6 821 aa25.48■■□□□ 1.67
CLK2-201ENST00000355560 PBXIP1Q96AQ6 731 aa25.48■■□□□ 1.67
CLK2-201ENST00000355560 L3HYPDHQ96EM0 354 aa25.48■■□□□ 1.67
CLK2-201ENST00000355560 PPP1R36Q96LQ0 422 aa25.48■■□□□ 1.67
CLK2-201ENST00000355560 NUF2Q9BZD4 464 aa25.48■■□□□ 1.67
CLK2-201ENST00000355560 VTI1BQ9UEU0 232 aa25.48■■□□□ 1.67
CLK2-201ENST00000355560 RNF112Q9ULX5 631 aa25.48■■□□□ 1.67
CLK2-201ENST00000355560 HEPACAM2A8MVW5 462 aa25.48■■□□□ 1.67
CLK2-201ENST00000355560 TMEM233B4DJY2 109 aa25.48■■□□□ 1.67
CLK2-201ENST00000355560 GRID2O43424 1007 aa25.48■■□□□ 1.67
CLK2-201ENST00000355560 TSPAN12O95859 305 aa25.48■■□□□ 1.67
CLK2-201ENST00000355560 HERVK_113P63132 956 aa25.48■■□□□ 1.67
CLK2-201ENST00000355560 TSNQ15631 228 aaKnown RBP25.48■■□□□ 1.67
CLK2-201ENST00000355560 ZNF678Q5SXM1 525 aa25.48■■□□□ 1.67
CLK2-201ENST00000355560 ETFBKMTQ8IXQ9 262 aa25.48■■□□□ 1.67
CLK2-201ENST00000355560 PTGR2Q8N8N7 351 aaPredicted RBP25.48■■□□□ 1.67
CLK2-201ENST00000355560 KDM1BQ8NB78 822 aa25.48■■□□□ 1.67
CLK2-201ENST00000355560 NAT14Q8WUY8 206 aa25.48■■□□□ 1.67
CLK2-201ENST00000355560 ERVK-6Q9BXR3 956 aa25.48■■□□□ 1.67
CLK2-201ENST00000355560 EML4Q9HC35 981 aaKnown RBP25.48■■□□□ 1.67
CLK2-201ENST00000355560 TCF7L2Q9NQB0 619 aa25.48■■□□□ 1.67
CLK2-201ENST00000355560 SLC27A6Q9Y2P4 619 aa25.48■■□□□ 1.67
CLK2-201ENST00000355560 OTOL1A6NHN0 477 aaPredicted RBP25.47■■□□□ 1.67
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CLK2-201ENST00000355560 RFXAPO00287 272 aa25.47■■□□□ 1.67
CLK2-201ENST00000355560 NEMP1O14524 444 aa25.47■■□□□ 1.67
CLK2-201ENST00000355560 SUPT7LO94864 414 aa25.47■■□□□ 1.67
CLK2-201ENST00000355560 ASLP04424 464 aa25.47■■□□□ 1.67
CLK2-201ENST00000355560 SRPRAP08240 638 aaKnown RBP25.47■■□□□ 1.67
CLK2-201ENST00000355560 CLCN7P51798 805 aa25.47■■□□□ 1.67
CLK2-201ENST00000355560 IL2P60568 153 aa25.47■■□□□ 1.67
CLK2-201ENST00000355560 GPR33Q49SQ1 333 aa25.47■■□□□ 1.67
CLK2-201ENST00000355560 PTRHD1Q6GMV3 140 aaKnown RBP25.47■■□□□ 1.67
CLK2-201ENST00000355560 UGT3A1Q6NUS8 523 aa25.47■■□□□ 1.67
CLK2-201ENST00000355560 CPNE9Q8IYJ1 553 aa25.47■■□□□ 1.67
CLK2-201ENST00000355560 ZNF366Q8N895 744 aa25.47■■□□□ 1.67
CLK2-201ENST00000355560 LINGO1Q96FE5 620 aa25.47■■□□□ 1.67
CLK2-201ENST00000355560 RAB3IPQ96QF0 476 aaPredicted RBP25.47■■□□□ 1.67
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CLK2-201ENST00000355560 REV3LO60673 3130 aa25.46■■□□□ 1.67
CLK2-201ENST00000355560 GOLGA8QA0A0J9YX86 632 aa25.46■■□□□ 1.67
CLK2-201ENST00000355560 GOLGA8OA6NCC3 632 aa25.46■■□□□ 1.67
CLK2-201ENST00000355560 NPEPPSL1A6NEC2 478 aa25.46■■□□□ 1.67
CLK2-201ENST00000355560 E9PBE3 544 aa25.46■■□□□ 1.67
CLK2-201ENST00000355560 GOLGA8NF8WBI6 632 aa25.46■■□□□ 1.67
CLK2-201ENST00000355560 CDC7O00311 574 aa25.46■■□□□ 1.67
CLK2-201ENST00000355560 BTN3A1O00481 513 aa25.46■■□□□ 1.67
CLK2-201ENST00000355560 KLHL41O60662 606 aa25.46■■□□□ 1.67
CLK2-201ENST00000355560 RPS3P23396 243 aaKnown RBP eCLIP25.46■■□□□ 1.67
CLK2-201ENST00000355560 MESP2Q0VG99 397 aa25.46■■□□□ 1.67
CLK2-201ENST00000355560 RAB30Q15771 203 aa25.46■■□□□ 1.67
CLK2-201ENST00000355560 PFKFB4Q16877 469 aa25.46■■□□□ 1.67
CLK2-201ENST00000355560 ARSIQ5FYB1 569 aa25.46■■□□□ 1.67
CLK2-201ENST00000355560 GPR149Q86SP6 731 aa25.46■■□□□ 1.67
CLK2-201ENST00000355560 EEF1AKMT1Q8WVE0 214 aa25.46■■□□□ 1.67
CLK2-201ENST00000355560 UTP4Q969X6 686 aaKnown RBP25.46■■□□□ 1.67
CLK2-201ENST00000355560 OR52B2Q96RD2 323 aa25.46■■□□□ 1.67
CLK2-201ENST00000355560 TBC1D10AQ9BXI6 508 aa25.46■■□□□ 1.67
CLK2-201ENST00000355560 WDR55Q9H6Y2 383 aaPredicted RBP25.46■■□□□ 1.67
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CLK2-201ENST00000355560 GNPTGQ9UJJ9 305 aa25.46■■□□□ 1.67
CLK2-201ENST00000355560 SUPT3HB4E1H0 165 aa25.46■■□□□ 1.67
CLK2-201ENST00000355560 SUPT3HO75486 399 aa25.46■■□□□ 1.67
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