RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000354241.5

TRIM4-202, Transcript of tripartite motif containing 4, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene TRIM4, Length 1,942 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM4-202ENST00000354241 Q6ZVL8 140 aa20.38■□□□□ 0.85
TRIM4-202ENST00000354241 Q7L0L9 218 aa20.38■□□□□ 0.85
TRIM4-202ENST00000354241 PIGWQ7Z7B1 504 aa20.38■□□□□ 0.85
TRIM4-202ENST00000354241 RAB3IL1Q8TBN0 382 aa20.38■□□□□ 0.85
TRIM4-202ENST00000354241 SEC16BQ96JE7 1060 aa20.38■□□□□ 0.85
TRIM4-202ENST00000354241 UBXN10Q96LJ8 280 aa20.38■□□□□ 0.85
TRIM4-202ENST00000354241 GPR21Q99679 349 aa20.38■□□□□ 0.85
TRIM4-202ENST00000354241 FAM83DQ9H4H8 585 aa20.38■□□□□ 0.85
TRIM4-202ENST00000354241 MED16Q9Y2X0 877 aa20.38■□□□□ 0.85
TRIM4-202ENST00000354241 PCDHB1Q9Y5F3 818 aa20.38■□□□□ 0.85
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TRIM4-202ENST00000354241 ZNF37AP17032 561 aaPredicted RBP20.37■□□□□ 0.85
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TRIM4-202ENST00000354241 ELP6Q0PNE2 266 aa20.37■□□□□ 0.85
TRIM4-202ENST00000354241 BST1Q10588 318 aa20.37■□□□□ 0.85
TRIM4-202ENST00000354241 ITGA9Q13797 1035 aa20.37■□□□□ 0.85
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TRIM4-202ENST00000354241 C2orf27AQ580R0 203 aa20.37■□□□□ 0.85
TRIM4-202ENST00000354241 PTRHD1Q6GMV3 140 aaKnown RBP20.37■□□□□ 0.85
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TRIM4-202ENST00000354241 RDH11Q8TC12 318 aa20.37■□□□□ 0.85
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TRIM4-202ENST00000354241 CDX2Q99626 313 aaPredicted RBP20.37■□□□□ 0.85
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TRIM4-202ENST00000354241 CES4AQ5XG92 561 aa20.37■□□□□ 0.85
TRIM4-202ENST00000354241 ZYG11AQ6WRX3 759 aa20.37■□□□□ 0.85
TRIM4-202ENST00000354241 ERN2Q76MJ5 926 aaKnown RBP20.37■□□□□ 0.85
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TRIM4-202ENST00000354241 C8orf33Q9H7E9 229 aaPredicted RBP20.37■□□□□ 0.85
TRIM4-202ENST00000354241 SYTL2Q9HCH5 934 aa20.37■□□□□ 0.85
TRIM4-202ENST00000354241 SARS2Q9NP81 518 aaKnown RBP20.37■□□□□ 0.85
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TRIM4-202ENST00000354241 EYSQ5T1H1 3165 aa20.37■□□□□ 0.85
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TRIM4-202ENST00000354241 STX3Q13277 289 aa20.36■□□□□ 0.85
TRIM4-202ENST00000354241 SETMARQ53H47 684 aaPredicted RBP20.36■□□□□ 0.85
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TRIM4-202ENST00000354241 PAQR3Q6TCH7 311 aa20.36■□□□□ 0.85
TRIM4-202ENST00000354241 SPATA21Q7Z572 469 aa20.36■□□□□ 0.85
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TRIM4-202ENST00000354241 DNASE1L2Q92874 299 aa20.36■□□□□ 0.85
TRIM4-202ENST00000354241 GRAMD1AQ96CP6 724 aa20.36■□□□□ 0.85
TRIM4-202ENST00000354241 SGF29Q96ES7 293 aa20.36■□□□□ 0.85
TRIM4-202ENST00000354241 THOC1Q96FV9 657 aaKnown RBP20.36■□□□□ 0.85
TRIM4-202ENST00000354241 ZDHHC3Q9NYG2 299 aa20.36■□□□□ 0.85
TRIM4-202ENST00000354241 OAS3Q9Y6K5 1087 aaKnown RBP20.36■□□□□ 0.85
TRIM4-202ENST00000354241 PRSS21Q9Y6M0 314 aa20.36■□□□□ 0.85
TRIM4-202ENST00000354241 MYO10Q9HD67 2058 aa20.36■□□□□ 0.85
TRIM4-202ENST00000354241 RNASEH1O60930 286 aaKnown RBP20.35■□□□□ 0.85
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TRIM4-202ENST00000354241 OVGP1Q12889 678 aa20.35■□□□□ 0.85
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TRIM4-202ENST00000354241 CCDC197Q8NCU1 140 aa20.35■□□□□ 0.85
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TRIM4-202ENST00000354241 SERPINE1P05121 402 aa20.35■□□□□ 0.85
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TRIM4-202ENST00000354241 TFEBP19484 476 aa20.35■□□□□ 0.85
TRIM4-202ENST00000354241 P2RY2P41231 377 aa20.35■□□□□ 0.85
TRIM4-202ENST00000354241 SATB1Q01826 763 aa20.35■□□□□ 0.85
TRIM4-202ENST00000354241 CNTN1Q12860 1018 aa20.35■□□□□ 0.85
TRIM4-202ENST00000354241 ITIH4Q14624 930 aa20.35■□□□□ 0.85
TRIM4-202ENST00000354241 ZNF284Q2VY69 593 aa20.35■□□□□ 0.85
TRIM4-202ENST00000354241 TECPR1Q7Z6L1 1165 aa20.35■□□□□ 0.85
TRIM4-202ENST00000354241 CLDN19Q8N6F1 224 aa20.35■□□□□ 0.85
TRIM4-202ENST00000354241 COPS8Q99627 209 aa20.35■□□□□ 0.85
TRIM4-202ENST00000354241 HDAC8Q9BY41 377 aa20.35■□□□□ 0.85
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