RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000332175.12

PTPRM-201, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type M, humanhuman

APPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC

Gene PTPRM, Length 6,095 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRM-201ENST00000332175 SLC43A3Q8NBI5 491 aa22.27■■□□□ 1.15
PTPRM-201ENST00000332175 OR10H5Q8NGA6 315 aa22.27■■□□□ 1.15
PTPRM-201ENST00000332175 XAGE5Q8WWM1 108 aa22.27■■□□□ 1.15
PTPRM-201ENST00000332175 R3HDM2Q9Y2K5 976 aaKnown RBP22.27■■□□□ 1.15
PTPRM-201ENST00000332175 SNAP91O60641 907 aa22.26■■□□□ 1.15
PTPRM-201ENST00000332175 TMCC2O75069 709 aa22.26■■□□□ 1.15
PTPRM-201ENST00000332175 DRD4P21917 467 aa22.26■■□□□ 1.15
PTPRM-201ENST00000332175 TTC27Q6P3X3 843 aa22.26■■□□□ 1.15
PTPRM-201ENST00000332175 VSTM1Q6UX27 236 aa22.26■■□□□ 1.15
PTPRM-201ENST00000332175 ZNF730Q6ZMV8 503 aa22.26■■□□□ 1.15
PTPRM-201ENST00000332175 SPPL2CQ8IUH8 684 aa22.26■■□□□ 1.15
PTPRM-201ENST00000332175 EIF1ADQ8N9N8 165 aaKnown RBP22.26■■□□□ 1.15
PTPRM-201ENST00000332175 SPATA22Q8NHS9 363 aa22.26■■□□□ 1.15
PTPRM-201ENST00000332175 GALNT18Q6P9A2 607 aa22.26■■□□□ 1.15
PTPRM-201ENST00000332175 OR7D4Q8NG98 312 aa22.26■■□□□ 1.15
PTPRM-201ENST00000332175 MRTO4Q9UKD2 239 aaKnown RBP22.26■■□□□ 1.15
PTPRM-201ENST00000332175 SLC26A3P40879 764 aa22.26■■□□□ 1.15
PTPRM-201ENST00000332175 PMEPA1Q969W9 287 aa22.26■■□□□ 1.15
PTPRM-201ENST00000332175 NOL11Q9H8H0 719 aaKnown RBP22.26■■□□□ 1.15
PTPRM-201ENST00000332175 UBE2QL1A1L167 161 aa22.26■■□□□ 1.15
PTPRM-201ENST00000332175 BPGMP07738 259 aa22.26■■□□□ 1.15
PTPRM-201ENST00000332175 FUT10Q6P4F1 479 aa22.26■■□□□ 1.15
PTPRM-201ENST00000332175 ARL14EPQ8N8R7 260 aaPredicted RBP22.26■■□□□ 1.15
PTPRM-201ENST00000332175 PCDHGC4Q9Y5F7 938 aa22.26■■□□□ 1.15
PTPRM-201ENST00000332175 PRMT5O14744 637 aaPredicted RBP22.26■■□□□ 1.15
PTPRM-201ENST00000332175 FADS2O95864 444 aaKnown RBP22.26■■□□□ 1.15
PTPRM-201ENST00000332175 LRRC73Q5JTD7 316 aa22.26■■□□□ 1.15
PTPRM-201ENST00000332175 CLEC6AQ6EIG7 209 aa22.26■■□□□ 1.15
PTPRM-201ENST00000332175 POC5Q8NA72 575 aa22.26■■□□□ 1.15
PTPRM-201ENST00000332175 OR2T12Q8NG77 320 aa22.26■■□□□ 1.15
PTPRM-201ENST00000332175 GBA3Q9H227 469 aa22.26■■□□□ 1.15
PTPRM-201ENST00000332175 TRMT13Q9NUP7 481 aaKnown RBP22.26■■□□□ 1.15
PTPRM-201ENST00000332175 SSR3Q9UNL2 185 aa22.26■■□□□ 1.15
PTPRM-201ENST00000332175 FSBPO95073 299 aa22.25■■□□□ 1.15
PTPRM-201ENST00000332175 C22orf31O95567 290 aa22.25■■□□□ 1.15
PTPRM-201ENST00000332175 SMARCB1Q12824 385 aa22.25■■□□□ 1.15
PTPRM-201ENST00000332175 PRSS55Q6UWB4 352 aaPredicted RBP22.25■■□□□ 1.15
PTPRM-201ENST00000332175 ZCCHC10Q8TBK6 192 aa22.25■■□□□ 1.15
PTPRM-201ENST00000332175 PPM1MQ96MI6 270 aa22.25■■□□□ 1.15
PTPRM-201ENST00000332175 H7C0S8 307 aa22.25■■□□□ 1.15
PTPRM-201ENST00000332175 DDX3YO15523 660 aaKnown RBP22.25■■□□□ 1.15
PTPRM-201ENST00000332175 PRAMEF1O95521 474 aa22.25■■□□□ 1.15
PTPRM-201ENST00000332175 IFNGP01579 166 aa22.25■■□□□ 1.15
PTPRM-201ENST00000332175 POLR2JP52435 117 aaKnown RBP22.25■■□□□ 1.15
PTPRM-201ENST00000332175 PRDM8Q9NQV8 689 aa22.25■■□□□ 1.15
PTPRM-201ENST00000332175 FBXW2Q9UKT8 454 aa22.25■■□□□ 1.15
PTPRM-201ENST00000332175 PCDHB1Q9Y5F3 818 aa22.25■■□□□ 1.15
PTPRM-201ENST00000332175 CD48P09326 243 aa22.25■■□□□ 1.15
PTPRM-201ENST00000332175 SAGP10523 405 aaPredicted RBP22.25■■□□□ 1.15
PTPRM-201ENST00000332175 CYP4F8P98187 520 aa22.25■■□□□ 1.15
PTPRM-201ENST00000332175 PLEKHG4Q58EX7 1191 aa22.25■■□□□ 1.15
PTPRM-201ENST00000332175 SPATA19Q7Z5L4 167 aa22.25■■□□□ 1.15
PTPRM-201ENST00000332175 OAFQ86UD1 273 aa22.25■■□□□ 1.15
PTPRM-201ENST00000332175 SLC34A3Q8N130 599 aa22.25■■□□□ 1.15
PTPRM-201ENST00000332175 FBXO22Q8NEZ5 403 aa22.25■■□□□ 1.15
PTPRM-201ENST00000332175 ARNTL2Q8WYA1 636 aa22.25■■□□□ 1.15
PTPRM-201ENST00000332175 SEC14L3Q9UDX4 400 aa22.25■■□□□ 1.15
PTPRM-201ENST00000332175 GTF2IRD1Q9UHL9 959 aa22.25■■□□□ 1.15
PTPRM-201ENST00000332175 COLEC10Q9Y6Z7 277 aa22.25■■□□□ 1.15
PTPRM-201ENST00000332175 SMPD1P17405 629 aa22.25■■□□□ 1.15
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PTPRM-201ENST00000332175 TWIST2Q8WVJ9 160 aa22.25■■□□□ 1.15
PTPRM-201ENST00000332175 ALKBH4Q9NXW9 302 aa22.25■■□□□ 1.15
PTPRM-201ENST00000332175 AMER2Q8N7J2 671 aa22.24■■□□□ 1.15
PTPRM-201ENST00000332175 PCED1BQ96HM7 432 aa22.24■■□□□ 1.15
PTPRM-201ENST00000332175 TEFMQ96QE5 360 aaKnown RBP22.24■■□□□ 1.15
PTPRM-201ENST00000332175 EBPLQ9BY08 206 aa22.24■■□□□ 1.15
PTPRM-201ENST00000332175 PLOD3O60568 738 aa22.24■■□□□ 1.15
PTPRM-201ENST00000332175 SNUPNO95149 360 aaKnown RBP22.24■■□□□ 1.15
PTPRM-201ENST00000332175 HSPA7P48741 367 aa22.24■■□□□ 1.15
PTPRM-201ENST00000332175 ATAT1Q5SQI0 421 aa22.24■■□□□ 1.15
PTPRM-201ENST00000332175 DQX1Q8TE96 717 aaKnown RBP22.24■■□□□ 1.15
PTPRM-201ENST00000332175 FAM237AA0A1B0GTK4 181 aa22.24■■□□□ 1.15
PTPRM-201ENST00000332175 CLUP10909 449 aa22.24■■□□□ 1.15
PTPRM-201ENST00000332175 MTHFRP42898 656 aa22.24■■□□□ 1.15
PTPRM-201ENST00000332175 GSTCDQ8NEC7 633 aa22.24■■□□□ 1.15
PTPRM-201ENST00000332175 TRPV3Q8NET8 790 aa22.24■■□□□ 1.15
PTPRM-201ENST00000332175 C12orf65Q9H3J6 166 aaKnown RBP22.24■■□□□ 1.15
PTPRM-201ENST00000332175 DHX15O43143 795 aaKnown RBP22.24■■□□□ 1.15
PTPRM-201ENST00000332175 ICAM3P32942 547 aa22.24■■□□□ 1.15
PTPRM-201ENST00000332175 MINDY4Q4G0A6 757 aa22.24■■□□□ 1.15
PTPRM-201ENST00000332175 FAM91A1Q658Y4 838 aa22.24■■□□□ 1.15
PTPRM-201ENST00000332175 AHI1Q8N157 1196 aa22.24■■□□□ 1.15
PTPRM-201ENST00000332175 KBTBD8Q8NFY9 601 aa22.24■■□□□ 1.15
PTPRM-201ENST00000332175 KLK6Q92876 244 aa22.24■■□□□ 1.15
PTPRM-201ENST00000332175 RPL10LQ96L21 214 aaKnown RBP22.24■■□□□ 1.15
PTPRM-201ENST00000332175 C2P06681 752 aa22.24■■□□□ 1.15
PTPRM-201ENST00000332175 NUDT17P0C025 328 aa22.24■■□□□ 1.15
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PTPRM-201ENST00000332175 CAPSLQ8WWF8 208 aa22.24■■□□□ 1.15
PTPRM-201ENST00000332175 METTL21AQ8WXB1 218 aa22.24■■□□□ 1.15
PTPRM-201ENST00000332175 TBATAQ96M53 351 aa22.24■■□□□ 1.15
PTPRM-201ENST00000332175 UBAP1Q9NZ09 502 aa22.24■■□□□ 1.15
PTPRM-201ENST00000332175 ADGRB1O14514 1584 aa22.23■■□□□ 1.15
PTPRM-201ENST00000332175 MAP2K7O14733 419 aa22.23■■□□□ 1.15
PTPRM-201ENST00000332175 IPO13O94829 963 aaKnown RBP22.23■■□□□ 1.15
PTPRM-201ENST00000332175 QPRTQ15274 297 aa22.23■■□□□ 1.15
PTPRM-201ENST00000332175 LIN54Q6MZP7 749 aa22.23■■□□□ 1.15
PTPRM-201ENST00000332175 TRABD2AQ86V40 505 aa22.23■■□□□ 1.15
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