RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000325942.10

FRAS1-201, Transcript of Fraser extracellular matrix complex subunit 1, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene FRAS1, Length 7,142 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FRAS1-201ENST00000325942 PRICKLE2Q7Z3G6 844 aa9.51□□□□□ -0.89
FRAS1-201ENST00000325942 DEFB107AQ8IZN7 70 aa9.51□□□□□ -0.89
FRAS1-201ENST00000325942 SDR16C5Q8N3Y7 309 aa9.51□□□□□ -0.89
FRAS1-201ENST00000325942 OR51V1Q9H2C8 321 aa9.51□□□□□ -0.89
FRAS1-201ENST00000325942 TMA7Q9Y2S6 64 aaKnown RBP9.51□□□□□ -0.89
FRAS1-201ENST00000325942 ERVK-7P63135 1459 aa9.51□□□□□ -0.89
FRAS1-201ENST00000325942 SMCO3A2RU48 225 aa9.51□□□□□ -0.89
FRAS1-201ENST00000325942 NEMP2A6NFY4 417 aa9.51□□□□□ -0.89
FRAS1-201ENST00000325942 MEIS2O14770 477 aa9.51□□□□□ -0.89
FRAS1-201ENST00000325942 LTA4HP09960 611 aaKnown RBP9.51□□□□□ -0.89
FRAS1-201ENST00000325942 THRAP10827 490 aa9.51□□□□□ -0.89
FRAS1-201ENST00000325942 SPANXN3Q5MJ09 141 aa9.51□□□□□ -0.89
FRAS1-201ENST00000325942 USP53Q70EK8 1073 aa9.51□□□□□ -0.89
FRAS1-201ENST00000325942 OR4E2Q8NGC2 313 aa9.51□□□□□ -0.89
FRAS1-201ENST00000325942 OR6K6Q8NGW6 343 aa9.51□□□□□ -0.89
FRAS1-201ENST00000325942 OMA1Q96E52 524 aa9.51□□□□□ -0.89
FRAS1-201ENST00000325942 XRN2Q9H0D6 950 aaKnown RBP eCLIP9.51□□□□□ -0.89
FRAS1-201ENST00000325942 GDAP2Q9NXN4 497 aa9.51□□□□□ -0.89
FRAS1-201ENST00000325942 SH3PXD2BA1X283 911 aa9.5□□□□□ -0.89
FRAS1-201ENST00000325942 UGT2B17O75795 530 aa9.5□□□□□ -0.89
FRAS1-201ENST00000325942 KLF8O95600 359 aaPredicted RBP9.5□□□□□ -0.89
FRAS1-201ENST00000325942 CDH13P55290 713 aa9.5□□□□□ -0.89
FRAS1-201ENST00000325942 NAE1Q13564 534 aa9.5□□□□□ -0.89
FRAS1-201ENST00000325942 ZNF613Q6PF04 617 aa9.5□□□□□ -0.89
FRAS1-201ENST00000325942 STOX1Q6ZVD7 989 aa9.5□□□□□ -0.89
FRAS1-201ENST00000325942 USP49Q70CQ1 688 aa9.5□□□□□ -0.89
FRAS1-201ENST00000325942 RAB11FIP2Q7L804 512 aa9.5□□□□□ -0.89
FRAS1-201ENST00000325942 TBATAQ96M53 351 aa9.5□□□□□ -0.89
FRAS1-201ENST00000325942 SPATA5L1Q9BVQ7 753 aa9.5□□□□□ -0.89
FRAS1-201ENST00000325942 CDH19Q9H159 772 aa9.5□□□□□ -0.89
FRAS1-201ENST00000325942 PABPC3Q9H361 631 aaKnown RBP9.5□□□□□ -0.89
FRAS1-201ENST00000325942 FBRSQ9HAH7 460 aa9.5□□□□□ -0.89
FRAS1-201ENST00000325942 PNPLA7Q6ZV29 1317 aa9.5□□□□□ -0.89
FRAS1-201ENST00000325942 LGR5O75473 907 aa9.5□□□□□ -0.89
FRAS1-201ENST00000325942 TPPPO94811 219 aa9.5□□□□□ -0.89
FRAS1-201ENST00000325942 MLYCDO95822 493 aa9.5□□□□□ -0.89
FRAS1-201ENST00000325942 IFNGP01579 166 aa9.5□□□□□ -0.89
FRAS1-201ENST00000325942 ADH5P11766 374 aa9.5□□□□□ -0.89
FRAS1-201ENST00000325942 RBL1P28749 1068 aa9.5□□□□□ -0.89
FRAS1-201ENST00000325942 GAD2Q05329 585 aa9.5□□□□□ -0.89
FRAS1-201ENST00000325942 CTBP1Q13363 440 aa9.5□□□□□ -0.89
FRAS1-201ENST00000325942 ZC3H14Q6PJT7 736 aaKnown RBP9.5□□□□□ -0.89
FRAS1-201ENST00000325942 TMED8Q6PL24 325 aaPredicted RBP9.5□□□□□ -0.89
FRAS1-201ENST00000325942 SLC2A7Q6PXP3 512 aa9.5□□□□□ -0.89
FRAS1-201ENST00000325942 IZUMO2Q6UXV1 221 aa9.5□□□□□ -0.89
FRAS1-201ENST00000325942 ZBTB49Q6ZSB9 765 aa9.5□□□□□ -0.89
FRAS1-201ENST00000325942 ZBTB46Q86UZ6 589 aa9.5□□□□□ -0.89
FRAS1-201ENST00000325942 RIOX2Q8IUF8 465 aa9.5□□□□□ -0.89
FRAS1-201ENST00000325942 PCDH20Q8N6Y1 951 aaKnown RBP9.5□□□□□ -0.89
FRAS1-201ENST00000325942 BEND7Q8N7W2 519 aaPredicted RBP9.5□□□□□ -0.89
FRAS1-201ENST00000325942 C12orf76Q8N812 135 aaPredicted RBP9.5□□□□□ -0.89
FRAS1-201ENST00000325942 COX18Q8N8Q8 333 aa9.5□□□□□ -0.89
FRAS1-201ENST00000325942 BTBD1Q9H0C5 482 aa9.5□□□□□ -0.89
FRAS1-201ENST00000325942 GOLGA4Q13439 2230 aaKnown RBP9.5□□□□□ -0.89
FRAS1-201ENST00000325942 SEC14L5O43304 696 aa9.5□□□□□ -0.89
FRAS1-201ENST00000325942 C9P02748 559 aa9.5□□□□□ -0.89
FRAS1-201ENST00000325942 FHP07954 510 aa9.5□□□□□ -0.89
FRAS1-201ENST00000325942 GIT2Q14161 759 aa9.5□□□□□ -0.89
FRAS1-201ENST00000325942 TEAD2Q15562 447 aa9.5□□□□□ -0.89
FRAS1-201ENST00000325942 ZNF598Q86UK7 904 aaKnown RBP9.5□□□□□ -0.89
FRAS1-201ENST00000325942 LRRC6Q86X45 466 aa9.5□□□□□ -0.89
FRAS1-201ENST00000325942 GKN2Q86XP6 184 aa9.5□□□□□ -0.89
FRAS1-201ENST00000325942 GSTCDQ8NEC7 633 aa9.5□□□□□ -0.89
FRAS1-201ENST00000325942 OR5T2Q8NGG2 359 aa9.5□□□□□ -0.89
FRAS1-201ENST00000325942 LRRC20Q8TCA0 184 aa9.5□□□□□ -0.89
FRAS1-201ENST00000325942 CST11Q9H112 138 aa9.5□□□□□ -0.89
FRAS1-201ENST00000325942 TMEM27Q9HBJ8 222 aa9.5□□□□□ -0.89
FRAS1-201ENST00000325942 TMEM5Q9Y2B1 443 aa9.5□□□□□ -0.89
FRAS1-201ENST00000325942 ARHGAP31Q2M1Z3 1444 aa9.5□□□□□ -0.89
FRAS1-201ENST00000325942 ARHGEF40Q8TER5 1519 aa9.5□□□□□ -0.89
FRAS1-201ENST00000325942 NDUFS4O43181 175 aa9.5□□□□□ -0.89
FRAS1-201ENST00000325942 PAGE1O75459 146 aa9.5□□□□□ -0.89
FRAS1-201ENST00000325942 PDE5AO76074 875 aa9.5□□□□□ -0.89
FRAS1-201ENST00000325942 TNFAIP8O95379 198 aa9.5□□□□□ -0.89
FRAS1-201ENST00000325942 CSTBP04080 98 aaKnown RBP9.5□□□□□ -0.89
FRAS1-201ENST00000325942 GOT1P17174 413 aa9.5□□□□□ -0.89
FRAS1-201ENST00000325942 ATP13A5Q4VNC0 1218 aa9.5□□□□□ -0.89
FRAS1-201ENST00000325942 TMPPEQ6ZT21 453 aa9.5□□□□□ -0.89
FRAS1-201ENST00000325942 CMTR2Q8IYT2 770 aaKnown RBP9.5□□□□□ -0.89
FRAS1-201ENST00000325942 GALNT11Q8NCW6 608 aa9.5□□□□□ -0.89
FRAS1-201ENST00000325942 SH3YL1Q96HL8 342 aaPredicted RBP9.5□□□□□ -0.89
FRAS1-201ENST00000325942 NOL6Q9H6R4 1146 aaKnown RBP9.5□□□□□ -0.89
FRAS1-201ENST00000325942 C17orf75Q9HAS0 396 aa9.5□□□□□ -0.89
FRAS1-201ENST00000325942 ZNF490Q9ULM2 529 aaPredicted RBP9.5□□□□□ -0.89
FRAS1-201ENST00000325942 TMEM98Q9Y2Y6 226 aa9.5□□□□□ -0.89
FRAS1-201ENST00000325942 DNMT1P26358 1616 aaKnown RBP9.5□□□□□ -0.89
FRAS1-201ENST00000325942 GLYATL1P3A0A0U1RQE8 302 aa9.5□□□□□ -0.89
FRAS1-201ENST00000325942 HSPA12AO43301 675 aa9.5□□□□□ -0.89
FRAS1-201ENST00000325942 CHP2O43745 196 aa9.5□□□□□ -0.89
FRAS1-201ENST00000325942 BANF1O75531 89 aa9.5□□□□□ -0.89
FRAS1-201ENST00000325942 CRABP2P29373 138 aa9.5□□□□□ -0.89
FRAS1-201ENST00000325942 RFX5P48382 616 aaPredicted RBP9.5□□□□□ -0.89
FRAS1-201ENST00000325942 GATMP50440 423 aa9.5□□□□□ -0.89
FRAS1-201ENST00000325942 ID2Q02363 134 aa9.5□□□□□ -0.89
FRAS1-201ENST00000325942 WDR45BQ5MNZ6 344 aa9.5□□□□□ -0.89
FRAS1-201ENST00000325942 NEK5Q6P3R8 708 aa9.5□□□□□ -0.89
FRAS1-201ENST00000325942 TMCO2Q7Z6W1 182 aaPredicted RBP9.5□□□□□ -0.89
FRAS1-201ENST00000325942 SIDT2Q8NBJ9 832 aaKnown RBP9.5□□□□□ -0.89
FRAS1-201ENST00000325942 OR52J3Q8NH60 311 aa9.5□□□□□ -0.89
FRAS1-201ENST00000325942 APOL4Q9BPW4 351 aa9.5□□□□□ -0.89
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 49.8 ms