RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000318988.10

CTDNEP1-201, Transcript of CTD nuclear envelope phosphatase 1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene CTDNEP1, Length 1,549 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTDNEP1-201ENST00000318988 DNAJC3Q13217 504 aa27.21■■□□□ 1.95
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CTDNEP1-201ENST00000318988 SLC25A14O95258 325 aaPredicted RBP27.19■■□□□ 1.94
CTDNEP1-201ENST00000318988 SAT1P21673 171 aa27.19■■□□□ 1.94
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CTDNEP1-201ENST00000318988 SLC39A10Q9ULF5 831 aa27.19■■□□□ 1.94
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CTDNEP1-201ENST00000318988 IGHV1OR15-9A0A0B4J2B8 117 aa27.18■■□□□ 1.94
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CTDNEP1-201ENST00000318988 FAM45BPQ6NSW5 357 aa27.17■■□□□ 1.94
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CTDNEP1-201ENST00000318988 FAM45AQ8TCE6 357 aa27.17■■□□□ 1.94
CTDNEP1-201ENST00000318988 TSPAN17Q96FV3 270 aa27.17■■□□□ 1.94
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CTDNEP1-201ENST00000318988 C6orf106Q9H6K1 298 aaPredicted RBP27.17■■□□□ 1.94
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CTDNEP1-201ENST00000318988 TRABD2AQ86V40 505 aa27.16■■□□□ 1.94
CTDNEP1-201ENST00000318988 SLC41A1Q8IVJ1 513 aa27.16■■□□□ 1.94
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CTDNEP1-201ENST00000318988 MBNL1Q9NR56 388 aaKnown RBP27.16■■□□□ 1.94
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CTDNEP1-201ENST00000318988 F8W8V4 182 aa27.16■■□□□ 1.94
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CTDNEP1-201ENST00000318988 RPS3P23396 243 aaKnown RBP eCLIP27.16■■□□□ 1.945e-9■■■■■ 27.8
CTDNEP1-201ENST00000318988 HOXA6P31267 233 aa27.16■■□□□ 1.94
CTDNEP1-201ENST00000318988 MAGOHP61326 146 aaKnown RBP27.16■■□□□ 1.94
CTDNEP1-201ENST00000318988 TNFAIP8L3Q5GJ75 292 aa27.16■■□□□ 1.94
CTDNEP1-201ENST00000318988 FAM160A2Q8N612 972 aaPredicted RBP27.16■■□□□ 1.94
CTDNEP1-201ENST00000318988 DENND6BQ8NEG7 585 aa27.16■■□□□ 1.94
CTDNEP1-201ENST00000318988 MZB1Q8WU39 189 aa27.16■■□□□ 1.94
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