RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000299339.2

CLDN10-201, Transcript of claudin 10, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene CLDN10, Length 949 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLDN10-201ENST00000299339 PCDH19Q8TAB3 1148 aa6.6□□□□□ -1.35
CLDN10-201ENST00000299339 PYROXD1Q8WU10 500 aa6.6□□□□□ -1.35
CLDN10-201ENST00000299339 TFB1MQ8WVM0 346 aaKnown RBP6.6□□□□□ -1.35
CLDN10-201ENST00000299339 CPT1BQ92523 772 aa6.6□□□□□ -1.35
CLDN10-201ENST00000299339 FAM149B1Q96BN6 582 aa6.6□□□□□ -1.35
CLDN10-201ENST00000299339 BIRC7Q96CA5 298 aa6.6□□□□□ -1.35
CLDN10-201ENST00000299339 SGF29Q96ES7 293 aa6.6□□□□□ -1.35
CLDN10-201ENST00000299339 SGSM3Q96HU1 749 aa6.6□□□□□ -1.35
CLDN10-201ENST00000299339 C8orf48Q96LL4 319 aa6.6□□□□□ -1.35
CLDN10-201ENST00000299339 CSPG4P5Q96PW8 444 aa6.6□□□□□ -1.35
CLDN10-201ENST00000299339 HAPLN3Q96S86 360 aa6.6□□□□□ -1.35
CLDN10-201ENST00000299339 SMOQ99835 787 aa6.6□□□□□ -1.35
CLDN10-201ENST00000299339 NAT9Q9BTE0 207 aa6.6□□□□□ -1.35
CLDN10-201ENST00000299339 ACE2Q9BYF1 805 aaPredicted RBP6.6□□□□□ -1.35
CLDN10-201ENST00000299339 FBXO44Q9H4M3 255 aa6.6□□□□□ -1.35
CLDN10-201ENST00000299339 XAB2Q9HCS7 855 aaKnown RBP6.6□□□□□ -1.35
CLDN10-201ENST00000299339 EIF2B3Q9NR50 452 aaKnown RBP6.6□□□□□ -1.35
CLDN10-201ENST00000299339 SPHK2Q9NRA0 654 aa6.6□□□□□ -1.35
CLDN10-201ENST00000299339 ABCC13Q9NSE7 274 aa6.6□□□□□ -1.35
CLDN10-201ENST00000299339 DNAJC17Q9NVM6 304 aaKnown RBP6.6□□□□□ -1.35
CLDN10-201ENST00000299339 EURLQ9NYK6 297 aa6.6□□□□□ -1.35
CLDN10-201ENST00000299339 NINJ2Q9NZG7 142 aa6.6□□□□□ -1.35
CLDN10-201ENST00000299339 IL37Q9NZH6 218 aa6.6□□□□□ -1.35
CLDN10-201ENST00000299339 TBC1D14Q9P2M4 693 aa6.6□□□□□ -1.35
CLDN10-201ENST00000299339 AP4E1Q9UPM8 1137 aa6.6□□□□□ -1.35
CLDN10-201ENST00000299339 SATB2Q9UPW6 733 aa6.6□□□□□ -1.35
CLDN10-201ENST00000299339 NAV3Q8IVL0 2385 aa6.59□□□□□ -1.35
CLDN10-201ENST00000299339 FAM95CA0A1B0GW59 222 aa6.59□□□□□ -1.35
CLDN10-201ENST00000299339 TLDC2A0PJX2 215 aa6.59□□□□□ -1.35
CLDN10-201ENST00000299339 ERI2A8K979 691 aaKnown RBP6.59□□□□□ -1.35
CLDN10-201ENST00000299339 VILLO15195 856 aa6.59□□□□□ -1.35
CLDN10-201ENST00000299339 YKT6O15498 198 aa6.59□□□□□ -1.35
CLDN10-201ENST00000299339 TSPAN3O60637 253 aa6.59□□□□□ -1.35
CLDN10-201ENST00000299339 ATP2C2O75185 946 aa6.59□□□□□ -1.35
CLDN10-201ENST00000299339 CSO75390 466 aaKnown RBP6.59□□□□□ -1.35
CLDN10-201ENST00000299339 GRAP2O75791 330 aa6.59□□□□□ -1.35
CLDN10-201ENST00000299339 FSBPO95073 299 aa6.59□□□□□ -1.35
CLDN10-201ENST00000299339 OLFM2O95897 454 aa6.59□□□□□ -1.35
CLDN10-201ENST00000299339 SHBGP04278 402 aa6.59□□□□□ -1.35
CLDN10-201ENST00000299339 SLC2A3P11169 496 aa6.59□□□□□ -1.35
CLDN10-201ENST00000299339 RBMS1P29558 406 aaKnown RBP6.59□□□□□ -1.35
CLDN10-201ENST00000299339 ACSL1P33121 698 aa6.59□□□□□ -1.35
CLDN10-201ENST00000299339 SERPINB6P35237 376 aa6.59□□□□□ -1.35
CLDN10-201ENST00000299339 CASRP41180 1078 aa6.59□□□□□ -1.35
CLDN10-201ENST00000299339 SULT1E1P49888 294 aa6.59□□□□□ -1.35
CLDN10-201ENST00000299339 COPAP53621 1224 aa6.59□□□□□ -1.35
CLDN10-201ENST00000299339 GEMIN4P57678 1058 aaKnown RBP6.59□□□□□ -1.35
CLDN10-201ENST00000299339 RACK1P63244 317 aaKnown RBP6.59□□□□□ -1.35
CLDN10-201ENST00000299339 ID3Q02535 119 aa6.59□□□□□ -1.35
CLDN10-201ENST00000299339 BNIP3Q12983 259 aa6.59□□□□□ -1.35
CLDN10-201ENST00000299339 SEMA5AQ13591 1074 aa6.59□□□□□ -1.35
CLDN10-201ENST00000299339 MAP7Q14244 749 aa6.59□□□□□ -1.35
CLDN10-201ENST00000299339 KCNJ11Q14654 390 aa6.59□□□□□ -1.35
CLDN10-201ENST00000299339 LRRC14Q15048 493 aa6.59□□□□□ -1.35
CLDN10-201ENST00000299339 LLGL1Q15334 1064 aa6.59□□□□□ -1.35
CLDN10-201ENST00000299339 TAF5Q15542 800 aa6.59□□□□□ -1.35
CLDN10-201ENST00000299339 TRIP13Q15645 432 aaPredicted RBP6.59□□□□□ -1.35
CLDN10-201ENST00000299339 CPSF6Q16630 551 aaKnown RBP eCLIP6.59□□□□□ -1.35
CLDN10-201ENST00000299339 TBR1Q16650 682 aa6.59□□□□□ -1.35
CLDN10-201ENST00000299339 CDO1Q16878 200 aa6.59□□□□□ -1.35
CLDN10-201ENST00000299339 MSMPQ1L6U9 139 aa6.59□□□□□ -1.35
CLDN10-201ENST00000299339 PARP6Q2NL67 630 aa6.59□□□□□ -1.35
CLDN10-201ENST00000299339 C3orf38Q5JPI3 329 aa6.59□□□□□ -1.35
CLDN10-201ENST00000299339 CDPF1Q6NVV7 123 aa6.59□□□□□ -1.35
CLDN10-201ENST00000299339 ARHGEF18Q6ZSZ5 1173 aa6.59□□□□□ -1.35
CLDN10-201ENST00000299339 C3orf62Q6ZUJ4 267 aa6.59□□□□□ -1.35
CLDN10-201ENST00000299339 KANSL1Q7Z3B3 1105 aa6.59□□□□□ -1.35
CLDN10-201ENST00000299339 YTHDF3Q7Z739 585 aaKnown RBP6.59□□□□□ -1.35
CLDN10-201ENST00000299339 EXOC3L1Q86VI1 746 aa6.59□□□□□ -1.35
CLDN10-201ENST00000299339 CCDC25Q86WR0 208 aa6.59□□□□□ -1.35
CLDN10-201ENST00000299339 TMEM25Q86YD3 366 aa6.59□□□□□ -1.35
CLDN10-201ENST00000299339 UNC45BQ8IWX7 931 aa6.59□□□□□ -1.35
CLDN10-201ENST00000299339 PALM2Q8IXS6 379 aa6.59□□□□□ -1.35
CLDN10-201ENST00000299339 SRRM1Q8IYB3 904 aaKnown RBP6.59□□□□□ -1.35
CLDN10-201ENST00000299339 FAM71DQ8N9W8 422 aa6.59□□□□□ -1.35
CLDN10-201ENST00000299339 ZMIZ2Q8NF64 920 aa6.59□□□□□ -1.35
CLDN10-201ENST00000299339 OR2W6PQ8NHA6 318 aa6.59□□□□□ -1.35
CLDN10-201ENST00000299339 BCAS4Q8TDM0 211 aa6.59□□□□□ -1.35
CLDN10-201ENST00000299339 MAML1Q92585 1016 aa6.59□□□□□ -1.35
CLDN10-201ENST00000299339 ARHGEF2Q92974 986 aaKnown RBP6.59□□□□□ -1.35
CLDN10-201ENST00000299339 GRAMD1AQ96CP6 724 aa6.59□□□□□ -1.35
CLDN10-201ENST00000299339 OTUB2Q96DC9 234 aa6.59□□□□□ -1.35
CLDN10-201ENST00000299339 PIWIL1Q96J94 861 aaKnown RBP6.59□□□□□ -1.35
CLDN10-201ENST00000299339 C1orf74Q96LT6 269 aa6.59□□□□□ -1.35
CLDN10-201ENST00000299339 SLC46A1Q96NT5 459 aa6.59□□□□□ -1.35
CLDN10-201ENST00000299339 OLFM3Q96PB7 478 aa6.59□□□□□ -1.35
CLDN10-201ENST00000299339 PLCD4Q9BRC7 762 aa6.59□□□□□ -1.35
CLDN10-201ENST00000299339 ORAI3Q9BRQ5 295 aa6.59□□□□□ -1.35
CLDN10-201ENST00000299339 ULBP1Q9BZM6 244 aa6.59□□□□□ -1.35
CLDN10-201ENST00000299339 CENPHQ9H3R5 247 aa6.59□□□□□ -1.35
CLDN10-201ENST00000299339 DHX35Q9H5Z1 703 aaKnown RBP6.59□□□□□ -1.35
CLDN10-201ENST00000299339 ACSS3Q9H6R3 686 aa6.59□□□□□ -1.35
CLDN10-201ENST00000299339 WDCPQ9H6R7 721 aa6.59□□□□□ -1.35
CLDN10-201ENST00000299339 SAYSD1Q9NPB0 183 aa6.59□□□□□ -1.35
CLDN10-201ENST00000299339 INTS9Q9NV88 658 aaKnown RBP6.59□□□□□ -1.35
CLDN10-201ENST00000299339 KLHL11Q9NVR0 708 aa6.59□□□□□ -1.35
CLDN10-201ENST00000299339 GEMIN8Q9NWZ8 242 aaKnown RBP6.59□□□□□ -1.35
CLDN10-201ENST00000299339 TRPM5Q9NZQ8 1165 aa6.59□□□□□ -1.35
CLDN10-201ENST00000299339 CRIM1Q9NZV1 1036 aa6.59□□□□□ -1.35
CLDN10-201ENST00000299339 ZNF180Q9UJW8 692 aa6.59□□□□□ -1.35
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 37.5 ms